MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 chromosome

Total Repeats: 11308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008769	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	121635884
2	NC_008769	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	121635884
3	NC_008769	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	121635884
4	NC_008769	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	121635884
5	NC_008769	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	121635884
6	NC_008769	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008769	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	121635885
8	NC_008769	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	121635885
9	NC_008769	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	121635885
10	NC_008769	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	121635885
11	NC_008769	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	121635885
12	NC_008769	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	121635885
13	NC_008769	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	121635886
14	NC_008769	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	121635886
15	NC_008769	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	121635886
16	NC_008769	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	121635886
17	NC_008769	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	121635888
18	NC_008769	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	121635888
19	NC_008769	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	121635888
20	NC_008769	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	121635888
21	NC_008769	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	121635888
22	NC_008769	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	121635889
23	NC_008769	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	121635889
24	NC_008769	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	121635889
25	NC_008769	CGTG	2	8	8735	8742	0 %	25 %	50 %	25 %	121635889
26	NC_008769	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	121635889
27	NC_008769	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	121635889
28	NC_008769	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	121635889
29	NC_008769	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	121635890
30	NC_008769	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008769	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	121635891
32	NC_008769	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	121635891
33	NC_008769	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_008769	AACC	2	8	13337	13344	50 %	0 %	0 %	50 %	121635893
35	NC_008769	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	121635893
36	NC_008769	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008769	ACCC	2	8	14097	14104	25 %	0 %	0 %	75 %	121635895
38	NC_008769	TGAT	2	8	14134	14141	25 %	50 %	25 %	0 %	121635895
39	NC_008769	TGCT	2	8	14181	14188	0 %	50 %	25 %	25 %	121635895
40	NC_008769	GCCC	2	8	14668	14675	0 %	0 %	25 %	75 %	121635895
41	NC_008769	GGGC	2	8	15449	15456	0 %	0 %	75 %	25 %	121635896
