MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 chromosome

Total Repeats: 3458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008769	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	121635884
2	NC_008769	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	121635885
3	NC_008769	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	121635885
4	NC_008769	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	121635887
5	NC_008769	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	121635888
6	NC_008769	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	121635889
7	NC_008769	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	121635889
8	NC_008769	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	121635889
9	NC_008769	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	121635890
10	NC_008769	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	121635890
11	NC_008769	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008769	CGACC	2	10	13671	13680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008769	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	121635895
14	NC_008769	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	121635895
15	NC_008769	GCGTT	2	10	15181	15190	0 %	40 %	40 %	20 %	121635896
16	NC_008769	CCAGC	2	10	15721	15730	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_008769	ACCGA	2	10	16484	16493	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008769	CCCGT	2	10	17964	17973	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008769	CGGCC	2	10	18150	18159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_008769	CCGGG	2	10	18288	18297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008769	CGGAC	2	10	18677	18686	20 %	0 %	40 %	40 %	121635897
22	NC_008769	CCGCC	2	10	19867	19876	0 %	0 %	20 %	80 %	121635899
23	NC_008769	TGCGC	2	10	21356	21365	0 %	20 %	40 %	40 %	121635901
24	NC_008769	CTGCG	2	10	22131	22140	0 %	20 %	40 %	40 %	121635901
25	NC_008769	GTCGC	2	10	23812	23821	0 %	20 %	40 %	40 %	121635903
26	NC_008769	TCCGG	2	10	23932	23941	0 %	20 %	40 %	40 %	121635903
27	NC_008769	CGCGC	2	10	24695	24704	0 %	0 %	40 %	60 %	121635904
28	NC_008769	CCGAG	2	10	28610	28619	20 %	0 %	40 %	40 %	121635909
29	NC_008769	TCATC	2	10	30569	30578	20 %	40 %	0 %	40 %	121635911
30	NC_008769	CGTTT	2	10	31759	31768	0 %	60 %	20 %	20 %	121635912
31	NC_008769	CGGTT	2	10	32908	32917	0 %	40 %	40 %	20 %	121635912
32	NC_008769	GTCGG	2	10	34256	34265	0 %	20 %	60 %	20 %	121635914
33	NC_008769	ACGGT	2	10	35414	35423	20 %	20 %	40 %	20 %	121635915
34	NC_008769	GCAGC	2	10	37040	37049	20 %	0 %	40 %	40 %	121635916
35	NC_008769	CGGTG	2	10	38948	38957	0 %	20 %	60 %	20 %	121635916
36	NC_008769	CAGAC	2	10	39466	39475	40 %	0 %	20 %	40 %	121635916
37	NC_008769	CGCAA	2	10	39990	39999	40 %	0 %	20 %	40 %	121635917
38	NC_008769	CGGCG	2	10	40116	40125	0 %	0 %	60 %	40 %	121635917
39	NC_008769	ACCCG	2	10	40946	40955	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008769	CGACC	2	10	43338	43347	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_008769	GGCGT	2	10	43820	43829	0 %	20 %	60 %	20 %	121635922
42	NC_008769	GGGCC	2	10	44103	44112	0 %	0 %	60 %	40 %	121635922
43	NC_008769	GCGTT	2	10	44848	44857	0 %	40 %	40 %	20 %	121635923
44	NC_008769	CCAGC	2	10	45388	45397	20 %	0 %	20 %	60 %	121635924
