MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 4263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008789	GC	4	8	246	253	0 %	0 %	50 %	50 %	121996811
2	NC_008789	GC	3	6	457	462	0 %	0 %	50 %	50 %	121996811
3	NC_008789	CG	3	6	551	556	0 %	0 %	50 %	50 %	121996811
4	NC_008789	CG	3	6	948	953	0 %	0 %	50 %	50 %	121996812
5	NC_008789	GC	3	6	1055	1060	0 %	0 %	50 %	50 %	121996812
6	NC_008789	AC	3	6	1376	1381	50 %	0 %	0 %	50 %	121996812
7	NC_008789	GC	3	6	2232	2237	0 %	0 %	50 %	50 %	121996812
8	NC_008789	GC	3	6	2426	2431	0 %	0 %	50 %	50 %	121996812
9	NC_008789	CG	3	6	3814	3819	0 %	0 %	50 %	50 %	121996814
10	NC_008789	GC	4	8	3941	3948	0 %	0 %	50 %	50 %	121996814
11	NC_008789	CA	3	6	4371	4376	50 %	0 %	0 %	50 %	121996814
12	NC_008789	CG	3	6	5030	5035	0 %	0 %	50 %	50 %	121996815
13	NC_008789	CG	4	8	6178	6185	0 %	0 %	50 %	50 %	121996816
14	NC_008789	TC	3	6	6333	6338	0 %	50 %	0 %	50 %	121996817
15	NC_008789	GC	3	6	6686	6691	0 %	0 %	50 %	50 %	121996817
16	NC_008789	GC	3	6	6912	6917	0 %	0 %	50 %	50 %	121996817
17	NC_008789	CG	3	6	9243	9248	0 %	0 %	50 %	50 %	121996819
18	NC_008789	GC	3	6	10600	10605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008789	GC	3	6	11005	11010	0 %	0 %	50 %	50 %	121996821
20	NC_008789	GC	3	6	11820	11825	0 %	0 %	50 %	50 %	121996822
21	NC_008789	TC	3	6	12496	12501	0 %	50 %	0 %	50 %	121996822
22	NC_008789	GC	3	6	14395	14400	0 %	0 %	50 %	50 %	121996824
23	NC_008789	CA	3	6	15768	15773	50 %	0 %	0 %	50 %	121996825
24	NC_008789	GT	3	6	17806	17811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008789	CT	3	6	17842	17847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008789	CG	3	6	18726	18731	0 %	0 %	50 %	50 %	121996828
27	NC_008789	TC	3	6	19019	19024	0 %	50 %	0 %	50 %	121996828
28	NC_008789	GC	3	6	19175	19180	0 %	0 %	50 %	50 %	121996828
29	NC_008789	CG	3	6	19563	19568	0 %	0 %	50 %	50 %	121996828
30	NC_008789	CG	4	8	20683	20690	0 %	0 %	50 %	50 %	121996829
31	NC_008789	TC	3	6	22101	22106	0 %	50 %	0 %	50 %	121996830
32	NC_008789	CG	3	6	22204	22209	0 %	0 %	50 %	50 %	121996830
33	NC_008789	CG	3	6	22691	22696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008789	GC	3	6	22697	22702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008789	GC	3	6	22926	22931	0 %	0 %	50 %	50 %	121996831
36	NC_008789	GC	3	6	24011	24016	0 %	0 %	50 %	50 %	121996832
37	NC_008789	AC	3	6	24309	24314	50 %	0 %	0 %	50 %	121996832
38	NC_008789	GC	3	6	24425	24430	0 %	0 %	50 %	50 %	121996832
39	NC_008789	GC	3	6	24998	25003	0 %	0 %	50 %	50 %	121996832
40	NC_008789	CG	3	6	25251	25256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008789	CG	3	6	25534	25539	0 %	0 %	50 %	50 %	121996833
42	NC_008789	CA	3	6	26708	26713	50 %	0 %	0 %	50 %	121996834
43	NC_008789	GC	3	6	26985	26990	0 %	0 %	50 %	50 %	121996835
44	NC_008789	GC	3	6	27169	27174	0 %	0 %	50 %	50 %	121996835
45	NC_008789	CG	3	6	28180	28185	0 %	0 %	50 %	50 %	121996835
46	NC_008789	CG	3	6	28263	28268	0 %	0 %	50 %	50 %	121996835
