MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	CAAGGG	2	12	864	875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121582659
2	NC_008770	GACAAA	2	12	1560	1571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121582659
3	NC_008770	ATTTGT	2	12	3391	3402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121582662
4	NC_008770	TAAAAA	2	12	3504	3515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121582662
5	NC_008770	TGAAGA	2	12	5324	5335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121582664
6	NC_008770	TCATTT	2	12	6629	6640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008770	GGTAAG	2	12	7938	7949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	121582667
8	NC_008770	TATAAT	2	12	11311	11322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008770	AACAAA	2	12	11323	11334	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008770	CTATAT	2	12	15732	15743	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	121582680
11	NC_008770	GCTTTA	2	12	16945	16956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121582682
12	NC_008770	GCTTAT	2	12	17806	17817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121582683
13	NC_008770	GTAAAA	2	12	18103	18114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582684
14	NC_008770	CCTTGT	2	12	18130	18141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	121582684
15	NC_008770	TCTTTT	2	12	18151	18162	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	121582684
16	NC_008770	CTTTGT	2	12	18817	18828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008770	TTTATA	2	12	19012	19023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008770	TTTATT	2	12	19106	19117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008770	TATTTT	2	12	19824	19835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008770	AGAAAA	2	12	20022	20033	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121582685
21	NC_008770	AAAAGA	2	12	20646	20657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121582685
22	NC_008770	CAAGGA	2	12	21028	21039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121582685
23	NC_008770	TTCAAA	2	12	21559	21570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	121582686
24	NC_008770	AAATGG	2	12	21779	21790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121582686
25	NC_008770	TCGGCT	2	12	22078	22089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582687
26	NC_008770	CCATAA	2	12	25344	25355	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008770	TATAAT	2	12	25664	25675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008770	AACAAA	2	12	25676	25687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008770	ACGCTT	2	12	25786	25797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121582692
30	NC_008770	TAAAAG	2	12	27704	27715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582697
31	NC_008770	TATAAT	2	12	29064	29075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008770	AACAAA	2	12	29076	29087	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008770	ATATTG	2	12	29637	29648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121582702
34	NC_008770	TATAAT	2	12	29999	30010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008770	AACAAA	2	12	30011	30022	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008770	AAAATA	2	12	30289	30300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121582703
37	NC_008770	TATAAA	2	12	30596	30607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008770	GAAAAA	2	12	30688	30699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121582704
39	NC_008770	CAAAAA	2	12	30851	30862	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	121582704
40	NC_008770	AGATTA	2	12	31032	31043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121582704
41	NC_008770	TGGCGA	2	12	31343	31354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121582705
42	NC_008770	TTTATA	2	12	31822	31833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008770	TAGAAA	2	12	32067	32078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582706
44	NC_008770	AATGTG	2	12	32974	32985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582706
45	NC_008770	AAGAAA	2	12	33839	33850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008770	TGATAT	2	12	36340	36351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121582710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.