45	NC_008769	ACCGA	2	10	46151	46160	40 %	0 %	20 %	40 %	121635924
46	NC_008769	ATCGG	2	10	46543	46552	20 %	20 %	40 %	20 %	121635924
47	NC_008769	CGGCC	2	10	47552	47561	0 %	0 %	40 %	60 %	121635925
48	NC_008769	TTAGC	2	10	48703	48712	20 %	40 %	20 %	20 %	121635926
49	NC_008769	GGTCC	2	10	48775	48784	0 %	20 %	40 %	40 %	121635926
50	NC_008769	GTCGT	2	10	51294	51303	0 %	40 %	40 %	20 %	121635927
51	NC_008769	ATCAC	2	10	53567	53576	40 %	20 %	0 %	40 %	121635930
52	NC_008769	GCCGG	2	10	54254	54263	0 %	0 %	60 %	40 %	121635930
53	NC_008769	CGAGC	2	10	56616	56625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008769	GGCAA	2	10	58948	58957	40 %	0 %	40 %	20 %	121635935
55	NC_008769	CGATC	2	10	59774	59783	20 %	20 %	20 %	40 %	121635936
56	NC_008769	CGACG	2	10	61961	61970	20 %	0 %	40 %	40 %	121635939
57	NC_008769	GCGTC	2	10	62016	62025	0 %	20 %	40 %	40 %	121635939
58	NC_008769	GACAC	2	10	62113	62122	40 %	0 %	20 %	40 %	121635939
59	NC_008769	CCGCC	2	10	63459	63468	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_008769	TCCTG	2	10	67118	67127	0 %	40 %	20 %	40 %	121635945
61	NC_008769	CTCGG	2	10	67211	67220	0 %	20 %	40 %	40 %	121635945
62	NC_008769	GGCGC	2	10	67754	67763	0 %	0 %	60 %	40 %	121635945
63	NC_008769	TGGCC	2	10	67902	67911	0 %	20 %	40 %	40 %	121635945
64	NC_008769	CGGCG	2	10	68434	68443	0 %	0 %	60 %	40 %	121635945
65	NC_008769	GTCCA	2	10	69045	69054	20 %	20 %	20 %	40 %	121635946
66	NC_008769	GCCAA	2	10	71179	71188	40 %	0 %	20 %	40 %	121635948
67	NC_008769	GCGTC	2	10	71594	71603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_008769	GCACA	2	10	71978	71987	40 %	0 %	20 %	40 %	121635949
69	NC_008769	GGTAC	2	10	74512	74521	20 %	20 %	40 %	20 %	121635951
70	NC_008769	TCGAA	2	10	74744	74753	40 %	20 %	20 %	20 %	121635951
71	NC_008769	GCACC	2	10	75674	75683	20 %	0 %	20 %	60 %	121635951
72	NC_008769	CGGTG	2	10	76708	76717	0 %	20 %	60 %	20 %	121635952
73	NC_008769	TCATG	2	10	76854	76863	20 %	40 %	20 %	20 %	121635952
74	NC_008769	ATCGG	2	10	77001	77010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008769	GCAGC	2	10	78248	78257	20 %	0 %	40 %	40 %	121635954
76	NC_008769	CCCGA	2	10	78331	78340	20 %	0 %	20 %	60 %	121635954
77	NC_008769	CAGCG	2	10	79456	79465	20 %	0 %	40 %	40 %	121635955
78	NC_008769	CTCCC	2	10	85899	85908	0 %	20 %	0 %	80 %	121635961
79	NC_008769	CGGCG	2	10	86348	86357	0 %	0 %	60 %	40 %	121635961
80	NC_008769	CGACC	2	10	87880	87889	20 %	0 %	20 %	60 %	121635963
81	NC_008769	CTTCG	2	10	88567	88576	0 %	40 %	20 %	40 %	121635964
82	NC_008769	CGGTG	2	10	89623	89632	0 %	20 %	60 %	20 %	121635967
83	NC_008769	TCAGG	2	10	92109	92118	20 %	20 %	40 %	20 %	121635968
84	NC_008769	TGCCG	2	10	95140	95149	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008769	GGCGA	2	10	96072	96081	20 %	0 %	60 %	20 %	121635972
86	NC_008769	GGTGT	2	10	98648	98657	0 %	40 %	60 %	0 %	121635974
87	NC_008769	ATCGG	2	10	99285	99294	20 %	20 %	40 %	20 %	121635974
88	NC_008769	CCGCG	2	10	99822	99831	0 %	0 %	40 %	60 %	121635974
89	NC_008769	GGCAA	2	10	100173	100182	40 %	0 %	40 %	20 %	121635974
90	NC_008769	CGACC	2	10	100462	100471	20 %	0 %	20 %	60 %	121635974
91	NC_008769	CGGGT	2	10	100916	100925	0 %	20 %	60 %	20 %	121635974
92	NC_008769	GGTCG	2	10	100976	100985	0 %	20 %	60 %	20 %	121635974
