MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia mallei SAVP1 chromosome II

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008784	GCGCG	2	10	201	210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008784	TCGTG	2	10	1575	1584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008784	CGAAT	2	10	2383	2392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008784	GGGAG	2	10	3132	3141	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008784	CTCAT	2	10	5132	5141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008784	GTTGC	2	10	5677	5686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008784	AGGCG	2	10	16964	16973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008784	GCGGG	2	10	17473	17482	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008784	GTCGG	2	10	17641	17650	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008784	GTCGG	2	10	17652	17661	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008784	CTCGT	2	10	18440	18449	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008784	CGGCG	2	10	18471	18480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008784	GCGCG	2	10	24583	24592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008784	TGCAA	2	10	27869	27878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008784	CCGCT	2	10	42291	42300	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008784	CGAAC	2	10	48839	48848	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008784	GCCCG	2	10	49175	49184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_008784	CGCGC	2	10	49383	49392	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008784	CGCGA	2	10	52932	52941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008784	CGTGC	2	10	53428	53437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008784	GCCCC	2	10	55175	55184	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_008784	GACGC	2	10	55200	55209	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008784	GCCCG	2	10	57987	57996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008784	GGCGC	2	10	58583	58592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008784	CGACG	2	10	60612	60621	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008784	CGCCC	2	10	60625	60634	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_008784	GCGCC	2	10	71052	71061	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008784	GTGCC	2	10	79855	79864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008784	GACGC	2	10	79881	79890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008784	CGCGC	2	10	79917	79926	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_008784	CGCGC	2	10	80145	80154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008784	CGGCG	2	10	81535	81544	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_008784	GGCCG	2	10	83514	83523	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_008784	CGGCG	2	10	88047	88056	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008784	CGCGA	2	10	88238	88247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008784	TCGCT	2	10	89532	89541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008784	CTGGA	2	10	92495	92504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008784	CCACC	2	10	98419	98428	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_008784	GCGCG	2	10	99722	99731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008784	TGCCG	2	10	104580	104589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008784	CGGCG	2	10	110662	110671	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008784	GCGCC	2	10	119935	119944	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008784	CGGCC	2	10	119957	119966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_008784	CGCCT	2	10	136146	136155	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_008784	ACGCC	2	10	144723	144732	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_008784	TTACG	2	10	146061	146070	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008784	GGATC	2	10	154721	154730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008784	GCCGC	2	10	155327	155336	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008784	CGCGC	2	10	155981	155990	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_008784	GCGCC	2	10	156102	156111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_008784	CATGC	2	10	204207	204216	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008784	CGGCG	2	10	204229	204238	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008784	CGCGC	2	10	207423	207432	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_008784	GCCGA	2	10	209251	209260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008784	CGCGG	2	10	211250	211259	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008784	CGGGC	2	10	217345	217354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008784	GCCGC	2	10	218957	218966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_008784	GGTTC	2	10	224810	224819	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008784	GCGCG	2	10	230327	230336	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_008784	CGCGC	2	10	235010	235019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_008784	CTCGC	2	10	245335	245344	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_008784	GCGCG	2	10	248185	248194	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008784	CCGCG	2	10	249002	249011	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_008784	GGCGC	2	10	249045	249054	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008784	CGGCT	2	10	255265	255274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008784	CGCGG	2	10	255415	255424	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_008784	CCGCC	2	10	255517	255526	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
68	NC_008784	GCGCG	2	10	256888	256897	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008784	TCGAT	2	10	258254	258263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008784	GCCGC	2	10	260253	260262	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_008784	CGCGC	2	10	274633	274642	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_008784	GCCGC	2	10	282571	282580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_008784	TGGCG	2	10	282867	282876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008784	TGCCG	2	10	283026	283035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_008784	CCGGC	3	15	283040	283054	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_008784	CCGCG	2	10	283769	283778	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_008784	AATCC	2	10	290960	290969	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008784	CGCGC	2	10	291048	291057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_008784	GCCGC	2	10	300807	300816	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_008784	TCAAA	2	10	314599	314608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008784	GCGCC	2	10	315214	315223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_008784	GAGCG	2	10	322226	322235	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008784	GCCGA	2	10	323278	323287	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008784	TTCGA	2	10	340835	340844	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008784	CCCGC	2	10	346556	346565	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_008784	CCCGC	2	10	348971	348980	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
87	NC_008784	GCCAC	2	10	352896	352905	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_008784	GGTTT	2	10	357459	357468	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008784	CATCG	2	10	358189	358198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_008784	ACGCG	2	10	359267	359276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_008784	GCCGC	2	10	367377	367386	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_008784	CGCGC	2	10	374129	374138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_008784	TCAGC	2	10	378127	378136	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_008784	GCCGC	2	10	378609	378618	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_008784	GGCGC	2	10	378840	378849	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_008784	CATTC	2	10	379146	379155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008784	CTGAT	2	10	381461	381470	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008784	GCCGG	2	10	383552	383561	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008784	GCGCG	2	10	383595	383604	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008784	TTGCG	3	15	385704	385718	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008784	CATCG	2	10	385719	385728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008784	CGCGC	2	10	399682	399691	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_008784	ATCCG	2	10	417484	417493	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_008784	GCCGC	2	10	421879	421888	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_008784	CGGCG	2	10	423479	423488	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008784	CCAAC	2	10	423800	423809	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_008784	ACGGC	2	10	424467	424476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008784	CGCGC	2	10	424945	424954	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_008784	GCCGG	2	10	430569	430578	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008784	CGCCC	2	10	430604	430613	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
