MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008790	GA	3	6	11	16	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008790	CA	3	6	304	309	50 %	0 %	0 %	50 %	121999252
3	NC_008790	GT	3	6	611	616	0 %	50 %	50 %	0 %	121999252
4	NC_008790	GA	3	6	1004	1009	50 %	0 %	50 %	0 %	121999252
5	NC_008790	AG	3	6	1034	1039	50 %	0 %	50 %	0 %	121999252
6	NC_008790	AT	3	6	1157	1162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008790	AT	3	6	1212	1217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008790	AT	3	6	1643	1648	50 %	50 %	0 %	0 %	121999254
9	NC_008790	AT	4	8	1852	1859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008790	TA	3	6	1893	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008790	TA	4	8	1901	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008790	TC	4	8	2193	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	121999255
13	NC_008790	AG	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	121999257
14	NC_008790	AT	3	6	3523	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	121999258
15	NC_008790	TA	3	6	3540	3545	50 %	50 %	0 %	0 %	121999258
16	NC_008790	TA	3	6	3691	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008790	TA	3	6	4505	4510	50 %	50 %	0 %	0 %	121999260
18	NC_008790	AG	3	6	4833	4838	50 %	0 %	50 %	0 %	121999261
19	NC_008790	AG	3	6	4958	4963	50 %	0 %	50 %	0 %	121999261
20	NC_008790	AT	3	6	5644	5649	50 %	50 %	0 %	0 %	121999261
21	NC_008790	TA	4	8	7631	7638	50 %	50 %	0 %	0 %	121999261
22	NC_008790	AC	3	6	7917	7922	50 %	0 %	0 %	50 %	121999261
23	NC_008790	AT	3	6	8279	8284	50 %	50 %	0 %	0 %	121999261
24	NC_008790	TG	3	6	8708	8713	0 %	50 %	50 %	0 %	121999261
25	NC_008790	CA	3	6	8900	8905	50 %	0 %	0 %	50 %	121999261
26	NC_008790	TA	3	6	9091	9096	50 %	50 %	0 %	0 %	121999261
27	NC_008790	GA	3	6	9371	9376	50 %	0 %	50 %	0 %	121999261
28	NC_008790	TA	3	6	10800	10805	50 %	50 %	0 %	0 %	121999262
29	NC_008790	AT	3	6	11001	11006	50 %	50 %	0 %	0 %	121999262
30	NC_008790	CT	3	6	11382	11387	0 %	50 %	0 %	50 %	121999263
31	NC_008790	TC	4	8	11408	11415	0 %	50 %	0 %	50 %	121999263
32	NC_008790	TC	3	6	11490	11495	0 %	50 %	0 %	50 %	121999263
33	NC_008790	TC	3	6	11645	11650	0 %	50 %	0 %	50 %	121999263
34	NC_008790	AT	4	8	12253	12260	50 %	50 %	0 %	0 %	121999263
35	NC_008790	AT	4	8	12690	12697	50 %	50 %	0 %	0 %	121999264
36	NC_008790	TA	3	6	13029	13034	50 %	50 %	0 %	0 %	121999264
37	NC_008790	TA	4	8	13390	13397	50 %	50 %	0 %	0 %	121999265
38	NC_008790	AT	3	6	13500	13505	50 %	50 %	0 %	0 %	121999265
39	NC_008790	AT	3	6	13775	13780	50 %	50 %	0 %	0 %	121999266
40	NC_008790	AT	3	6	13962	13967	50 %	50 %	0 %	0 %	121999266
41	NC_008790	GT	3	6	14312	14317	0 %	50 %	50 %	0 %	121999267
42	NC_008790	AC	3	6	14782	14787	50 %	0 %	0 %	50 %	121999267
43	NC_008790	TA	3	6	15831	15836	50 %	50 %	0 %	0 %	121999268
44	NC_008790	TA	3	6	16244	16249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008790	AT	3	6	16263	16268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008790	AT	3	6	16700	16705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008790	AT	3	6	16718	16723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008790	AT	3	6	17286	17291	50 %	50 %	0 %	0 %	121999271
49	NC_008790	TA	3	6	18999	19004	50 %	50 %	0 %	0 %	121999274
50	NC_008790	TC	3	6	19155	19160	0 %	50 %	0 %	50 %	121999274
51	NC_008790	AT	3	6	19321	19326	50 %	50 %	0 %	0 %	121999274
52	NC_008790	AT	3	6	19690	19695	50 %	50 %	0 %	0 %	121999274
53	NC_008790	TA	4	8	20998	21005	50 %	50 %	0 %	0 %	121999277
54	NC_008790	AT	3	6	23472	23477	50 %	50 %	0 %	0 %	121999279
55	NC_008790	CA	3	6	23529	23534	50 %	0 %	0 %	50 %	121999279
56	NC_008790	AC	3	6	25873	25878	50 %	0 %	0 %	50 %	121999282
57	NC_008790	AT	3	6	26884	26889	50 %	50 %	0 %	0 %	121999284
58	NC_008790	CA	3	6	27857	27862	50 %	0 %	0 %	50 %	121999285
59	NC_008790	GA	3	6	29477	29482	50 %	0 %	50 %	0 %	121999288
60	NC_008790	AG	3	6	30043	30048	50 %	0 %	50 %	0 %	121999288
61	NC_008790	GA	3	6	32230	32235	50 %	0 %	50 %	0 %	121999290
62	NC_008790	TA	3	6	33331	33336	50 %	50 %	0 %	0 %	121999291
63	NC_008790	AG	3	6	33661	33666	50 %	0 %	50 %	0 %	121999291
64	NC_008790	CA	3	6	34296	34301	50 %	0 %	0 %	50 %	121999292
65	NC_008790	GA	3	6	34471	34476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008790	TA	3	6	35859	35864	50 %	50 %	0 %	0 %	121999294
67	NC_008790	TA	3	6	36055	36060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008790	AT	4	8	36391	36398	50 %	50 %	0 %	0 %	121999295
69	NC_008790	TA	3	6	36918	36923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008790	AT	3	6	37082	37087	50 %	50 %	0 %	0 %	121999296
71	NC_008790	AG	3	6	38616	38621	50 %	0 %	50 %	0 %	121999296
72	NC_008790	TA	3	6	38622	38627	50 %	50 %	0 %	0 %	121999296
73	NC_008790	AT	3	6	39897	39902	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
74	NC_008790	AT	3	6	40107	40112	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
75	NC_008790	TA	3	6	40272	40277	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
76	NC_008790	AT	3	6	41838	41843	50 %	50 %	0 %	0 %	121999299
77	NC_008790	TA	4	8	42081	42088	50 %	50 %	0 %	0 %	121999299
78	NC_008790	TA	4	8	42528	42535	50 %	50 %	0 %	0 %	121999299
79	NC_008790	TC	3	6	42924	42929	0 %	50 %	0 %	50 %	121999299
80	NC_008790	GA	3	6	43977	43982	50 %	0 %	50 %	0 %	121999301
81	NC_008790	AG	3	6	44014	44019	50 %	0 %	50 %	0 %	121999301
82	NC_008790	AG	3	6	44162	44167	50 %	0 %	50 %	0 %	121999301

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.