MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Verminephrobacter eiseniae EF01-2 chromosome

Total Repeats: 5662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008786	GCCGG	2	10	89	98	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008786	GCAGG	2	10	278	287	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008786	ACCAC	2	10	1838	1847	40 %	0 %	0 %	60 %	121607005
4	NC_008786	ACAAG	2	10	2060	2069	60 %	0 %	20 %	20 %	121607006
5	NC_008786	CCTGC	2	10	3372	3381	0 %	20 %	20 %	60 %	121607007
6	NC_008786	GTGCT	2	10	4281	4290	0 %	40 %	40 %	20 %	121607007
7	NC_008786	CAAGC	2	10	5400	5409	40 %	0 %	20 %	40 %	121607007
8	NC_008786	TGGCA	2	10	6253	6262	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008786	GCACG	2	10	7770	7779	20 %	0 %	40 %	40 %	121607008
10	NC_008786	GCGCC	2	10	12328	12337	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008786	CTGGA	2	10	15909	15918	20 %	20 %	40 %	20 %	121607014
12	NC_008786	CTGCG	2	10	17034	17043	0 %	20 %	40 %	40 %	121607015
13	NC_008786	TCGGC	2	10	17413	17422	0 %	20 %	40 %	40 %	121607015
14	NC_008786	TGCGG	2	10	19887	19896	0 %	20 %	60 %	20 %	121607016
15	NC_008786	GCGTC	2	10	20680	20689	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_008786	CTGCG	2	10	22265	22274	0 %	20 %	40 %	40 %	121607018
17	NC_008786	GGCCA	2	10	23422	23431	20 %	0 %	40 %	40 %	121607018
18	NC_008786	CCGCC	2	10	23898	23907	0 %	0 %	20 %	80 %	121607018
19	NC_008786	CAAGC	2	10	24202	24211	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008786	CAGGC	2	10	24212	24221	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008786	GCCTG	2	10	24630	24639	0 %	20 %	40 %	40 %	121607019
22	NC_008786	GGAAA	2	10	24972	24981	60 %	0 %	40 %	0 %	121607019
23	NC_008786	CGGCC	2	10	25246	25255	0 %	0 %	40 %	60 %	121607020
24	NC_008786	ATGGC	2	10	25521	25530	20 %	20 %	40 %	20 %	121607020
25	NC_008786	GCGCC	2	10	30013	30022	0 %	0 %	40 %	60 %	121607023
26	NC_008786	CCTGG	2	10	30545	30554	0 %	20 %	40 %	40 %	121607024
27	NC_008786	CGCAG	2	10	31349	31358	20 %	0 %	40 %	40 %	121607025
28	NC_008786	CGCTC	2	10	32439	32448	0 %	20 %	20 %	60 %	121607026
29	NC_008786	GCGCA	2	10	32463	32472	20 %	0 %	40 %	40 %	121607026
30	NC_008786	GGCCA	2	10	37618	37627	20 %	0 %	40 %	40 %	121607030
31	NC_008786	GCGCG	2	10	38451	38460	0 %	0 %	60 %	40 %	121607030
32	NC_008786	GCGTG	2	10	40054	40063	0 %	20 %	60 %	20 %	121607032
33	NC_008786	ACGGC	2	10	40290	40299	20 %	0 %	40 %	40 %	121607032
34	NC_008786	GGGCA	2	10	42800	42809	20 %	0 %	60 %	20 %	121607035
35	NC_008786	GACCT	2	10	44731	44740	20 %	20 %	20 %	40 %	121607036
36	NC_008786	TGCGC	2	10	44895	44904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008786	GACAC	2	10	44942	44951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008786	CTGCG	2	10	45064	45073	0 %	20 %	40 %	40 %	121607037
39	NC_008786	GCACC	2	10	45543	45552	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008786	GCTGC	2	10	45606	45615	0 %	20 %	40 %	40 %	121607038
41	NC_008786	ATGGC	2	10	45922	45931	20 %	20 %	40 %	20 %	121607038
42	NC_008786	AGCGC	2	10	46463	46472	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008786	CGCAG	2	10	46600	46609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008786	GCCCG	3	15	49888	49902	0 %	0 %	40 %	60 %	121607041
