MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 3866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008782	ATTGT	2	10	1	10	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008782	GCCCA	2	10	2164	2173	20 %	0 %	20 %	60 %	121592439
3	NC_008782	GGGCG	2	10	2928	2937	0 %	0 %	80 %	20 %	121592439
4	NC_008782	CGCGG	2	10	3494	3503	0 %	0 %	60 %	40 %	121592439
5	NC_008782	GCTTG	2	10	6215	6224	0 %	40 %	40 %	20 %	121592441
6	NC_008782	CAGGG	2	10	6966	6975	20 %	0 %	60 %	20 %	121592442
7	NC_008782	GCGCC	2	10	7004	7013	0 %	0 %	40 %	60 %	121592442
8	NC_008782	CCGCC	2	10	8202	8211	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_008782	AGGGC	2	10	9800	9809	20 %	0 %	60 %	20 %	121592445
10	NC_008782	CCGCC	2	10	10787	10796	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_008782	GCCCG	2	10	11634	11643	0 %	0 %	40 %	60 %	121592446
12	NC_008782	CCCCG	2	10	13057	13066	0 %	0 %	20 %	80 %	121592446
13	NC_008782	GGCCG	2	10	14482	14491	0 %	0 %	60 %	40 %	121592448
14	NC_008782	TGGCG	2	10	15091	15100	0 %	20 %	60 %	20 %	121592448
15	NC_008782	CCGCG	2	10	15151	15160	0 %	0 %	40 %	60 %	121592448
16	NC_008782	TGCGC	2	10	15715	15724	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008782	ACCGT	2	10	17684	17693	20 %	20 %	20 %	40 %	121592451
18	NC_008782	GCGCG	2	10	17880	17889	0 %	0 %	60 %	40 %	121592451
19	NC_008782	GCTGC	2	10	18652	18661	0 %	20 %	40 %	40 %	121592453
20	NC_008782	GGGCG	2	10	19014	19023	0 %	0 %	80 %	20 %	121592453
21	NC_008782	CGCGG	2	10	19025	19034	0 %	0 %	60 %	40 %	121592453
22	NC_008782	TGCGC	2	10	19523	19532	0 %	20 %	40 %	40 %	121592455
23	NC_008782	GGGCG	2	10	20327	20336	0 %	0 %	80 %	20 %	121592455
24	NC_008782	CGCGG	2	10	21300	21309	0 %	0 %	60 %	40 %	121592455
25	NC_008782	GACCA	2	10	22518	22527	40 %	0 %	20 %	40 %	121592456
26	NC_008782	GCGCA	2	10	23169	23178	20 %	0 %	40 %	40 %	121592456
27	NC_008782	TTTTG	2	10	24565	24574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008782	GCGCC	2	10	24901	24910	0 %	0 %	40 %	60 %	121592458
29	NC_008782	AGGCC	2	10	25010	25019	20 %	0 %	40 %	40 %	121592458
30	NC_008782	TGCCA	2	10	26748	26757	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008782	GGCTT	2	10	27208	27217	0 %	40 %	40 %	20 %	121592461
32	NC_008782	GGCGC	2	10	27276	27285	0 %	0 %	60 %	40 %	121592461
33	NC_008782	GCCGG	2	10	27834	27843	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_008782	CGCGC	2	10	30947	30956	0 %	0 %	40 %	60 %	121592464
35	NC_008782	TGGAG	2	10	34187	34196	20 %	20 %	60 %	0 %	121592468
36	NC_008782	GCTGC	2	10	34221	34230	0 %	20 %	40 %	40 %	121592468
37	NC_008782	GCAAG	2	10	35353	35362	40 %	0 %	40 %	20 %	121592469
38	NC_008782	TGGCG	2	10	36055	36064	0 %	20 %	60 %	20 %	121592470
39	NC_008782	CCGGG	2	10	36220	36229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008782	GCCAC	2	10	36966	36975	20 %	0 %	20 %	60 %	121592471
41	NC_008782	TCCAT	2	10	38747	38756	20 %	40 %	0 %	40 %	121592473
