MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 1635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008782	CCTT	2	8	735	742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008782	CCGC	2	8	1983	1990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008782	TTCC	2	8	2111	2118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008782	CTCC	2	8	5254	5261	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_008782	CGGC	2	8	7279	7286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008782	ACGG	2	8	14220	14227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008782	CCCT	2	8	15512	15519	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_008782	TTTG	2	8	15693	15700	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008782	CGGC	2	8	18469	18476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008782	GGTT	2	8	18478	18485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008782	ACGC	2	8	23608	23615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008782	ATCC	2	8	24620	24627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008782	AGGG	2	8	25931	25938	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008782	GCAC	2	8	26020	26027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008782	AAAC	2	8	27779	27786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008782	GGGC	2	8	36273	36280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008782	GCCG	2	8	37575	37582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008782	GCCT	2	8	39795	39802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008782	CTTC	2	8	42586	42593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008782	GTGG	2	8	42601	42608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008782	TCTA	2	8	43849	43856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008782	CCCG	2	8	43896	43903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008782	CAGC	2	8	44481	44488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008782	GCAG	2	8	47403	47410	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008782	CCGG	2	8	49137	49144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008782	GCAG	2	8	49145	49152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008782	GATT	2	8	49950	49957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008782	AGGT	2	8	55803	55810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008782	GTGC	2	8	55872	55879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008782	TGGG	2	8	55932	55939	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008782	CGGG	2	8	57386	57393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008782	CGGC	2	8	57696	57703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008782	CGGC	2	8	57738	57745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008782	CGTG	2	8	57755	57762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008782	ATCA	2	8	68329	68336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008782	GGCG	2	8	78454	78461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008782	CGCA	2	8	78469	78476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008782	TGTC	2	8	83126	83133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008782	GCGG	2	8	83245	83252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008782	TGCG	2	8	93686	93693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008782	ATAG	2	8	98574	98581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008782	CGGC	2	8	108329	108336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008782	CGGG	2	8	109451	109458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008782	CAGC	2	8	112141	112148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008782	CGGC	2	8	112158	112165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008782	GCGG	2	8	112723	112730	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008782	CCGC	2	8	113815	113822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008782	CAAG	2	8	113862	113869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008782	AGGG	2	8	113958	113965	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008782	TGCG	2	8	116244	116251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008782	CAGC	2	8	120131	120138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008782	CTAT	2	8	121056	121063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008782	CGCC	2	8	124557	124564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_008782	GCTG	2	8	128029	128036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008782	GCCG	2	8	131979	131986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008782	GCCC	2	8	134323	134330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008782	GCGG	2	8	134349	134356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008782	CAAA	2	8	134396	134403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008782	GCAG	2	8	135412	135419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008782	CGGC	2	8	135504	135511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008782	TCAT	2	8	138857	138864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008782	TTCA	2	8	147161	147168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008782	GGGC	2	8	148198	148205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008782	GCAG	2	8	150592	150599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008782	GGCA	2	8	150816	150823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008782	CTTG	2	8	161619	161626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008782	TGCG	2	8	161666	161673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008782	TGGC	2	8	163168	163175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008782	AACC	2	8	163196	163203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008782	TGCC	2	8	163261	163268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008782	GCCG	2	8	163325	163332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008782	CGTG	2	8	163393	163400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008782	TGTC	2	8	169094	169101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008782	CGGC	2	8	169161	169168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008782	CCCG	2	8	179047	179054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_008782	AAGG	2	8	180824	180831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008782	TCCC	2	8	183717	183724	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_008782	GCCC	2	8	185247	185254	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_008782	GGGC	2	8	189559	189566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008782	CCTG	2	8	191538	191545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008782	TTCC	2	8	191573	191580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008782	TGGC	2	8	192461	192468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008782	GGAT	2	8	197741	197748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008782	ATTG	2	8	205854	205861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008782	CGGG	2	8	221704	221711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008782	TGCC	2	8	222138	222145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008782	GCGG	2	8	225781	225788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008782	GGCG	2	8	232893	232900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008782	GCAC	2	8	233581	233588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008782	CGCA	2	8	234778	234785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008782	CAAA	2	8	235291	235298	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008782	GGGC	2	8	245495	245502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008782	TGCT	2	8	262432	262439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008782	TGCG	2	8	270388	270395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008782	CAGG	2	8	270472	270479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008782	AGGA	2	8	271515	271522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008782	CGGC	2	8	272045	272052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008782	CGCC	2	8	272150	272157	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_008782	GGGC	2	8	279831	279838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008782	GGTG	2	8	283634	283641	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008782	CTGC	2	8	283700	283707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008782	GCGG	2	8	284302	284309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008782	TTGA	2	8	289014	289021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008782	TTGC	2	8	292927	292934	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008782	CTTG	2	8	292978	