MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Verminephrobacter eiseniae EF01-2 plasmid pVEIS01

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008771	AAC	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583591
2	NC_008771	TGG	2	6	239	244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583591
3	NC_008771	GCG	2	6	271	276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583591
4	NC_008771	TGG	2	6	410	415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583591
5	NC_008771	GTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583591
6	NC_008771	ACG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583591
7	NC_008771	GCG	2	6	731	736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583591
8	NC_008771	CAA	2	6	765	770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583591
9	NC_008771	ACA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583591
10	NC_008771	GCG	2	6	878	883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583591
11	NC_008771	ACG	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583591
12	NC_008771	TGG	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583592
13	NC_008771	GCC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
14	NC_008771	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583592
15	NC_008771	CAC	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583592
16	NC_008771	GCC	2	6	1683	1688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
17	NC_008771	GCC	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
18	NC_008771	TCG	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
19	NC_008771	GTC	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
20	NC_008771	CCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583592
21	NC_008771	TTG	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583592
22	NC_008771	TCG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
23	NC_008771	CTG	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583592
24	NC_008771	TGG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583592
25	NC_008771	GCT	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583593
26	NC_008771	TGG	2	6	2952	2957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583593
27	NC_008771	TTC	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583593
28	NC_008771	TGG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583593
29	NC_008771	CCA	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583593
30	NC_008771	CTT	2	6	3276	3281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583593
31	NC_008771	TGG	3	9	3285	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583593
32	NC_008771	GCG	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
33	NC_008771	GCG	3	9	3490	3498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
34	NC_008771	CGG	3	9	3537	3545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
35	NC_008771	GGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583593
36	NC_008771	CCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583593
37	NC_008771	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583593
38	NC_008771	CGC	2	6	3837	3842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583593
39	NC_008771	CCG	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583594
40	NC_008771	CCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
41	NC_008771	CGC	2	6	4225	4230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583594
42	NC_008771	CGA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
43	NC_008771	GCC	2	6	4291	4296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583594
44	NC_008771	TCG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
45	NC_008771	ACC	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
46	NC_008771	CCA	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
47	NC_008771	ACC	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
48	NC_008771	AGC	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
49	NC_008771	CCA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
50	NC_008771	TGA	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583594
51	NC_008771	GCA	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
52	NC_008771	ATC	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583594
53	NC_008771	CGT	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
54	NC_008771	TCG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
55	NC_008771	TCG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
56	NC_008771	CAG	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
57	NC_008771	TGT	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583594
58	NC_008771	ATG	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583594
59	NC_008771	AGC	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
60	NC_008771	ACC	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
61	NC_008771	CTT	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583594
62	NC_008771	ATG	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583594
63	NC_008771	TCA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583594
64	NC_008771	CAG	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
65	NC_008771	TCA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583594
66	NC_008771	CAC	3	9	5758	5766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
67	NC_008771	CAC	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
68	NC_008771	GTC	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583594
69	NC_008771	CAG	2	6	6034	6039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
70	NC_008771	CCA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583594
71	NC_008771	CTT	2	6	6091	6096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583594
72	NC_008771	CAG	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
73	NC_008771	CAG	3	9	6220	6228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583594
74	NC_008771	GCA	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583595
75	NC_008771	TTC	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583595
76	NC_008771	GAA	2	6	6336	6341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583595
77	NC_008771	ACC	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583595
78	NC_008771	ACC	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583595
79	NC_008771	ATG	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583595
80	NC_008771	TGA	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583595
81	NC_008771	ACA	2	6	6584	6589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583595
82	NC_008771	GGC	2	6	6683	6688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583595
83	NC_008771	CGT	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583595
84	NC_008771	GCC	2	6	6747	6752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583595
85	NC_008771	AAG	2	6	6793	6798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583595
86	NC_008771	TTG	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583595
87	NC_008771	TTC	2	6	6855	6860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583595
88	NC_008771	GCC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583595
89	NC_008771	CTT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583595
90	NC_008771	CCG	2	6	7133	7138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583595
91	NC_008771	CCA	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
92	NC_008771	TCG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
93	NC_008771	CAC	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
94	NC_008771	TGC	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
95	NC_008771	GCC	2	6	7534	7539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
96	NC_008771	TGC	2	6	7697	7702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
97	NC_008771	CAA	2	6	7732	7737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583596
98	NC_008771	GTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583596
99	NC_008771	CGT	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
100	NC_008771	GTG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583596
101	NC_008771	CCA	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
102	NC_008771	CCA	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583596
103	NC_008771	GCC	3	9	8012	8020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
104	NC_008771	TGC	2	6	8042	8047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
105	NC_008771	CGC	2	6	8109	8114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
106	NC_008771	CTG	2	6	8164	8169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583596
107	NC_008771	CGC	2	6	8193	8198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
108	NC_008771	GTT	2	6	8199	8204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583596
109	NC_008771	TTC	2	6	8324	8329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583596
110	NC_008771	CCG	2	6	8370	8375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583596
111	NC_008771	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583596
112	NC_008771	TAA	2	6	8717	8722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583597
113	NC_008771	CAA	2	6	8817	8822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583597
114	NC_008771	GAA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583597
115	NC_008771	CAA	2	6	8928	8933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583597
116	NC_008771	GCG	2	6	8992	8997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583597
117	NC_008771	GCC	2	6	9025	9030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583597
118	NC_008771	CAC	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583597
119	NC_008771	TGT	2	6	9194	9199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583597
120	NC_008771	TCT	2	6	9277	9282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583597
121	NC_008771	ACC	2	6	9331	9336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583597
122	NC_008771	GTT	2	6	9490	9495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583598
123	NC_008771	TCA	2	6	9502	9507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583598
124	NC_008771	TGG	2	6	9532	9537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583598
125	NC_008771	ACC	2	6	9654	9659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583598
126	NC_008771	ACC	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583598
127	NC_008771	TCG	2	6	9840	9845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583598
128	NC_008771	GTT	2	6	9882	9887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583598
129	NC_008771	CAG	2	6	9941	9946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583598
130	NC_008771	AAT	2	6	10001	10006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583598
131	NC_008771	GCC	2	6	10179	10184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583599
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.