MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Verminephrobacter eiseniae EF01-2 plasmid pVEIS01

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008771	ACTG	2	8	147	154	25 %	25 %	25 %	25 %	121583591
2	NC_008771	GGGC	2	8	1180	1187	0 %	0 %	75 %	25 %	121583591
3	NC_008771	TCAG	2	8	2661	2668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008771	TTGT	2	8	2800	2807	0 %	75 %	25 %	0 %	121583593
5	NC_008771	GCTT	2	8	3134	3141	0 %	50 %	25 %	25 %	121583593
6	NC_008771	CAAC	2	8	4362	4369	50 %	0 %	0 %	50 %	121583594
7	NC_008771	CGAA	2	8	5295	5302	50 %	0 %	25 %	25 %	121583594
8	NC_008771	CTTG	2	8	5880	5887	0 %	50 %	25 %	25 %	121583594
9	NC_008771	ACCC	2	8	5937	5944	25 %	0 %	0 %	75 %	121583594
10	NC_008771	AGCC	2	8	6866	6873	25 %	0 %	25 %	50 %	121583595
11	NC_008771	CTCA	2	8	7281	7288	25 %	25 %	0 %	50 %	121583595
12	NC_008771	GTGG	2	8	7367	7374	0 %	25 %	75 %	0 %	121583596
13	NC_008771	GTTC	2	8	7667	7674	0 %	50 %	25 %	25 %	121583596
14	NC_008771	CTTG	2	8	7680	7687	0 %	50 %	25 %	25 %	121583596
15	NC_008771	GCCC	2	8	7876	7883	0 %	0 %	25 %	75 %	121583596
16	NC_008771	GTGG	2	8	8138	8145	0 %	25 %	75 %	0 %	121583596
17	NC_008771	GTTT	2	8	8785	8792	0 %	75 %	25 %	0 %	121583597
18	NC_008771	TAGG	2	8	9082	9089	25 %	25 %	50 %	0 %	121583597
19	NC_008771	GAAT	2	8	9120	9127	50 %	25 %	25 %	0 %	121583597
20	NC_008771	GTTT	2	8	9156	9163	0 %	75 %	25 %	0 %	121583597
21	NC_008771	CCAA	2	8	9817	9824	50 %	0 %	0 %	50 %	121583598
22	NC_008771	CCGC	2	8	10314	10321	0 %	0 %	25 %	75 %	121583599
23	NC_008771	AATC	2	8	11605	11612	50 %	25 %	0 %	25 %	121583600
24	NC_008771	GTCA	2	8	11987	11994	25 %	25 %	25 %	25 %	121583600
25	NC_008771	CTTG	2	8	12294	12301	0 %	50 %	25 %	25 %	121583601
26	NC_008771	AAAT	2	8	12422	12429	75 %	25 %	0 %	0 %	121583601
27	NC_008771	GCAG	2	8	12455	12462	25 %	0 %	50 %	25 %	121583601
28	NC_008771	GCCA	2	8	12685	12692	25 %	0 %	25 %	50 %	121583601
29	NC_008771	CGTC	2	8	12779	12786	0 %	25 %	25 %	50 %	121583601
30	NC_008771	TTGC	2	8	13342	13349	0 %	50 %	25 %	25 %	121583601
31	NC_008771	ACTG	2	8	13983	13990	25 %	25 %	25 %	25 %	121583601
32	NC_008771	TCAT	2	8	14105	14112	25 %	50 %	0 %	25 %	121583601
33	NC_008771	CAGC	2	8	14687	14694	25 %	0 %	25 %	50 %	121583602
34	NC_008771	CCCA	2	8	14924	14931	25 %	0 %	0 %	75 %	121583603
35	NC_008771	GATT	2	8	15491	15498	25 %	50 %	25 %	0 %	121583604
36	NC_008771	CCTC	2	8	15785	15792	0 %	25 %	0 %	75 %	121583605
37	NC_008771	CCAT	2	8	16039	16046	25 %	25 %	0 %	50 %	121583605
38	NC_008771	CTCA	2	8	16315	16322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008771	CTTG	2	8	16426	16433	0 %	50 %	25 %	25 %	121583606
40	NC_008771	GCAG	2	8	16592	16599	25 %	0 %	50 %	25 %	121583606
41	NC_008771	CGGG	2	8	16825	16832	0 %	0 %	75 %	25 %	121583606
42	NC_008771	CTTG	2	8	16902	16909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008771	AGCG	2	8	16968	16975	25 %	0 %	50 %	25 %	121583607
44	NC_008771	CTGC	2	8	17197	17204	0 %	25 %	25 %	50 %	121583607
45	NC_008771	TGCT	2	8	17506	17513	0 %	50 %	25 %	25 %	121583608
46	NC_008771	TTCT	2	8	18453	18460	0 %	75 %	0 %	25 %	121583610
47	NC_008771	CTGC	2	8	18587	18594	0 %	25 %	25 %	50 %	121583610
48	NC_008771	GCAA	2	8	19837	19844	50 %	0 %	25 %	25 %	121583611
49	NC_008771	GACC	2	8	20658	20665	25 %	0 %	25 %	50 %	121583612
50	NC_008771	CAGG	2	8	20853	20860	25 %	0 %	50 %	25 %	121583613
51	NC_008771	GCTT	2	8	20939	20946	0 %	50 %	25 %	25 %	121583613
52	NC_008771	CCCG	2	8	22160	22167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_008771	CGAG	2	8	23291	23298	25 %	0 %	50 %	25 %	121583615
54	NC_008771	GCCG	2	8	23896	23903	0 %	0 %	50 %	50 %	121583617
55	NC_008771	GCAT	2	8	23910	23917	25 %	25 %	25 %	25 %	121583617
56	NC_008771	CCGG	2	8	24031	24038	0 %	0 %	50 %	50 %	121583618
57	NC_008771	CGGT	2	8	24188	24195	0 %	25 %	50 %	25 %	121583618
58	NC_008771	GGCC	2	8	24279	24286	0 %	0 %	50 %	50 %	121583618
59	NC_008771	GCAG	2	8	24643	24650	25 %	0 %	50 %	25 %	121583619
60	NC_008771	ATCC	2	8	25489	25496	25 %	25 %	0 %	50 %	121583621
61	NC_008771	GACG	2	8	25583	25590	25 %	0 %	50 %	25 %	121583622
62	NC_008771	GGCT	2	8	25603	25610	0 %	25 %	50 %	25 %	121583622
63	NC_008771	GCGG	2	8	26656	26663	0 %	0 %	75 %	25 %	121583623
64	NC_008771	CGCA	2	8	28572	28579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008771	TGAA	2	8	29435	29442	50 %	25 %	25 %	0 %	121583627
66	NC_008771	GAGC	2	8	29721	29728	25 %	0 %	50 %	25 %	121583627
67	NC_008771	ACGC	2	8	30109	30116	25 %	0 %	25 %	50 %	121583628

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.