45	NC_008786	TGGGC	2	10	50622	50631	0 %	20 %	60 %	20 %	121607041
46	NC_008786	CGGCC	2	10	51792	51801	0 %	0 %	40 %	60 %	121607042
47	NC_008786	CCAAG	2	10	53098	53107	40 %	0 %	20 %	40 %	121607045
48	NC_008786	GCCCG	2	10	54339	54348	0 %	0 %	40 %	60 %	121607046
49	NC_008786	GGCGC	2	10	54515	54524	0 %	0 %	60 %	40 %	121607046
50	NC_008786	CTGCC	2	10	55097	55106	0 %	20 %	20 %	60 %	121607047
51	NC_008786	GCGCC	2	10	57335	57344	0 %	0 %	40 %	60 %	121607048
52	NC_008786	CCTTG	2	10	57990	57999	0 %	40 %	20 %	40 %	121607049
53	NC_008786	ACCAC	2	10	58948	58957	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_008786	GCCGA	2	10	59443	59452	20 %	0 %	40 %	40 %	121607050
55	NC_008786	CTGGT	2	10	59503	59512	0 %	40 %	40 %	20 %	121607050
56	NC_008786	GTGCT	2	10	59650	59659	0 %	40 %	40 %	20 %	121607050
57	NC_008786	GCATG	2	10	63273	63282	20 %	20 %	40 %	20 %	121607054
58	NC_008786	GAAAT	2	10	64008	64017	60 %	20 %	20 %	0 %	121607055
59	NC_008786	CGATG	2	10	65714	65723	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008786	GACAC	2	10	65769	65778	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008786	TGTCT	2	10	69203	69212	0 %	60 %	20 %	20 %	121607059
62	NC_008786	GAACG	2	10	70812	70821	40 %	0 %	40 %	20 %	121607061
63	NC_008786	AAACG	2	10	72030	72039	60 %	0 %	20 %	20 %	121607062
64	NC_008786	CCGCG	2	10	72368	72377	0 %	0 %	40 %	60 %	121607063
65	NC_008786	TTGGC	2	10	74130	74139	0 %	40 %	40 %	20 %	121607064
66	NC_008786	AGGCC	2	10	74790	74799	20 %	0 %	40 %	40 %	121607065
67	NC_008786	CCGGG	2	10	76876	76885	0 %	0 %	60 %	40 %	121607066
68	NC_008786	GCCGG	2	10	76928	76937	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008786	GGCGT	2	10	77599	77608	0 %	20 %	60 %	20 %	121607067
70	NC_008786	GGCGT	2	10	78668	78677	0 %	20 %	60 %	20 %	121607068
71	NC_008786	CAGAA	2	10	79138	79147	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008786	TCGGC	2	10	80590	80599	0 %	20 %	40 %	40 %	121607069
73	NC_008786	GCGCA	2	10	82528	82537	20 %	0 %	40 %	40 %	121607070
74	NC_008786	GCAAT	2	10	85050	85059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008786	CGCGC	3	15	85738	85752	0 %	0 %	40 %	60 %	121607074
76	NC_008786	CCAGC	2	10	85882	85891	20 %	0 %	20 %	60 %	121607074
77	NC_008786	AGCGC	2	10	86642	86651	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008786	CGGCC	2	10	86759	86768	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_008786	CGCTG	2	10	87026	87035	0 %	20 %	40 %	40 %	121607075
80	NC_008786	GCCCG	2	10	90194	90203	0 %	0 %	40 %	60 %	121607077
81	NC_008786	GCCCG	2	10	90688	90697	0 %	0 %	40 %	60 %	121607078
82	NC_008786	GCCTG	2	10	94772	94781	0 %	20 %	40 %	40 %	121607082
83	NC_008786	CTTTT	2	10	96783	96792	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008786	CAGCG	2	10	97619	97628	20 %	0 %	40 %	40 %	121607084
85	NC_008786	CCCCG	2	10	98370	98379	0 %	0 %	20 %	80 %	121607085
86	NC_008786	TGGCC	2	10	98963	98972	0 %	20 %	40 %	40 %	121607085
87	NC_008786	GCGCA	2	10	100731	100740	20 %	0 %	40 %	40 %	121607087
88	NC_008786	TCGGG	2	10	101837	101846	0 %	20 %	60 %	20 %	121607089
89	NC_008786	CGCGG	2	10	101909	101918	0 %	0 %	60 %	40 %	121607089
90	NC_008786	GATGC	2	10	102295	102304	20 %	20 %	40 %	20 %	121607089
91	NC_008786	TGCGC	2	10	103162	103171	0 %	20 %	40 %	40 %	121607089
