MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	AAACGA	2	12	42	53	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121612751
2	NC_008787	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008787	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	121612492
4	NC_008787	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121612492
5	NC_008787	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	121612557
6	NC_008787	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121612557
7	NC_008787	ATGCTA	2	12	9430	9441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121613706
8	NC_008787	AGATTT	2	12	10232	10243	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121613706
9	NC_008787	TTCAAG	2	12	12974	12985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121612537
10	NC_008787	TTTTCA	2	12	17130	17141	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121612692
11	NC_008787	ATGGGT	2	12	18908	18919	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	121613697
12	NC_008787	TTCATT	2	12	19932	19943	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121613008
13	NC_008787	AATTTA	2	12	20966	20977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008787	AAGAAA	2	12	21146	21157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121612477
15	NC_008787	AAGATA	2	12	22065	22076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121613521
16	NC_008787	AGCAAA	2	12	22848	22859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121613521
17	NC_008787	TTTTCT	2	12	23355	23366	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	121613284
18	NC_008787	TATAAG	2	12	27786	27797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121613293
19	NC_008787	TTTTAT	2	12	28149	28160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	121613293
20	NC_008787	TTATGC	2	12	29211	29222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121612216
21	NC_008787	GAACTT	2	12	29696	29707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121613048
22	NC_008787	CTTTAA	2	12	31458	31469	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	121613048
23	NC_008787	CTATTT	2	12	31578	31589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121613048
24	NC_008787	ATGTGT	2	12	32272	32283	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	121612756
25	NC_008787	ATGGAT	2	12	36139	36150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121612339
26	NC_008787	GAAATT	2	12	36348	36359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121612339
27	NC_008787	TATTTA	2	12	41081	41092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008787	TTTATT	2	12	44883	44894	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008787	GCTTTA	2	12	51897	51908	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121612515
30	NC_008787	CCTGTG	2	12	52572	52583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121612515
31	NC_008787	ATTTTA	2	12	52620	52631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612515
32	NC_008787	TTATAG	2	12	59274	59285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008787	AGAAAA	2	12	60756	60767	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121612434
34	NC_008787	TACACT	2	12	63173	63184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612271
35	NC_008787	GCAAAA	2	12	64871	64882	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121612999
36	NC_008787	ATGAAA	2	12	64921	64932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121612999
37	NC_008787	TAAGCT	2	12	65453	65464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121612999
38	NC_008787	AGTTTT	2	12	67635	67646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121613635
39	NC_008787	TTCTTT	2	12	67851	67862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	121612682
40	NC_008787	CGCCTT	2	12	68256	68267	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	121612682
41	NC_008787	CAAAAT	2	12	71833	71844	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	121612481
42	NC_008787	TTCATC	2	12	72767	72778	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	121613172
43	NC_008787	TAATTT	2	12	74561	74572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612936
44	NC_008787	ATTTTA	2	12	74813	74824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612936
45	NC_008787	AAATAT	2	12	75170	75181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612936
46	NC_008787	GTTGGA	2	12	76110	76121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	121612936
47	NC_008787	TACAGC	2	12	78282	78293	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	121613331
48	NC_008787	CTTTTA	2	12	78551	78562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121613497
49	NC_008787	TAGCTT	2	12	85016	85027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121613064
50	NC_008787	TTCATT	2	12	87375	87386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121613262
51	NC_008787	CATCTT	2	12	89121	89132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	121613495
52	NC_008787	TTTAAA	2	12	91541	91552	50 %	50 %	0 %	0 %	121612374
53	NC_008787	CTAGCT	2	12	91973	91984	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121613641
54	NC_008787	GAATGA	2	12	92227	92238	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121613641
55	NC_008787	GATGCT	2	12	93389	93400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121612896
56	NC_008787	TAAATT	2	12	95103	95114	50 %	50 %	0 %	0 %	121613178
57	NC_008787	TTTTTG	2	12	101965	101976	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	121613710
58	NC_008787	GAATTT	2	12	102285	102296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121612182
59	NC_008787	AACTCA	2	12	102800	102811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	121612182
60	NC_008787	ATTTAT	2	12	104361	104372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121613219
61	NC_008787	CTTTAA	2	12	104580	104591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	121613219
62	NC_008787	ATATTT	2	12	105340	105351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612261
63	NC_008787	TGTAAC	2	12	107752	107763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121613732
64	NC_008787	CAGGAA	2	12	108460	108471	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121612684
65	NC_008787	ATAAAA	2	12	110871	110882	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121613226
66	NC_008787	TTAATG	2	12	113087	113098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121613576
67	NC_008787	GCAAGC	2	12	113167	113178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121613576
68	NC_008787	AACTTA	2	12	115904	115915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	121613578
69	NC_008787	GAACTT	2	12	118151	118162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121612514
70	NC_008787	TTAGAA	2	12	118202	118213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121612514
71	NC_008787	AAAAAT	2	12	120505	120516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121612620
