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Tri-nucleotide Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 50750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008789	CGA	2	6	61	66	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996811
2	NC_008789	CGA	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996811
3	NC_008789	CTC	2	6	149	154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996811
4	NC_008789	CAG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996811
5	NC_008789	GAG	2	6	200	205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996811
6	NC_008789	GAC	2	6	482	487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996811
7	NC_008789	GCA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996811
8	NC_008789	CGG	2	6	697	702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
9	NC_008789	CAG	3	9	714	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996812
10	NC_008789	GCC	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
11	NC_008789	GGC	2	6	828	833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
12	NC_008789	TGG	2	6	874	879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996812
13	NC_008789	CGT	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996812
14	NC_008789	CCT	2	6	968	973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996812
15	NC_008789	GCA	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996812
16	NC_008789	CTG	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996812
17	NC_008789	GGC	3	9	1196	1204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
18	NC_008789	GTC	2	6	1233	1238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996812
19	NC_008789	CCT	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996812
20	NC_008789	TCC	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996812
21	NC_008789	GCG	2	6	1414	1419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
22	NC_008789	CCT	2	6	1421	1426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996812
23	NC_008789	GTG	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996812
24	NC_008789	TGG	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996812
25	NC_008789	GCC	2	6	1558	1563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
26	NC_008789	TGG	3	9	1678	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996812
27	NC_008789	GAC	2	6	1704	1709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996812
28	NC_008789	CGA	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996812
29	NC_008789	CGC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
30	NC_008789	GAT	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996812
31	NC_008789	CGT	2	6	1815	1820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996812
32	NC_008789	GCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
33	NC_008789	CGG	2	6	1860	1865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
34	NC_008789	GCT	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996812
35	NC_008789	GCG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
36	NC_008789	CCG	3	9	2018	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
37	NC_008789	CAC	3	9	2100	2108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996812
38	NC_008789	CGC	2	6	2129	2134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
39	NC_008789	CAG	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996812
40	NC_008789	CTC	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996812
41	NC_008789	GGC	2	6	2184	2189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
42	NC_008789	GCC	2	6	2342	2347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
43	NC_008789	GCC	2	6	2400	2405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
44	NC_008789	AGG	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996812
45	NC_008789	GCG	2	6	2482	2487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996812
46	NC_008789	CGC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996812
47	NC_008789	GCC	2	6	2569	2574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008789	GGC	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
49	NC_008789	CGG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
50	NC_008789	GCG	2	6	2732	2737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
51	NC_008789	CGG	2	6	2855	2860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
52	NC_008789	GCA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996813
53	NC_008789	GAT	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996813
54	NC_008789	CGC	2	6	3062	3067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996813
55	NC_008789	GGC	2	6	3128	3133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
56	NC_008789	TCC	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996813
57	NC_008789	GTG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996813
58	NC_008789	CGA	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996813
59	NC_008789	CGG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
60	NC_008789	GGC	2	6	3473	3478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
61	NC_008789	CCA	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996813
62	NC_008789	CTG	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996813
63	NC_008789	ATC	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996813
64	NC_008789	CCG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996813
65	NC_008789	AGC	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996813
66	NC_008789	CGG	2	6	3731	3736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996813
67	NC_008789	GCC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996814
68	NC_008789	GGT	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121996814
69	NC_008789	GCA	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996814
70	NC_008789	GCC	2	6	4077	4082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996814
71	NC_008789	CCG	2	6	4135	4140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996814
72	NC_008789	GCC	2	6	4264	4269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996814
73	NC_008789	GCG	2	6	4398	4403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996814
74	NC_008789	AGC	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996814
75	NC_008789	GCG	2	6	4634	4639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996814
76	NC_008789	CGA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008789	TGG	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008789	GTC	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008789	TGT	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121996815
80	NC_008789	GTC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996815
81	NC_008789	CGG	2	6	4724	4729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996815
82	NC_008789	GTC	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996815
83	NC_008789	GCT	2	6	4961	4966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996815
84	NC_008789	CGT	2	6	5009	5014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996815
85	NC_008789	GGA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996815
86	NC_008789	ACC	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996815
87	NC_008789	GCT	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996815
88	NC_008789	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121996815
89	NC_008789	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996815
90	NC_008789	ACG	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996815
91	NC_008789	GCC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996815
92	NC_008789	ACA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121996815
93	NC_008789	GCC	2	6	5504	5509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996815
94	NC_008789	CGT	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996815
95	NC_008789	GCC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996815
96	NC_008789	CCA	2	6	5606	5611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996815
97	NC_008789	GGA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996815
98	NC_008789	TCA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996816
99	NC_008789	ACC	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996816
100	NC_008789	TGC	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996816
101	NC_008789	CTG	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996816
102	NC_008789	CTT	2	6	6166	6171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996816
103	NC_008789	CGC	2	6	6202	6207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996816
104	NC_008789	GAC	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996816
105	NC_008789	GCC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
106	NC_008789	GCT	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996817
107	NC_008789	GCT	2	6	6507	6512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996817
108	NC_008789	CGG	2	6	6576	6581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996817
109	NC_008789	CGC	3	9	6744	6752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
110	NC_008789	GGA	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996817
111	NC_008789	GCC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
112	NC_008789	CGC	2	6	6872	6877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
113	NC_008789	GCG	2	6	6894	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996817
114	NC_008789	CGG	2	6	6960	6965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996817
115	NC_008789	TCC	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996817
116	NC_008789	GCT	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996817
117	NC_008789	CAG	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996817
118	NC_008789	GGA	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996817
119	NC_008789	AGG	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996817
120	NC_008789	ACT	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996817
121	NC_008789	CGC	2	6	7184	7189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
122	NC_008789	CAG	2	6	7195	7200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996817
123	NC_008789	CCA	2	6	7230	7235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121996817
124	NC_008789	AGC	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996817
125	NC_008789	GCC	2	6	7297	7302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
126	NC_008789	GCC	3	9	7324	7332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
127	NC_008789	CCG	2	6	7352	7357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996817
128	NC_008789	GCC	3	9	7373	7381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996818
129	NC_008789	TCC	2	6	7387	7392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996818
130	NC_008789	TGT	2	6	7406	7411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121996818
131	NC_008789	CGC	2	6	7436	7441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996818
132	NC_008789	GCC	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996818
133	NC_008789	CGC	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996818
134	NC_008789	TCG	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996818
135	NC_008789	CGA	2	6	7877	7882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996818
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138	NC_008789	TGA	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996818
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140	NC_008789	GCG	2	6	8269	8274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996818
141	NC_008789	GCC	2	6	8560	8565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008789	TAT	2	6	8599	8604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_008789	TGA	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996819
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177	NC_008789	ACC	2	6	10582	10587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_008789	AGG	2	6	10646	10651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_008789	TTC	3	9	15344	15352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996824
255	NC_008789	CAT	2	6	15397	15402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996824
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500	NC_008789	CGG	2	6	33326	33331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996841

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