MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	GA	3	6	49	54	50 %	0 %	50 %	0 %	121582658
2	NC_008770	GA	3	6	307	312	50 %	0 %	50 %	0 %	121582658
3	NC_008770	TG	3	6	345	350	0 %	50 %	50 %	0 %	121582658
4	NC_008770	TA	3	6	1350	1355	50 %	50 %	0 %	0 %	121582659
5	NC_008770	AT	3	6	1851	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	121582660
6	NC_008770	AT	4	8	2382	2389	50 %	50 %	0 %	0 %	121582660
7	NC_008770	GA	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	121582660
8	NC_008770	TC	3	6	3312	3317	0 %	50 %	0 %	50 %	121582662
9	NC_008770	TA	3	6	3629	3634	50 %	50 %	0 %	0 %	121582662
10	NC_008770	AT	3	6	5620	5625	50 %	50 %	0 %	0 %	121582664
11	NC_008770	CA	3	6	7308	7313	50 %	0 %	0 %	50 %	121582666
12	NC_008770	TA	3	6	8116	8121	50 %	50 %	0 %	0 %	121582668
13	NC_008770	TA	3	6	8517	8522	50 %	50 %	0 %	0 %	121582668
14	NC_008770	AT	3	6	10796	10801	50 %	50 %	0 %	0 %	121582669
15	NC_008770	AT	3	6	11923	11928	50 %	50 %	0 %	0 %	121582671
16	NC_008770	TA	3	6	12458	12463	50 %	50 %	0 %	0 %	121582672
17	NC_008770	AT	3	6	13495	13500	50 %	50 %	0 %	0 %	121582674
18	NC_008770	TA	3	6	14484	14489	50 %	50 %	0 %	0 %	121582677
19	NC_008770	AG	3	6	14911	14916	50 %	0 %	50 %	0 %	121582678
20	NC_008770	TA	3	6	15151	15156	50 %	50 %	0 %	0 %	121582679
21	NC_008770	TG	4	8	15802	15809	0 %	50 %	50 %	0 %	121582680
22	NC_008770	TA	3	6	16075	16080	50 %	50 %	0 %	0 %	121582681
23	NC_008770	TA	3	6	16224	16229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008770	TA	3	6	16235	16240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008770	TA	3	6	16577	16582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008770	AT	3	6	17479	17484	50 %	50 %	0 %	0 %	121582683
27	NC_008770	AT	3	6	17952	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008770	TA	3	6	18930	18935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008770	AT	3	6	20892	20897	50 %	50 %	0 %	0 %	121582685
30	NC_008770	GA	3	6	21337	21342	50 %	0 %	50 %	0 %	121582686
31	NC_008770	TA	3	6	21969	21974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008770	TA	3	6	21980	21985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008770	AG	3	6	22975	22980	50 %	0 %	50 %	0 %	121582688
34	NC_008770	AG	3	6	23157	23162	50 %	0 %	50 %	0 %	121582688
35	NC_008770	TC	3	6	23959	23964	0 %	50 %	0 %	50 %	121582689
36	NC_008770	CA	3	6	24104	24109	50 %	0 %	0 %	50 %	121582689
37	NC_008770	AG	3	6	24620	24625	50 %	0 %	50 %	0 %	121582689
38	NC_008770	TA	3	6	25631	25636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008770	GA	3	6	25761	25766	50 %	0 %	50 %	0 %	121582692
40	NC_008770	AG	3	6	25922	25927	50 %	0 %	50 %	0 %	121582692
41	NC_008770	GA	3	6	26457	26462	50 %	0 %	50 %	0 %	121582694
42	NC_008770	TA	3	6	27118	27123	50 %	50 %	0 %	0 %	121582696
43	NC_008770	TA	3	6	28434	28439	50 %	50 %	0 %	0 %	121582699
44	NC_008770	AG	3	6	28457	28462	50 %	0 %	50 %	0 %	121582699
45	NC_008770	TA	3	6	29031	29036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008770	TA	3	6	29966	29971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008770	TA	3	6	31223	31228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008770	TA	3	6	31741	31746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008770	TA	3	6	32197	32202	50 %	50 %	0 %	0 %	121582706
50	NC_008770	GT	3	6	33002	33007	0 %	50 %	50 %	0 %	121582706
51	NC_008770	AT	3	6	33944	33949	50 %	50 %	0 %	0 %	121582707
52	NC_008770	AT	3	6	34954	34959	50 %	50 %	0 %	0 %	121582710
53	NC_008770	GA	3	6	36886	36891	50 %	0 %	50 %	0 %	121582710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.