MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008790	AAGT	2	8	88	95	50 %	25 %	25 %	0 %	121999252
2	NC_008790	TCCG	2	8	565	572	0 %	25 %	25 %	50 %	121999252
3	NC_008790	AGTC	2	8	621	628	25 %	25 %	25 %	25 %	121999252
4	NC_008790	ATTT	2	8	1441	1448	25 %	75 %	0 %	0 %	121999253
5	NC_008790	GATT	2	8	1675	1682	25 %	50 %	25 %	0 %	121999254
6	NC_008790	TAAT	2	8	1860	1867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008790	ATTT	2	8	2048	2055	25 %	75 %	0 %	0 %	121999255
8	NC_008790	TTAT	2	8	2448	2455	25 %	75 %	0 %	0 %	121999256
9	NC_008790	AAAT	2	8	2607	2614	75 %	25 %	0 %	0 %	121999256
10	NC_008790	TATT	2	8	2668	2675	25 %	75 %	0 %	0 %	121999256
11	NC_008790	TAAA	2	8	3447	3454	75 %	25 %	0 %	0 %	121999258
12	NC_008790	ATTT	2	8	3659	3666	25 %	75 %	0 %	0 %	121999258
13	NC_008790	AAAG	2	8	3948	3955	75 %	0 %	25 %	0 %	121999259
14	NC_008790	ATAA	2	8	4282	4289	75 %	25 %	0 %	0 %	121999259
15	NC_008790	GAAC	2	8	4758	4765	50 %	0 %	25 %	25 %	121999261
16	NC_008790	AAAT	2	8	5003	5010	75 %	25 %	0 %	0 %	121999261
17	NC_008790	TCAA	2	8	5012	5019	50 %	25 %	0 %	25 %	121999261
18	NC_008790	ATCT	2	8	5205	5212	25 %	50 %	0 %	25 %	121999261
19	NC_008790	AGAT	2	8	5225	5232	50 %	25 %	25 %	0 %	121999261
20	NC_008790	TAAA	2	8	5317	5324	75 %	25 %	0 %	0 %	121999261
21	NC_008790	ATTT	2	8	5701	5708	25 %	75 %	0 %	0 %	121999261
22	NC_008790	TAAG	2	8	6370	6377	50 %	25 %	25 %	0 %	121999261
23	NC_008790	CAAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	0 %	25 %	121999261
24	NC_008790	AGAT	2	8	6944	6951	50 %	25 %	25 %	0 %	121999261
25	NC_008790	ACAA	2	8	7174	7181	75 %	0 %	0 %	25 %	121999261
26	NC_008790	ATTT	2	8	7222	7229	25 %	75 %	0 %	0 %	121999261
27	NC_008790	AGAA	2	8	7310	7317	75 %	0 %	25 %	0 %	121999261
28	NC_008790	TAAA	2	8	7741	7748	75 %	25 %	0 %	0 %	121999261
29	NC_008790	AACA	2	8	7996	8003	75 %	0 %	0 %	25 %	121999261
30	NC_008790	ATTA	2	8	8156	8163	50 %	50 %	0 %	0 %	121999261
31	NC_008790	ATAC	2	8	8366	8373	50 %	25 %	0 %	25 %	121999261
32	NC_008790	ACTT	2	8	8752	8759	25 %	50 %	0 %	25 %	121999261
33	NC_008790	TAAA	2	8	8986	8993	75 %	25 %	0 %	0 %	121999261
34	NC_008790	AACA	2	8	9025	9032	75 %	0 %	0 %	25 %	121999261
35	NC_008790	TTCA	2	8	9150	9157	25 %	50 %	0 %	25 %	121999261
36	NC_008790	GAAA	2	8	9864	9871	75 %	0 %	25 %	0 %	121999261
37	NC_008790	AAAG	2	8	10228	10235	75 %	0 %	25 %	0 %	121999261
38	NC_008790	TAAA	2	8	10357	10364	75 %	25 %	0 %	0 %	121999261
39	NC_008790	AGAA	2	8	10378	10385	75 %	0 %	25 %	0 %	121999261
40	NC_008790	TTTA	2	8	10827	10834	25 %	75 %	0 %	0 %	121999262
41	NC_008790	CTTT	2	8	11141	11148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008790	TTTC	2	8	11324	11331	0 %	75 %	0 %	25 %	121999263
43	NC_008790	CTTT	2	8	11572	11579	0 %	75 %	0 %	25 %	121999263
44	NC_008790	ATTT	2	8	11854	11861	25 %	75 %	0 %	0 %	121999263
45	NC_008790	CCTT	2	8	12176	12183	0 %	50 %	0 %	50 %	121999263
46	NC_008790	TAAT	2	8	12273	12280	50 %	50 %	0 %	0 %	121999263
47	NC_008790	ATTT	2	8	12645	12652	25 %	75 %	0 %	0 %	121999264
48	NC_008790	ATTT	2	8	12914	12921	25 %	75 %	0 %	0 %	121999264
49	NC_008790	GTTT	2	8	13014	13021	0 %	75 %	25 %	0 %	121999264
50	NC_008790	AAAG	2	8	13301	13308	75 %	0 %	25 %	0 %	121999265
51	NC_008790	AAAT	2	8	13431	13438	75 %	25 %	0 %	0 %	121999265
52	NC_008790	TAAA	2	8	13702	13709	75 %	25 %	0 %	0 %	121999266
