MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 1612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	121612751
2	NC_008787	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	121612751
3	NC_008787	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	121612751
4	NC_008787	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	121612492
5	NC_008787	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	121612557
6	NC_008787	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	121612266
7	NC_008787	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008787	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008787	GTTTT	2	10	7485	7494	0 %	80 %	20 %	0 %	121612732
10	NC_008787	ATTTT	2	10	8702	8711	20 %	80 %	0 %	0 %	121613706
11	NC_008787	AAGAG	2	10	9734	9743	60 %	0 %	40 %	0 %	121613706
12	NC_008787	ACTTC	2	10	10396	10405	20 %	40 %	0 %	40 %	121613706
13	NC_008787	TCAAA	2	10	10958	10967	60 %	20 %	0 %	20 %	121613706
14	NC_008787	TGTGG	2	10	14525	14534	0 %	40 %	60 %	0 %	121613542
15	NC_008787	GACAA	2	10	15304	15313	60 %	0 %	20 %	20 %	121613542
16	NC_008787	AAGGC	2	10	15546	15555	40 %	0 %	40 %	20 %	121613542
17	NC_008787	CTTAA	2	10	16733	16742	40 %	40 %	0 %	20 %	121612692
18	NC_008787	CATTT	2	10	17283	17292	20 %	60 %	0 %	20 %	121612692
19	NC_008787	GCGAT	2	10	17553	17562	20 %	20 %	40 %	20 %	121613697
20	NC_008787	AAAAT	2	10	19654	19663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008787	TTTCA	2	10	20121	20130	20 %	60 %	0 %	20 %	121613008
22	NC_008787	AAGAT	2	10	21674	21683	60 %	20 %	20 %	0 %	121612477
23	NC_008787	ACCAA	2	10	23337	23346	60 %	0 %	0 %	40 %	121613284
24	NC_008787	AAAAT	2	10	23478	23487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008787	GTTAA	2	10	23505	23514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008787	TTTAT	2	10	27266	27275	20 %	80 %	0 %	0 %	121613293
27	NC_008787	TTCTT	2	10	28021	28030	0 %	80 %	0 %	20 %	121613293
28	NC_008787	TTTGG	2	10	28694	28703	0 %	60 %	40 %	0 %	121612216
29	NC_008787	AGATA	2	10	29779	29788	60 %	20 %	20 %	0 %	121613048
30	NC_008787	GCTTT	2	10	30293	30302	0 %	60 %	20 %	20 %	121613048
31	NC_008787	ATACT	2	10	31702	31711	40 %	40 %	0 %	20 %	121613048
32	NC_008787	AATCC	2	10	32153	32162	40 %	20 %	0 %	40 %	121612756
33	NC_008787	TGTTT	2	10	33140	33149	0 %	80 %	20 %	0 %	121612756
34	NC_008787	GCAAA	2	10	33207	33216	60 %	0 %	20 %	20 %	121612756
35	NC_008787	GAAAT	2	10	33625	33634	60 %	20 %	20 %	0 %	121613393
36	NC_008787	AAAGT	2	10	34109	34118	60 %	20 %	20 %	0 %	121613393
37	NC_008787	AAAAT	2	10	35361	35370	80 %	20 %	0 %	0 %	121612860
38	NC_008787	ATTAT	2	10	36106	36115	40 %	60 %	0 %	0 %	121612339
39	NC_008787	AAATC	2	10	36776	36785	60 %	20 %	0 %	20 %	121612339
40	NC_008787	TATAT	2	10	38638	38647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008787	TTTTA	2	10	38872	38881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008787	CTTTT	2	10	38926	38935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008787	CTTTT	2	10	39097	39106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008787	GGTAA	2	10	39408	39417	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008787	TCGTG	2	10	40204	40213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008787	TCTTT	2	10	41228	41237	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008787	AGAAA	2	10	41602	41611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008787	CCGTA	2	10	43163	43172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008787	ATTAT	2	10	45224	45233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008787	GGAAT	2	10	45606	45615	40 %	20 %	40 %	0 %	121612652
