MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 6351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008789	GCCC	2	8	72	79	0 %	0 %	25 %	75 %	121996811
2	NC_008789	GAAG	2	8	346	353	50 %	0 %	50 %	0 %	121996811
3	NC_008789	CGAT	2	8	389	396	25 %	25 %	25 %	25 %	121996811
4	NC_008789	CAGC	2	8	687	694	25 %	0 %	25 %	50 %	121996812
5	NC_008789	CCGA	2	8	1183	1190	25 %	0 %	25 %	50 %	121996812
6	NC_008789	TCAA	2	8	1315	1322	50 %	25 %	0 %	25 %	121996812
7	NC_008789	GCCA	2	8	1452	1459	25 %	0 %	25 %	50 %	121996812
8	NC_008789	TCGA	2	8	1717	1724	25 %	25 %	25 %	25 %	121996812
9	NC_008789	CAGG	2	8	1830	1837	25 %	0 %	50 %	25 %	121996812
10	NC_008789	GTAG	2	8	2247	2254	25 %	25 %	50 %	0 %	121996812
11	NC_008789	GCAC	2	8	2278	2285	25 %	0 %	25 %	50 %	121996812
12	NC_008789	TCCA	2	8	2970	2977	25 %	25 %	0 %	50 %	121996813
13	NC_008789	GTTG	2	8	4611	4618	0 %	50 %	50 %	0 %	121996814
14	NC_008789	GCGT	2	8	4951	4958	0 %	25 %	50 %	25 %	121996815
15	NC_008789	CGGG	2	8	4982	4989	0 %	0 %	75 %	25 %	121996815
16	NC_008789	CGAC	2	8	5182	5189	25 %	0 %	25 %	50 %	121996815
17	NC_008789	GAGC	2	8	5246	5253	25 %	0 %	50 %	25 %	121996815
18	NC_008789	CGGG	2	8	5528	5535	0 %	0 %	75 %	25 %	121996815
19	NC_008789	CGAG	2	8	5677	5684	25 %	0 %	50 %	25 %	121996816
20	NC_008789	GGTG	2	8	6301	6308	0 %	25 %	75 %	0 %	121996816
21	NC_008789	CGGG	2	8	6360	6367	0 %	0 %	75 %	25 %	121996817
22	NC_008789	GGCG	2	8	6486	6493	0 %	0 %	75 %	25 %	121996817
23	NC_008789	GCGT	2	8	6653	6660	0 %	25 %	50 %	25 %	121996817
24	NC_008789	TGGC	2	8	6901	6908	0 %	25 %	50 %	25 %	121996817
25	NC_008789	CTCC	2	8	7583	7590	0 %	25 %	0 %	75 %	121996818
26	NC_008789	GCCG	2	8	7725	7732	0 %	0 %	50 %	50 %	121996818
27	NC_008789	CCAG	2	8	7737	7744	25 %	0 %	25 %	50 %	121996818
28	NC_008789	GCGA	2	8	8128	8135	25 %	0 %	50 %	25 %	121996818
29	NC_008789	TGGG	2	8	8466	8473	0 %	25 %	75 %	0 %	121996818
30	NC_008789	GCCG	2	8	8550	8557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008789	GAAG	2	8	8629	8636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008789	GCCG	2	8	8637	8644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008789	ACCC	2	8	8688	8695	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_008789	GTTC	2	8	9464	9471	0 %	50 %	25 %	25 %	121996819
35	NC_008789	GCCA	2	8	10026	10033	25 %	0 %	25 %	50 %	121996820
36	NC_008789	GATC	2	8	10135	10142	25 %	25 %	25 %	25 %	121996820
37	NC_008789	CTGC	2	8	10724	10731	0 %	25 %	25 %	50 %	121996821
38	NC_008789	GGCG	2	8	11269	11276	0 %	0 %	75 %	25 %	121996821
39	NC_008789	GCGG	2	8	11326	11333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008789	AGGG	2	8	11422	11429	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008789	GATC	2	8	12586	12593	25 %	25 %	25 %	25 %	121996822
42	NC_008789	GCCC	2	8	13762	13769	0 %	0 %	25 %	75 %	121996823
43	NC_008789	GTGG	2	8	13835	13842	0 %	25 %	75 %	0 %	121996823
44	NC_008789	GACG	2	8	14453	14460	25 %	0 %	50 %	25 %	121996824
45	NC_008789	CTCG	2	8	15355	15362	0 %	25 %	25 %	50 %	121996824
46	NC_008789	CGGC	2	8	16169	16176	0 %	0 %	50 %	50 %	121996825
47	NC_008789	CCAG	2	8	16280	16287	25 %	0 %	25 %	50 %	121996825
48	NC_008789	CGAA	2	8	16302	16309	50 %	0 %	25 %	25 %	121996825