92	NC_008786	GTCGT	2	10	103279	103288	0 %	40 %	40 %	20 %	121607089
93	NC_008786	CCAGT	2	10	103793	103802	20 %	20 %	20 %	40 %	121607090
94	NC_008786	CGGCG	2	10	104052	104061	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_008786	TCGGG	2	10	104129	104138	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008786	AGCCC	2	10	104211	104220	20 %	0 %	20 %	60 %	121607091
97	NC_008786	GCGCC	2	10	108819	108828	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_008786	AGGCC	2	10	109068	109077	20 %	0 %	40 %	40 %	121607096
99	NC_008786	GCTGC	2	10	109225	109234	0 %	20 %	40 %	40 %	121607096
100	NC_008786	TGCGC	2	10	109420	109429	0 %	20 %	40 %	40 %	121607096
101	NC_008786	GGCAC	2	10	109491	109500	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008786	GGCCC	2	10	109658	109667	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_008786	CTGCC	2	10	111037	111046	0 %	20 %	20 %	60 %	121607097
104	NC_008786	CGCGG	2	10	111374	111383	0 %	0 %	60 %	40 %	121607097
105	NC_008786	TCCGT	2	10	111879	111888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008786	GCTGC	2	10	114185	114194	0 %	20 %	40 %	40 %	121607099
107	NC_008786	ATTGC	2	10	114453	114462	20 %	40 %	20 %	20 %	121607099
108	NC_008786	CGGCC	2	10	114910	114919	0 %	0 %	40 %	60 %	121607099
109	NC_008786	TCCTC	2	10	115211	115220	0 %	40 %	0 %	60 %	121607100
110	NC_008786	GCACG	2	10	118135	118144	20 %	0 %	40 %	40 %	121607102
111	NC_008786	ATCCG	2	10	118189	118198	20 %	20 %	20 %	40 %	121607102
112	NC_008786	GCGCG	2	10	120618	120627	0 %	0 %	60 %	40 %	121607103
113	NC_008786	GCCGA	2	10	122434	122443	20 %	0 %	40 %	40 %	121607103
114	NC_008786	GCGCC	2	10	123277	123286	0 %	0 %	40 %	60 %	121607104
115	NC_008786	TGCCT	2	10	124244	124253	0 %	40 %	20 %	40 %	121607105
116	NC_008786	CGCGC	2	10	126047	126056	0 %	0 %	40 %	60 %	121607106
117	NC_008786	GCCAC	2	10	126189	126198	20 %	0 %	20 %	60 %	121607106
118	NC_008786	CCTGC	2	10	128672	128681	0 %	20 %	20 %	60 %	121607109
119	NC_008786	CTGCG	2	10	130596	130605	0 %	20 %	40 %	40 %	121607110
120	NC_008786	GGCGC	2	10	132023	132032	0 %	0 %	60 %	40 %	121607111
121	NC_008786	GCCGC	2	10	133652	133661	0 %	0 %	40 %	60 %	121607113
122	NC_008786	GCGCC	2	10	134304	134313	0 %	0 %	40 %	60 %	121607113
123	NC_008786	CGAAT	2	10	134556	134565	40 %	20 %	20 %	20 %	121607113
124	NC_008786	GAAAA	2	10	134574	134583	80 %	0 %	20 %	0 %	121607113
125	NC_008786	GCGCG	2	10	134782	134791	0 %	0 %	60 %	40 %	121607114
126	NC_008786	CCCAG	2	10	135801	135810	20 %	0 %	20 %	60 %	121607114
127	NC_008786	ATGCG	2	10	136029	136038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008786	GCCGC	2	10	136720	136729	0 %	0 %	40 %	60 %	121607115
129	NC_008786	GCCTG	2	10	137029	137038	0 %	20 %	40 %	40 %	121607116
130	NC_008786	CTCAT	2	10	137955	137964	20 %	40 %	0 %	40 %	121607116
131	NC_008786	CGCAG	2	10	138505	138514	20 %	0 %	40 %	40 %	121607117
132	NC_008786	GCGCG	2	10	139581	139590	0 %	0 %	60 %	40 %	121607118
133	NC_008786	GCCGA	2	10	141024	141033	20 %	0 %	40 %	40 %	121607119
134	NC_008786	GCATC	2	10	142163	142172	20 %	20 %	20 %	40 %	121607120
135	NC_008786	GGCGG	2	10	142738	142747	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008786	GTGTC	2	10	143869	143878	0 %	40 %	40 %	20 %	121607122
