MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella bacilliformis KC583

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008783	TTTAAA	2	12	23389	23400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008783	ATATTT	2	12	35654	35665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008783	CATTTT	2	12	35845	35856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008783	ATTTAT	2	12	47508	47519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008783	ATTTTT	2	12	75996	76007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008783	ATAAGG	2	12	91858	91869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008783	ATAAGA	2	12	111031	111042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008783	TTAATT	2	12	113922	113933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008783	TAAAAA	2	12	140932	140943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008783	TTTTTC	2	12	147603	147614	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008783	GTTTTA	2	12	154151	154162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008783	TAAGAA	2	12	172831	172842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008783	TTTTGC	2	12	183905	183916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008783	TGCTTA	2	12	184024	184035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008783	CTCTTA	2	12	217982	217993	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008783	AATGGC	2	12	218058	218069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008783	CTCTTA	2	12	219029	219040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008783	AATGGC	2	12	219105	219116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008783	CTCTTA	2	12	220123	220134	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008783	TAGTAT	2	12	221595	221606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008783	AAACTA	2	12	221744	221755	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008783	ATAAAG	2	12	221777	221788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008783	TGCCAG	2	12	240295	240306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008783	TAAAAC	2	12	257135	257146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008783	TTAGCT	2	12	258097	258108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008783	AAAATA	2	12	260963	260974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008783	GTTTTT	2	12	266500	266511	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008783	TTGGCC	2	12	280564	280575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008783	TTTGTT	2	12	280784	280795	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008783	CATGAT	2	12	291998	292009	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008783	ACCGAT	2	12	309093	309104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008783	GGAAGA	2	12	322661	322672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008783	AAATTA	2	12	324278	324289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008783	TTTTAT	2	12	324404	324415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008783	TTTATC	2	12	349306	349317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008783	ATTTTT	2	12	361796	361807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008783	ATTTTA	2	12	386657	386668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008783	TTTTGT	2	12	405143	405154	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008783	TTTTCA	2	12	405294	405305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008783	AATTAA	2	12	409385	409396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008783	AATGAA	2	12	427727	427738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008783	AGATTA	2	12	454815	454826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008783	TTTTAT	2	12	455146	455157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008783	TTTAAT	2	12	459024	459035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008783	TTTTAA	2	12	463957	463968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008783	TTTTGT	2	12	475835	475846	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008783	AGTGCC	2	12	490972	490983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008783	AAATAT	2	12	518998	519009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008783	ATAATG	2	12	523303	523314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008783	ATTTTT	2	12	538317	538328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008783	ATTTTA	2	12	546904	546915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008783	AAAAGA	2	12	557562	557573	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008783	TGAGAT	2	12	576435	576446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008783	GTTGGT	2	12	587836	587847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008783	AAAAAT	2	12	631695	631706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008783	TAAAAA	2	12	639281	639292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008783	ATTGAA	2	12	665100	665111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008783	GTTTTT	2	12	670575	670586	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008783	TTTATT	2	12	680517	680528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008783	ATTGAA	2	12	692853	692864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008783	GTTTTT	2	12	698259	698270	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008783	TTTATT	2	12	706673	706684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008783	ATTTTT	2	12	739462	739473	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008783	TTTTCC	2	12	773723	773734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008783	TCTTGA	2	12	776163	776174	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008783	GATATT	2	12	781724	781735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008783	TCTTGA	2	12	786223	786234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008783	GTTTTT	2	12	788960	788971	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008783	TAAATC	2	12	789399	789410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008783	ATTAAA	2	12	816065	816076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008783	TGCTGT	2	12	817853	817864	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008783	TAAATG	2	12	819503	819514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008783	AGTGTT	2	12	821289	821300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008783	TAAATA	2	12	821306	821317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008783	CATACA	2	12	821407	821418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008783	ATTATA	2	12	866921	866932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008783	TCAAAA	2	12	868843	868854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008783	TCTATT	2	12	893113	893124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008783	AAAACA	2	12	898358	898369	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008783	AAAGCT	2	12	934753	934764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008783	TAAAAA	2	12	943649	943660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008783	ATTGAT	2	12	956412	956423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008783	GAATCA	2	12	974704	974715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008783	AACTTT	2	12	988180	988191	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008783	CAAAAA	2	12	988295	988306	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008783	TTTAAA	2	12	990497	990508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008783	GACATT	2	12	994677	994688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008783	AATTTT	2	12	997128	997139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008783	TTTTGC	2	12	1006474	1006485	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008783	ATACTT	2	12	1006663	1006674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008783	ATAATT	2	12	1029706	1029717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008783	TAACAA	2	12	1037338	1037349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008783	ATTTTT	2	12	1061454	1061465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008783	GTTTAT	2	12	1061736	1061747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008783	CTTTAT	2	12	1082629	1082640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008783	TCAAGA	2	12	1091513	1091524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008783	TTAAAT	2	12	1096525	1096536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008783	ATGAAG	2	12	1099879	1099890	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008783	TCAAGA	2	12	1104037	1104048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008783	AAAGCT	2	12	1107598	1107609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008783	AGTTTT	2	12	1108645	1108656	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008783	CAGCTT	2	12	1118296	1118307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008783	ATTGAT	2	12	1132320	1132331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008783	ACACCG	2	12	1132538	1132549	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008783	TAGAAA	2	12	1134448	1134459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008783	AAAATA	2	12	1135057	1135068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008783	GAAAAT	2	12	1135483	1135494	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008783	ATAAAA	2	12	1143146	1143157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008783	ATAAAT	2	12	1149896	1149907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008783	CAAACA	2	12	1169564	1169575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008783	AGACGC	2	12	1195785	1195796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008783	CCTTTT	2	12	1208447	1208458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008783	AACCAA	2	12	1209375	1209386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008783	AGCTTT	2	12	1210285	1210296	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008783	AAAGCT	2	12	1223435	1223446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008783	TCAAGA	2	12	1225748	1225759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008783	AAAGCT	2	12	1229296	1229307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008783	CAAAAA	2	12	1229519	1229530	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008783	ATAACG	2	12	1240942	1240953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008783	TTTTTC	2	12	1241474	1241485	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008783	GCTAAA	2	12	1261533	1261544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008783	TTGTGC	2	12	1277028	1277039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008783	TGTTTT	2	12	1302241	1302252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008783	GAATAT	2	12	1337453	1337464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008783	TCTATG	2	12	1412069	1412080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008783	TGTTAC	2	12	1418515	1418526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008783	TTATAT	2	12	1440797	1440808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008783	TCGGTA	2	12	1444942	1444953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.