49	NC_008789	CATC	2	8	16614	16621	25 %	25 %	0 %	50 %	121996825
50	NC_008789	GACC	2	8	16861	16868	25 %	0 %	25 %	50 %	121996825
51	NC_008789	GAAT	2	8	17177	17184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008789	GCCT	2	8	18863	18870	0 %	25 %	25 %	50 %	121996828
53	NC_008789	GGAG	2	8	19288	19295	25 %	0 %	75 %	0 %	121996828
54	NC_008789	GCCG	2	8	19339	19346	0 %	0 %	50 %	50 %	121996828
55	NC_008789	CCCT	2	8	21289	21296	0 %	25 %	0 %	75 %	121996830
56	NC_008789	GAGG	2	8	22020	22027	25 %	0 %	75 %	0 %	121996830
57	NC_008789	CCGG	2	8	22167	22174	0 %	0 %	50 %	50 %	121996830
58	NC_008789	GCAC	2	8	22349	22356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008789	CCCG	2	8	22438	22445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_008789	CCTG	2	8	22595	22602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008789	CCCT	2	8	22645	22652	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_008789	GAGC	2	8	23320	23327	25 %	0 %	50 %	25 %	121996832
63	NC_008789	GATG	2	8	23332	23339	25 %	25 %	50 %	0 %	121996832
64	NC_008789	TCCC	2	8	23858	23865	0 %	25 %	0 %	75 %	121996832
65	NC_008789	CTCC	2	8	24282	24289	0 %	25 %	0 %	75 %	121996832
66	NC_008789	GCAG	2	8	24604	24611	25 %	0 %	50 %	25 %	121996832
67	NC_008789	GCTG	2	8	25161	25168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008789	ACCT	2	8	25993	26000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008789	ACTG	2	8	26059	26066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008789	GGCA	2	8	26635	26642	25 %	0 %	50 %	25 %	121996834
71	NC_008789	GCTC	2	8	27020	27027	0 %	25 %	25 %	50 %	121996835
72	NC_008789	GGCC	2	8	27314	27321	0 %	0 %	50 %	50 %	121996835
73	NC_008789	GGCC	2	8	27452	27459	0 %	0 %	50 %	50 %	121996835
74	NC_008789	GCCC	2	8	28891	28898	0 %	0 %	25 %	75 %	121996836
75	NC_008789	GGCC	2	8	29136	29143	0 %	0 %	50 %	50 %	121996836
76	NC_008789	CGAT	2	8	29370	29377	25 %	25 %	25 %	25 %	121996836
77	NC_008789	ACCT	2	8	29786	29793	25 %	25 %	0 %	50 %	121996836
78	NC_008789	GCCA	2	8	29981	29988	25 %	0 %	25 %	50 %	121996837
79	NC_008789	CTGG	2	8	30118	30125	0 %	25 %	50 %	25 %	121996837
80	NC_008789	CGAG	2	8	30253	30260	25 %	0 %	50 %	25 %	121996837
81	NC_008789	ATCG	2	8	30322	30329	25 %	25 %	25 %	25 %	121996837
82	NC_008789	GCTC	2	8	30883	30890	0 %	25 %	25 %	50 %	121996838
83	NC_008789	GCCA	2	8	31519	31526	25 %	0 %	25 %	50 %	121996838
84	NC_008789	CGGT	2	8	31943	31950	0 %	25 %	50 %	25 %	121996839
85	NC_008789	TCGG	2	8	32939	32946	0 %	25 %	50 %	25 %	121996840
86	NC_008789	GCCC	2	8	33449	33456	0 %	0 %	25 %	75 %	121996841
87	NC_008789	AGCG	2	8	33807	33814	25 %	0 %	50 %	25 %	121996842
88	NC_008789	CCCA	2	8	33842	33849	25 %	0 %	0 %	75 %	121996842
89	NC_008789	CCGC	2	8	33865	33872	0 %	0 %	25 %	75 %	121996842
90	NC_008789	TGCC	2	8	33982	33989	0 %	25 %	25 %	50 %	121996842
91	NC_008789	CCTG	2	8	34275	34282	0 %	25 %	25 %	50 %	121996842
92	NC_008789	TCGT	2	8	34535	34542	0 %	50 %	25 %	25 %	121996843
93	NC_008789	CAGC	2	8	34965	34972	25 %	0 %	25 %	50 %	121996843
94	NC_008789	CTTC	2	8	35085	35092	0 %	50 %	0 %	50 %	121996843
95	NC_008789	ATGC	2	8	35194	35201	25 %	25 %	25 %	25 %	121996843
96	NC_008789	CCGA	2	8	35347	35354	25 %	0 %	25 %	50 %	121996843
