MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	CGAT	2	8	461	468	25 %	25 %	25 %	25 %	121582658
2	NC_008770	CTTA	2	8	559	566	25 %	50 %	0 %	25 %	121582658
3	NC_008770	TACT	2	8	932	939	25 %	50 %	0 %	25 %	121582659
4	NC_008770	AATT	2	8	1375	1382	50 %	50 %	0 %	0 %	121582659
5	NC_008770	TATG	2	8	1701	1708	25 %	50 %	25 %	0 %	121582659
6	NC_008770	AAGA	2	8	2133	2140	75 %	0 %	25 %	0 %	121582660
7	NC_008770	ATTT	2	8	2195	2202	25 %	75 %	0 %	0 %	121582660
8	NC_008770	AATC	2	8	2984	2991	50 %	25 %	0 %	25 %	121582661
9	NC_008770	AGAA	2	8	3034	3041	75 %	0 %	25 %	0 %	121582661
10	NC_008770	CTTA	2	8	3134	3141	25 %	50 %	0 %	25 %	121582662
11	NC_008770	ATAA	2	8	3706	3713	75 %	25 %	0 %	0 %	121582662
12	NC_008770	AATG	2	8	4451	4458	50 %	25 %	25 %	0 %	121582663
13	NC_008770	TTTA	2	8	4525	4532	25 %	75 %	0 %	0 %	121582664
14	NC_008770	ATTT	2	8	4918	4925	25 %	75 %	0 %	0 %	121582664
15	NC_008770	CAAG	2	8	5433	5440	50 %	0 %	25 %	25 %	121582664
16	NC_008770	TATG	2	8	5588	5595	25 %	50 %	25 %	0 %	121582664
17	NC_008770	TTTA	2	8	5657	5664	25 %	75 %	0 %	0 %	121582664
18	NC_008770	GAAT	2	8	5899	5906	50 %	25 %	25 %	0 %	121582664
19	NC_008770	AATC	2	8	6057	6064	50 %	25 %	0 %	25 %	121582664
20	NC_008770	ACAA	2	8	7175	7182	75 %	0 %	0 %	25 %	121582666
21	NC_008770	AAAG	2	8	7347	7354	75 %	0 %	25 %	0 %	121582666
22	NC_008770	GTTT	2	8	8449	8456	0 %	75 %	25 %	0 %	121582668
23	NC_008770	GAAT	2	8	9355	9362	50 %	25 %	25 %	0 %	121582669
24	NC_008770	TTAT	2	8	9437	9444	25 %	75 %	0 %	0 %	121582669
25	NC_008770	AATG	2	8	9644	9651	50 %	25 %	25 %	0 %	121582669
26	NC_008770	ATTA	2	8	10028	10035	50 %	50 %	0 %	0 %	121582669
27	NC_008770	ATTT	2	8	10266	10273	25 %	75 %	0 %	0 %	121582669
28	NC_008770	AATT	2	8	10498	10505	50 %	50 %	0 %	0 %	121582669
29	NC_008770	AAAG	2	8	10536	10543	75 %	0 %	25 %	0 %	121582669
30	NC_008770	TAGA	2	8	10618	10625	50 %	25 %	25 %	0 %	121582669
31	NC_008770	TTTG	2	8	11481	11488	0 %	75 %	25 %	0 %	121582670
32	NC_008770	TTTA	2	8	11520	11527	25 %	75 %	0 %	0 %	121582670
33	NC_008770	AATA	2	8	11639	11646	75 %	25 %	0 %	0 %	121582670
34	NC_008770	TAAA	2	8	12188	12195	75 %	25 %	0 %	0 %	121582671
35	NC_008770	TATT	2	8	12236	12243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008770	TAGT	2	8	12318	12325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008770	TTTG	2	8	12624	12631	0 %	75 %	25 %	0 %	121582673
38	NC_008770	ATCA	2	8	12640	12647	50 %	25 %	0 %	25 %	121582673
39	NC_008770	GATT	2	8	12792	12799	25 %	50 %	25 %	0 %	121582673
40	NC_008770	AAGA	2	8	13106	13113	75 %	0 %	25 %	0 %	121582673
41	NC_008770	GATT	2	8	13342	13349	25 %	50 %	25 %	0 %	121582674
42	NC_008770	TTAG	2	8	13561	13568	25 %	50 %	25 %	0 %	121582674
43	NC_008770	TAAT	2	8	13794	13801	50 %	50 %	0 %	0 %	121582675
