MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO02

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008766	GCCG	2	8	300	307	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
2	NC_008766	TCAT	2	8	505	512	25 %	50 %	0 %	25 %	121582554
3	NC_008766	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
4	NC_008766	CACG	2	8	1161	1168	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
5	NC_008766	CCGG	2	8	1191	1198	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
6	NC_008766	CGAC	2	8	1199	1206	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
7	NC_008766	GCCA	2	8	1615	1622	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
8	NC_008766	GCAA	2	8	2486	2493	50 %	0 %	25 %	25 %	121582554
9	NC_008766	ATGA	2	8	2698	2705	50 %	25 %	25 %	0 %	121582554
10	NC_008766	CCTT	2	8	2747	2754	0 %	50 %	0 %	50 %	121582554
11	NC_008766	CCAG	2	8	3221	3228	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
12	NC_008766	CGGC	2	8	3839	3846	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
13	NC_008766	ACCG	2	8	4096	4103	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
14	NC_008766	GCCC	2	8	5854	5861	0 %	0 %	25 %	75 %	121582556
15	NC_008766	GTTC	2	8	5972	5979	0 %	50 %	25 %	25 %	121582556
16	NC_008766	TCAA	2	8	6328	6335	50 %	25 %	0 %	25 %	121582557
17	NC_008766	TGGC	2	8	6416	6423	0 %	25 %	50 %	25 %	121582558
18	NC_008766	CGTG	2	8	6690	6697	0 %	25 %	50 %	25 %	121582558
19	NC_008766	TGGC	2	8	6939	6946	0 %	25 %	50 %	25 %	121582558
20	NC_008766	GTCC	2	8	7278	7285	0 %	25 %	25 %	50 %	121582558
21	NC_008766	CAAG	2	8	7426	7433	50 %	0 %	25 %	25 %	121582559
22	NC_008766	CGTG	2	8	7538	7545	0 %	25 %	50 %	25 %	121582559
23	NC_008766	ATTG	2	8	8022	8029	25 %	50 %	25 %	0 %	121582559
24	NC_008766	GCGG	2	8	8851	8858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008766	GCCG	2	8	8889	8896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008766	CCAT	2	8	9102	9109	25 %	25 %	0 %	50 %	121582562
27	NC_008766	TAGG	2	8	9386	9393	25 %	25 %	50 %	0 %	121582562
28	NC_008766	GGCC	2	8	9921	9928	0 %	0 %	50 %	50 %	121582563
29	NC_008766	CCAG	2	8	10059	10066	25 %	0 %	25 %	50 %	121582563
30	NC_008766	GCCG	2	8	10362	10369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008766	CGGC	2	8	11162	11169	0 %	0 %	50 %	50 %	121582565
32	NC_008766	CCGG	2	8	11411	11418	0 %	0 %	50 %	50 %	121582565
33	NC_008766	CGGC	2	8	11464	11471	0 %	0 %	50 %	50 %	121582565
34	NC_008766	GGCC	2	8	11882	11889	0 %	0 %	50 %	50 %	121582567
35	NC_008766	CGTT	2	8	12587	12594	0 %	50 %	25 %	25 %	121582568
36	NC_008766	CGGC	2	8	12818	12825	0 %	0 %	50 %	50 %	121582568
37	NC_008766	CGGC	2	8	13440	13447	0 %	0 %	50 %	50 %	121582569
38	NC_008766	GTTC	2	8	13555	13562	0 %	50 %	25 %	25 %	121582569
39	NC_008766	TGCC	2	8	13840	13847	0 %	25 %	25 %	50 %	121582569
40	NC_008766	GCCA	2	8	14817	14824	25 %	0 %	25 %	50 %	121582569
41	NC_008766	TGGC	2	8	14857	14864	0 %	25 %	50 %	25 %	121582569
42	NC_008766	CCGC	2	8	16617	16624	0 %	0 %	25 %	75 %	121582572
43	NC_008766	ACGA	2	8	17196	17203	50 %	0 %	25 %	25 %	121582572
44	NC_008766	GACG	2	8	17248	17255	25 %	0 %	50 %	25 %	121582572
45	NC_008766	CGGC	2	8	17348	17355	0 %	0 %	50 %	50 %	121582573
46	NC_008766	CGGG	2	8	17382	17389	0 %	0 %	75 %	25 %	121582573
47	NC_008766	GCCG	2	8	17544	17551	0 %	0 %	50 %	50 %	121582573
48	NC_008766	CACG	2	8	18759	18766	25 %	0 %	25 %	50 %	121582575
49	NC_008766	GTAG	2	8	18829	18836	25 %	25 %	50 %	0 %	121582575