47	NC_008789	CT	3	6	28363	28368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008789	GC	3	6	29432	29437	0 %	0 %	50 %	50 %	121996836
49	NC_008789	CA	3	6	29513	29518	50 %	0 %	0 %	50 %	121996836
50	NC_008789	CG	3	6	29717	29722	0 %	0 %	50 %	50 %	121996836
51	NC_008789	CG	3	6	29858	29863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008789	GC	3	6	31021	31026	0 %	0 %	50 %	50 %	121996838
53	NC_008789	GC	3	6	32530	32535	0 %	0 %	50 %	50 %	121996839
54	NC_008789	TC	3	6	32648	32653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008789	CG	3	6	33102	33107	0 %	0 %	50 %	50 %	121996841
56	NC_008789	CG	3	6	33707	33712	0 %	0 %	50 %	50 %	121996841
57	NC_008789	CT	3	6	34083	34088	0 %	50 %	0 %	50 %	121996842
58	NC_008789	GC	3	6	34489	34494	0 %	0 %	50 %	50 %	121996842
59	NC_008789	CG	3	6	36192	36197	0 %	0 %	50 %	50 %	121996845
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62	NC_008789	CG	3	6	40288	40293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008789	GC	3	6	41524	41529	0 %	0 %	50 %	50 %	121996849
64	NC_008789	GC	3	6	41706	41711	0 %	0 %	50 %	50 %	121996849
65	NC_008789	GC	3	6	41721	41726	0 %	0 %	50 %	50 %	121996849
66	NC_008789	CG	3	6	41754	41759	0 %	0 %	50 %	50 %	121996849
67	NC_008789	CG	3	6	41897	41902	0 %	0 %	50 %	50 %	121996849
68	NC_008789	CT	3	6	42378	42383	0 %	50 %	0 %	50 %	121996850
69	NC_008789	TC	3	6	42863	42868	0 %	50 %	0 %	50 %	121996851
70	NC_008789	GC	3	6	43022	43027	0 %	0 %	50 %	50 %	121996851
71	NC_008789	CG	4	8	43601	43608	0 %	0 %	50 %	50 %	121996851
72	NC_008789	CG	3	6	43621	43626	0 %	0 %	50 %	50 %	121996851
73	NC_008789	GC	3	6	43962	43967	0 %	0 %	50 %	50 %	121996851
74	NC_008789	CG	3	6	44088	44093	0 %	0 %	50 %	50 %	121996851
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80	NC_008789	CG	3	6	49889	49894	0 %	0 %	50 %	50 %	121996858
81	NC_008789	CG	3	6	50130	50135	0 %	0 %	50 %	50 %	121996858
82	NC_008789	GC	3	6	51430	51435	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
83	NC_008789	CG	3	6	51833	51838	0 %	0 %	50 %	50 %	121996859
84	NC_008789	CG	3	6	52388	52393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008789	CA	3	6	52530	52535	50 %	0 %	0 %	50 %	121996860
86	NC_008789	CG	3	6	52852	52857	0 %	0 %	50 %	50 %	121996860
87	NC_008789	CA	3	6	52988	52993	50 %	0 %	0 %	50 %	121996860
88	NC_008789	TC	3	6	54240	54245	0 %	50 %	0 %	50 %	121996861
89	NC_008789	GC	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008789	GC	3	6	54493	54498	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
91	NC_008789	CG	3	6	54843	54848	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
92	NC_008789	GC	3	6	55913	55918	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
93	NC_008789	GC	3	6	56340	56345	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
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95	NC_008789	CG	3	6	56789	56794	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
96	NC_008789	CG	3	6	56943	56948	0 %	0 %	50 %	50 %	121996862
97	NC_008789	GA	3	6	57207	57212	50 %	0 %	50 %	0 %	121996863