51	NC_008787	TAAAA	2	10	47227	47236	80 %	20 %	0 %	0 %	121612652
52	NC_008787	TATGT	2	10	47632	47641	20 %	60 %	20 %	0 %	121612148
53	NC_008787	TACTT	2	10	48387	48396	20 %	60 %	0 %	20 %	121612148
54	NC_008787	AAGGT	2	10	50347	50356	40 %	20 %	40 %	0 %	121612515
55	NC_008787	TTCTT	2	10	52711	52720	0 %	80 %	0 %	20 %	121613257
56	NC_008787	AAGAA	2	10	56110	56119	80 %	0 %	20 %	0 %	121612693
57	NC_008787	ATGTT	2	10	56208	56217	20 %	60 %	20 %	0 %	121612693
58	NC_008787	AGGGG	2	10	57167	57176	20 %	0 %	80 %	0 %	121612693
59	NC_008787	GAAAT	2	10	57615	57624	60 %	20 %	20 %	0 %	121612693
60	NC_008787	AAAAG	2	10	57919	57928	80 %	0 %	20 %	0 %	121612693
61	NC_008787	TAATA	2	10	58006	58015	60 %	40 %	0 %	0 %	121612693
62	NC_008787	ATTAT	2	10	58764	58773	40 %	60 %	0 %	0 %	121613607
63	NC_008787	TATAT	2	10	59767	59776	40 %	60 %	0 %	0 %	121612434
64	NC_008787	AAATT	2	10	61522	61531	60 %	40 %	0 %	0 %	121613387
65	NC_008787	GAAAA	2	10	62095	62104	80 %	0 %	20 %	0 %	121613387
66	NC_008787	GTTTA	2	10	62306	62315	20 %	60 %	20 %	0 %	121613387
67	NC_008787	AGCTT	2	10	62567	62576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008787	AGCAA	2	10	63715	63724	60 %	0 %	20 %	20 %	121613225
69	NC_008787	CAAAT	2	10	64614	64623	60 %	20 %	0 %	20 %	121612999
70	NC_008787	TACTC	2	10	66894	66903	20 %	40 %	0 %	40 %	121612292
71	NC_008787	ACCGC	2	10	68210	68219	20 %	0 %	20 %	60 %	121612682
72	NC_008787	CTTTT	2	10	68376	68385	0 %	80 %	0 %	20 %	121612682
73	NC_008787	ACCGC	2	10	68402	68411	20 %	0 %	20 %	60 %	121612682
74	NC_008787	TTTCA	2	10	68623	68632	20 %	60 %	0 %	20 %	121612682
75	NC_008787	AAGAT	2	10	70015	70024	60 %	20 %	20 %	0 %	121612574
76	NC_008787	TAATG	2	10	70067	70076	40 %	40 %	20 %	0 %	121612574
77	NC_008787	GATAA	2	10	70393	70402	60 %	20 %	20 %	0 %	121612481
78	NC_008787	AAATT	2	10	71341	71350	60 %	40 %	0 %	0 %	121612481
79	NC_008787	CAATG	2	10	71724	71733	40 %	20 %	20 %	20 %	121612481
80	NC_008787	TACTA	2	10	73197	73206	40 %	40 %	0 %	20 %	121612241
81	NC_008787	TGCTT	2	10	73991	74000	0 %	60 %	20 %	20 %	121612241
82	NC_008787	AATAT	2	10	74176	74185	60 %	40 %	0 %	0 %	121612241
83	NC_008787	CATTT	2	10	74775	74784	20 %	60 %	0 %	20 %	121612936
84	NC_008787	AATTT	2	10	74789	74798	40 %	60 %	0 %	0 %	121612936
85	NC_008787	ATTTC	2	10	74891	74900	20 %	60 %	0 %	20 %	121612936
86	NC_008787	TGATT	2	10	74942	74951	20 %	60 %	20 %	0 %	121612936
87	NC_008787	TTTTA	2	10	75009	75018	20 %	80 %	0 %	0 %	121612936
88	NC_008787	GATAA	2	10	75943	75952	60 %	20 %	20 %	0 %	121612936
89	NC_008787	TCTTT	2	10	76237	76246	0 %	80 %	0 %	20 %	121612936
90	NC_008787	TCAAA	2	10	76490	76499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008787	TGTGT	2	10	76984	76993	0 %	60 %	40 %	0 %	121613643
92	NC_008787	AAAAT	2	10	77164	77173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008787	ATTAC	2	10	77521	77530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008787	AAAAT	2	10	78210	78219	80 %	20 %	0 %	0 %	121613331
95	NC_008787	ATATT	2	10	80493	80502	40 %	60 %	0 %	0 %	121612195
96	NC_008787	TTTAT	2	10	80880	80889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008787	CAAGA	2	10	82936	82945	60 %	0 %	20 %	20 %	121613168
98	NC_008787	GAGCA	2	10	83308	83317	40 %	0 %	40 %	20 %	121613168
99	NC_008787	ATCAA	2	10	83786	83795	60 %	20 %	0 %	20 %	121613047