137	NC_008786	AGCGC	2	10	143915	143924	20 %	0 %	40 %	40 %	121607122
138	NC_008786	GCGCG	2	10	144213	144222	0 %	0 %	60 %	40 %	121607123
139	NC_008786	CGGCG	3	15	144280	144294	0 %	0 %	60 %	40 %	121607123
140	NC_008786	GGCGG	2	10	145625	145634	0 %	0 %	80 %	20 %	121607124
141	NC_008786	TGGAC	2	10	146086	146095	20 %	20 %	40 %	20 %	121607124
142	NC_008786	GCTGC	2	10	146839	146848	0 %	20 %	40 %	40 %	121607125
143	NC_008786	ACGGA	2	10	149579	149588	40 %	0 %	40 %	20 %	121607127
144	NC_008786	GCAAG	2	10	150479	150488	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008786	TTGCA	2	10	150658	150667	20 %	40 %	20 %	20 %	121607129
146	NC_008786	ATCAT	2	10	150693	150702	40 %	40 %	0 %	20 %	121607129
147	NC_008786	CCGCA	2	10	150803	150812	20 %	0 %	20 %	60 %	121607130
148	NC_008786	AGCAG	2	10	150872	150881	40 %	0 %	40 %	20 %	121607130
149	NC_008786	CGATA	2	10	153124	153133	40 %	20 %	20 %	20 %	121607133
150	NC_008786	CGAAT	2	10	154358	154367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008786	ATGTG	2	10	154963	154972	20 %	40 %	40 %	0 %	121607136
152	NC_008786	CTGCG	2	10	155552	155561	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_008786	GGCGC	2	10	158894	158903	0 %	0 %	60 %	40 %	121607141
154	NC_008786	GCCGG	2	10	159413	159422	0 %	0 %	60 %	40 %	121607141
155	NC_008786	CCGGC	2	10	159460	159469	0 %	0 %	40 %	60 %	121607141
156	NC_008786	GCGCC	2	10	160447	160456	0 %	0 %	40 %	60 %	121607142
157	NC_008786	GCCCG	2	10	160907	160916	0 %	0 %	40 %	60 %	121607142
158	NC_008786	CGACC	2	10	161457	161466	20 %	0 %	20 %	60 %	121607143
159	NC_008786	GCCGC	2	10	161819	161828	0 %	0 %	40 %	60 %	121607143
160	NC_008786	GGACT	2	10	163699	163708	20 %	20 %	40 %	20 %	121607144
161	NC_008786	TGGCG	2	10	163755	163764	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_008786	CTGCC	2	10	164383	164392	0 %	20 %	20 %	60 %	121607145
163	NC_008786	GCTGC	2	10	164825	164834	0 %	20 %	40 %	40 %	121607145
164	NC_008786	TGGCG	2	10	164978	164987	0 %	20 %	60 %	20 %	121607146
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166	NC_008786	AGCGC	2	10	166261	166270	20 %	0 %	40 %	40 %	121607148
167	NC_008786	GGCGC	2	10	167725	167734	0 %	0 %	60 %	40 %	121607150
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169	NC_008786	CGGGC	2	10	168352	168361	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
170	NC_008786	GCCTG	2	10	168725	168734	0 %	20 %	40 %	40 %	121607151
171	NC_008786	GCCTG	2	10	174515	174524	0 %	20 %	40 %	40 %	121607158
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186	NC_008786	GAAGG	2	10	181027	181036	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008786	CAGCG	2	10	181856	181865	20 %	0 %	40 %	40 %	121607162
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192	NC_008786	CGCTG	2	10	186665	186674	0 %	20 %	40 %	40 %	121607167
193	NC_008786	GGCGG	2	10	188086	188095	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
194	NC_008786	GCTGC	2	10	189074	189083	0 %	20 %	40 %	40 %	121607170
195	NC_008786	AAGCA	2	10	190891	190900	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
196	NC_008786	TGCGC	2	10	191167	191176	0 %	20 %	40 %	40 %	121607172
197	NC_008786	CCACG	2	10	192579	192588	20 %	0 %	20 %	60 %	121607173