50	NC_008766	CCAC	2	8	18900	18907	25 %	0 %	0 %	75 %	121582575
51	NC_008766	TCAT	2	8	19019	19026	25 %	50 %	0 %	25 %	121582575
52	NC_008766	CGGC	2	8	19549	19556	0 %	0 %	50 %	50 %	121582576
53	NC_008766	GCCG	2	8	20466	20473	0 %	0 %	50 %	50 %	121582576
54	NC_008766	GCCG	2	8	20952	20959	0 %	0 %	50 %	50 %	121582576
55	NC_008766	CGTG	2	8	21389	21396	0 %	25 %	50 %	25 %	121582576
56	NC_008766	CAGC	2	8	22697	22704	25 %	0 %	25 %	50 %	121582578
57	NC_008766	TCGG	2	8	23156	23163	0 %	25 %	50 %	25 %	121582579
58	NC_008766	TGGC	2	8	24077	24084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008766	GGTC	2	8	24290	24297	0 %	25 %	50 %	25 %	121582580
60	NC_008766	AGGG	2	8	24358	24365	25 %	0 %	75 %	0 %	121582580
61	NC_008766	AGGA	2	8	24394	24401	50 %	0 %	50 %	0 %	121582580
62	NC_008766	TGAG	2	8	25047	25054	25 %	25 %	50 %	0 %	121582582
63	NC_008766	GCCG	2	8	25372	25379	0 %	0 %	50 %	50 %	121582582
64	NC_008766	CCAC	2	8	26037	26044	25 %	0 %	0 %	75 %	121582582
65	NC_008766	CAAT	2	8	26875	26882	50 %	25 %	0 %	25 %	121582584
66	NC_008766	GAGC	2	8	27119	27126	25 %	0 %	50 %	25 %	121582584
67	NC_008766	GATT	2	8	27874	27881	25 %	50 %	25 %	0 %	121582584
68	NC_008766	GGCA	2	8	28213	28220	25 %	0 %	50 %	25 %	121582584
69	NC_008766	GCAC	2	8	28660	28667	25 %	0 %	25 %	50 %	121582584
70	NC_008766	AGCC	2	8	28771	28778	25 %	0 %	25 %	50 %	121582584
71	NC_008766	GCCC	2	8	28838	28845	0 %	0 %	25 %	75 %	121582584
72	NC_008766	AGCC	2	8	29095	29102	25 %	0 %	25 %	50 %	121582584
73	NC_008766	CCCA	2	8	29400	29407	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_008766	GACT	2	8	29550	29557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008766	TCGC	2	8	30338	30345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008766	GGGT	2	8	30473	30480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008766	CTCG	2	8	30773	30780	0 %	25 %	25 %	50 %	121582585
78	NC_008766	CGGT	2	8	30920	30927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008766	CGGG	2	8	31375	31382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008766	GCGG	2	8	31487	31494	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008766	GCCC	2	8	32050	32057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008766	GGTC	2	8	32309	32316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008766	GCCA	2	8	32518	32525	25 %	0 %	25 %	50 %	121582586
84	NC_008766	GCTG	2	8	32604	32611	0 %	25 %	50 %	25 %	121582586
85	NC_008766	GGCG	2	8	33127	33134	0 %	0 %	75 %	25 %	121582586
86	NC_008766	GCCC	2	8	33404	33411	0 %	0 %	25 %	75 %	121582586
87	NC_008766	GCCT	2	8	33492	33499	0 %	25 %	25 %	50 %	121582586
88	NC_008766	GCAC	2	8	33588	33595	25 %	0 %	25 %	50 %	121582586
89	NC_008766	AGCC	2	8	33699	33706	25 %	0 %	25 %	50 %	121582586
90	NC_008766	GCCC	2	8	33766	33773	0 %	0 %	25 %	75 %	121582586
91	NC_008766	AGCC	2	8	34023	34030	25 %	0 %	25 %	50 %	121582586
92	NC_008766	CAAC	2	8	34363	34370	50 %	0 %	0 %	50 %	121582587
93	NC_008766	GACC	2	8	34588	34595	25 %	0 %	25 %	50 %	121582587
94	NC_008766	GCCT	2	8	34748	34755	0 %	25 %	25 %	50 %	121582587
95	NC_008766	GACC	2	8	34861	34868	25 %	0 %	25 %	50 %	121582587
96	NC_008766	AACG	2	8	35188	35195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008766	CAAT	2	8	35965	35972	50 %	25 %	0 %	25 %	121582589
98	NC_008766	GAGC	2	8	36209	36216	25 %	0 %	50 %	25 %	121582589
99	NC_008766	GATT	2	8	36964	36971	25 %	50 %	25 %	0 %	121582589