53	NC_008790	TAAT	2	8	13867	13874	50 %	50 %	0 %	0 %	121999266
54	NC_008790	ATTA	2	8	13889	13896	50 %	50 %	0 %	0 %	121999266
55	NC_008790	TGAA	2	8	14131	14138	50 %	25 %	25 %	0 %	121999266
56	NC_008790	TAAA	2	8	14155	14162	75 %	25 %	0 %	0 %	121999266
57	NC_008790	AAAT	2	8	14363	14370	75 %	25 %	0 %	0 %	121999267
58	NC_008790	TCAT	2	8	14521	14528	25 %	50 %	0 %	25 %	121999267
59	NC_008790	AAAT	2	8	14540	14547	75 %	25 %	0 %	0 %	121999267
60	NC_008790	CAAT	2	8	14594	14601	50 %	25 %	0 %	25 %	121999267
61	NC_008790	TTAA	2	8	14832	14839	50 %	50 %	0 %	0 %	121999267
62	NC_008790	ATGG	2	8	15238	15245	25 %	25 %	50 %	0 %	121999268
63	NC_008790	TGCT	2	8	16382	16389	0 %	50 %	25 %	25 %	121999269
64	NC_008790	TAAT	2	8	16739	16746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008790	GAAA	2	8	16915	16922	75 %	0 %	25 %	0 %	121999270
66	NC_008790	ATTT	2	8	17489	17496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008790	GGAT	2	8	17592	17599	25 %	25 %	50 %	0 %	121999272
68	NC_008790	TTTA	2	8	17690	17697	25 %	75 %	0 %	0 %	121999272
69	NC_008790	TTCG	2	8	18559	18566	0 %	50 %	25 %	25 %	121999274
70	NC_008790	GCTT	2	8	18600	18607	0 %	50 %	25 %	25 %	121999274
71	NC_008790	AATG	2	8	18805	18812	50 %	25 %	25 %	0 %	121999274
72	NC_008790	AAAG	2	8	19499	19506	75 %	0 %	25 %	0 %	121999274
73	NC_008790	AAAG	2	8	19525	19532	75 %	0 %	25 %	0 %	121999274
74	NC_008790	ATTT	2	8	19650	19657	25 %	75 %	0 %	0 %	121999274
75	NC_008790	ATGA	2	8	19795	19802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008790	CAAG	2	8	20004	20011	50 %	0 %	25 %	25 %	121999275
77	NC_008790	TAAG	2	8	20149	20156	50 %	25 %	25 %	0 %	121999275
78	NC_008790	ATTA	2	8	20263	20270	50 %	50 %	0 %	0 %	121999275
79	NC_008790	TATG	2	8	20491	20498	25 %	50 %	25 %	0 %	121999275
80	NC_008790	AATT	2	8	20855	20862	50 %	50 %	0 %	0 %	121999276
81	NC_008790	AATC	2	8	20983	20990	50 %	25 %	0 %	25 %	121999277
82	NC_008790	TAAA	2	8	21252	21259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008790	ATAA	2	8	21329	21336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008790	AATT	2	8	21998	22005	50 %	50 %	0 %	0 %	121999279
85	NC_008790	ATTA	2	8	23107	23114	50 %	50 %	0 %	0 %	121999279
86	NC_008790	CAAA	2	8	23201	23208	75 %	0 %	0 %	25 %	121999279
87	NC_008790	ATTT	2	8	23416	23423	25 %	75 %	0 %	0 %	121999279
88	NC_008790	GAAA	2	8	23665	23672	75 %	0 %	25 %	0 %	121999279
89	NC_008790	ATTT	2	8	23825	23832	25 %	75 %	0 %	0 %	121999279
90	NC_008790	GAAA	2	8	24387	24394	75 %	0 %	25 %	0 %	121999279
91	NC_008790	TTAT	2	8	24843	24850	25 %	75 %	0 %	0 %	121999280
92	NC_008790	GTGG	2	8	25471	25478	0 %	25 %	75 %	0 %	121999281
93	NC_008790	CAAT	2	8	25923	25930	50 %	25 %	0 %	25 %	121999282
94	NC_008790	ATCA	2	8	26290	26297	50 %	25 %	0 %	25 %	121999283
95	NC_008790	AAAG	2	8	27178	27185	75 %	0 %	25 %	0 %	121999284
96	NC_008790	TGGA	2	8	27643	27650	25 %	25 %	50 %	0 %	121999285
97	NC_008790	AATT	2	8	28370	28377	50 %	50 %	0 %	0 %	121999285
98	NC_008790	GGAT	2	8	28465	28472	25 %	25 %	50 %	0 %	121999286
99	NC_008790	TAAA	2	8	28499	28506	75 %	25 %	0 %	0 %	121999286
100	NC_008790	TACT	2	8	28653	28660	25 %	50 %	0 %	25 %	121999287
101	NC_008790	TACT	2	8	28842	28849	25 %	50 %	0 %	25 %	121999287
102	NC_008790	AAGT	2	8	28941	28948	50 %	25 %	25 %	0 %	121999287
103	NC_008790	TTTA	2	8	29415	29422	25 %	75 %	0 %	0 %	121999288