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100	NC_008789	CG	4	8	57463	57470	0 %	0 %	50 %	50 %	121996863
101	NC_008789	GC	3	6	57505	57510	0 %	0 %	50 %	50 %	121996863
102	NC_008789	GC	3	6	57587	57592	0 %	0 %	50 %	50 %	121996863
103	NC_008789	CG	3	6	57630	57635	0 %	0 %	50 %	50 %	121996863
104	NC_008789	GC	3	6	59996	60001	0 %	0 %	50 %	50 %	121996863
105	NC_008789	GC	3	6	62508	62513	0 %	0 %	50 %	50 %	121996866
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107	NC_008789	GC	3	6	63378	63383	0 %	0 %	50 %	50 %	121996866
108	NC_008789	GC	3	6	64765	64770	0 %	0 %	50 %	50 %	121996867
109	NC_008789	GC	3	6	65093	65098	0 %	0 %	50 %	50 %	121996867
110	NC_008789	CG	3	6	66191	66196	0 %	0 %	50 %	50 %	121996867
111	NC_008789	GC	3	6	66230	66235	0 %	0 %	50 %	50 %	121996868
112	NC_008789	CG	3	6	66684	66689	0 %	0 %	50 %	50 %	121996868
113	NC_008789	GT	3	6	67378	67383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008789	GC	3	6	67561	67566	0 %	0 %	50 %	50 %	121996869
115	NC_008789	GC	3	6	67868	67873	0 %	0 %	50 %	50 %	121996869
116	NC_008789	GC	3	6	68488	68493	0 %	0 %	50 %	50 %	121996869
117	NC_008789	CT	3	6	69094	69099	0 %	50 %	0 %	50 %	121996869
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119	NC_008789	CG	3	6	69584	69589	0 %	0 %	50 %	50 %	121996869
120	NC_008789	TC	3	6	69748	69753	0 %	50 %	0 %	50 %	121996869
121	NC_008789	CA	3	6	70636	70641	50 %	0 %	0 %	50 %	121996870
122	NC_008789	CG	3	6	70665	70670	0 %	0 %	50 %	50 %	121996870
123	NC_008789	CG	3	6	71386	71391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008789	TC	3	6	71681	71686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008789	TC	3	6	71712	71717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008789	GC	3	6	71930	71935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008789	AG	3	6	71994	71999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008789	CA	3	6	74859	74864	50 %	0 %	0 %	50 %	121996874
129	NC_008789	TG	3	6	74925	74930	0 %	50 %	50 %	0 %	121996874
130	NC_008789	CG	3	6	75452	75457	0 %	0 %	50 %	50 %	121996875
131	NC_008789	GC	3	6	78319	78324	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
132	NC_008789	GC	3	6	78448	78453	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
133	NC_008789	GC	3	6	79076	79081	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
134	NC_008789	GC	3	6	79799	79804	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
135	NC_008789	GA	3	6	79947	79952	50 %	0 %	50 %	0 %	121996876
136	NC_008789	CG	3	6	80026	80031	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
137	NC_008789	CG	3	6	80305	80310	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
138	NC_008789	GC	3	6	80878	80883	0 %	0 %	50 %	50 %	121996876
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141	NC_008789	CT	3	6	82480	82485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008789	GC	4	8	83065	83072	0 %	0 %	50 %	50 %	121996878
143	NC_008789	CG	3	6	83131	83136	0 %	0 %	50 %	50 %	121996878
144	NC_008789	GC	3	6	84600	84605	0 %	0 %	50 %	50 %	121996879
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