111	NC_008784	ACATC	2	10	433440	433449	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008784	GCCGG	2	10	434637	434646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008784	AATTC	2	10	434778	434787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008784	TCGCC	2	10	437501	437510	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_008784	CGGGC	2	10	438636	438645	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008784	TCGCG	2	10	446228	446237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008784	CGGCG	2	10	451622	451631	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008784	GCGCC	2	10	451649	451658	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_008784	CCTCA	2	10	454212	454221	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_008784	CGGCG	2	10	455286	455295	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008784	CGCGC	2	10	474679	474688	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_008784	ACACG	2	10	478475	478484	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008784	GCCGC	2	10	484080	484089	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_008784	CGCGC	2	10	490361	490370	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_008784	ATGCC	2	10	491781	491790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_008784	GGGCA	2	10	493599	493608	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008784	GCCGC	2	10	496888	496897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_008784	GCGCC	2	10	505268	505277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_008784	TCGCG	2	10	506249	506258	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008784	CGGCG	2	10	506405	506414	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008784	ACGCA	2	10	514843	514852	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_008784	CTTCG	2	10	523896	523905	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_008784	CGAAC	2	10	524996	525005	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008784	GCGGA	2	10	527510	527519	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008784	GCGCC	2	10	529500	529509	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_008784	GGCGC	2	10	540484	540493	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_008784	GTGCG	2	10	540507	540516	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008784	AGGGA	2	10	541764	541773	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008784	GTTCG	2	10	543920	543929	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008784	CGCGC	2	10	543964	543973	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_008784	GCGCG	2	10	562017	562026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008784	GCTTC	2	10	567097	567106	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008784	CGTCG	2	10	567769	567778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_008784	GGCGC	2	10	568079	568088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008784	CGATA	2	10	578129	578138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008784	GCACC	2	10	582916	582925	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_008784	ACCGG	2	10	583147	583156	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_008784	GGCCG	2	10	583998	584007	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_008784	CGGCG	2	10	590977	590986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_008784	AAGGC	2	10	591071	591080	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008784	GCGCG	2	10	591183	591192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
152	NC_008784	AGCGA	2	10	591551	591560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_008784	CGCGC	2	10	607217	607226	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_008784	GCCCG	2	10	614140	614149	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_008784	GCCGC	2	10	628012	628021	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
159	NC_008784	CGGCG	2	10	628065	628074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
160	NC_008784	GATGT	2	10	638504	638513	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_008784	GCCGC	2	10	664826	664835	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
166	NC_008784	CCCGC	2	10	664845	664854	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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168	NC_008784	GCGTC	2	10	665658	665667	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_008784	GCCGG	2	10	683731	683740	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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174	NC_008784	CGGCC	2	10	688262	688271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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177	NC_008784	GGCGA	2	10	693978	693987	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_008784	TCTCG	2	10	783060	783069	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
187	NC_008784	GCCGT	2	10	790511	790520	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_008784	GCCGC	2	10	795312	795321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
189	NC_008784	GCGCG	2	10	797559	797568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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255	NC_008784	CGCGC	2	10	1056392	1056401	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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271	NC_008784	ACCTC	2	10	1164095	1164104	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
272	NC_008784	CGATG	2	10	1184883	1184892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
273	NC_008784	ACGCG	2	10	1184937	1184946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
274	NC_008784	GCCGC	2	10	1188964	1188973	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
275	NC_008784	ATTGC	2	10	1206459	1206468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_008784	GCATC	2	10	1212168	1212177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
277	NC_008784	CGGAC	2	10	1219954	1219963	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
278	NC_008784	CGCGG	2	10	1222001	1222010	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
279	NC_008784	TCCGC	2	10	1236548	1236557	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
280	NC_008784	CTTTT	2	10	1236732	1236741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
281	NC_008784	GCCGA	2	10	1237274	1237283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
282	NC_008784	ACACG	2	10	1237938	1237947	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_008784	CTTCC	2	10	1241119	1241128	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
284	NC_008784	TGTCG	2	10	1246150	1246159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_008784	CGCGT	2	10	1251763	1251772	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
286	NC_008784	GGAAC	2	10	1255538	1255547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_008784	ACGCT	2	10	1268585	1268594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_008784	CCATC	2	10	1271324	1271333	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
289	NC_008784	CGTGT	2	10	1274432	1274441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_008784	TGCGG	2	10	1313401	1313410	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
291	NC_008784	CGAAA	2	10	1313711	1313720	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_008784	GCCGC	2	10	1313892	1313901	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
293	NC_008784	CGGCG	2	10	1316811	1316820	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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343	NC_008784	CCTAT	2	10	1520309	1520318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
344	NC_008784	CCGAA	2	10	1543072	1543081	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
345	NC_008784	CATGG	2	10	1578712	1578721	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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363	NC_008784	TTCGC	2	10	1657687	1657696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
364	NC_008784	GCTCG	2	10	1657735	1657744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
365	NC_008784	ATCGC	2	10	1663098	1663107	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
366	NC_008784	CGGCG	2	10	1663115	1663124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
367	NC_008784	CGGGG	2	10	1667662	1667671	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
368	NC_008784	AACGG	2	10	1672924	1672933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
369	NC_008784	CGGCG	2	10	1678119	1678128	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
370	NC_008784	ACGAG	2	10	1678402	1678411	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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376	NC_008784	GCGCG	3	15	1709112	1709126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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378	NC_008784	CGCGC	2	10	1713939	1713948	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
379	NC_008784	GCCGA	2	10	1718603	1718612	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
380	NC_008784	GGGGC	2	10	1718634	1718643	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
381	NC_008784	CGGCG	2	10	1731529	1731538	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
382	NC_008784	CGTGC	2	10	1734901	1734910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.