100	NC_008787	CTCTT	2	10	86781	86790	0 %	60 %	0 %	40 %	121613389
101	NC_008787	TTTTC	2	10	86822	86831	0 %	80 %	0 %	20 %	121613389
102	NC_008787	TCTCT	2	10	87086	87095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008787	ATCTC	2	10	87637	87646	20 %	40 %	0 %	40 %	121613262
104	NC_008787	GCCAA	2	10	87775	87784	40 %	0 %	20 %	40 %	121613262
105	NC_008787	TTTTG	2	10	89019	89028	0 %	80 %	20 %	0 %	121613495
106	NC_008787	AGTAA	2	10	89592	89601	60 %	20 %	20 %	0 %	121612539
107	NC_008787	TAAGG	2	10	93493	93502	40 %	20 %	40 %	0 %	121612896
108	NC_008787	ATTTT	2	10	93546	93555	20 %	80 %	0 %	0 %	121612896
109	NC_008787	TAGGA	2	10	93822	93831	40 %	20 %	40 %	0 %	121612413
110	NC_008787	AAAAT	2	10	93848	93857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008787	ATTTT	2	10	93858	93867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008787	TAAGA	2	10	94274	94283	60 %	20 %	20 %	0 %	121612681
113	NC_008787	TTAAT	2	10	94583	94592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008787	TATTT	2	10	94651	94660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008787	TATAA	2	10	94668	94677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008787	TTTGC	2	10	95347	95356	0 %	60 %	20 %	20 %	121613178
117	NC_008787	TGGAC	2	10	95696	95705	20 %	20 %	40 %	20 %	121612415
118	NC_008787	TAAAA	2	10	98444	98453	80 %	20 %	0 %	0 %	121612542
119	NC_008787	CAAAA	2	10	98977	98986	80 %	0 %	0 %	20 %	121612542
120	NC_008787	TAAAA	2	10	99416	99425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008787	TAAAA	2	10	101687	101696	80 %	20 %	0 %	0 %	121613564
122	NC_008787	GAAAT	2	10	102559	102568	60 %	20 %	20 %	0 %	121612182
123	NC_008787	TGGTT	2	10	102743	102752	0 %	60 %	40 %	0 %	121612182
124	NC_008787	TCCAT	2	10	103356	103365	20 %	40 %	0 %	40 %	121612182
125	NC_008787	TATTT	2	10	103903	103912	20 %	80 %	0 %	0 %	121613219
126	NC_008787	TTTTA	2	10	103915	103924	20 %	80 %	0 %	0 %	121613219
127	NC_008787	TATTT	2	10	104263	104272	20 %	80 %	0 %	0 %	121613219
128	NC_008787	TTGGC	2	10	104777	104786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008787	AAGAT	2	10	104864	104873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008787	GTAAA	2	10	105513	105522	60 %	20 %	20 %	0 %	121612261
131	NC_008787	TTATT	2	10	105663	105672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008787	AGAAT	2	10	106047	106056	60 %	20 %	20 %	0 %	121612589
133	NC_008787	TTAAA	2	10	106689	106698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008787	AAGAA	2	10	106729	106738	80 %	0 %	20 %	0 %	121613732
135	NC_008787	CCTTG	2	10	107170	107179	0 %	40 %	20 %	40 %	121613732
136	NC_008787	AGGTA	2	10	107686	107695	40 %	20 %	40 %	0 %	121613732
137	NC_008787	ACCTT	2	10	110456	110465	20 %	40 %	0 %	40 %	121613226
138	NC_008787	TTATT	2	10	110970	110979	20 %	80 %	0 %	0 %	121613232
139	NC_008787	TCAAA	2	10	111029	111038	60 %	20 %	0 %	20 %	121613232
140	NC_008787	TTAGA	2	10	111300	111309	40 %	40 %	20 %	0 %	121613232
141	NC_008787	GCTTT	2	10	111391	111400	0 %	60 %	20 %	20 %	121613530
142	NC_008787	GTTTA	2	10	111908	111917	20 %	60 %	20 %	0 %	121613530
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268	NC_008787	TGCTT	2	10	248830	248839	0 %	60 %	20 %	20 %	121613119
269	NC_008787	AATTT	2	10	250426	250435	40 %	60 %	0 %	0 %	121612740
270	NC_008787	ATATT	2	10	251071	251080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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