MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008789	G	6	6	3779	3784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008789	C	8	8	13387	13394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_008789	C	8	8	17711	17718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_008789	C	6	6	17735	17740	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_008789	T	8	8	17757	17764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008789	C	7	7	22301	22307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_008789	C	6	6	22312	22317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_008789	A	8	8	38724	38731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008789	G	6	6	63625	63630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008789	C	6	6	71820	71825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_008789	C	6	6	71870	71875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_008789	T	6	6	82415	82420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008789	G	7	7	111800	111806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008789	T	7	7	121567	121573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008789	A	8	8	128942	128949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008789	G	10	10	152050	152059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008789	C	6	6	152714	152719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_008789	C	7	7	161979	161985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_008789	G	6	6	195947	195952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008789	C	6	6	204334	204339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_008789	A	6	6	213830	213835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008789	T	6	6	213862	213867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008789	C	6	6	224016	224021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_008789	G	6	6	228887	228892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008789	G	6	6	237745	237750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008789	G	6	6	251224	251229	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008789	C	6	6	262409	262414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_008789	G	6	6	267158	267163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008789	G	6	6	272159	272164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008789	C	7	7	272226	272232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_008789	C	7	7	274027	274033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_008789	C	6	6	299092	299097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_008789	C	7	7	301803	301809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_008789	C	6	6	307187	307192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_008789	C	6	6	311664	311669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_008789	A	6	6	312700	312705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008789	G	6	6	312827	312832	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008789	C	6	6	327179	327184	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_008789	T	7	7	334550	334556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008789	T	6	6	340264	340269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008789	C	6	6	352769	352774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_008789	C	6	6	359455	359460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_008789	C	7	7	359586	359592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_008789	T	6	6	359659	359664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008789	T	8	8	359846	359853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008789	C	6	6	359886	359891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_008789	T	7	7	360054	360060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008789	A	6	6	362383	362388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008789	T	6	6	365375	365380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008789	G	6	6	366313	366318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008789	A	6	6	366332	366337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008789	A	8	8	376688	376695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008789	C	6	6	378106	378111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_008789	C	6	6	378968	378973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_008789	C	6	6	379441	379446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_008789	C	7	7	390628	390634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_008789	G	6	6	398251	398256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008789	G	6	6	402890	402895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008789	G	7	7	404835	404841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008789	C	7	7	451235	451241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_008789	C	13	13	456246	456258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_008789	A	7	7	460321	460327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008789	G	7	7	462329	462335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008789	A	6	6	470734	470739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008789	G	6	6	472629	472634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008789	T	6	6	473970	473975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008789	A	6	6	474254	474259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008789	G	6	6	475295	475300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008789	C	7	7	477802	477808	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_008789	C	8	8	479925	479932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_008789	C	7	7	483080	483086	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_008789	G	6	6	483174	483179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008789	G	14	14	483742	483755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008789	C	7	7	483770	483776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_008789	G	9	9	486431	486439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008789	G	6	6	486710	486715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008789	G	6	6	486970	486975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008789	C	6	6	490215	490220	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_008789	C	8	8	493900	493907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_008789	C	8	8	493938	493945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_008789	C	6	6	493986	493991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_008789	G	6	6	513051	513056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008789	G	6	6	519320	519325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008789	C	6	6	522404	522409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_008789	C	6	6	545625	545630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_008789	G	7	7	557121	557127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_008789	A	7	7	578047	578053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008789	C	8	8	580462	580469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_008789	C	6	6	594561	594566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_008789	C	6	6	610363	610368	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_008789	C	8	8	612755	612762	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_008789	C	6	6	628394	628399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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99	NC_008789	G	6	6	650717	650722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008789	C	6	6	650910	650915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_008789	C	6	6	667269	667274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_008789	C	6	6	675827	675832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_008789	G	6	6	676020	676025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_008789	G	6	6	691486	691491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008789	C	6	6	699769	699774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_008789	G	6	6	714097	714102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008789	C	7	7	714271	714277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_008789	T	6	6	714652	714657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008789	T	8	8	714804	714811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008789	C	6	6	719348	719353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_008789	C	6	6	722002	722007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_008789	C	6	6	723134	723139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_008789	C	6	6	742353	742358	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_008789	T	7	7	742578	742584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008789	C	10	10	745375	745384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_008789	A	6	6	763963	763968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008789	G	6	6	774792	774797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008789	C	7	7	781654	781660	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_008789	C	6	6	782352	782357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_008789	C	6	6	791204	791209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_008789	G	6	6	795172	795177	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008789	G	6	6	795215	795220	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008789	C	6	6	795426	795431	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_008789	G	6	6	795462	795467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_008789	C	6	6	831988	831993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_008789	A	6	6	832203	832208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008789	C	6	6	834897	834902	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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138	NC_008789	C	6	6	837924	837929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_008789	G	7	7	838520	838526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008789	A	6	6	845433	845438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_008789	C	9	9	884781	884789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
152	NC_008789	C	6	6	888143	888148	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_008789	C	6	6	906645	906650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.