42	NC_008782	GCCGG	2	10	39664	39673	0 %	0 %	60 %	40 %	121592474
43	NC_008782	CTGGG	2	10	40271	40280	0 %	20 %	60 %	20 %	121592475
44	NC_008782	GCGGT	2	10	40347	40356	0 %	20 %	60 %	20 %	121592475
45	NC_008782	GCGCC	2	10	40458	40467	0 %	0 %	40 %	60 %	121592475
46	NC_008782	CCGGC	2	10	40566	40575	0 %	0 %	40 %	60 %	121592475
47	NC_008782	GCGCT	2	10	42859	42868	0 %	20 %	40 %	40 %	121592477
48	NC_008782	GTGAA	2	10	42937	42946	40 %	20 %	40 %	0 %	121592477
49	NC_008782	GGCCC	2	10	44273	44282	0 %	0 %	40 %	60 %	121592478
50	NC_008782	CGCGC	2	10	45016	45025	0 %	0 %	40 %	60 %	121592479
51	NC_008782	CGCAG	2	10	45281	45290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008782	GCCGT	2	10	48398	48407	0 %	20 %	40 %	40 %	121592482
53	NC_008782	GCTGC	2	10	49390	49399	0 %	20 %	40 %	40 %	121592483
54	NC_008782	GCGCG	2	10	49470	49479	0 %	0 %	60 %	40 %	121592483
55	NC_008782	TGGTC	2	10	51860	51869	0 %	40 %	40 %	20 %	121592485
56	NC_008782	TCTGC	2	10	52772	52781	0 %	40 %	20 %	40 %	121592485
57	NC_008782	GCCCA	2	10	54419	54428	20 %	0 %	20 %	60 %	121592486
58	NC_008782	CGGCG	2	10	54922	54931	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008782	CCCGC	2	10	55050	55059	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_008782	GCCGG	2	10	55122	55131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008782	CCGCG	2	10	56242	56251	0 %	0 %	40 %	60 %	121592487
62	NC_008782	GCGCC	2	10	56518	56527	0 %	0 %	40 %	60 %	121592487
63	NC_008782	CGCTG	2	10	57241	57250	0 %	20 %	40 %	40 %	121592487
64	NC_008782	CTTGC	2	10	57341	57350	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008782	AGCGC	2	10	60148	60157	20 %	0 %	40 %	40 %	121592490
66	NC_008782	GCCGA	2	10	60726	60735	20 %	0 %	40 %	40 %	121592490
67	NC_008782	GCGTG	2	10	62805	62814	0 %	20 %	60 %	20 %	121592492
68	NC_008782	GCCGT	2	10	63122	63131	0 %	20 %	40 %	40 %	121592492
69	NC_008782	TGCGC	2	10	63358	63367	0 %	20 %	40 %	40 %	121592492
70	NC_008782	GACCT	2	10	68768	68777	20 %	20 %	20 %	40 %	121592498
71	NC_008782	CGCAA	2	10	70913	70922	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_008782	GCGCC	2	10	73143	73152	0 %	0 %	40 %	60 %	121592504
73	NC_008782	GCACG	2	10	73251	73260	20 %	0 %	40 %	40 %	121592504
74	NC_008782	CGTGC	2	10	73440	73449	0 %	20 %	40 %	40 %	121592504
75	NC_008782	CGTGC	2	10	74051	74060	0 %	20 %	40 %	40 %	121592505
76	NC_008782	GCTGG	2	10	74411	74420	0 %	20 %	60 %	20 %	121592505
77	NC_008782	ACGGC	2	10	74674	74683	20 %	0 %	40 %	40 %	121592505
78	NC_008782	CAGGC	2	10	74893	74902	20 %	0 %	40 %	40 %	121592506
79	NC_008782	CCAGC	2	10	75018	75027	20 %	0 %	20 %	60 %	121592506
80	NC_008782	TGCGC	2	10	76787	76796	0 %	20 %	40 %	40 %	121592507
81	NC_008782	GCGCG	2	10	78210	78219	0 %	0 %	60 %	40 %	121592509
82	NC_008782	GCCGC	2	10	80131	80140	0 %	0 %	40 %	60 %	121592511
83	NC_008782	GCCGA	2	10	81032	81041	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008782	GCGCG	2	10	83550	83559	0 %	0 %	60 %	40 %	121592515
