MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008800	AGGCT	2	10	21193	21202	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008800	ATCAA	2	10	22902	22911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008800	AAAGG	2	10	44219	44228	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008800	TAATC	2	10	61408	61417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008800	GAAAG	2	10	66831	66840	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008800	AAAGA	2	10	69168	69177	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008800	GGAGA	2	10	70128	70137	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008800	TGATT	2	10	74350	74359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008800	TAACA	2	10	78728	78737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008800	TTAAT	2	10	89522	89531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008800	AAATA	2	10	91097	91106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008800	GCCGG	2	10	96239	96248	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008800	GCTTT	2	10	103183	103192	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008800	TTTCT	2	10	103807	103816	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008800	GGTAA	2	10	134376	134385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008800	TTATT	2	10	138045	138054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008800	GCTAA	2	10	142469	142478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008800	ATTTA	2	10	147190	147199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008800	ATCAC	2	10	149345	149354	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008800	AAAAT	2	10	151820	151829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008800	TATCT	2	10	151907	151916	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008800	AGGCT	2	10	164260	164269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008800	GATTG	2	10	165790	165799	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008800	TGTTT	2	10	172273	172282	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008800	TATCC	2	10	191494	191503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008800	AACTT	2	10	209720	209729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008800	AAAAT	2	10	218808	218817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008800	TAAAC	2	10	226479	226488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008800	ATGTT	2	10	258571	258580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008800	TTGCT	2	10	260359	260368	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008800	CAACA	2	10	265854	265863	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008800	TTAAT	2	10	276325	276334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008800	AACAG	2	10	282514	282523	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008800	GATGG	2	10	288617	288626	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008800	ATGAG	2	10	288866	288875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008800	TTTAT	2	10	294309	294318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008800	AGGTG	2	10	295886	295895	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008800	AGGCT	2	10	317813	317822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008800	ATCAA	2	10	319521	319530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008800	CGAGC	2	10	324122	324131	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008800	TTTGC	2	10	325983	325992	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008800	GTCTT	2	10	327001	327010	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008800	AGGCT	2	10	358392	358401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008800	GATTG	2	10	359922	359931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008800	ATCAA	2	10	360097	360106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008800	TGTTT	2	10	367025	367034	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008800	CGGGT	2	10	367591	367600	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008800	AATTA	2	10	370208	370217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008800	GGGCC	2	10	371765	371774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008800	TGGCA	2	10	375435	375444	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008800	TAAAT	2	10	386079	386088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008800	ATTAT	2	10	388685	388694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008800	TAAAT	2	10	399345	399354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008800	TTGTT	2	10	429590	429599	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008800	TGATT	2	10	460189	460198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008800	TTCAT	2	10	466410	466419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008800	AATTG	2	10	468596	468605	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008800	TATTC	2	10	482868	482877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008800	TAAAT	2	10	484584	484593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008800	CAAGG	2	10	486205	486214	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008800	TATTT	2	10	513981	513990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008800	TTATT	2	10	531888	531897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008800	TATTT	2	10	532798	532807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008800	AAAAT	2	10	536337	536346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008800	TTAAT	2	10	536663	536672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008800	GTTTT	2	10	536737	536746	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008800	CTATT	2	10	543263	543272	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008800	ATTTT	2	10	544321	544330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008800	ATTAA	2	10	544422	544431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008800	TTGAT	2	10	544909	544918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008800	ATAGA	2	10	555053	555062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008800	GGAAA	2	10	579903	579912	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008800	GATAC	2	10	580759	580768	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008800	TGAGT	2	10	581921	581930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008800	GGTGT	2	10	582525	582534	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008800	GAAAA	2	10	587139	587148	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008800	CTATA	2	10	587686	587695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008800	ATAAA	2	10	587701	587710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008800	AATAT	2	10	587824	587833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008800	CTATT	2	10	587898	587907	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008800	ATTTA	2	10	587921	587930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008800	TTAAA	2	10	598142	598151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008800	TAAAA	2	10	604612	604621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008800	TTTAT	2	10	604831	604840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008800	TGAAA	2	10	604918	604927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008800	AATTT	2	10	605012	605021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008800	ATTCT	2	10	605078	605087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008800	CTGCA	2	10	636527	636536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008800	AGCAA	2	10	637689	637698	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008800	TGTGC	2	10	644099	644108	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008800	GGTCA	2	10	644152	644161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008800	TTGCT	2	10	648458	648467	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008800	CAAAA	2	10	650410	650419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008800	GATAG	2	10	662373	662382	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008800	GCCTC	2	10	671323	671332	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_008800	GCCTC	2	10	671525	671534	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_008800	