MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO02

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008766	CATCGC	2	12	2220	2231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121582554
2	NC_008766	CGACGG	2	12	2286	2297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582554
3	NC_008766	CATCGC	2	12	5448	5459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121582555
4	NC_008766	GCAGGG	2	12	6382	6393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	121582558
5	NC_008766	CGCGGG	2	12	8688	8699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582561
6	NC_008766	GCGCTC	2	12	9724	9735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121582563
7	NC_008766	ATCGGC	2	12	13202	13213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121582569
8	NC_008766	GGCCTT	2	12	13376	13387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582569
9	NC_008766	CGCCAC	2	12	13774	13785	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121582569
10	NC_008766	GTCGGC	2	12	15198	15209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121582571
11	NC_008766	AGGGCG	2	12	17773	17784	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	121582573
12	NC_008766	TGGCGA	2	12	18562	18573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121582574
13	NC_008766	GGCCAG	2	12	18650	18661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582574
14	NC_008766	ATGAAG	2	12	21136	21147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	121582576
15	NC_008766	TCACGT	2	12	25719	25730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121582582
16	NC_008766	GCCCGC	2	12	32726	32737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582586
17	NC_008766	TCACCC	2	12	33531	33542	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	121582586
18	NC_008766	CCAAGC	2	12	39231	39242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	121582590
19	NC_008766	TGCCCG	2	12	39427	39438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121582590
20	NC_008766	CGGGCA	2	12	40386	40397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582590
21	NC_008766	GCGACG	2	12	50742	50753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582603
22	NC_008766	AGGCCG	2	12	51594	51605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582604
23	NC_008766	AAGGGC	3	18	52151	52168	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121582604
24	NC_008766	GCAGGC	2	12	53309	53320	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582606
25	NC_008766	GTTGAA	2	12	54766	54777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582609
26	NC_008766	ACAGCC	2	12	57249	57260	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	121582612
27	NC_008766	GCAAAG	2	12	58722	58733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121582614
28	NC_008766	CGTGGC	2	12	58970	58981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121582614
29	NC_008766	CCACCG	2	12	59125	59136	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121582614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.