MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 80604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008782	CGC	2	6	186	191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008782	GCT	2	6	193	198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008782	CTG	2	6	254	259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592437
4	NC_008782	GTG	2	6	260	265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592437
5	NC_008782	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592437
6	NC_008782	GCC	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592437
7	NC_008782	CGC	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592437
8	NC_008782	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592437
9	NC_008782	CGG	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592437
10	NC_008782	CGC	2	6	468	473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592437
11	NC_008782	TGG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592437
12	NC_008782	GCG	2	6	618	623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592437
13	NC_008782	ACC	2	6	639	644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592437
14	NC_008782	GCG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008782	GCC	2	6	754	759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008782	CAC	2	6	854	859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592438
17	NC_008782	CGA	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
18	NC_008782	TCA	2	6	910	915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592438
19	NC_008782	GCT	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592438
20	NC_008782	GGC	2	6	953	958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592438
21	NC_008782	TGG	2	6	967	972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592438
22	NC_008782	AGC	2	6	975	980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
23	NC_008782	TGC	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592438
24	NC_008782	GAC	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
25	NC_008782	TCG	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592438
26	NC_008782	TGG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592438
27	NC_008782	CAC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592438
28	NC_008782	TGC	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592438
29	NC_008782	CTG	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592438
30	NC_008782	CGC	2	6	1309	1314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592438
31	NC_008782	TCA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592438
32	NC_008782	ACC	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592438
33	NC_008782	GGC	2	6	1434	1439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592438
34	NC_008782	GGC	2	6	1448	1453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592438
35	NC_008782	GGC	2	6	1514	1519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592438
36	NC_008782	GCG	2	6	1564	1569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592438
37	NC_008782	GCC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592438
38	NC_008782	TGA	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592438
39	NC_008782	CAG	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
40	NC_008782	AGC	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
41	NC_008782	CCG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592438
42	NC_008782	CAG	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
43	NC_008782	CGC	2	6	1730	1735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592438
44	NC_008782	TGA	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592438
45	NC_008782	AGG	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592438
46	NC_008782	GCC	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592438
47	NC_008782	GCA	2	6	1877	1882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592438
48	NC_008782	CGC	2	6	1905	1910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592438
49	NC_008782	AGG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008782	TTC	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008782	CGC	2	6	2031	2036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008782	CCG	2	6	2041	2046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008782	GCC	2	6	2100	2105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008782	GCT	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
55	NC_008782	CAG	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
56	NC_008782	GTG	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592439
57	NC_008782	CGC	2	6	2415	2420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592439
58	NC_008782	GCC	2	6	2428	2433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592439
59	NC_008782	CAG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
60	NC_008782	GCT	2	6	2481	2486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
61	NC_008782	CAT	2	6	2505	2510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592439
62	NC_008782	AGG	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592439
63	NC_008782	GCT	2	6	2610	2615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
64	NC_008782	GGA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592439
65	NC_008782	CAG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
66	NC_008782	GCA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
67	NC_008782	GCG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592439
68	NC_008782	CTT	2	6	2838	2843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592439
69	NC_008782	GCT	2	6	2877	2882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
70	NC_008782	CTG	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
71	NC_008782	GCT	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
72	NC_008782	GCG	2	6	3074	3079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592439
73	NC_008782	GTG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592439
74	NC_008782	TGG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592439
75	NC_008782	AGC	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
76	NC_008782	GCA	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
77	NC_008782	CAC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592439
78	NC_008782	GCA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
79	NC_008782	CTG	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
80	NC_008782	TGC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
81	NC_008782	GAG	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592439
82	NC_008782	TGC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
83	NC_008782	TGC	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
84	NC_008782	GAC	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
85	NC_008782	GCC	2	6	3709	3714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592439
86	NC_008782	CTG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
87	NC_008782	GGA	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592439
88	NC_008782	GCC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592439
89	NC_008782	CCA	2	6	3791	3796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592439
90	NC_008782	GGC	2	6	3798	3803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592439
91	NC_008782	GAC	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
92	NC_008782	TCG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
93	NC_008782	ACG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592439
94	NC_008782	CAT	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592439
95	NC_008782	GCC	2	6	3976	3981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592439
96	NC_008782	CTG	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
97	NC_008782	CTG	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592439
98	NC_008782	CGC	2	6	4131	4136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592439
99	NC_008782	CAG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592440
100	NC_008782	GCC	2	6	4321	4326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592440
101	NC_008782	GGC	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592440
102	NC_008782	CAC	3	9	4405	4413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592440
103	NC_008782	CAG	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592440
104	NC_008782	CAG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592440
105	NC_008782	GCG	2	6	4611	4616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592440
106	NC_008782	GCC	2	6	4766	4771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592440
107	NC_008782	CAC	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592440
108	NC_008782	TCG	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592440
109	NC_008782	ATT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008782	TCA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008782	CCG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592441
112	NC_008782	CTG	3	9	5298	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592441
113	NC_008782	GCC	2	6	5307	5312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592441
114	NC_008782	GCC	2	6	5359	5364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592441
115	NC_008782	CCG	2	6	5389	5394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592441
116	NC_008782	ATC	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592441
117	NC_008782	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592441
118	NC_008782	TGC	2	6	5494	5499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592441
119	NC_008782	GAT	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592441
120	NC_008782	AGA	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592441
121	NC_008782	TGG	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592441
122	NC_008782	AAC	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592441
123	NC_008782	TGG	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592441
124	NC_008782	TGC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592441
125	NC_008782	ACG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592441
126	NC_008782	AAG	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592441
127	NC_008782	CTA	2	6	6140	6145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592441
128	NC_008782	TCA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592441
129	NC_008782	GCT	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008782	AAT	2	6	6291	6296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008782	GTA	3	9	6374	6382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_008782	GCA	2	6	12630	12635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592446
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261	NC_008782	CGA	2	6	12708	12713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592446
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382	NC_008782	ATG	2	6	17834	17839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592451
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495	NC_008782	GCC	3	9	23627	23635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
496	NC_008782	CAA	2	6	23642	23647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_008782	CCT	2	6	23650	23655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
498	NC_008782	TAA	2	6	23737	23742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008782	GCT	2	6	23746	23751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_008782	CAG	2	6	23796	23801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592457

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