85	NC_008782	GTCCA	2	10	86482	86491	20 %	20 %	20 %	40 %	121592516
86	NC_008782	CGGCC	2	10	86876	86885	0 %	0 %	40 %	60 %	121592517
87	NC_008782	TGGCG	2	10	87200	87209	0 %	20 %	60 %	20 %	121592517
88	NC_008782	GCCCT	2	10	89339	89348	0 %	20 %	20 %	60 %	121592519
89	NC_008782	CCGCG	2	10	90146	90155	0 %	0 %	40 %	60 %	121592519
90	NC_008782	CGCAG	2	10	90637	90646	20 %	0 %	40 %	40 %	121592520
91	NC_008782	GCCGC	2	10	91555	91564	0 %	0 %	40 %	60 %	121592522
92	NC_008782	GTGGC	2	10	93103	93112	0 %	20 %	60 %	20 %	121592522
93	NC_008782	TGGCC	2	10	93290	93299	0 %	20 %	40 %	40 %	121592522
94	NC_008782	CGTTG	2	10	93353	93362	0 %	40 %	40 %	20 %	121592522
95	NC_008782	GCCGC	2	10	95755	95764	0 %	0 %	40 %	60 %	121592523
96	NC_008782	AGTGG	2	10	98152	98161	20 %	20 %	60 %	0 %	121592524
97	NC_008782	TTCAC	2	10	99485	99494	20 %	40 %	0 %	40 %	121592525
98	NC_008782	AGCGC	2	10	99563	99572	20 %	0 %	40 %	40 %	121592525
99	NC_008782	GACCA	2	10	101913	101922	40 %	0 %	20 %	40 %	121592527
100	NC_008782	CCGGC	2	10	103319	103328	0 %	0 %	40 %	60 %	121592528
101	NC_008782	TGAGC	2	10	103422	103431	20 %	20 %	40 %	20 %	121592528
102	NC_008782	GCGCG	2	10	103605	103614	0 %	0 %	60 %	40 %	121592528
103	NC_008782	GCCGC	2	10	104060	104069	0 %	0 %	40 %	60 %	121592528
104	NC_008782	GCTGC	2	10	104593	104602	0 %	20 %	40 %	40 %	121592529
105	NC_008782	GCTCG	2	10	107301	107310	0 %	20 %	40 %	40 %	121592531
106	NC_008782	GCGGG	2	10	107571	107580	0 %	0 %	80 %	20 %	121592531
107	NC_008782	CGTGC	2	10	108064	108073	0 %	20 %	40 %	40 %	121592531
108	NC_008782	CGGCG	2	10	109034	109043	0 %	0 %	60 %	40 %	121592532
109	NC_008782	GCGCT	2	10	109883	109892	0 %	20 %	40 %	40 %	121592533
110	NC_008782	GGCCG	2	10	110405	110414	0 %	0 %	60 %	40 %	121592533
111	NC_008782	GCTGT	2	10	110788	110797	0 %	40 %	40 %	20 %	121592533
112	NC_008782	GCGCC	2	10	111117	111126	0 %	0 %	40 %	60 %	121592534
113	NC_008782	ACGCG	2	10	113039	113048	20 %	0 %	40 %	40 %	121592536
114	NC_008782	CGCGC	2	10	113890	113899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_008782	GCCTG	2	10	118259	118268	0 %	20 %	40 %	40 %	121592540
116	NC_008782	ACCGC	2	10	118544	118553	20 %	0 %	20 %	60 %	121592540
117	NC_008782	CTGGC	2	10	119020	119029	0 %	20 %	40 %	40 %	121592540
118	NC_008782	TTGAT	2	10	119233	119242	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008782	GGCCA	2	10	119421	119430	20 %	0 %	40 %	40 %	121592541
120	NC_008782	CGCTG	2	10	122345	122354	0 %	20 %	40 %	40 %	121592544
121	NC_008782	GCCCG	2	10	122681	122690	0 %	0 %	40 %	60 %	121592544
122	NC_008782	CACGA	2	10	124966	124975	40 %	0 %	20 %	40 %	121592547
123	NC_008782	CAAAC	2	10	126796	126805	60 %	0 %	0 %	40 %	121592548
124	NC_008782	CCAGG	2	10	127992	128001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_008782	AGCTC	2	10	128225	128234	20 %	20 %	20 %	40 %	121592550
126	NC_008782	TGGTC	2	10	128477	128486	0 %	40 %	40 %	20 %	121592550
127	NC_008782	GGCCG	2	10	130443	130452	0 %	0 %	60 %	40 %	121592551