292985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008782	CGGC	2	8	301387	301394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008782	CCAG	2	8	301472	301479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008782	CCTT	2	8	309482	309489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008782	AGAA	2	8	309778	309785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008782	AAGA	2	8	310848	310855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008782	GGCC	2	8	314770	314777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008782	TGGG	2	8	315306	315313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008782	GCCA	2	8	315349	315356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008782	TGGA	2	8	318195	318202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008782	TGCA	2	8	324065	324072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008782	CGGC	2	8	326300	326307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008782	CGCC	2	8	326945	326952	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_008782	TCGC	2	8	328520	328527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008782	TGGC	2	8	328635	328642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008782	GCTC	2	8	329719	329726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008782	GCCG	2	8	330774	330781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008782	CAGG	2	8	331104	331111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008782	CTGG	2	8	331366	331373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008782	GGTG	2	8	332983	332990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008782	TCCA	3	12	333033	333044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008782	TGTA	2	8	333045	333052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008782	AGTG	2	8	334884	334891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008782	GGTC	2	8	335044	335051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008782	GCCC	2	8	342403	342410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_008782	ACGG	2	8	343324	343331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008782	TCAA	2	8	344831	344838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008782	CCTC	2	8	344841	344848	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_008782	GGGC	2	8	351490	351497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008782	TCAG	2	8	361941	361948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008782	CCGT	2	8	361970	361977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008782	GCCA	2	8	362026	362033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008782	TGGG	2	8	362041	362048	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008782	ACCG	2	8	362070	362077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008782	CCCG	2	8	362262	362269	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_008782	CCGA	2	8	364419	364426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008782	TGAC	2	8	371751	371758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008782	TCGT	2	8	375305	375312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008782	TTCA	2	8	375423	375430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008782	AAGC	2	8	379426	379433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008782	TGCC	2	8	386791	386798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008782	GCAG	2	8	386835	386842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008782	TCCA	2	8	387030	387037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008782	GCCG	2	8	389386	389393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008782	GCCG	2	8	392576	392583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008782	TGGC	2	8	399439	399446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008782	TGCG	2	8	401507	401514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008782	GACT	2	8	405220	405227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008782	GCAG	2	8	406857	406864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_008782	CGGA	2	8	414293	414300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_008782	GATG	2	8	420367	420374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008782	GCCC	2	8	423228	423235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
157	NC_008782	GGCG	2	8	435120	435127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008782	GGCT	2	8	435224	435231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_008782	CGCC	2	8	435303	435310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
160	NC_008782	GAGC	2	8	435580	435587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_008782	CCGG	2	8	436649	436656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_008782	GCTG	2	8	436682	436689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_008782	GATC	2	8	437097	437104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_008782	GAGC	2	8	437342	437349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_008782	CCCG	2	8	458282	458289	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
170	NC_008782	TTAT	2	8	465169	465176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008782	TCGT	2	8	468905	468912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_008782	GGGC	2	8	469287	469294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
173	NC_008782	GGCG	2	8	474038	474045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
174	NC_008782	GGCG	2	8	475226	475233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
175	NC_008782	GACG	2	8	475234	475241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_008782	CGCC	2	8	475242	475249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
177	NC_008782	GCGG	2	8	476375	476382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
178	NC_008782	GACG	2	8	476410	476417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
179	NC_008782	GCCG	3	12	476420	476431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_008782	TGTC	2	8	477746	477753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_008782	TGGA	2	8	480135	480142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008782	TTGC	2	8	482317	482324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_008782	TTTC	2	8	490186	490193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_008782	GACC	2	8	492221	492228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_008782	GGCC	2	8	500285	500292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_008782	GCAT	2	8	501566	501573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
188	NC_008782	CTGC	2	8	502812	502819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
189	NC_008782	TGAG	2	8	503644	503651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_008782	CCCA	2	8	503894	503901	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
191	NC_008782	CTTG	2	8	512783	512790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_008782	AACC	2	8	525452	525459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_008782	AATC	2	8	536483	536490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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229	NC_008782	TGCA	2	8	633266	633273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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231	NC_008782	GGGC	2	8	639864	639871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
232	NC_008782	GCCT	2	8	639897	639904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
233	NC_008782	ATGG	2	8	645504	645511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
234	NC_008782	GCGG	2	8	647151	647158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
235	NC_008782	GGCG	2	8	650446	650453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
236	NC_008782	CGTG	2	8	655509	655516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_008782	ATGG	2	8	1375099	1375106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_008782	GCCG	2	8	1376218	1376225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_008782	TCGC	2	8	1382519	1382526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_008782	CAGT	2	8	1382568	1382575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_008782	CCTC	2	8	1384747	1384754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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497	NC_008782	GAGC	2	8	1408149	1408156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_008782	TGGA	2	8	1408234	1408241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008782	AGCG	2	8	1408788	1408795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_008782	CCAC	2	8	1408806	1408813	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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