104	NC_008790	TAAA	2	8	29702	29709	75 %	25 %	0 %	0 %	121999288
105	NC_008790	AAAG	2	8	29863	29870	75 %	0 %	25 %	0 %	121999288
106	NC_008790	ATAA	2	8	30049	30056	75 %	25 %	0 %	0 %	121999288
107	NC_008790	TGAT	2	8	31138	31145	25 %	50 %	25 %	0 %	121999289
108	NC_008790	ATTT	2	8	32212	32219	25 %	75 %	0 %	0 %	121999290
109	NC_008790	ACTT	2	8	32296	32303	25 %	50 %	0 %	25 %	121999291
110	NC_008790	TAAA	2	8	32330	32337	75 %	25 %	0 %	0 %	121999291
111	NC_008790	CTTT	2	8	32419	32426	0 %	75 %	0 %	25 %	121999291
112	NC_008790	ATTT	2	8	32546	32553	25 %	75 %	0 %	0 %	121999291
113	NC_008790	TTTA	2	8	32774	32781	25 %	75 %	0 %	0 %	121999291
114	NC_008790	AGAC	2	8	32797	32804	50 %	0 %	25 %	25 %	121999291
115	NC_008790	TTAT	2	8	32944	32951	25 %	75 %	0 %	0 %	121999291
116	NC_008790	TTAT	2	8	32961	32968	25 %	75 %	0 %	0 %	121999291
117	NC_008790	TACA	2	8	33117	33124	50 %	25 %	0 %	25 %	121999291
118	NC_008790	ATTT	2	8	33369	33376	25 %	75 %	0 %	0 %	121999291
119	NC_008790	CTAT	2	8	33497	33504	25 %	50 %	0 %	25 %	121999291
120	NC_008790	ATCA	2	8	33557	33564	50 %	25 %	0 %	25 %	121999291
121	NC_008790	CAAG	2	8	34681	34688	50 %	0 %	25 %	25 %	121999293
122	NC_008790	AATG	2	8	35246	35253	50 %	25 %	25 %	0 %	121999294
123	NC_008790	AATT	2	8	35258	35265	50 %	50 %	0 %	0 %	121999294
124	NC_008790	AGAA	2	8	35521	35528	75 %	0 %	25 %	0 %	121999294
125	NC_008790	CTTA	2	8	35853	35860	25 %	50 %	0 %	25 %	121999294
126	NC_008790	AAAG	2	8	35889	35896	75 %	0 %	25 %	0 %	121999294
127	NC_008790	TGAA	2	8	36038	36045	50 %	25 %	25 %	0 %	121999294
128	NC_008790	AATT	2	8	36467	36474	50 %	50 %	0 %	0 %	121999295
129	NC_008790	TAAT	2	8	37387	37394	50 %	50 %	0 %	0 %	121999296
130	NC_008790	GTAG	2	8	37572	37579	25 %	25 %	50 %	0 %	121999296
131	NC_008790	AATT	2	8	37781	37788	50 %	50 %	0 %	0 %	121999296
132	NC_008790	AATT	2	8	38237	38244	50 %	50 %	0 %	0 %	121999296
133	NC_008790	ATAG	2	8	38322	38329	50 %	25 %	25 %	0 %	121999296
134	NC_008790	TATC	2	8	38371	38378	25 %	50 %	0 %	25 %	121999296
135	NC_008790	CAAA	2	8	38430	38437	75 %	0 %	0 %	25 %	121999296
136	NC_008790	AAGT	2	8	38629	38636	50 %	25 %	25 %	0 %	121999296
137	NC_008790	TTAA	2	8	38682	38689	50 %	50 %	0 %	0 %	121999296
138	NC_008790	AAAC	2	8	38867	38874	75 %	0 %	0 %	25 %	121999296
139	NC_008790	AGCA	2	8	39023	39030	50 %	0 %	25 %	25 %	121999296
140	NC_008790	ATTT	2	8	39207	39214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008790	TAAT	2	8	39215	39222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008790	AAAT	2	8	39652	39659	75 %	25 %	0 %	0 %	121999297
143	NC_008790	AATT	2	8	39983	39990	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
144	NC_008790	TAAA	2	8	39997	40004	75 %	25 %	0 %	0 %	121999297
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147	NC_008790	TAAA	2	8	41044	41051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_008790	ATGG	2	8	42743	42750	25 %	25 %	50 %	0 %	121999299
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158	NC_008790	CAGG	2	8	43884	43891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_008790	CGAG	2	8	44093	44100	25 %	0 %	50 %	25 %	121999301
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161	NC_008790	TTAT	2	8	44912	44919	25 %	75 %	0 %	0 %	121999303

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.