128	NC_008782	CGGGC	2	10	130496	130505	0 %	0 %	60 %	40 %	121592551
129	NC_008782	CCAGC	2	10	130745	130754	20 %	0 %	20 %	60 %	121592552
130	NC_008782	GGCCA	2	10	134898	134907	20 %	0 %	40 %	40 %	121592555
131	NC_008782	CTGGG	2	10	135533	135542	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008782	CGGCC	2	10	136884	136893	0 %	0 %	40 %	60 %	121592557
133	NC_008782	CGCGC	2	10	136943	136952	0 %	0 %	40 %	60 %	121592557
134	NC_008782	GGCCA	2	10	137593	137602	20 %	0 %	40 %	40 %	121592558
135	NC_008782	TGCGC	2	10	141764	141773	0 %	20 %	40 %	40 %	121592561
136	NC_008782	GCGCT	2	10	142131	142140	0 %	20 %	40 %	40 %	121592561
137	NC_008782	CGCTG	2	10	144062	144071	0 %	20 %	40 %	40 %	121592563
138	NC_008782	GCGCG	2	10	146964	146973	0 %	0 %	60 %	40 %	121592566
139	NC_008782	TGGCG	2	10	147481	147490	0 %	20 %	60 %	20 %	121592567
140	NC_008782	CCGCG	2	10	148036	148045	0 %	0 %	40 %	60 %	121592567
141	NC_008782	GACCA	2	10	153391	153400	40 %	0 %	20 %	40 %	121592572
142	NC_008782	CGGCG	2	10	154959	154968	0 %	0 %	60 %	40 %	121592574
143	NC_008782	CGGGC	2	10	156991	157000	0 %	0 %	60 %	40 %	121592575
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147	NC_008782	CGTGG	2	10	161507	161516	0 %	20 %	60 %	20 %	121592580
148	NC_008782	GCGCA	2	10	161542	161551	20 %	0 %	40 %	40 %	121592580
149	NC_008782	GGGCA	2	10	161564	161573	20 %	0 %	60 %	20 %	121592580
150	NC_008782	CGTGC	2	10	161991	162000	0 %	20 %	40 %	40 %	121592581
151	NC_008782	CGCGT	2	10	163047	163056	0 %	20 %	40 %	40 %	121592581
152	NC_008782	CGCCT	2	10	165700	165709	0 %	20 %	20 %	60 %	121592582
153	NC_008782	CAGCG	2	10	166179	166188	20 %	0 %	40 %	40 %	121592582
154	NC_008782	CAGGC	2	10	167427	167436	20 %	0 %	40 %	40 %	121592583
155	NC_008782	GGCGC	2	10	168316	168325	0 %	0 %	60 %	40 %	121592584
156	NC_008782	GCCCG	2	10	169191	169200	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_008782	GGCCT	2	10	169691	169700	0 %	20 %	40 %	40 %	121592586
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159	NC_008782	GTTGC	2	10	172266	172275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_008782	CCAGC	2	10	173450	173459	20 %	0 %	20 %	60 %	121592589
161	NC_008782	CGTGG	2	10	174543	174552	0 %	20 %	60 %	20 %	121592590
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171	NC_008782	GGCCT	2	10	184014	184023	0 %	20 %	40 %	40 %	121592599
172	NC_008782	GGCCT	2	10	184623	184632	0 %	20 %	40 %	40 %	121592599
173	NC_008782	CGCGC	2	10	185553	185562	0 %	0 %	40 %	60 %	121592600
174	NC_008782	CGCTG	2	10	185703	185712	0 %	20 %	40 %	40 %	121592600
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177	NC_008782	GCTGG	2	10	187830	187839	0 %	20 %	60 %	20 %	121592602
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179	NC_008782	GCGGT	2	10	188916	188925	0 %	20 %	60 %	20 %	121592603
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181	NC_008782	GCCAG	2	10	193654	193663	20 %	0 %	40 %	40 %	121592609