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205	NC_008786	AAGGA	2	10	202844	202853	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_008786	AGCGC	2	10	208421	208430	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
212	NC_008786	CGCAA	2	10	209081	209090	40 %	0 %	20 %	40 %	121607193
213	NC_008786	AGCGC	2	10	211195	211204	20 %	0 %	40 %	40 %	121607195
214	NC_008786	TGCCC	2	10	212029	212038	0 %	20 %	20 %	60 %	121607195
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217	NC_008786	TGGCC	2	10	214050	214059	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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221	NC_008786	GGCAT	2	10	216752	216761	20 %	20 %	40 %	20 %	121607199
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225	NC_008786	ATTTG	2	10	219093	219102	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
226	NC_008786	CAGGC	2	10	219315	219324	20 %	0 %	40 %	40 %	121607203
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237	NC_008786	GGCAA	2	10	227038	227047	40 %	0 %	40 %	20 %	121607210
238	NC_008786	AGCGC	2	10	227251	227260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
239	NC_008786	CATTC	2	10	228756	228765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
240	NC_008786	GCGTC	2	10	228790	228799	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
241	NC_008786	CAGGT	2	10	229939	229948	20 %	20 %	40 %	20 %	121607212
242	NC_008786	CGATG	2	10	230538	230547	20 %	20 %	40 %	20 %	121607213
243	NC_008786	GGTCA	2	10	231046	231055	20 %	20 %	40 %	20 %	121607213
244	NC_008786	AGTGC	2	10	234656	234665	20 %	20 %	40 %	20 %	121607217
245	NC_008786	CAGCC	2	10	235924	235933	20 %	0 %	20 %	60 %	121607218
246	NC_008786	TGAAG	2	10	236354	236363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
247	NC_008786	AGCGC	2	10	236590	236599	20 %	0 %	40 %	40 %	121607219
248	NC_008786	TGCGG	2	10	237747	237756	0 %	20 %	60 %	20 %	121607220
249	NC_008786	CATCG	2	10	237860	237869	20 %	20 %	20 %	40 %	121607220
250	NC_008786	AGCGC	2	10	237997	238006	20 %	0 %	40 %	40 %	121607220
251	NC_008786	CGGGC	2	10	238629	238638	0 %	0 %	60 %	40 %	121607221
252	NC_008786	GCGCT	2	10	239645	239654	0 %	20 %	40 %	40 %	121607222
253	NC_008786	GCGCC	2	10	241196	241205	0 %	0 %	40 %	60 %	121607223
254	NC_008786	CATGC	2	10	242594	242603	20 %	20 %	20 %	40 %	121607223
255	NC_008786	GTGAT	2	10	247510	247519	20 %	40 %	40 %	0 %	121607228
256	NC_008786	CCGGG	2	10	248689	248698	0 %	0 %	60 %	40 %	121607229
257	NC_008786	TTCGC	2	10	248915	248924	0 %	40 %	20 %	40 %	121607229
258	NC_008786	TGGCA	2	10	249604	249613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_008786	GCCGG	2	10	250916	250925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
260	NC_008786	TGCAC	2	10	251807	251816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
261	NC_008786	CGATG	2	10	252282	252291	20 %	20 %	40 %	20 %	121607231
262	NC_008786	CCGAG	2	10	256597	256606	20 %	0 %	40 %	40 %	121607235
263	NC_008786	ATGGC	2	10	259271	259280	20 %	20 %	40 %	20 %	121607239
264	NC_008786	GGCAC	2	10	259471	259480	20 %	0 %	40 %	40 %	121607239
265	NC_008786	GCCGG	2	10	261239	261248	0 %	0 %	60 %	40 %	121607240
266	NC_008786	TGGCG	2	10	262458	262467	0 %	20 %	60 %	20 %	121607242
267	NC_008786	CAGCG	2	10	263889	263898	20 %	0 %	40 %	40 %	121607243
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