42	NC_008769	CTGA	2	8	15904	15911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008769	TGGC	2	8	16047	16054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008769	GCTT	2	8	16106	16113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008769	CAGT	2	8	16134	16141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008769	CGGT	2	8	16505	16512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008769	GCCG	2	8	16564	16571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008769	TCGA	2	8	17220	17227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008769	CGGT	2	8	17487	17494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008769	CACC	2	8	17794	17801	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_008769	GCCA	2	8	18302	18309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008769	CCTG	2	8	19573	19580	0 %	25 %	25 %	50 %	121635898
53	NC_008769	CGAT	2	8	19627	19634	25 %	25 %	25 %	25 %	121635898
54	NC_008769	TCGC	2	8	19785	19792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008769	CGTT	2	8	19820	19827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008769	GATG	2	8	20081	20088	25 %	25 %	50 %	0 %	121635899
57	NC_008769	TCGC	2	8	20392	20399	0 %	25 %	25 %	50 %	121635899
58	NC_008769	ACCA	2	8	20490	20497	50 %	0 %	0 %	50 %	121635899
59	NC_008769	CCGC	2	8	21078	21085	0 %	0 %	25 %	75 %	121635900
60	NC_008769	GTCC	2	8	22069	22076	0 %	25 %	25 %	50 %	121635901
61	NC_008769	TTCA	2	8	22236	22243	25 %	50 %	0 %	25 %	121635901
62	NC_008769	CTGT	2	8	22509	22516	0 %	50 %	25 %	25 %	121635901
63	NC_008769	CGAG	2	8	22517	22524	25 %	0 %	50 %	25 %	121635901
64	NC_008769	GCCG	2	8	22580	22587	0 %	0 %	50 %	50 %	121635902
65	NC_008769	CCGG	2	8	23453	23460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008769	CACG	2	8	24209	24216	25 %	0 %	25 %	50 %	121635903
67	NC_008769	GGGC	2	8	25028	25035	0 %	0 %	75 %	25 %	121635904
68	NC_008769	GATC	2	8	25144	25151	25 %	25 %	25 %	25 %	121635904
69	NC_008769	CGCT	2	8	25173	25180	0 %	25 %	25 %	50 %	121635904
70	NC_008769	CGGT	2	8	25260	25267	0 %	25 %	50 %	25 %	121635904
71	NC_008769	GTGG	2	8	25442	25449	0 %	25 %	75 %	0 %	121635904
72	NC_008769	TCGG	2	8	26444	26451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008769	GGGT	2	8	27055	27062	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008769	CACC	2	8	27613	27620	25 %	0 %	0 %	75 %	121635907
75	NC_008769	CAGT	2	8	27757	27764	25 %	25 %	25 %	25 %	121635907
76	NC_008769	CGCA	2	8	28046	28053	25 %	0 %	25 %	50 %	121635907
77	NC_008769	CAAA	2	8	28189	28196	75 %	0 %	0 %	25 %	121635907
78	NC_008769	GTCT	2	8	28254	28261	0 %	50 %	25 %	25 %	121635908
79	NC_008769	AGAC	2	8	28539	28546	50 %	0 %	25 %	25 %	121635908
80	NC_008769	CACT	2	8	29105	29112	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008769	CGAC	2	8	29978	29985	25 %	0 %	25 %	50 %	121635911
82	NC_008769	CGTT	2	8	30194	30201	0 %	50 %	25 %	25 %	121635911
83	NC_008769	CCCG	2	8	30256	30263	0 %	0 %	25 %	75 %	121635911
84	NC_008769	GGCA	2	8	30327	30334	25 %	0 %	50 %	25 %	121635911
85	NC_008769	CCCA	2	8	30585	30592	25 %	0 %	0 %	75 %	121635911
86	NC_008769	CCGA	2	8	31392	31399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008769	GTGG	2	8	31799	31806	0 %	25 %	75 %	0 %	121635912
88	NC_008769	GCCA	2	8	31817	31824	25 %	0 %	25 %	50 %	121635912
89	NC_008769	TCAG	2	8	32161	32168	25 %	25 %	25 %	25 %	121635912
90	NC_008769	CGTT	2	8	32387	32394	0 %	50 %	25 %	25 %	121635912
91	NC_008769	ACGG	2	8	32739	32746	25 %	0 %	50 %	25 %	121635912
92	NC_008769	GCCT	2	8	32801	32808	0 %	25 %	25 %	50 %	121635912