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183	NC_008782	GCGCT	2	10	196836	196845	0 %	20 %	40 %	40 %	121592612
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186	NC_008782	GCGTT	2	10	198572	198581	0 %	40 %	40 %	20 %	121592615
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203	NC_008782	CGGGT	2	10	212743	212752	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
204	NC_008782	GGCCA	2	10	213210	213219	20 %	0 %	40 %	40 %	121592630
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222	NC_008782	GGTTC	2	10	231369	231378	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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239	NC_008782	CGCTG	2	10	260583	260592	0 %	20 %	40 %	40 %	121592678
240	NC_008782	GCCAG	2	10	261359	261368	20 %	0 %	40 %	40 %	121592679
241	NC_008782	GGCGC	2	10	263922	263931	0 %	0 %	60 %	40 %	121592682
242	NC_008782	CGGGC	2	10	264888	264897	0 %	0 %	60 %	40 %	121592683
243	NC_008782	GCGCG	2	10	266545	266554	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
244	NC_008782	CGCGG	2	10	267073	267082	0 %	0 %	60 %	40 %	121592684
245	NC_008782	CCCGC	2	10	267765	267774	0 %	0 %	20 %	80 %	121592685
246	NC_008782	CACGC	2	10	268208	268217	20 %	0 %	20 %	60 %	121592685
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248	NC_008782	GACAT	2	10	271447	271456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
249	NC_008782	GTCGC	2	10	272167	272176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
250	NC_008782	GGCAC	2	10	275318	275327	20 %	0 %	40 %	40 %	121592694
251	NC_008782	GTGGG	2	10	275470	275479	0 %	20 %	80 %	0 %	121592695
252	NC_008782	GCGCC	2	10	277495	277504	0 %	0 %	40 %	60 %	121592696
253	NC_008782	AAAAC	2	10	280418	280427	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_008782	GCCGT	2	10	284579	284588	0 %	20 %	40 %	40 %	121592703
255	NC_008782	CGCGG	2	10	285216	285225	0 %	0 %	60 %	40 %	121592703
256	NC_008782	GGCTG	2	10	285363	285372	0 %	20 %	60 %	20 %	121592703
257	NC_008782	GATCT	2	10	288604	288613	20 %	40 %	20 %	20 %	121592708
258	NC_008782	GAAGT	2	10	288685	288694	40 %	20 %	40 %	0 %	121592708
259	NC_008782	GTTCG	2	10	293334	293343	0 %	40 %	40 %	20 %	121592712
260	NC_008782	GCGCG	2	10	294814	294823	0 %	0 %	60 %	40 %	121592715
261	NC_008782	CCGCT	2	10	295240	295249	0 %	20 %	20 %	60 %	121592715
262	NC_008782	GTCGC	2	10	295582	295591	0 %	20 %	40 %	40 %	121592715
263	NC_008782	GTCGC	2	10	295712	295721	0 %	20 %	40 %	40 %	121592716
264	NC_008782	GGCCA	2	10	298625	298634	20 %	0 %	40 %	40 %	121592722
265	NC_008782	GAAAC	2	10	299614	299623	60 %	0 %	20 %	20 %	121592724
266	NC_008782	CAGGC	2	10	299842	299851	20 %	0 %	40 %	40 %	121592724
267	NC_008782	TTCCC	2	10	300164	300173	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
268	NC_008782	GCGCC	2	10	302003	302012	0 %	0 %	40 %	60 %	121592727
269	NC_008782	GGCGC	2	10	303255	303264	0 %	0 %	60 %	40 %	121592728
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