72	NC_008787	GGTTTG	2	12	126210	126221	0 %	50 %	50 %	0 %	121613437
73	NC_008787	AAAATA	2	12	128021	128032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121612657
74	NC_008787	AATAGT	2	12	128974	128985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121613592
75	NC_008787	ATTTTG	2	12	129558	129569	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121612869
76	NC_008787	GAAAAA	2	12	130465	130476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121613259
77	NC_008787	GTTGTG	2	12	131312	131323	0 %	50 %	50 %	0 %	121613510
78	NC_008787	ACGGAC	3	18	131351	131368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121613510
79	NC_008787	CGGTTG	2	12	131397	131408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121613510
80	NC_008787	TTTGAT	2	12	132944	132955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121613059
81	NC_008787	TTATGG	2	12	135746	135757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	121612405
82	NC_008787	TTCTTT	2	12	142578	142589	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	121612878
83	NC_008787	GGGCTT	2	12	143257	143268	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121613622
84	NC_008787	AAAGAT	2	12	146329	146340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121612939
85	NC_008787	TTGTTA	2	12	148417	148428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121613218
86	NC_008787	AAAGAA	2	12	148556	148567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121613218
87	NC_008787	GAAAAA	2	12	151251	151262	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121613126
88	NC_008787	TTAATT	2	12	151612	151623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121612502
89	NC_008787	AAAATA	2	12	152050	152061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121612502
90	NC_008787	AATTTA	2	12	152562	152573	50 %	50 %	0 %	0 %	121612502
91	NC_008787	TAAAAA	2	12	153544	153555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121613733
92	NC_008787	ACCTTT	2	12	154722	154733	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	121613370
93	NC_008787	CTATAC	2	12	155370	155381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121612280
94	NC_008787	TAAGGA	2	12	159678	159689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121612931
95	NC_008787	TTTTAC	2	12	161693	161704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121613636
96	NC_008787	ATTTTC	2	12	164491	164502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121613169
97	NC_008787	AAAACT	2	12	167530	167541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	121613667
98	NC_008787	ATAAAA	2	12	167598	167609	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121613667
99	NC_008787	TTTTGC	2	12	168154	168165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	121612798
100	NC_008787	AGCTAT	2	12	169209	169220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121613031
101	NC_008787	GGCTAA	2	12	169608	169619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121613031
102	NC_008787	ATTTTT	2	12	170335	170346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	121612824
103	NC_008787	TCAAAT	2	12	171234	171245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	121612162
104	NC_008787	AAATAA	2	12	174003	174014	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121612687
105	NC_008787	TTATCT	2	12	174632	174643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121612687
106	NC_008787	ATTTTC	2	12	176075	176086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	121612473
107	NC_008787	ATTTTT	2	12	176475	176486	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008787	AGCTTT	2	12	176771	176782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121612377
109	NC_008787	GGCTGT	2	12	177413	177424	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121612707
110	NC_008787	TATAAA	2	12	178822	178833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121612631
111	NC_008787	AAAAGC	2	12	180326	180337	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121613129
112	NC_008787	AACAAG	2	12	181118	181129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121612175
113	NC_008787	ATATTA	2	12	183511	183522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008787	ATTCTA	2	12	183840	183851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	121613512
115	NC_008787	GCTATT	2	12	184067	184078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121613512
116	NC_008787	TTGCAG	2	12	185414	185425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121612599
117	NC_008787	AACATA	2	12	185762	185773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	121612599
118	NC_008787	GCTAAA	2	12	187884	187895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	121613682
119	NC_008787	TGACTT	2	12	188103	188114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121613682
120	NC_008787	AAAACC	2	12	189207	189218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121612474
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232	NC_008787	ATGATA	2	12	359701	359712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121612269
233	NC_008787	ATTGAT	2	12	360225	360236	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121612269
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235	NC_008787	CATTGA	2	12	365275	365286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121612678
236	NC_008787	CAAATT	2	12	365863	365874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	121612489
237	NC_008787	TATTTT	2	12	366978	366989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	121613251
238	NC_008787	TATTTT	2	12	367267	367278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_008787	ATTTAA	2	12	371089	371100	50 %	50 %	0 %	0 %	121613405
240	NC_008787	TTTAAA	2	12	371661	371672	50 %	50 %	0 %	0 %	121612581
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332	NC_008787	TTTTAA	2	12	519974	519985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_008787	TTTAGG	2	12	520239	520250	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	121612390
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343	NC_008787	TTTATA	2	12	544456	544467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121613689
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350	NC_008787	TAAATG	2	12	550169	550180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121612905
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352	NC_008787	AGGCAA	2	12	554131	554142	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121613602
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458	NC_008787	TATTTA	2	12	694839	694850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_008787	TTTATT	2	12	698643	698654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_008787	CAAAGA	2	12	705126	705137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121612129
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