MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008790	CGAGGA	2	12	1046	1057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121999252
2	NC_008790	GAAAAA	2	12	1662	1673	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121999254
3	NC_008790	AGAAAG	2	12	3329	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999257
4	NC_008790	GAGAAA	2	12	4074	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999259
5	NC_008790	GATTTA	2	12	4475	4486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121999260
6	NC_008790	CACAAA	2	12	4907	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999261
7	NC_008790	ACAAGA	2	12	5300	5311	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121999261
8	NC_008790	ATTTTT	2	12	11792	11803	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	121999263
9	NC_008790	TTTATT	2	12	12436	12447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	121999263
10	NC_008790	AAAAAG	2	12	13365	13376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121999265
11	NC_008790	ATTTCT	2	12	17120	17131	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121999271
12	NC_008790	AATTTT	2	12	17178	17189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999271
13	NC_008790	AAAGAC	2	12	19814	19825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008790	TCCTTC	2	12	20885	20896	0 %	50 %	0 %	50 %	121999277
15	NC_008790	AATCCA	2	12	20942	20953	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	121999277
16	NC_008790	GATAAA	2	12	23425	23436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121999279
17	NC_008790	TATTGA	2	12	23937	23948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121999279
18	NC_008790	AAGATG	2	12	25934	25945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121999282
19	NC_008790	TATTCT	2	12	26631	26642	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121999284
20	NC_008790	CAAGAA	2	12	29674	29685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121999288
21	NC_008790	ATTAAG	2	12	33264	33275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121999291
22	NC_008790	CCAAAA	2	12	34103	34114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999292
23	NC_008790	TATAAA	2	12	34741	34752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999293
24	NC_008790	AGACAA	2	12	38537	38548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121999296
25	NC_008790	TGAATT	2	12	39566	39577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121999297

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.