93	NC_008769	TGCCT	2	10	101717	101726	0 %	40 %	20 %	40 %	121635976
94	NC_008769	GTCCA	2	10	102588	102597	20 %	20 %	20 %	40 %	121635977
95	NC_008769	TGACC	2	10	105212	105221	20 %	20 %	20 %	40 %	121635979
96	NC_008769	GCCAA	2	10	105526	105535	40 %	0 %	20 %	40 %	121635979
97	NC_008769	GTCGC	2	10	105603	105612	0 %	20 %	40 %	40 %	121635979
98	NC_008769	GCGCG	2	10	106691	106700	0 %	0 %	60 %	40 %	121635980
99	NC_008769	CACGA	2	10	109593	109602	40 %	0 %	20 %	40 %	121635982
100	NC_008769	GCACC	2	10	110033	110042	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008769	CCACC	2	10	110226	110235	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
102	NC_008769	GAGCA	2	10	112131	112140	40 %	0 %	40 %	20 %	121635984
103	NC_008769	GCCGG	2	10	112230	112239	0 %	0 %	60 %	40 %	121635984
104	NC_008769	GCGAC	2	10	112306	112315	20 %	0 %	40 %	40 %	121635984
105	NC_008769	ATCCG	2	10	113076	113085	20 %	20 %	20 %	40 %	121635985
106	NC_008769	CACCG	2	10	113856	113865	20 %	0 %	20 %	60 %	121635986
107	NC_008769	TGGTC	2	10	115991	116000	0 %	40 %	40 %	20 %	121635988
108	NC_008769	GCTGG	2	10	116628	116637	0 %	20 %	60 %	20 %	121635989
109	NC_008769	TGGGT	2	10	119666	119675	0 %	40 %	60 %	0 %	121635995
110	NC_008769	TCGCC	2	10	119873	119882	0 %	20 %	20 %	60 %	121635995
111	NC_008769	GGGCC	2	10	120846	120855	0 %	0 %	60 %	40 %	121635996
112	NC_008769	GGCCG	2	10	122165	122174	0 %	0 %	60 %	40 %	121635997
113	NC_008769	GCGCC	2	10	122817	122826	0 %	0 %	40 %	60 %	121635997
114	NC_008769	GCTTG	2	10	124849	124858	0 %	40 %	40 %	20 %	121635999
115	NC_008769	CGTGT	2	10	125281	125290	0 %	40 %	40 %	20 %	121636000
116	NC_008769	AGATC	2	10	125360	125369	40 %	20 %	20 %	20 %	121636000
117	NC_008769	CGGCG	2	10	128941	128950	0 %	0 %	60 %	40 %	121636003
118	NC_008769	CGGCG	2	10	129068	129077	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008769	GCGGT	2	10	130017	130026	0 %	20 %	60 %	20 %	121636004
120	NC_008769	GGTGA	2	10	130235	130244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008769	GCGCC	2	10	132849	132858	0 %	0 %	40 %	60 %	121636006
122	NC_008769	GGTGG	2	10	133537	133546	0 %	20 %	80 %	0 %	121636007
123	NC_008769	CTGGC	2	10	135273	135282	0 %	20 %	40 %	40 %	121636009
124	NC_008769	GCACA	2	10	136394	136403	40 %	0 %	20 %	40 %	121636009
125	NC_008769	CTGAA	2	10	138724	138733	40 %	20 %	20 %	20 %	121636012
126	NC_008769	ATCGC	2	10	139219	139228	20 %	20 %	20 %	40 %	121636012
127	NC_008769	TCTGA	2	10	140553	140562	20 %	40 %	20 %	20 %	121636014
128	NC_008769	CGGTC	2	10	140828	140837	0 %	20 %	40 %	40 %	121636014
129	NC_008769	GACCA	2	10	141966	141975	40 %	0 %	20 %	40 %	121636014
130	NC_008769	GGCTG	2	10	144530	144539	0 %	20 %	60 %	20 %	121636014
131	NC_008769	CCGCG	2	10	148450	148459	0 %	0 %	40 %	60 %	121636015
132	NC_008769	TCGTG	2	10	152403	152412	0 %	40 %	40 %	20 %	121636017
133	NC_008769	GCACG	2	10	154058	154067	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008769	CCGGA	2	10	154184	154193	20 %	0 %	40 %	40 %	121636019
135	NC_008769	GGCCG	2	10	156545	156554	0 %	0 %	60 %	40 %	121636020
136	NC_008769	TGCGC	2	10	156657	156666	0 %	20 %	40 %	40 %	121636020
137	NC_008769	GCGAG	2	10	157168	157177	20 %	0 %	60 %	20 %	121636020
138	NC_008769	GGGGT	2	10	158177	158186	0 %	20 %	80 %	0 %	121636020
139	NC_008769	CCCAC	2	10	158739	158748	20 %	0 %	0 %	80 %	121636020