97	NC_008789	TTCA	2	8	35407	35414	25 %	50 %	0 %	25 %	121996843
98	NC_008789	GCCT	2	8	35487	35494	0 %	25 %	25 %	50 %	121996844
99	NC_008789	CGGC	2	8	35609	35616	0 %	0 %	50 %	50 %	121996844
100	NC_008789	GTCG	2	8	35934	35941	0 %	25 %	50 %	25 %	121996844
101	NC_008789	ACCG	2	8	36264	36271	25 %	0 %	25 %	50 %	121996845
102	NC_008789	GCCC	2	8	37159	37166	0 %	0 %	25 %	75 %	121996846
103	NC_008789	CGCT	2	8	38587	38594	0 %	25 %	25 %	50 %	121996846
104	NC_008789	GACG	2	8	38965	38972	25 %	0 %	50 %	25 %	121996847
105	NC_008789	AGCC	2	8	39389	39396	25 %	0 %	25 %	50 %	121996847
106	NC_008789	CGGC	2	8	40848	40855	0 %	0 %	50 %	50 %	121996848
107	NC_008789	GAGG	2	8	40931	40938	25 %	0 %	75 %	0 %	121996848
108	NC_008789	CACG	2	8	41280	41287	25 %	0 %	25 %	50 %	121996848
109	NC_008789	GATC	2	8	41366	41373	25 %	25 %	25 %	25 %	121996849
110	NC_008789	CGGA	2	8	41499	41506	25 %	0 %	50 %	25 %	121996849
111	NC_008789	GCGA	2	8	42064	42071	25 %	0 %	50 %	25 %	121996850
112	NC_008789	CCGT	2	8	42190	42197	0 %	25 %	25 %	50 %	121996850
113	NC_008789	GTGG	2	8	42682	42689	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008789	GGGC	2	8	43121	43128	0 %	0 %	75 %	25 %	121996851
115	NC_008789	AGCG	2	8	44429	44436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008789	CCGT	2	8	44856	44863	0 %	25 %	25 %	50 %	121996852
117	NC_008789	AGCA	2	8	45330	45337	50 %	0 %	25 %	25 %	121996853
118	NC_008789	TCCC	2	8	45610	45617	0 %	25 %	0 %	75 %	121996853
119	NC_008789	GGGA	2	8	45902	45909	25 %	0 %	75 %	0 %	121996854
120	NC_008789	CGGT	2	8	46161	46168	0 %	25 %	50 %	25 %	121996854
121	NC_008789	GTGG	2	8	47288	47295	0 %	25 %	75 %	0 %	121996854
122	NC_008789	GGCG	2	8	49292	49299	0 %	0 %	75 %	25 %	121996857
123	NC_008789	GGCC	2	8	49539	49546	0 %	0 %	50 %	50 %	121996857
124	NC_008789	CGAT	2	8	49763	49770	25 %	25 %	25 %	25 %	121996858
125	NC_008789	TCAG	2	8	50165	50172	25 %	25 %	25 %	25 %	121996858
126	NC_008789	GCTG	2	8	51192	51199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008789	GGCC	2	8	51215	51222	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
128	NC_008789	GATC	2	8	51602	51609	25 %	25 %	25 %	25 %	121996859
129	NC_008789	CAGC	2	8	51735	51742	25 %	0 %	25 %	50 %	121996859
130	NC_008789	GAGC	2	8	52684	52691	25 %	0 %	50 %	25 %	121996860
131	NC_008789	CAGC	2	8	53683	53690	25 %	0 %	25 %	50 %	121996860
132	NC_008789	CACC	2	8	54785	54792	25 %	0 %	0 %	75 %	121996862
133	NC_008789	GATA	2	8	55510	55517	50 %	25 %	25 %	0 %	121996862
134	NC_008789	GCCG	2	8	55544	55551	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
135	NC_008789	GCCG	2	8	55642	55649	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
136	NC_008789	GGCC	2	8	55966	55973	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
137	NC_008789	GGCG	2	8	56191	56198	0 %	0 %	75 %	25 %	121996862
138	NC_008789	TCGG	2	8	56619	56626	0 %	25 %	50 %	25 %	121996862
139	NC_008789	CAGG	2	8	56846	56853	25 %	0 %	50 %	25 %	121996862
140	NC_008789	CTCC	2	8	57078	57085	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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142	NC_008789	GAAG	2	8	58315	58322	50 %	0 %	50 %	0 %	121996863
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