MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	CAAGGG	2	12	864	875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121582659
2	NC_008770	GACAAA	2	12	1560	1571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	121582659
3	NC_008770	ATTTGT	2	12	3391	3402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	121582662
4	NC_008770	TAAAAA	2	12	3504	3515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121582662
5	NC_008770	TGAAGA	2	12	5324	5335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121582664
6	NC_008770	GGTAAG	2	12	7938	7949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	121582667
7	NC_008770	CTATAT	2	12	15732	15743	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	121582680
8	NC_008770	GCTTTA	2	12	16945	16956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121582682
9	NC_008770	GCTTAT	2	12	17806	17817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	121582683
10	NC_008770	GTAAAA	2	12	18103	18114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582684
11	NC_008770	CCTTGT	2	12	18130	18141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	121582684
12	NC_008770	TCTTTT	2	12	18151	18162	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	121582684
13	NC_008770	AGAAAA	2	12	20022	20033	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121582685
14	NC_008770	AAAAGA	2	12	20646	20657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121582685
15	NC_008770	CAAGGA	2	12	21028	21039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121582685
16	NC_008770	TTCAAA	2	12	21559	21570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	121582686
17	NC_008770	AAATGG	2	12	21779	21790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121582686
18	NC_008770	TCGGCT	2	12	22078	22089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582687
19	NC_008770	ACGCTT	2	12	25786	25797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121582692
20	NC_008770	TAAAAG	2	12	27704	27715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582697
21	NC_008770	ATATTG	2	12	29637	29648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121582702
22	NC_008770	AAAATA	2	12	30289	30300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	121582703
23	NC_008770	GAAAAA	2	12	30688	30699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	121582704
24	NC_008770	CAAAAA	2	12	30851	30862	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	121582704
25	NC_008770	AGATTA	2	12	31032	31043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	121582704
26	NC_008770	TGGCGA	2	12	31343	31354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121582705
27	NC_008770	TAGAAA	2	12	32067	32078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	121582706
28	NC_008770	AATGTG	2	12	32974	32985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582706
29	NC_008770	TGATAT	2	12	36340	36351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121582710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.