140	NC_008769	CCGGC	2	10	159249	159258	0 %	0 %	40 %	60 %	121636020
141	NC_008769	TGCGG	2	10	159659	159668	0 %	20 %	60 %	20 %	121636020
142	NC_008769	ATCAC	2	10	161138	161147	40 %	20 %	0 %	40 %	121636022
143	NC_008769	ATCGG	2	10	161186	161195	20 %	20 %	40 %	20 %	121636022
144	NC_008769	CGGGC	2	10	162277	162286	0 %	0 %	60 %	40 %	121636022
145	NC_008769	GCGAT	2	10	164082	164091	20 %	20 %	40 %	20 %	121636024
146	NC_008769	GTTCG	2	10	164303	164312	0 %	40 %	40 %	20 %	121636024
147	NC_008769	CCTGG	2	10	164695	164704	0 %	20 %	40 %	40 %	121636024
148	NC_008769	GGCCC	2	10	164801	164810	0 %	0 %	40 %	60 %	121636024
149	NC_008769	CGTTG	2	10	165313	165322	0 %	40 %	40 %	20 %	121636024
150	NC_008769	CGACC	2	10	165385	165394	20 %	0 %	20 %	60 %	121636024
151	NC_008769	GAGAT	2	10	168405	168414	40 %	20 %	40 %	0 %	121636028
152	NC_008769	CGGCG	2	10	170560	170569	0 %	0 %	60 %	40 %	121636029
153	NC_008769	TGCGG	2	10	171193	171202	0 %	20 %	60 %	20 %	121636030
154	NC_008769	CGCTG	2	10	171900	171909	0 %	20 %	40 %	40 %	121636031
155	NC_008769	GTTGC	2	10	172446	172455	0 %	40 %	40 %	20 %	121636031
156	NC_008769	CCGAT	2	10	173194	173203	20 %	20 %	20 %	40 %	121636031
157	NC_008769	ATCGC	2	10	173885	173894	20 %	20 %	20 %	40 %	121636032
158	NC_008769	AACCG	2	10	174624	174633	40 %	0 %	20 %	40 %	121636032
159	NC_008769	CCGCC	2	10	175211	175220	0 %	0 %	20 %	80 %	121636032
160	NC_008769	CCGCC	2	10	175854	175863	0 %	0 %	20 %	80 %	121636033
161	NC_008769	GGGTC	2	10	177607	177616	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_008769	ATCGG	2	10	179337	179346	20 %	20 %	40 %	20 %	121636037
163	NC_008769	ATTGG	2	10	182145	182154	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008769	AGCGA	2	10	184048	184057	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_008769	AGCGA	2	10	184101	184110	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_008769	TCGTC	2	10	184448	184457	0 %	40 %	20 %	40 %	121636040
167	NC_008769	CACGC	2	10	184912	184921	20 %	0 %	20 %	60 %	121636040
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169	NC_008769	AGGCG	2	10	186284	186293	20 %	0 %	60 %	20 %	121636041
170	NC_008769	TGACC	2	10	189288	189297	20 %	20 %	20 %	40 %	121636044
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172	NC_008769	GCACC	2	10	189704	189713	20 %	0 %	20 %	60 %	121636045
173	NC_008769	CCGCA	2	10	190882	190891	20 %	0 %	20 %	60 %	121636046
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176	NC_008769	GTCGC	2	10	191450	191459	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
177	NC_008769	GCCGG	2	10	191749	191758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
178	NC_008769	GCGCG	2	10	191871	191880	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_008769	GTTGG	2	10	196647	196656	0 %	40 %	60 %	0 %	121636051
182	NC_008769	GCGTG	2	10	197813	197822	0 %	20 %	60 %	20 %	121636054
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185	NC_008769	GCATG	2	10	201100	201109	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
186	NC_008769	CTACC	2	10	201703	201712	20 %	20 %	0 %	60 %	121636057
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188	NC_008769	ACCAA	2	10	204569	204578	60 %	0 %	0 %	40 %	121636059
189	NC_008769	CCCGA	2	10	204579	204588	20 %	0 %	20 %	60 %	121636059
190	NC_008769	TGGTC	2	10	205236	205245	0 %	40 %	40 %	20 %	121636060
