MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia mallei SAVP1 chromosome II

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008784	TCGGAG	4	24	17675	17698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008784	TCCATC	2	12	39024	39035	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008784	CGCCCG	2	12	48801	48812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008784	CGATCG	2	12	53045	53056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008784	CCGAGC	2	12	80233	80244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008784	CCGCGC	2	12	81547	81558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008784	GCAGCG	2	12	85526	85537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008784	CGTCGG	2	12	88452	88463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008784	GTCGAA	2	12	119428	119439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008784	ATGTCG	2	12	121512	121523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008784	GCGCTC	2	12	128175	128186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008784	CGCGCT	2	12	128414	128425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008784	CGGGCG	2	12	128497	128508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008784	GCGCCG	2	12	128714	128725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008784	CGGCCT	2	12	136126	136137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008784	CGCTCC	2	12	142958	142969	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008784	GGCCGC	2	12	153831	153842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008784	GGTACA	2	12	157280	157291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008784	CGATCG	2	12	204001	204012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008784	CACGGC	2	12	204503	204514	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008784	GCTACG	2	12	209339	209350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008784	GCGCGG	2	12	234756	234767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008784	TCCGTA	2	12	242035	242046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008784	GGGCGC	2	12	260097	260108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008784	TCGATG	2	12	271056	271067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008784	GCGCGG	2	12	297478	297489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008784	CCGACG	2	12	322729	322740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008784	ACAGCA	2	12	346428	346439	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008784	TCGCAT	2	12	353475	353486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008784	CGCACG	2	12	359412	359423	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008784	CGAGCG	2	12	379020	379031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008784	CGAGCG	2	12	379650	379661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008784	ATCCGC	2	12	381404	381415	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008784	CGGACG	2	12	385608	385619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008784	GTGGCG	2	12	385634	385645	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008784	GCCAGA	8	48	385768	385815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008784	CGGATG	2	12	387883	387894	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008784	CGGAAA	2	12	452934	452945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008784	CGGCCC	2	12	459920	459931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008784	CGCGGC	2	12	464992	465003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008784	TTCGGC	2	12	468246	468257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008784	TTCGTC	3	18	468258	468275	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008784	TTCGGC	2	12	468276	468287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008784	TTCGTC	2	12	468288	468299	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008784	TCAACA	2	12	478751	478762	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008784	CGCCTT	2	12	493868	493879	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008784	CCGGCG	2	12	506644	506655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008784	CGTCGA	2	12	507958	507969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008784	GCGATG	2	12	521304	521315	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008784	CGCATG	2	12	521376	521387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008784	GCGCAC	2	12	540587	540598	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008784	CGCGTC	2	12	549289	549300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008784	TGTCGT	2	12	563511	563522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008784	CGGCGC	2	12	578051	578062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008784	TCGCGC	2	12	580604	580615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008784	CTGCAC	4	24	591763	591786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008784	CGCGGC	2	12	593082	593093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008784	GGGTCG	3	18	593228	593245	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008784	CCGCCC	2	12	601975	601986	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_008784	CGCGAT	2	12	602755	602766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008784	CGCCAC	5	30	605659	605688	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008784	CCACCG	3	18	605739	605756	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008784	GCAGCC	2	12	648023	648034	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008784	CGGGCC	2	12	649776	649787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008784	CCTGGC	2	12	653441	653452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008784	CCGAAT	2	12	656911	656922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008784	CATCGG	2	12	676616	676627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008784	GCTCCG	2	12	683785	683796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008784	GGCTAG	3	18	684876	684893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008784	TCGACG	2	12	688237	688248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008784	ATTCGG	2	12	692878	692889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008784	TCGGCG	2	12	715891	715902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008784	CGCGGC	2	12	728784	728795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008784	TTCGGC	2	12	732038	732049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008784	TTCGTC	3	18	732050	732067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008784	TTCGGC	2	12	732068	732079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008784	TTCGTC	2	12	732080	732091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008784	CGCGAC	2	12	737276	737287	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008784	TATATG	2	12	766965	766976	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008784	GTGCGC	2	12	792525	792536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008784	CCGGCC	2	12	796083	796094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008784	CCCCCG	2	12	827187	827198	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_008784	GCGCCG	2	12	854362	854373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008784	CCCGCG	2	12	881949	881960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008784	ATTGAA	2	12	888213	888224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008784	CGGCGC	2	12	892476	892487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008784	ACCGCG	2	12	909954	909965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008784	GCATCG	4	24	917100	917123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008784	TCTCGC	2	12	962991	963002	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008784	CCGAGA	2	12	982703	982714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008784	GACAGG	2	12	991388	991399	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008784	GCACGC	2	12	998232	998243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008784	GCATCG	2	12	1012448	1012459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008784	AGCCCG	2	12	1062561	1062572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008784	ACGCAC	2	12	1066615	1066626	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008784	GGCGCC	2	12	1085207	1085218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008784	CTGCGG	4	24	1157993	1158016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008784	TCCGTC	3	18	1158735	1158752	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008784	CGTTGG	2	12	1158841	1158852	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008784	CTTCGC	2	12	1177651	1177662	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008784	GCTTTC	2	12	1184985	1184996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008784	GCGACG	2	12	1186900	1186911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008784	CGTTTC	2	12	1188718	1188729	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008784	CGCCGG	2	12	1201618	1201629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008784	CCACGC	2	12	1228243	1228254	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008784	GAGCGC	2	12	1236649	1236660	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008784	CGACGG	2	12	1240955	1240966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008784	GCGGAA	2	12	1245929	1245940	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008784	TCGCCA	4	24	1271060	1271083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008784	TCGCCG	3	18	1271084	1271101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008784	CGGAAA	2	12	1274175	1274186	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008784	TCGATC	2	12	1293857	1293868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008784	CAGCGC	2	12	1296836	1296847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008784	GAGCGC	2	12	1319478	1319489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008784	CCGCGC	2	12	1323545	1323556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008784	CGTTCG	2	12	1341811	1341822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008784	CGCGCC	2	12	1357818	1357829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008784	CGAAGC	6	36	1394154	1394189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008784	TGCCAG	2	12	1394193	1394204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008784	TGCCAA	2	12	1394205	1394216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008784	CGCCAA	3	18	1394217	1394234	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008784	TTCCTT	2	12	1407140	1407151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008784	TGGCCG	2	12	1428458	1428469	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008784	CGTCCG	2	12	1471801	1471812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008784	GCGCCG	2	12	1491136	1491147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008784	GAAGAC	3	18	1540874	1540891	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008784	GAAGGC	3	18	1540892	1540909	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008784	AGAGGC	2	12	1540910	1540921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008784	CGATCG	2	12	1543192	1543203	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008784	CGCCGG	2	12	1560969	1560980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008784	CGGCGC	2	12	1636829	1636840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008784	TCGATA	2	12	1648504	1648515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008784	CAGCGG	2	12	1655070	1655081	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008784	CCGTCG	2	12	1658362	1658373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008784	CGTAGT	2	12	1673065	1673076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_008784	GATGCC	6	36	1673090	1673125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008784	CGTGCG	2	12	1678228	1678239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008784	CGACGT	2	12	1720649	1720660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008784	TCGACG	2	12	1720666	1720677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008784	CCGACG	3	18	1720678	1720695	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008784	AGCGCA	2	12	1723116	1723127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.