MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	CAAAA	2	10	1725	1734	80 %	0 %	0 %	20 %	121582659
2	NC_008770	AGCAC	2	10	3357	3366	40 %	0 %	20 %	40 %	121582662
3	NC_008770	AACAA	2	10	7552	7561	80 %	0 %	0 %	20 %	121582666
4	NC_008770	TGTTT	2	10	8497	8506	0 %	80 %	20 %	0 %	121582668
5	NC_008770	AGCCA	2	10	10287	10296	40 %	0 %	20 %	40 %	121582669
6	NC_008770	GAATT	2	10	11355	11364	40 %	40 %	20 %	0 %	121582670
7	NC_008770	CAAAT	2	10	12090	12099	60 %	20 %	0 %	20 %	121582671
8	NC_008770	ATTTT	2	10	12342	12351	20 %	80 %	0 %	0 %	121582672
9	NC_008770	AAAGC	2	10	12924	12933	60 %	0 %	20 %	20 %	121582673
10	NC_008770	GCAAA	2	10	13007	13016	60 %	0 %	20 %	20 %	121582673
11	NC_008770	GAAAA	2	10	13061	13070	80 %	0 %	20 %	0 %	121582673
12	NC_008770	GAAAA	2	10	14689	14698	80 %	0 %	20 %	0 %	121582677
13	NC_008770	AAAAT	2	10	15911	15920	80 %	20 %	0 %	0 %	121582681
14	NC_008770	AAAAC	2	10	16872	16881	80 %	0 %	0 %	20 %	121582682
15	NC_008770	TCTTT	2	10	18076	18085	0 %	80 %	0 %	20 %	121582684
16	NC_008770	AAATT	2	10	20695	20704	60 %	40 %	0 %	0 %	121582685
17	NC_008770	CTTTT	2	10	21072	21081	0 %	80 %	0 %	20 %	121582686
18	NC_008770	TAGTT	2	10	22323	22332	20 %	60 %	20 %	0 %	121582687
19	NC_008770	TGATA	2	10	23609	23618	40 %	40 %	20 %	0 %	121582689
20	NC_008770	ACTTT	2	10	24294	24303	20 %	60 %	0 %	20 %	121582689
21	NC_008770	TATAT	2	10	26895	26904	40 %	60 %	0 %	0 %	121582695
22	NC_008770	TAGCC	2	10	27255	27264	20 %	20 %	20 %	40 %	121582696
23	NC_008770	AAAAT	2	10	27293	27302	80 %	20 %	0 %	0 %	121582696
24	NC_008770	AAATA	2	10	27497	27506	80 %	20 %	0 %	0 %	121582697
25	NC_008770	CAAAA	2	10	28300	28309	80 %	0 %	0 %	20 %	121582698
26	NC_008770	CAAAA	2	10	28482	28491	80 %	0 %	0 %	20 %	121582699
27	NC_008770	TTAAA	2	10	29439	29448	60 %	40 %	0 %	0 %	121582701
28	NC_008770	ATTAA	2	10	29461	29470	60 %	40 %	0 %	0 %	121582701
29	NC_008770	AAAAT	2	10	29673	29682	80 %	20 %	0 %	0 %	121582702
30	NC_008770	TTAAG	2	10	30076	30085	40 %	40 %	20 %	0 %	121582703
31	NC_008770	ATTTT	2	10	30992	31001	20 %	80 %	0 %	0 %	121582704
32	NC_008770	AAGAA	2	10	31623	31632	80 %	0 %	20 %	0 %	121582705
33	NC_008770	CTTTC	2	10	32714	32723	0 %	60 %	0 %	40 %	121582706
34	NC_008770	AATAA	2	10	34961	34970	80 %	20 %	0 %	0 %	121582710
35	NC_008770	ATCTT	2	10	35149	35158	20 %	60 %	0 %	20 %	121582710
36	NC_008770	GAATT	2	10	35229	35238	40 %	40 %	20 %	0 %	121582710
37	NC_008770	AACAA	2	10	35387	35396	80 %	0 %	0 %	20 %	121582710
38	NC_008770	TATTT	2	10	35647	35656	20 %	80 %	0 %	0 %	121582710
39	NC_008770	AAAAG	2	10	35800	35809	80 %	0 %	20 %	0 %	121582710
40	NC_008770	TAATG	2	10	37228	37237	40 %	40 %	20 %	0 %	121582710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.