MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis FAM18 chromosome

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008767	CTTGC	2	10	3237	3246	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008767	ATTTC	2	10	3520	3529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008767	GCCTT	2	10	14851	14860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008767	GGCGG	2	10	28451	28460	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008767	AACAT	2	10	30201	30210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008767	TAATT	2	10	30222	30231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008767	GAATT	2	10	30252	30261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008767	CCCGT	2	10	34367	34376	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008767	CAATT	2	10	37682	37691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008767	CCCGC	2	10	42463	42472	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_008767	TCGTG	2	10	47708	47717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008767	AGAAA	2	10	48669	48678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008767	GGGAG	2	10	49333	49342	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008767	AGGTT	2	10	50275	50284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008767	ATTTT	2	10	52689	52698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008767	TGCTA	2	10	60962	60971	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008767	TTGAT	2	10	73584	73593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008767	TTTCC	2	10	73905	73914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008767	ATTTT	2	10	74254	74263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008767	GGCAA	2	10	81896	81905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008767	ACCAA	2	10	90405	90414	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008767	ATTTA	2	10	91227	91236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008767	AAATA	2	10	91237	91246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008767	ATTAA	2	10	91262	91271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008767	TGCCG	2	10	106512	106521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008767	TTTCC	2	10	133612	133621	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008767	CAAAC	2	10	138824	138833	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008767	CTTTA	2	10	139451	139460	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008767	AATTT	2	10	144114	144123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008767	TTTAT	2	10	159928	159937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008767	TGCCG	2	10	161330	161339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008767	TAAAA	2	10	177883	177892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008767	CGCGG	2	10	210580	210589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_008767	GGGGT	2	10	210708	210717	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008767	ATAAA	2	10	215295	215304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008767	CTGCC	2	10	215407	215416	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_008767	ATTTT	2	10	235693	235702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008767	TTTTA	2	10	253022	253031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008767	CATTA	2	10	302466	302475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008767	CAAAC	2	10	305991	306000	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008767	GATAT	2	10	317009	317018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008767	ATATT	2	10	321431	321440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008767	TGGAA	2	10	330682	330691	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008767	AAGGG	2	10	333364	333373	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008767	AATCC	2	10	333487	333496	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008767	TATAG	2	10	334872	334881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008767	CGTGT	2	10	336464	336473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008767	TGGGT	2	10	341344	341353	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008767	TTTGA	2	10	344562	344571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008767	TTTCC	2	10	360868	360877	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008767	AATTG	2	10	376704	376713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008767	TTCCG	2	10	380272	380281	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008767	GGGAA	2	10	382021	382030	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008767	AAAAT	2	10	388804	388813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008767	GCTGC	2	10	402607	402616	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008767	ATTTT	2	10	403635	403644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008767	GGTTT	2	10	425684	425693	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008767	TGGGC	2	10	446493	446502	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008767	TAAAA	2	10	446985	446994	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008767	AAGGA	2	10	471299	471308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008767	AAGAA	2	10	483478	483487	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008767	GCGGG	2	10	504599	504608	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008767	ACAGA	2	10	511279	511288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008767	TTATA	2	10	512539	512548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008767	TTTTG	2	10	516777	516786	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008767	GTTTT	2	10	522314	522323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008767	ATATT	2	10	526874	526883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008767	TTGAT	2	10	539006	539015	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008767	GCGCG	2	10	540513	540522	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008767	GTAAA	2	10	540607	540616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008767	TTTCA	2	10	543963	543972	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008767	AATTT	2	10	546137	546146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008767	TGATA	2	10	563859	563868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008767	GTTCG	2	10	563896	563905	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008767	ACCGC	2	10	575199	575208	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_008767	TTTTC	2	10	582675	582684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008767	GGCAA	3	15	582777	582791	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008767	TAATA	2	10	582844	582853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008767	TTTTA	2	10	589286	589295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008767	TCCAA	2	10	595341	595350	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008767	ATTAC	2	