MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Verminephrobacter eiseniae EF01-2 chromosome

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008786	CAGATG	4	24	41455	41478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008786	CGGCGC	2	12	44084	44095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008786	CAGGCC	2	12	46617	46628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008786	GCCCAG	2	12	49031	49042	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008786	GCCCGC	2	12	49043	49054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008786	CCCAAG	2	12	52327	52338	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008786	CCTTCG	2	12	55798	55809	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008786	CCTTCG	2	12	55857	55868	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008786	CCTTCG	2	12	55917	55928	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008786	CCTTCG	2	12	55976	55987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008786	CCTTCG	2	12	56035	56046	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008786	CCTTCG	2	12	56094	56105	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008786	CCTTCG	2	12	56153	56164	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008786	CCTTCG	2	12	56212	56223	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008786	GTTGAT	2	12	77936	77947	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008786	GTATTG	4	24	111910	111933	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008786	GCCTTC	2	12	142377	142388	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008786	GCCTTC	2	12	142437	142448	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008786	GCCTTC	2	12	142497	142508	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008786	CCTTCG	2	12	142618	142629	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008786	TCATCC	2	12	145519	145530	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008786	GGGCTT	4	24	179631	179654	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008786	CGAAGG	2	12	213089	213100	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008786	CGCCGG	2	12	249417	249428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008786	GCCTGG	2	12	250763	250774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008786	CGAAGG	2	12	300119	300130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008786	CAATAG	2	12	300181	300192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008786	TGTCTC	2	12	354596	354607	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008786	ATGGCA	2	12	360343	360354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008786	CAAAAG	2	12	373631	373642	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008786	AAAAGT	2	12	410342	410353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008786	CCAATA	2	12	410868	410879	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008786	TTCACG	2	12	487994	488005	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008786	GCTGAT	2	12	496368	496379	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008786	CGGAGA	2	12	498331	498342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008786	TCGCGG	2	12	510186	510197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008786	CCAAGC	2	12	539007	539018	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008786	TTTTTC	2	12	546651	546662	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008786	CGAAGG	2	12	555054	555065	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008786	CCACAT	2	12	557053	557064	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008786	GGCGCA	2	12	557113	557124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008786	GTTCCG	2	12	604477	604488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008786	CATCGC	2	12	621199	621210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008786	CTGATC	2	12	638277	638288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008786	CGGCAG	2	12	654928	654939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008786	GGCATT	2	12	657025	657036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008786	AACCAC	2	12	661443	661454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008786	GCTGGC	2	12	665115	665126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008786	GGGCCG	2	12	672031	672042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008786	ACGTAT	2	12	797589	797600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008786	AGGCCC	2	12	819542	819553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008786	GCCGTC	2	12	841693	841704	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008786	CGGGGT	2	12	853949	853960	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008786	ATGTCG	2	12	862191	862202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008786	AGAAAG	2	12	862269	862280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008786	TGTGGG	2	12	919779	919790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008786	GCCCTT	2	12	919905	919916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008786	GCACGG	2	12	930555	930566	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008786	CGAAGG	2	12	943863	943874	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008786	CGAAGG	2	12	943983	943994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008786	CGAAGG	2	12	944043	944054	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008786	AGCGGC	2	12	944088	944099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008786	GCACCG	2	12	952084	952095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008786	CGGCGC	2	12	960534	960545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008786	CTTCGC	2	12	991414	991425	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008786	GCCGGT	2	12	1043860	1043871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008786	CGATAA	2	12	1057653	1057664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008786	ACAGCA	2	12	1103466	1103477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008786	GGCGCA	2	12	1105577	1105588	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008786	CCTTTG	2	12	1123641	1123652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008786	CGATGC	2	12	1135830	1135841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008786	CCGCCC	2	12	1156329	1156340	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_008786	CCGGCC	2	12	1190612	1190623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008786	CGCTCG	2	12	1244264	1244275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008786	ATCGTG	2	12	1245182	1245193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008786	CCCGGG	3	18	1275858	1275875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008786	CACGGC	2	12	1319892	1319903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008786	ACGATG	2	12	1325891	1325902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008786	CTTCGC	3	18	1327071	1327088	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008786	GGATAA	2	12	1328489	1328500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008786	CATGCG	2	12	1328565	1328576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008786	GCCAGG	2	12	1349004	1349015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008786	TGATAC	2	12	1365388	1365399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008786	CCTGCT	2	12	1370835	1370846	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008786	TCGGCC	2	12	1370918	1370929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008786	CTTCGC	2	12	1372883	1372894	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008786	CAGCGC	2	12	1380797	1380808	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008786	CCGGGG	2	12	1452066	1452077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008786	CCTTGA	2	12	1469131	1469142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008786	AAGCGC	2	12	1523867	1523878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008786	CGAAGG	2	12	1547105	1547116	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008786	CCCATT	2	12	1549873	