44	NC_008770	TCTT	2	8	13834	13841	0 %	75 %	0 %	25 %	121582675
45	NC_008770	ACGA	2	8	14171	14178	50 %	0 %	25 %	25 %	121582677
46	NC_008770	AAAG	2	8	14403	14410	75 %	0 %	25 %	0 %	121582677
47	NC_008770	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	121582677
48	NC_008770	ATTC	2	8	14867	14874	25 %	50 %	0 %	25 %	121582678
49	NC_008770	ATTT	2	8	15172	15179	25 %	75 %	0 %	0 %	121582679
50	NC_008770	TATT	2	8	15337	15344	25 %	75 %	0 %	0 %	121582679
51	NC_008770	AAAC	2	8	15565	15572	75 %	0 %	0 %	25 %	121582680
52	NC_008770	ATCT	2	8	15684	15691	25 %	50 %	0 %	25 %	121582680
53	NC_008770	ATTA	2	8	15861	15868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008770	ATAA	2	8	16192	16199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008770	ATAA	2	8	16567	16574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008770	TATC	2	8	16652	16659	25 %	50 %	0 %	25 %	121582682
57	NC_008770	ATTC	2	8	16896	16903	25 %	50 %	0 %	25 %	121582682
58	NC_008770	TAAT	2	8	17075	17082	50 %	50 %	0 %	0 %	121582682
59	NC_008770	AAAG	2	8	17432	17439	75 %	0 %	25 %	0 %	121582683
60	NC_008770	TTTA	2	8	17850	17857	25 %	75 %	0 %	0 %	121582683
61	NC_008770	AGTT	2	8	17966	17973	25 %	50 %	25 %	0 %	121582684
62	NC_008770	AACT	2	8	17978	17985	50 %	25 %	0 %	25 %	121582684
63	NC_008770	TATT	2	8	18352	18359	25 %	75 %	0 %	0 %	121582684
64	NC_008770	GAAA	2	8	18642	18649	75 %	0 %	25 %	0 %	121582684
65	NC_008770	TTAT	2	8	18787	18794	25 %	75 %	0 %	0 %	121582684
66	NC_008770	ACTT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008770	ATTA	2	8	19415	19422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008770	TATT	2	8	19897	19904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008770	GAAA	2	8	20193	20200	75 %	0 %	25 %	0 %	121582685
70	NC_008770	AGAA	2	8	20357	20364	75 %	0 %	25 %	0 %	121582685
71	NC_008770	AAAC	2	8	20953	20960	75 %	0 %	0 %	25 %	121582685
72	NC_008770	AATC	2	8	21278	21285	50 %	25 %	0 %	25 %	121582686
73	NC_008770	TCAA	2	8	21499	21506	50 %	25 %	0 %	25 %	121582686
74	NC_008770	TAAA	2	8	21622	21629	75 %	25 %	0 %	0 %	121582686
75	NC_008770	TAAA	2	8	22364	22371	75 %	25 %	0 %	0 %	121582687
76	NC_008770	AGTT	2	8	22665	22672	25 %	50 %	25 %	0 %	121582687
77	NC_008770	GAAA	2	8	22899	22906	75 %	0 %	25 %	0 %	121582688
78	NC_008770	CAAG	2	8	23228	23235	50 %	0 %	25 %	25 %	121582688
79	NC_008770	TAAA	2	8	23237	23244	75 %	25 %	0 %	0 %	121582688
80	NC_008770	TACT	2	8	23593	23600	25 %	50 %	0 %	25 %	121582689
81	NC_008770	AGAC	2	8	23709	23716	50 %	0 %	25 %	25 %	121582689
82	NC_008770	AATT	2	8	24563	24570	50 %	50 %	0 %	0 %	121582689
83	NC_008770	TAAA	2	8	25241	25248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008770	ATTT	2	8	25486	25493	25 %	75 %	0 %	0 %	121582691