10	621130	621139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008767	CAAAA	2	10	624558	624567	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008767	TTGGA	2	10	630701	630710	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008767	AAAAC	2	10	634978	634987	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008767	AGGAA	2	10	662121	662130	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008767	ATTTT	2	10	669995	670004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008767	TGGGG	2	10	675854	675863	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008767	CGGCG	2	10	675903	675912	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008767	AAATA	2	10	686620	686629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008767	GCTTG	2	10	687602	687611	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008767	GAAAA	2	10	690259	690268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008767	TTTAA	2	10	690291	690300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008767	TTTGA	2	10	691095	691104	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008767	GGGTA	2	10	692779	692788	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008767	GGATG	2	10	698892	698901	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008767	GTTTT	2	10	704843	704852	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008767	GAATG	2	10	705634	705643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008767	GGTAT	2	10	705979	705988	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008767	CCGTA	2	10	709802	709811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008767	AATAC	2	10	715908	715917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008767	ATCAT	2	10	726151	726160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008767	GCGGA	2	10	735945	735954	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008767	ATGGG	2	10	736101	736110	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008767	ACGGC	2	10	740166	740175	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008767	TTTTC	2	10	744202	744211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008767	TTTTC	2	10	745307	745316	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008767	CGCGC	2	10	752908	752917	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_008767	ATGAG	2	10	764481	764490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008767	CGAAA	2	10	785963	785972	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008767	GATAA	2	10	787755	787764	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008767	CAAAC	2	10	811088	811097	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008767	TTTTG	2	10	821289	821298	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008767	GCGCG	2	10	821303	821312	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008767	CAAAA	2	10	843887	843896	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008767	AAAAC	2	10	847076	847085	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008767	GTTTT	2	10	850015	850024	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008767	AATAC	2	10	850678	850687	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008767	AAACT	2	10	850759	850768	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008767	AGGAA	2	10	872381	872390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008767	GAAAA	2	10	877895	877904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008767	TAAAT	2	10	882300	882309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008767	TTGTT	2	10	897719	897728	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008767	TAACA	2	10	918085	918094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008767	AAAGA	2	10	929639	929648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008767	TAATA	2	10	939300	939309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008767	TAAAA	2	10	939458	939467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008767	TCCCA	2	10	962645	962654	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_008767	CCCTT	2	10	971854	971863	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_008767	GTTGC	2	10	974097	974106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008767	GTTGC	2	10	974250	974259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008767	GTTGC	2	10	974599	974608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008767	GTTGC	2	10	974874	974883	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008767	GTTGC	2	10	975226	975235	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008767	GAAAA	2	10	978354	978363	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008767	TTTGA	2	10	999933	999942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008767	TACTT	2	10	1014231	1014240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008767	ATGAT	2	10	1015684	1015693	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008767	AAGGG	2	10	1017337	1017346	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008767	ATAAA	2	10	1030195	1030204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008767	ATAGT	2	10	1030620	1030629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008767	GTAAG	2	10	1034403	1034412	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008767	GAAAG	2	10	1038468	1038477	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008767	GCCGC	2	10	1044064	1044073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_008767	CGCGG	2	10	1049863	1049872	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008767	ACGGA	2	10	1057624	1057633	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008767	AAAAC	2	10	1062852	1062861	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008767	CCGCA	2	10	1067132	1067141	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_008767	CGGAA	2	10	1067175	1067184	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_008767	GCTTT	2	10	1082914	1082923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_008767	CGGCG	2	10	1094011	1094020	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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233	NC_008767	TACAC	2	10	1524048	1524057	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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252	NC_008767	ATTTT	2	10	1609041	1609050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_008767	TGCCG	2	10	1632501	1632510	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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350	NC_008767	AAACC	2	10	2174434	2174443	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
351	NC_008767	GATAA	2	10	2176334	2176343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
352	NC_008767	GGCAA	2	10	2177197	2177206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
353	NC_008767	TGTAT	2	10	2178355	2178364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
354	NC_008767	ATTTA	2	10	2194851	2194860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.