MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 68354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008781	GAA	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602920
2	NC_008781	TCG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
3	NC_008781	CAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602920
4	NC_008781	TGC	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
5	NC_008781	GGC	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602920
6	NC_008781	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602920
7	NC_008781	CGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
8	NC_008781	GGA	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121602920
9	NC_008781	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602920
10	NC_008781	TTG	2	6	3337	3342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602920
11	NC_008781	ACG	2	6	3412	3417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602920
12	NC_008781	ACC	2	6	3468	3473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602920
13	NC_008781	GCT	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
14	NC_008781	CGT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
15	NC_008781	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
16	NC_008781	GCC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602921
17	NC_008781	GTG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602921
18	NC_008781	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
19	NC_008781	GCG	2	6	4011	4016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
20	NC_008781	CAC	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602921
21	NC_008781	CAG	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602921
22	NC_008781	GCG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
23	NC_008781	TGC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
24	NC_008781	ATC	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602921
25	NC_008781	CAT	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602922
26	NC_008781	CAA	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602922
27	NC_008781	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602922
28	NC_008781	CAA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602922
29	NC_008781	GCA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602922
30	NC_008781	GCA	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602923
31	NC_008781	GTG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602923
32	NC_008781	GCC	2	6	5236	5241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602923
33	NC_008781	GGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602923
34	NC_008781	CTG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602923
35	NC_008781	TGC	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602923
36	NC_008781	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602923
37	NC_008781	GCC	2	6	5546	5551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602923
38	NC_008781	AGC	3	9	5898	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602924
39	NC_008781	CGG	2	6	5977	5982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
40	NC_008781	GGC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
41	NC_008781	AGC	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602924
42	NC_008781	GGC	2	6	6175	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
43	NC_008781	GGC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
44	NC_008781	CGG	2	6	6286	6291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
45	NC_008781	GCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
46	NC_008781	GCG	2	6	6360	6365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
47	NC_008781	GCC	2	6	6371	6376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602924
48	NC_008781	GCG	2	6	6390	6395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
49	NC_008781	GAT	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602925
50	NC_008781	GAA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602926
51	NC_008781	CCG	2	6	7054	7059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
52	NC_008781	GCA	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602926
53	NC_008781	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602926
54	NC_008781	CGC	2	6	7222	7227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
55	NC_008781	GAC	2	6	7310	7315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602926
56	NC_008781	TCG	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602926
57	NC_008781	CGG	2	6	7366	7371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602926
58	NC_008781	CGC	2	6	7403	7408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
59	NC_008781	GGC	2	6	7472	7477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602926
60	NC_008781	TGA	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602926
61	NC_008781	CGG	2	6	7630	7635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602926
62	NC_008781	TGG	3	9	7678	7686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602926
63	NC_008781	CGC	2	6	7696	7701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
64	NC_008781	CCA	2	6	7915	7920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602927
65	NC_008781	GGC	2	6	7953	7958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
66	NC_008781	CAG	2	6	7997	8002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
67	NC_008781	CTG	2	6	8171	8176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602927
68	NC_008781	GCG	3	9	8215	8223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
69	NC_008781	TGC	3	9	8238	8246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602927
70	NC_008781	GCG	2	6	8277	8282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
71	NC_008781	CAG	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
72	NC_008781	GCG	2	6	8340	8345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
73	NC_008781	GCC	2	6	8363	8368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602927
74	NC_008781	GCA	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
75	NC_008781	GCG	2	6	8464	8469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
76	NC_008781	GCC	2	6	8547	8552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602927
77	NC_008781	AGC	3	9	8568	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
78	NC_008781	GGT	2	6	8612	8617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602927
79	NC_008781	GCA	2	6	8625	8630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
80	NC_008781	CCG	2	6	8946	8951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602928
81	NC_008781	TGG	2	6	9017	9022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602928
82	NC_008781	AAC	2	6	9143	9148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602929
83	NC_008781	CGA	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602929
84	NC_008781	GCC	2	6	9245	9250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602929
85	NC_008781	TGC	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602929
86	NC_008781	TCA	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602929
87	NC_008781	GCG	2	6	9420	9425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602929
88	NC_008781	CAC	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602929
89	NC_008781	GCT	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602929
90	NC_008781	GAT	2	6	9512	9517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602929
91	NC_008781	TGG	2	6	9537	9542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602929
92	NC_008781	CGG	2	6	9688	9693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602930
93	NC_008781	CCA	2	6	9694	9699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602930
94	NC_008781	GCA	2	6	9706	9711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
95	NC_008781	TAA	2	6	9714	9719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121602930
96	NC_008781	ACG	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
97	NC_008781	CCA	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602930
98	NC_008781	CAG	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
99	NC_008781	CAG	2	6	9776	9781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
100	NC_008781	CAG	3	9	9851	9859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
101	NC_008781	GCT	2	6	9889	9894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602930
102	NC_008781	GCA	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
103	NC_008781	CAG	2	6	9923	9928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
104	NC_008781	CAG	2	6	10061	10066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
105	NC_008781	GGC	2	6	10125	10130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602930
106	NC_008781	CAG	3	9	10154	10162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
107	NC_008781	ATG	2	6	10197	10202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602930
108	NC_008781	CGC	2	6	10261	10266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602930
109	NC_008781	ACC	2	6	10269	10274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602930
110	NC_008781	CAG	2	6	10313	10318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
111	NC_008781	CAG	2	6	10364	10369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
112	NC_008781	AGC	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
113	NC_008781	CAG	2	6	10385	10390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
114	NC_008781	GGC	3	9	10397	10405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602930
115	NC_008781	CAG	2	6	10496	10501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
116	NC_008781	CCA	2	6	10553	10558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602930
117	NC_008781	CGG	2	6	10581	10586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602930
118	NC_008781	GCG	2	6	10645	10650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602931
119	NC_008781	CGG	2	6	10703	10708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602931
120	NC_008781	GCG	2	6	10739	10744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602931
121	NC_008781	AAG	2	6	10801	10806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602931
122	NC_008781	CAC	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602931
123	NC_008781	CCA	2	6	10821	10826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602931
124	NC_008781	CTC	2	6	10833	10838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121602931
125	NC_008781	TGT	2	6	10868	10873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602931
126	NC_008781	TGA	3	9	10925	10933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602931
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128	NC_008781	CAG	2	6	11070	11075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602931
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253	NC_008781	CGA	2	6	20499	20504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602940
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500	NC_008781	CCA	2	6	35107	35112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602954

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