93	NC_008769	CGTC	2	8	32952	32959	0 %	25 %	25 %	50 %	121635913
94	NC_008769	GGTA	2	8	33132	33139	25 %	25 %	50 %	0 %	121635913
95	NC_008769	GGTT	2	8	33314	33321	0 %	50 %	50 %	0 %	121635913
96	NC_008769	CCGC	2	8	33542	33549	0 %	0 %	25 %	75 %	121635913
97	NC_008769	CCAC	2	8	35166	35173	25 %	0 %	0 %	75 %	121635915
98	NC_008769	ACCG	2	8	35185	35192	25 %	0 %	25 %	50 %	121635915
99	NC_008769	CAAG	2	8	35380	35387	50 %	0 %	25 %	25 %	121635915
100	NC_008769	CGCC	2	8	35476	35483	0 %	0 %	25 %	75 %	121635915
101	NC_008769	CGGC	2	8	36291	36298	0 %	0 %	50 %	50 %	121635915
102	NC_008769	GACA	2	8	36971	36978	50 %	0 %	25 %	25 %	121635916
103	NC_008769	CGGT	2	8	37191	37198	0 %	25 %	50 %	25 %	121635916
104	NC_008769	CGAG	2	8	38123	38130	25 %	0 %	50 %	25 %	121635916
105	NC_008769	CGTG	2	8	38402	38409	0 %	25 %	50 %	25 %	121635916
106	NC_008769	CCAC	2	8	38653	38660	25 %	0 %	0 %	75 %	121635916
107	NC_008769	CGAC	2	8	39022	39029	25 %	0 %	25 %	50 %	121635916
108	NC_008769	GGTT	2	8	39250	39257	0 %	50 %	50 %	0 %	121635916
109	NC_008769	CCCG	2	8	39799	39806	0 %	0 %	25 %	75 %	121635917
110	NC_008769	GCAC	2	8	41275	41282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008769	GAGC	2	8	41759	41766	25 %	0 %	50 %	25 %	121635918
112	NC_008769	CTCA	2	8	41970	41977	25 %	25 %	0 %	50 %	121635918
113	NC_008769	GCCC	2	8	42120	42127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_008769	AACC	2	8	43004	43011	50 %	0 %	0 %	50 %	121635920
115	NC_008769	CCCG	2	8	43113	43120	0 %	0 %	25 %	75 %	121635920
116	NC_008769	ATTC	2	8	43357	43364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008769	ACCC	2	8	43764	43771	25 %	0 %	0 %	75 %	121635922
118	NC_008769	TGAT	2	8	43801	43808	25 %	50 %	25 %	0 %	121635922
119	NC_008769	TGCT	2	8	43848	43855	0 %	50 %	25 %	25 %	121635922
120	NC_008769	GCCC	2	8	44335	44342	0 %	0 %	25 %	75 %	121635922
121	NC_008769	GGGC	2	8	45116	45123	0 %	0 %	75 %	25 %	121635923
122	NC_008769	CTGA	2	8	45571	45578	25 %	25 %	25 %	25 %	121635924
123	NC_008769	TGGC	2	8	45714	45721	0 %	25 %	50 %	25 %	121635924
124	NC_008769	GCTT	2	8	45773	45780	0 %	50 %	25 %	25 %	121635924
125	NC_008769	CAGT	2	8	45801	45808	25 %	25 %	25 %	25 %	121635924
126	NC_008769	CGGT	2	8	46172	46179	0 %	25 %	50 %	25 %	121635924
127	NC_008769	GCCG	2	8	46231	46238	0 %	0 %	50 %	50 %	121635924
128	NC_008769	CGGG	2	8	47466	47473	0 %	0 %	75 %	25 %	121635925
129	NC_008769	CTGG	2	8	47574	47581	0 %	25 %	50 %	25 %	121635925
130	NC_008769	GTGC	2	8	48074	48081	0 %	25 %	50 %	25 %	121635925
131	NC_008769	GCCG	2	8	48092	48099	0 %	0 %	50 %	50 %	121635925
132	NC_008769	CCGC	2	8	48457	48464	0 %	0 %	25 %	75 %	121635926
133	NC_008769	GCCG	2	8	49921	49928	0 %	0 %	50 %	50 %	121635927
134	NC_008769	CCAG	2	8	50409	50416	25 %	0 %	25 %	50 %	121635927
135	NC_008769	CACC	2	8	50592	50599	25 %	0 %	0 %	75 %	121635927
136	NC_008769	CGGG	2	8	51548	51555	0 %	0 %	75 %	25 %	121635928
137	NC_008769	GCCG	2	8	51639	51646	0 %	0 %	50 %	50 %	121635928
138	NC_008769	GCTG	2	8	52019	52026	0 %	25 %	50 %	25 %	121635928
139	NC_008769	CGGC	2	8	52039	52046	0 %	0 %	50 %	50 %	121635928
140	NC_008769	GCCG	2	8	52710	52717	0 %	0 %	50 %	50 %	121635928
141	NC_008769	CCCA	2	8	52722	52729	25 %	0 %	0 %	75 %	121635928
142	NC_008769	GCTG	2	8	53861	53868	0 %	25 %	50 %	25 %	121635930
143	NC_008769	CGGC	2	8	53909	53916	0 %	0 %	50 %	50 %	121635930
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