MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008787	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008787	AAAAT	2	10	19654	19663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008787	AAAAT	2	10	23478	23487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008787	GTTAA	2	10	23505	23514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008787	TATAT	2	10	38638	38647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008787	TTTTA	2	10	38872	38881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008787	CTTTT	2	10	38926	38935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008787	CTTTT	2	10	39097	39106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008787	GGTAA	2	10	39408	39417	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008787	TCGTG	2	10	40204	40213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008787	TCTTT	2	10	41228	41237	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008787	AGAAA	2	10	41602	41611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008787	CCGTA	2	10	43163	43172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008787	ATTAT	2	10	45224	45233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008787	AGCTT	2	10	62567	62576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008787	TCAAA	2	10	76490	76499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008787	AAAAT	2	10	77164	77173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008787	ATTAC	2	10	77521	77530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008787	TTTAT	2	10	80880	80889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008787	TCTCT	2	10	87086	87095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008787	AAAAT	2	10	93848	93857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008787	ATTTT	2	10	93858	93867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008787	TTAAT	2	10	94583	94592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008787	TATTT	2	10	94651	94660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008787	TATAA	2	10	94668	94677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008787	TAAAA	2	10	99416	99425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008787	TTGGC	2	10	104777	104786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008787	AAGAT	2	10	104864	104873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008787	TTATT	2	10	105663	105672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008787	TTAAA	2	10	106689	106698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008787	ATTGT	2	10	151509	151518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008787	TATTT	2	10	162830	162839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008787	TTATT	2	10	177041	177050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008787	TATTT	2	10	184948	184957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008787	TAAAA	2	10	195139	195148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008787	AAAAT	2	10	199307	199316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008787	AAGTG	2	10	202193	202202	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008787	AGGAT	2	10	203378	203387	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008787	TAAAA	2	10	204736	204745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008787	TAGAT	2	10	214406	214415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008787	AAAAT	2	10	229856	229865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008787	GATTT	2	10	233345	233354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008787	CATAA	2	10	240203	240212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008787	ATATT	2	10	251071	251080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008787	ATTAA	2	10	254349	254358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008787	TTAAT	2	10	256265	256274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008787	ATAAA	2	10	274351	274360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008787	AAATT	2	10	278174	278183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008787	TTAAA	2	10	305863	305872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008787	GAGTA	2	10	312509	312518	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008787	TTTTA	2	10	324783	324792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008787	ATTAA	2	10	340850	340859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008787	TTTTA	2	10	395482	395491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008787	CTTTT	2	10	395536	395545	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008787	CTTTT	2	10	395707	395716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008787	GGTAA	2	10	396018	396027	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008787	TCGTG	2	10	396814	396823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008787	TCTTT	2	10	397836	397845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008787	CCGTA	2	10	399773	399782	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008787	CTTAT	2	10	406872	406881	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008787	TAAAT	2	10	432680	432689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008787	TTGCT	2	10	436042	436051	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008787	GATTT	2	10	449878	449887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008787	ATATT	2	10	457604	457613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008787	AATAA	2	10	457622	457631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008787	TAATT	2	10	457639	457648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008787	AAAAT	2	10	507446	507455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008787	GTTTT	2	10	510539	510548	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008787	AAATA	2	10	510848	510857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008787	CATTC	2	10	511564	511573	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_008787	TTTTA	2	10	519844	519853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008787	AAAAT	2	10	519878	519887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008787	AATTA	2	10	522338	522347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008787	TTTGA	2	10	537045	537054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008787	ATTTG	2	10	538206	538215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008787	TAAAA	2	10	552068	552077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008787	GATAA	2	10	575219	575228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008787	GAAAA	2	10	592670	592679	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008787	TTTGC	2	10	596191	596200	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008787	AATTA	2	10	612233	612242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008787	TTTAA	2	10	621217	621226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008787	ATTTA	2	10	635606	635615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008787	TAAAA	3	15	651751	651765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008787	ATAAA	2	10	652574	652583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008787	ATTTA	2	10	654160	654169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008787	TTTAA	2	10	661489	661498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008787	TAAAA	2	10	684564	684573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008787	AAAAT	2	10	684634	684643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008787	ATTTT	2	10	684655	684664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008787	ATTTT	2	10	684727	684736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008787	TTGTA	2	10	690651	690660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008787	TTTTA	2	10	692630	