GGCCT	2	10	677174	677183	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008800	AGTGA	2	10	684378	684387	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008800	TTTCA	2	10	686868	686877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008800	TTATT	2	10	686903	686912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008800	TTTAC	2	10	695036	695045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008800	ATGTG	2	10	703417	703426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008800	ACAAG	2	10	710941	710950	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008800	GCTGA	2	10	728314	728323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008800	TATTT	2	10	735469	735478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008800	AAGAT	2	10	740299	740308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008800	GCAAT	2	10	752015	752024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008800	TTATC	2	10	757639	757648	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008800	TGTGA	2	10	757820	757829	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008800	ATCCA	2	10	759214	759223	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008800	ATTGT	2	10	765879	765888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008800	ACTGC	2	10	766322	766331	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008800	GCTGA	2	10	784731	784740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008800	AAGTG	2	10	791001	791010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008800	TTAGG	2	10	796863	796872	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008800	TAAAA	2	10	798701	798710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008800	TCATT	2	10	798769	798778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008800	TTTTA	2	10	808014	808023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008800	AAATA	2	10	808241	808250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008800	CTTAC	2	10	820157	820166	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008800	GCCTC	2	10	836978	836987	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_008800	TTATT	2	10	853200	853209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008800	TAAAA	2	10	875799	875808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008800	CTTAT	2	10	876820	876829	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008800	TTTTA	2	10	877118	877127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008800	TGCTC	2	10	877710	877719	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008800	GCCTC	2	10	879349	879358	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_008800	TTTGA	2	10	885492	885501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008800	GTTTG	2	10	891908	891917	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008800	TATGG	2	10	896436	896445	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008800	AAGTG	2	10	938561	938570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008800	CGTGA	2	10	940817	940826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008800	CGAGC	2	10	963306	963315	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008800	CGAGC	2	10	963466	963475	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008800	GCCTC	2	10	979441	979450	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_008800	ATTTA	2	10	988684	988693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008800	GTAAT	2	10	989872	989881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008800	AGGCT	2	10	1022892	1022901	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008800	GATTG	2	10	1024422	1024431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008800	TTTTA	2	10	1026738	1026747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008800	ATTAC	2	10	1043802	1043811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008800	CGATC	2	10	1054967	1054976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008800	CTATA	2	10	1058771	1058780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008800	AAGTA	2	10	1066110	1066119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008800	TCAAA	2	10	1068887	1068896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008800	AATAA	2	10	1074475	1074484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008800	TGTTT	2	10	1074755	1074764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008800	TTATT	2	10	1074765	1074774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008800	AGGCA	2	10	1075509	1075518	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_008800	AATTT	2	10	1155994	1156003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008800	CGTTT	2	10	1162799	1162808	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_008800	TACGA	2	10	1316239	1316248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_008800	TGGCT	2	10	1316873	1316882	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_008800	AACTA	2	10	1320925	1320934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_008800	CGAGC	2	10	1356768	1356777	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_008800	TACTC	2	10	1943760	1943769	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_008800	AACAG	2	10	1969537	1969546	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_008800	ATTAA	2	10	1973213	1973222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_008800	TCTTG	2	10	1989457	1989466	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
282	NC_008800	TCTGG	2	10	1995042	1995051	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_008800	ACACA	2	10	2017264	2017273	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_008800	TTTAC	2	10	2018834	2018843	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_008800	ATTTT	2	10	2019379	2019388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_008800	CATAT	2	10	2026290	2026299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_008800	TTATC	2	10	2029358	2029367	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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295	NC_008800	TTCGG	2	10	2072828	2072837	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_008800	GGTTT	2	10	2129102	2129111	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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333	NC_008800	ATTTC	2	10	2366381	2366390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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346	NC_008800	CCCTC	2	10	2453628	2453637	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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407	NC_008800	ATCAG	2	10	2881994	2882003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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410	NC_008800	TGGCA	2	10	2897655	2897664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
411	NC_008800	TTTTG	2	10	2905345	2905354	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
412	NC_008800	AATTA	2	10	2929175	2929184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_008800	TAAAA	2	10	2932149	2932158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_008800	GAAAA	2	10	3001320	3001329	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
420	NC_008800	TTCAT	2	10	3015193	3015202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
421	NC_008800	AAATA	2	10	3026526	3026535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_008800	AATTT	2	10	3033499	3033508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_008800	TGAAT	2	10	3035748	3035757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_008800	TAAAT	2	10	3176846	3176855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_008800	TTATT	2	10	3386239	3386248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_008800	ATTTA	2	10	3387789	3387798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_008800	CAACT	2	10	3405164	3405173	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
480	NC_008800	AATGA	2	10	3412419	3412428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_008800	AGCAG	2	10	3454820	3454829	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
486	NC_008800	TCTAC	2	10	3471778	3471787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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