MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO02

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008766	GCACC	2	10	722	731	20 %	0 %	20 %	60 %	121582554
2	NC_008766	GAACA	2	10	946	955	60 %	0 %	20 %	20 %	121582554
3	NC_008766	CGCGG	2	10	1735	1744	0 %	0 %	60 %	40 %	121582554
4	NC_008766	CAAGA	2	10	2677	2686	60 %	0 %	20 %	20 %	121582554
5	NC_008766	GCCGG	2	10	5485	5494	0 %	0 %	60 %	40 %	121582555
6	NC_008766	GCGCA	2	10	5548	5557	20 %	0 %	40 %	40 %	121582555
7	NC_008766	CAATT	2	10	6358	6367	40 %	40 %	0 %	20 %	121582558
8	NC_008766	CACAG	2	10	9907	9916	40 %	0 %	20 %	40 %	121582563
9	NC_008766	CAGGC	2	10	13016	13025	20 %	0 %	40 %	40 %	121582568
10	NC_008766	GGCCG	2	10	13057	13066	0 %	0 %	60 %	40 %	121582568
11	NC_008766	CTGCC	2	10	13529	13538	0 %	20 %	20 %	60 %	121582569
12	NC_008766	CAGCG	2	10	13976	13985	20 %	0 %	40 %	40 %	121582569
13	NC_008766	GGGCT	2	10	14899	14908	0 %	20 %	60 %	20 %	121582570
14	NC_008766	GCCGG	2	10	15971	15980	0 %	0 %	60 %	40 %	121582572
15	NC_008766	CCGAA	2	10	16162	16171	40 %	0 %	20 %	40 %	121582572
16	NC_008766	TGCGA	2	10	18238	18247	20 %	20 %	40 %	20 %	121582574
17	NC_008766	TGCGC	2	10	20288	20297	0 %	20 %	40 %	40 %	121582576
18	NC_008766	TCCAT	2	10	20339	20348	20 %	40 %	0 %	40 %	121582576
19	NC_008766	CGACG	2	10	25057	25066	20 %	0 %	40 %	40 %	121582582
20	NC_008766	CCGCC	2	10	25129	25138	0 %	0 %	20 %	80 %	121582582
21	NC_008766	GGTGC	2	10	27774	27783	0 %	20 %	60 %	20 %	121582584
22	NC_008766	GAACA	2	10	34799	34808	60 %	0 %	20 %	20 %	121582587
23	NC_008766	GCCGA	2	10	35360	35369	20 %	0 %	40 %	40 %	121582588
24	NC_008766	GGTGC	2	10	36864	36873	0 %	20 %	60 %	20 %	121582589
25	NC_008766	CGGTT	2	10	38304	38313	0 %	40 %	40 %	20 %	121582589
26	NC_008766	GCGCA	2	10	39702	39711	20 %	0 %	40 %	40 %	121582590
27	NC_008766	GCTCA	2	10	40506	40515	20 %	20 %	20 %	40 %	121582590
28	NC_008766	CCCTG	2	10	43692	43701	0 %	20 %	20 %	60 %	121582592
29	NC_008766	GGCGC	2	10	46627	46636	0 %	0 %	60 %	40 %	121582597
30	NC_008766	GGCCA	2	10	47808	47817	20 %	0 %	40 %	40 %	121582599
31	NC_008766	GCCGG	2	10	47857	47866	0 %	0 %	60 %	40 %	121582599
32	NC_008766	CCCTT	2	10	49520	49529	0 %	40 %	0 %	60 %	121582602
33	NC_008766	GCAAC	2	10	50350	50359	40 %	0 %	20 %	40 %	121582603
34	NC_008766	ACCCG	2	10	50797	50806	20 %	0 %	20 %	60 %	121582603
35	NC_008766	GCGCC	2	10	51826	51835	0 %	0 %	40 %	60 %	121582604
36	NC_008766	GCCGC	2	10	52899	52908	0 %	0 %	40 %	60 %	121582606
37	NC_008766	GCGAC	2	10	56015	56024	20 %	0 %	40 %	40 %	121582611
38	NC_008766	GGCTT	2	10	56436	56445	0 %	40 %	40 %	20 %	121582612
39	NC_008766	AGGGC	2	10	56649	56658	20 %	0 %	60 %	20 %	121582612
40	NC_008766	AAGCG	2	10	56937	56946	40 %	0 %	40 %	20 %	121582612
41	NC_008766	CGACC	2	10	57701	57710	20 %	0 %	20 %	60 %	121582612
42	NC_008766	AAGTG	2	10	58000	58009	40 %	20 %	40 %	0 %	121582612
43	NC_008766	CCCGA	2	10	59222	59231	20 %	0 %	20 %	60 %	121582614
44	NC_008766	ATCGG	2	10	59700	59709	20 %	20 %	40 %	20 %	121582614
45	NC_008766	CGCGC	2	10	62157	62166	0 %	0 %	40 %	60 %	121582616

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.