MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	CAAAA	2	10	1725	1734	80 %	0 %	0 %	20 %	121582659
2	NC_008770	AGCAC	2	10	3357	3366	40 %	0 %	20 %	40 %	121582662
3	NC_008770	GTTTA	2	10	6390	6399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008770	AACAA	2	10	7552	7561	80 %	0 %	0 %	20 %	121582666
5	NC_008770	GGTTT	2	10	7587	7596	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008770	TGTTT	2	10	8497	8506	0 %	80 %	20 %	0 %	121582668
7	NC_008770	AGCCA	2	10	10287	10296	40 %	0 %	20 %	40 %	121582669
8	NC_008770	GAATT	2	10	11355	11364	40 %	40 %	20 %	0 %	121582670
9	NC_008770	CAAAT	2	10	12090	12099	60 %	20 %	0 %	20 %	121582671
10	NC_008770	ATTTT	2	10	12342	12351	20 %	80 %	0 %	0 %	121582672
11	NC_008770	AAAGC	2	10	12924	12933	60 %	0 %	20 %	20 %	121582673
12	NC_008770	GCAAA	2	10	13007	13016	60 %	0 %	20 %	20 %	121582673
13	NC_008770	GAAAA	2	10	13061	13070	80 %	0 %	20 %	0 %	121582673
14	NC_008770	GAAAA	2	10	14689	14698	80 %	0 %	20 %	0 %	121582677
15	NC_008770	AAAAT	2	10	15911	15920	80 %	20 %	0 %	0 %	121582681
16	NC_008770	ACAAA	2	10	16269	16278	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008770	TTTTG	2	10	16462	16471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008770	ATTCT	2	10	16490	16499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008770	TATAA	2	10	16522	16531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008770	AAAAC	2	10	16872	16881	80 %	0 %	0 %	20 %	121582682
21	NC_008770	TCTTT	2	10	18076	18085	0 %	80 %	0 %	20 %	121582684
22	NC_008770	AAAAT	2	10	18896	18905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008770	ATTTT	2	10	19435	19444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008770	TTTGT	2	10	19797	19806	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008770	AAATT	2	10	20695	20704	60 %	40 %	0 %	0 %	121582685
26	NC_008770	CTTTT	2	10	21072	21081	0 %	80 %	0 %	20 %	121582686
27	NC_008770	TAGTT	2	10	22323	22332	20 %	60 %	20 %	0 %	121582687
28	NC_008770	TGATA	2	10	23609	23618	40 %	40 %	20 %	0 %	121582689
29	NC_008770	ACTTT	2	10	24294	24303	20 %	60 %	0 %	20 %	121582689
30	NC_008770	TATAT	2	10	26895	26904	40 %	60 %	0 %	0 %	121582695
31	NC_008770	TAGCC	2	10	27255	27264	20 %	20 %	20 %	40 %	121582696
32	NC_008770	AAAAT	2	10	27293	27302	80 %	20 %	0 %	0 %	121582696
33	NC_008770	AAATA	2	10	27497	27506	80 %	20 %	0 %	0 %	121582697
34	NC_008770	CAAAA	2	10	28300	28309	80 %	0 %	0 %	20 %	121582698
35	NC_008770	CAAAA	2	10	28482	28491	80 %	0 %	0 %	20 %	121582699
36	NC_008770	AATAA	2	10	28510	28519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008770	TTAAA	2	10	29439	29448	60 %	40 %	0 %	0 %	121582701
38	NC_008770	ATTAA	2	10	29461	29470	60 %	40 %	0 %	0 %	121582701
39	NC_008770	AAAAT	2	10	29673	29682	80 %	20 %	0 %	0 %	121582702
40	NC_008770	TTAAG	2	10	30076	30085	40 %	40 %	20 %	0 %	121582703
41	NC_008770	AATAA	2	10	30608	30617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008770	ATTTT	2	10	30992	31001	20 %	80 %	0 %	0 %	121582704
43	NC_008770	TTAAT	2	10	31255	31264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008770	AAGAA	2	10	31623	31632	80 %	0 %	20 %	0 %	121582705
45	NC_008770	CTTTC	2	10	32714	32723	0 %	60 %	0 %	40 %	121582706
46	NC_008770	TATGA	2	10	33749	33758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008770	AAAAT	2	10	33759	33768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008770	AATAA	2	10	34961	34970	80 %	20 %	0 %	0 %	121582710
49	NC_008770	ATCTT	2	10	35149	35158	20 %	60 %	0 %	20 %	121582710
50	NC_008770	GAATT	2	10	35229	35238	40 %	40 %	20 %	0 %	121582710
51	NC_008770	AACAA	2	10	35387	35396	80 %	0 %	0 %	20 %	121582710
52	NC_008770	TATTT	2	10	35647	35656	20 %	80 %	0 %	0 %	121582710
53	NC_008770	AAAAG	2	10	35800	35809	80 %	0 %	20 %	0 %	121582710
54	NC_008770	TAATG	2	10	37228	37237	40 %	40 %	20 %	0 %	121582710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.