1549884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008786	AACCCC	2	12	1552334	1552345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008786	TCGATA	2	12	1609987	1609998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008786	TGCGGG	2	12	1610287	1610298	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008786	TTCCTG	3	18	1611077	1611094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008786	TTTCTT	2	12	1614274	1614285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008786	ACGCAC	2	12	1614370	1614381	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008786	CGGCCC	4	24	1620329	1620352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008786	GGGTCA	3	18	1620868	1620885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008786	AGGTCA	2	12	1622749	1622760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008786	CATCGC	2	12	1624435	1624446	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008786	CCCTGA	4	24	1626891	1626914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008786	ATTATC	2	12	1627131	1627142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008786	GTTGAT	4	24	1642545	1642568	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008786	GTTGGT	4	24	1642569	1642592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008786	TGACAG	2	12	1642595	1642606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008786	TGGCAG	2	12	1642607	1642618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008786	GGCCAG	2	12	1678437	1678448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008786	CTGTTG	2	12	1711691	1711702	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008786	GACCGT	2	12	1711948	1711959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008786	CCGGCC	2	12	1733588	1733599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008786	GCGCCG	2	12	1736812	1736823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008786	CGCCAG	2	12	1739922	1739933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008786	GTTTGA	2	12	1773484	1773495	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008786	CGCAAC	2	12	1780237	1780248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008786	CGAAGG	2	12	1785213	1785224	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008786	CGAAGG	2	12	1785273	1785284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008786	TCCTTC	2	12	1813767	1813778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008786	CTTGCA	2	12	1830838	1830849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008786	CGAAGG	2	12	1830924	1830935	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008786	CGAAGG	2	12	1830984	1830995	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008786	CGAAGG	2	12	1831044	1831055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008786	CGAAGG	2	12	1831104	1831115	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008786	CGAAGG	2	12	1831164	1831175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008786	GCGCGG	2	12	1842262	1842273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008786	GCGCGG	2	12	1842311	1842322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008786	CCTCGG	2	12	1842740	1842751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008786	CGAAGG	2	12	1844154	1844165	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008786	CGAAGG	2	12	1844274	1844285	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008786	CGAAGG	2	12	1858535	1858546	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008786	GATGGG	2	12	1893438	1893449	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008786	CCAAGG	2	12	1912834	1912845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008786	ATGCCG	2	12	1920290	1920301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008786	CACCCC	2	12	1932507	1932518	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
136	NC_008786	TGCCCA	2	12	1954754	1954765	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008786	CAGAAC	2	12	1961882	1961893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008786	GAAGGT	2	12	1963635	1963646	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008786	TGCCCG	3	18	1969910	1969927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008786	CACGGA	2	12	1988013	1988024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008786	GCCTTC	2	12	2007925	2007936	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008786	CACAGC	3	18	2011158	2011175	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008786	GGAGCA	2	12	2026717	2026728	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_008786	TGGGGT	2	12	2040526	2040537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_008786	GTTCCG	2	12	2081337	2081348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008786	GCCGGA	2	12	2090302	2090313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008786	GGTGCC	2	12	2097776	2097787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008786	GGGGCC	2	12	2097788	2097799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008786	GGGAAA	2	12	2097815	2097826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008786	CTTCGC	2	12	2110207	2110218	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008786	GTTCAC	2	12	2110219	2110230	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008786	ACGGCG	2	12	2147306	2147317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_008786	CGTGCT	2	12	2147347	2147358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_008786	GCCAGC	2	12	2147464	2147475	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
157	NC_008786	GGTGTG	2	12	2181980	2181991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008786	TGCGGC	2	12	2191945	2191956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_008786	TGGCGG	4	24	2201291	2201314	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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231	NC_008786	ACGGCC	4	24	3399432	3399455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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234	NC_008786	GGCCGG	2	12	3487426	3487437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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236	NC_008786	ATCGCC	2	12	3509999	3510010	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
237	NC_008786	GGTGCT	2	12	3539024	3539035	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_008786	GATGGT	2	12	3571652	3571663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
239	NC_008786	CCAGTC	2	12	3578072	3578083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
240	NC_008786	CTTGCG	2	12	3578406	3578417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_008786	CCGTTC	2	12	3613311	3613322	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
242	NC_008786	TCCAAA	2	12	3623379	3623390	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_008786	TCCTGT	2	12	3647061	3647072	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_008786	GCCAAG	2	12	3653571	3653582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_008786	GCAGGG	2	12	3699198	3699209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_008786	CCTTCG	2	12	3718842	3718853	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
247	NC_008786	CCCTCG	2	12	3724905	3724916	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_008786	CATTGT	2	12	3738232	3738243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_008786	GAGTAC	2	12	3740423	3740434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_008786	CGGTGC	3	18	3774765	3774782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_008786	GGGCCG	2	12	3795435	3795446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_008786	CCATAT	2	12	3806835	3806846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_008786	GGCGCC	2	12	3834177	3834188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
254	NC_008786	GCCGGA	2	12	3834274	3834285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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362	NC_008786	CGATAT	2	12	5544365	5544376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.