MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella bacilliformis KC583

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008783	TAAAG	2	10	26842	26851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008783	TTTTG	2	10	35281	35290	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008783	TATTT	2	10	35337	35346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008783	CAAAT	2	10	35601	35610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008783	ATGCT	2	10	44730	44739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008783	GAGAT	2	10	52061	52070	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008783	ATTTT	2	10	58466	58475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008783	GAAGA	2	10	62608	62617	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008783	ATGAA	2	10	70852	70861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008783	AAAAG	2	10	79410	79419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008783	TGATG	2	10	86261	86270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008783	GTTGT	2	10	97493	97502	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008783	TCTTT	2	10	101297	101306	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008783	ATGAA	2	10	101478	101487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008783	AAGGA	2	10	111273	111282	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008783	TAAAA	2	10	124125	124134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008783	ATGGC	2	10	134931	134940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008783	AATAA	2	10	140807	140816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008783	AGACT	2	10	154164	154173	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008783	TATTT	2	10	155286	155295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008783	TATTT	2	10	155548	155557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008783	TAGTT	2	10	159207	159216	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008783	TTTTA	2	10	160728	160737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008783	CATCT	2	10	160894	160903	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008783	GAGGG	2	10	164015	164024	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008783	GAAAA	2	10	164277	164286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008783	GTTTT	2	10	176267	176276	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008783	GTTTT	2	10	176359	176368	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008783	GTTTT	2	10	176451	176460	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008783	GTTTT	2	10	176543	176552	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008783	GTTTT	2	10	176635	176644	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008783	GTTTT	2	10	176727	176736	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008783	GTTTT	2	10	183889	183898	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008783	TTAAA	2	10	185985	185994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008783	GGTGA	2	10	188667	188676	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008783	TATAA	2	10	189758	189767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008783	GAAGG	2	10	200363	200372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008783	TCAGG	2	10	204238	204247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008783	GTCAG	2	10	204385	204394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008783	GTCAG	2	10	204529	204538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008783	AAGCA	2	10	206421	206430	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008783	GAAGT	2	10	206610	206619	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008783	TTACT	2	10	208320	208329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008783	TCAAC	2	10	208619	208628	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008783	GCAAA	2	10	212533	212542	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008783	CTCTT	2	10	213551	213560	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008783	AGTTT	2	10	217609	217618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008783	AGTTT	2	10	218638	218647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008783	CTATC	2	10	221305	221314	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008783	TCCCC	2	10	221548	221557	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_008783	TTTGA	2	10	223410	223419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008783	ATATT	2	10	224589	224598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008783	CTTTG	2	10	224998	225007	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008783	AGAAT	2	10	226276	226285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008783	TTTTC	2	10	226933	226942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008783	AAAGA	2	10	229366	229375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008783	GGAAC	2	10	251035	251044	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008783	CAAAT	2	10	251872	251881	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008783	TCGTG	2	10	252905	252914	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008783	GGGCT	2	10	253050	253059	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008783	GTGCT	2	10	253270	253279	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008783	CTTAT	2	10	253821	253830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008783	GAAGA	2	10	254062	254071	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008783	TGAGT	2	10	254226	254235	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008783	AAGGT	2	10	255032	255041	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008783	ATTGA	2	10	256082	256091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008783	ATCCC	2	10	257225	257234	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_008783	AAATT	2	10	258015	258024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008783	GAAAG	2	10	261234	261243	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008783	TTAGC	2	10	262639	262648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008783	AGTTG	2	10	262753	262762	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008783	ATAGT	2	10	263156	263165	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008783	ACTAT	2	10	263166	263175	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008783	GTATC	2	10	263199	263208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008783	GATAC	2	10	265450	265459	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008783	AGTAT	2	10	265480	265489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008783	TACTA	2	10	265492	265501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008783	TACTA	2	10	267287	267296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008783	ACGCG	2	10	268791	268800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008783	CTTTC	2	10	269476	269485	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008783	AAAAG	2	10	276455	276464	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008783	TCATT	2	10	279592	279601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008783	ATTTT	2	10	280520	280529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008783	TAAAG	2	10	282275	282284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008783	TTCAT	2	10	291946	291955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008783	GTAAA	2	10	292576	292585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008783	TCTTT	2	10	303517	303526	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008783	ATTTT	2	10	303931	303940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008783	TATTT	2	10	318529	318538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008783	GCTTT	2	10	320118	320127	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008783	CTTTA	2	10	326628	326637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008783	TCATT	2	10	328080	328089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008783	GGTTT	2	10	336270	336279	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008783	TTTTA	2	10	337297	337306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008783	GTTAT	2	10	348730	348739	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008783	AGTGT	2	10	348923	348932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008783	TTAAT	2	10	355106	355115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008783	AAAAG	2	10	361682	361691	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008783	ATTTT	2	10	361846	361855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008783	GAAAA	2	10	364355	364364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008783	GATTG	2	10	367932	367941	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008783	ACTTT	2	10	374254	374263	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008783	TGTTT	2	10	377256	377265	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008783	CTCAT	2	10	382350	382359	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008783	ATTCT	2	10	383450	383459	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008783	TTCAT	2	10	402881	402890	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008783	ATTAT	2	10	409523	409532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008783	TTTGA	2	10	414694	414703	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008783	TAATT	2	10	414820	414829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008783	GAAGT	2	10	423051	423060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008783	ATTGC	2	10	423408	423417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008783	AAATT	2	10	423604	423613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008783	TATTT	2	10	426657	426666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008783	TTATT	2	10	428227	428236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008783	TTTTA	2	10	428312	428321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008783	ATAGA	2	10	430254	430263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008783	GAAAT	2	10	436849	436858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008783	GCTAT	2	10	456459	456468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008783	AAAAT	2	10	458797	458806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008783	CTTAC	2	10	462866	462875	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008783	TTGTT	2	10	472383	472392	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008783	GATTA	2	10	475857	475866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008783	GAGAA	2	10	482543	482552	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008783	GATTG	2	10	482568	482577	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008783	TTTTA	2	10	485276	485285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008783	CGTTT	2	10	494798	494807	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008783	TTGAT	2	10	500681	500690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008783	TTCTT	2	10	510003	510012	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008783	GATGA	2	10	515049	515058	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008783	TGCAA	2	10	516020	516029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008783	GCTTA	2	10	519160	519169	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008783	TATTT	2	10	519189	519198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008783	AGTTC	2	10	519229	519238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008783	CTAAA	2	10	523045	523054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008783	TTAGT	2	10	523278	523287	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008783	ATTTT	2	10	527892	527901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008783	TTATG	2	10	537736	537745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008783	TTCTG	2	10	551538	551547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008783	GAAAG	2	10	558741	558750	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008783	AGGAA	2	10	562839	562848	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008783	TGTCC	2	10	576377	576386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008783	TTTAA	2	10	577214	577223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008783	ATTTT	2	10	587546	587555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008783	AGTAC	2	10	596231	596240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008783	TTTCT	2	10	602150	602159	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008783	AGATA	2	10	602497	602506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008783	ATTTT	2	10	620003	620012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_008783	TGTTT	2	10	1254110	1254119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_008783	TTTTA	2	10	1316797	1316806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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316	NC_008783	TATTT	2	10	1444962	1444971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.