85	NC_008770	ATAA	2	8	25610	25617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008770	GATT	2	8	26112	26119	25 %	50 %	25 %	0 %	121582693
87	NC_008770	TTTA	2	8	26165	26172	25 %	75 %	0 %	0 %	121582693
88	NC_008770	AAAT	2	8	26213	26220	75 %	25 %	0 %	0 %	121582693
89	NC_008770	TTAA	2	8	26359	26366	50 %	50 %	0 %	0 %	121582693
90	NC_008770	TTAT	2	8	26591	26598	25 %	75 %	0 %	0 %	121582694
91	NC_008770	TTTA	2	8	26883	26890	25 %	75 %	0 %	0 %	121582695
92	NC_008770	TTTG	2	8	27265	27272	0 %	75 %	25 %	0 %	121582696
93	NC_008770	ATTA	2	8	27324	27331	50 %	50 %	0 %	0 %	121582696
94	NC_008770	TATT	2	8	27434	27441	25 %	75 %	0 %	0 %	121582696
95	NC_008770	CTTG	2	8	27614	27621	0 %	50 %	25 %	25 %	121582697
96	NC_008770	AAAG	2	8	27741	27748	75 %	0 %	25 %	0 %	121582697
97	NC_008770	AAAC	2	8	28605	28612	75 %	0 %	0 %	25 %	121582700
98	NC_008770	AAAC	2	8	29127	29134	75 %	0 %	0 %	25 %	121582701
99	NC_008770	TAAT	2	8	29187	29194	50 %	50 %	0 %	0 %	121582701
100	NC_008770	TTAG	2	8	29240	29247	25 %	50 %	25 %	0 %	121582701
101	NC_008770	ATTT	2	8	29274	29281	25 %	75 %	0 %	0 %	121582701
102	NC_008770	AAAT	2	8	29512	29519	75 %	25 %	0 %	0 %	121582702
103	NC_008770	ATAA	2	8	29839	29846	75 %	25 %	0 %	0 %	121582702
104	NC_008770	TTTG	2	8	30125	30132	0 %	75 %	25 %	0 %	121582703
105	NC_008770	AAGG	2	8	30773	30780	50 %	0 %	50 %	0 %	121582704
106	NC_008770	TAAT	2	8	30803	30810	50 %	50 %	0 %	0 %	121582704
107	NC_008770	GTTT	2	8	30824	30831	0 %	75 %	25 %	0 %	121582704
108	NC_008770	TCAG	2	8	31458	31465	25 %	25 %	25 %	25 %	121582705
109	NC_008770	TAAT	2	8	31946	31953	50 %	50 %	0 %	0 %	121582706
110	NC_008770	CTTT	2	8	32243	32250	0 %	75 %	0 %	25 %	121582706
111	NC_008770	TCTA	2	8	32809	32816	25 %	50 %	0 %	25 %	121582706
112	NC_008770	TTTA	2	8	32962	32969	25 %	75 %	0 %	0 %	121582706
113	NC_008770	TGCT	2	8	33304	33311	0 %	50 %	25 %	25 %	121582706
114	NC_008770	TCAA	2	8	33851	33858	50 %	25 %	0 %	25 %	121582707
115	NC_008770	ATCA	2	8	33894	33901	50 %	25 %	0 %	25 %	121582707
116	NC_008770	TATT	2	8	33998	34005	25 %	75 %	0 %	0 %	121582707
117	NC_008770	AACT	2	8	34189	34196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008770	TAAT	2	8	34450	34457	50 %	50 %	0 %	0 %	121582708
119	NC_008770	GAAA	3	12	34926	34937	75 %	0 %	25 %	0 %	121582710
120	NC_008770	ACTT	2	8	35324	35331	25 %	50 %	0 %	25 %	121582710
121	NC_008770	AAAG	2	8	35426	35433	75 %	0 %	25 %	0 %	121582710
122	NC_008770	GAAA	2	8	35657	35664	75 %	0 %	25 %	0 %	121582710
123	NC_008770	AAAC	2	8	35970	35977	75 %	0 %	0 %	25 %	121582710
124	NC_008770	TAGC	2	8	36114	36121	25 %	25 %	25 %	25 %	121582710
125	NC_008770	GTAT	2	8	36375	36382	25 %	50 %	25 %	0 %	121582710
126	NC_008770	AATC	2	8	37154	37161	50 %	25 %	0 %	25 %	121582710
127	NC_008770	GTGC	2	8	37424	37431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.