692639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008787	CTTTT	2	10	692684	692693	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008787	CTTTT	2	10	692855	692864	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008787	GGTAA	2	10	693166	693175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008787	TCGTG	2	10	693962	693971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008787	TCTTT	2	10	694986	694995	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008787	CCGTA	2	10	696923	696932	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008787	ATTTA	2	10	714149	714158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008787	ATTTT	2	10	738582	738591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008787	TTTTC	2	10	744507	744516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008787	TTTTA	2	10	810561	810570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008787	TTGCC	2	10	815206	815215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008787	AGGTT	2	10	816008	816017	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008787	AAAAT	2	10	824074	824083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008787	AAAAT	2	10	854961	854970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008787	ATTTT	2	10	860625	860634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008787	CTTAA	2	10	872772	872781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008787	TAAAT	2	10	873541	873550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008787	GGAAA	2	10	873790	873799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008787	AAAGC	2	10	877181	877190	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008787	AAAAT	2	10	898850	898859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008787	TTAAT	2	10	910828	910837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008787	AATTA	2	10	935628	935637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008787	TAAAA	2	10	935670	935679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008787	TTTAT	2	10	970089	970098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008787	TTAAT	2	10	975187	975196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008787	TATAT	2	10	1048201	1048210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008787	TTTTA	2	10	1053635	1053644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008787	ATAAA	2	10	1073511	1073520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008787	TTATT	2	10	1075391	1075400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008787	TAATT	2	10	1075402	1075411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008787	AATAT	2	10	1080149	1080158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008787	AAATT	2	10	1093457	1093466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008787	AGTTT	2	10	1111348	1111357	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008787	ATTTT	2	10	1115541	1115550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008787	TATCA	2	10	1121521	1121530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008787	TAAAA	2	10	1123928	1123937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008787	TTTTA	2	10	1129007	1129016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008787	TTTAT	2	10	1150706	1150715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008787	AAACT	2	10	1150735	1150744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008787	TTTAA	2	10	1150756	1150765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008787	ATTTA	2	10	1154751	1154760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008787	AATAA	2	10	1170693	1170702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008787	TATTT	2	10	1170731	1170740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008787	TTTAT	2	10	1170779	1170788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008787	AATTT	2	10	1172527	1172536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008787	TATTC	2	10	1194127	1194136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008787	TTTAA	2	10	1217018	1217027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008787	AAAAT	2	10	1217039	1217048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008787	GGTTT	2	10	1237321	1237330	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008787	ATATT	2	10	1237366	1237375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008787	TAATC	2	10	1238959	1238968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008787	TAAAA	2	10	1241801	1241810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008787	ATTTT	2	10	1246304	1246313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008787	TATAT	2	10	1246329	1246338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008787	TATTT	2	10	1272496	1272505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008787	TAAAG	2	10	1272789	1272798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008787	ACAAA	2	10	1273444	1273453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008787	AAAGA	2	10	1273501	1273510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008787	TAATA	2	10	1312801	1312810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008787	TAAAT	2	10	1327380	1327389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008787	AGAAA	2	10	1328843	1328852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008787	ATTAA	2	10	1372284	1372293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008787	TAAAA	2	10	1392989	1392998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008787	ATAAA	2	10	1417147	1417156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008787	TTATT	2	10	1418901	1418910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008787	TAAAA	2	10	1422798	1422807	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008787	TAAAT	2	10	1433451	1433460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008787	TACAA	2	10	1435891	1435900	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_008787	ATACT	2	10	1452012	1452021	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_008787	AAATT	2	10	1484585	1484594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008787	ATTAT	2	10	1489514	1489523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008787	TAAAA	2	10	1517196	1517205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008787	TATTT	2	10	1517348	1517357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008787	AAATT	2	10	1525352	1525361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008787	ACTTT	2	10	1526473	1526482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_008787	TTTTA	2	10	1530955	1530964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008787	ATATA	2	10	1551550	1551559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008787	TATAA	2	10	1556785	1556794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008787	TTGAA	2	10	1566706	1566715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008787	TAAAT	2	10	1566772	1566781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008787	AAAAT	2	10	1571441	1571450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008787	AAAAC	2	10	1580669	1580678	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_008787	AATAA	2	10	1585495	1585504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008787	ATTTT	2	10	1601023	1601032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008787	TTATT	2	10	1601226	1601235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008787	AAAAT	2	10	1607787	1607796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_008787	TATAT	2	10	1609371	1609380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008787	ATATT	2	10	1609943	1609952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008787	AAAAT	2	10	1616469	1616478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.