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201	NC_008769	GGCTG	2	10	220860	220869	0 %	20 %	60 %	20 %	121636073
202	NC_008769	ACGGT	2	10	221006	221015	20 %	20 %	40 %	20 %	121636073
203	NC_008769	CACCC	2	10	221128	221137	20 %	0 %	0 %	80 %	121636073
204	NC_008769	GGAAG	2	10	224872	224881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
205	NC_008769	GGCCG	2	10	226278	226287	0 %	0 %	60 %	40 %	121636078
206	NC_008769	CGGCG	2	10	227032	227041	0 %	0 %	60 %	40 %	121636079
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214	NC_008769	GCAGG	2	10	242356	242365	20 %	0 %	60 %	20 %	121636093
215	NC_008769	GCCGA	2	10	244827	244836	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
216	NC_008769	CCTCG	2	10	245263	245272	0 %	20 %	20 %	60 %	121636096
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226	NC_008769	GGTGC	2	10	252100	252109	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_008769	ACCCG	2	10	253709	253718	20 %	0 %	20 %	60 %	121636104
231	NC_008769	CGCAG	2	10	254779	254788	20 %	0 %	40 %	40 %	121636105
232	NC_008769	CCGGG	2	10	257848	257857	0 %	0 %	60 %	40 %	121636106
233	NC_008769	TGCGC	2	10	261411	261420	0 %	20 %	40 %	40 %	121636107
234	NC_008769	GGCCG	2	10	261463	261472	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
235	NC_008769	CTGCG	2	10	264438	264447	0 %	20 %	40 %	40 %	121636110
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238	NC_008769	TCGAT	2	10	267101	267110	20 %	40 %	20 %	20 %	121636111
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243	NC_008769	CCAGC	2	10	274902	274911	20 %	0 %	20 %	60 %	121636118
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246	NC_008769	GGTGA	2	10	281214	281223	20 %	20 %	60 %	0 %	121636122
247	NC_008769	TGGCC	2	10	282265	282274	0 %	20 %	40 %	40 %	121636123
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249	NC_008769	GTCCA	2	10	286913	286922	20 %	20 %	20 %	40 %	121636126
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251	NC_008769	GACCG	2	10	289265	289274	20 %	0 %	40 %	40 %	121636128
252	NC_008769	CGGTG	2	10	289471	289480	0 %	20 %	60 %	20 %	121636128
253	NC_008769	GGCTC	2	10	289522	289531	0 %	20 %	40 %	40 %	121636128
254	NC_008769	TGGCA	2	10	289985	289994	20 %	20 %	40 %	20 %	121636129
255	NC_008769	GGCCA	2	10	291087	291096	20 %	0 %	40 %	40 %	121636130
256	NC_008769	GGCGA	2	10	292008	292017	20 %	0 %	60 %	20 %	121636130
257	NC_008769	GCCGG	2	10	296343	296352	0 %	0 %	60 %	40 %	121636136
258	NC_008769	TCTGC	2	10	296696	296705	0 %	40 %	20 %	40 %	121636137
259	NC_008769	TCGGC	2	10	297100	297109	0 %	20 %	40 %	40 %	121636137
260	NC_008769	GTCGA	2	10	297116	297125	20 %	20 %	40 %	20 %	121636137
261	NC_008769	CGAGT	2	10	300711	300720	20 %	20 %	40 %	20 %	121636139
262	NC_008769	TCGAT	2	10	302545	302554	20 %	40 %	20 %	20 %	121636141
263	NC_008769	GCCGC	2	10	303436	303445	0 %	0 %	40 %	60 %	121636142
264	NC_008769	GCCCG	2	10	303655	303664	0 %	0 %	40 %	60 %	121636142
265	NC_008769	GCAGT	2	10	304033	304042	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_008769	GATCC	2	10	306475	306484	20 %	20 %	20 %	40 %	121636144
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268	NC_008769	AACCG	2	10	308581	308590	40 %	0 %	20 %	40 %	121636146
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