100	NC_008766	GGCA	2	8	37303	37310	25 %	0 %	50 %	25 %	121582589
101	NC_008766	GGCG	2	8	37991	37998	0 %	0 %	75 %	25 %	121582589
102	NC_008766	CCAG	2	8	38038	38045	25 %	0 %	25 %	50 %	121582589
103	NC_008766	CCGG	2	8	38479	38486	0 %	0 %	50 %	50 %	121582589
104	NC_008766	GCCA	2	8	39220	39227	25 %	0 %	25 %	50 %	121582590
105	NC_008766	TTCA	2	8	39749	39756	25 %	50 %	0 %	25 %	121582590
106	NC_008766	CGGT	2	8	40455	40462	0 %	25 %	50 %	25 %	121582590
107	NC_008766	CAGC	2	8	40468	40475	25 %	0 %	25 %	50 %	121582590
108	NC_008766	CCCA	2	8	40481	40488	25 %	0 %	0 %	75 %	121582590
109	NC_008766	CAGG	2	8	40913	40920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008766	TCGG	2	8	41272	41279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008766	GCCA	2	8	42594	42601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008766	AGCC	2	8	42674	42681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008766	CCAC	2	8	42855	42862	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_008766	CGGC	2	8	43742	43749	0 %	0 %	50 %	50 %	121582592
115	NC_008766	CCGG	2	8	43751	43758	0 %	0 %	50 %	50 %	121582592
116	NC_008766	CGGC	2	8	43792	43799	0 %	0 %	50 %	50 %	121582592
117	NC_008766	CTGC	2	8	44451	44458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008766	AAGG	2	8	44506	44513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008766	GTCG	2	8	44516	44523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008766	CTTC	2	8	44935	44942	0 %	50 %	0 %	50 %	121582594
121	NC_008766	GGTT	2	8	45139	45146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008766	CACG	2	8	45615	45622	25 %	0 %	25 %	50 %	121582595
123	NC_008766	GCCG	2	8	45875	45882	0 %	0 %	50 %	50 %	121582596
124	NC_008766	GCCG	2	8	45996	46003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008766	ACCG	2	8	46085	46092	25 %	0 %	25 %	50 %	121582597
126	NC_008766	CTGG	2	8	46603	46610	0 %	25 %	50 %	25 %	121582597
127	NC_008766	GCCG	2	8	46864	46871	0 %	0 %	50 %	50 %	121582597
128	NC_008766	GGGC	2	8	46873	46880	0 %	0 %	75 %	25 %	121582597
129	NC_008766	GGCC	2	8	46978	46985	0 %	0 %	50 %	50 %	121582597
130	NC_008766	GCCG	2	8	47126	47133	0 %	0 %	50 %	50 %	121582597
131	NC_008766	GAAC	2	8	47213	47220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008766	ACGA	2	8	47226	47233	50 %	0 %	25 %	25 %	121582598
133	NC_008766	GCCG	2	8	47261	47268	0 %	0 %	50 %	50 %	121582598
134	NC_008766	CGAC	2	8	47689	47696	25 %	0 %	25 %	50 %	121582599
135	NC_008766	CCGG	2	8	48460	48467	0 %	0 %	50 %	50 %	121582601
136	NC_008766	AAGG	2	8	48705	48712	50 %	0 %	50 %	0 %	121582601
137	NC_008766	GGCC	2	8	49295	49302	0 %	0 %	50 %	50 %	121582602
138	NC_008766	GACG	2	8	50722	50729	25 %	0 %	50 %	25 %	121582603
139	NC_008766	GCCG	2	8	51070	51077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008766	GGCG	2	8	51318	51325	0 %	0 %	75 %	25 %	121582604
141	NC_008766	GCCA	2	8	51332	51339	25 %	0 %	25 %	50 %	121582604
142	NC_008766	CGGC	2	8	51630	51637	0 %	0 %	50 %	50 %	121582604
143	NC_008766	AGCG	2	8	51722	51729	25 %	0 %	50 %	25 %	121582604
144	NC_008766	GGCG	2	8	52446	52453	0 %	0 %	75 %	25 %	121582605
145	NC_008766	CACC	2	8	52750	52757	25 %	0 %	0 %	75 %	121582606
146	NC_008766	GCCG	2	8	52758	52765	0 %	0 %	50 %	50 %	121582606
147	NC_008766	CGCC	2	8	52772	52779	0 %	0 %	25 %	75 %	121582606
148	NC_008766	CCGG	2	8	53057	53064	0 %	0 %	50 %	50 %	121582606
149	NC_008766	AAGG	2	8	53154	53161	50 %	0 %	50 %	0 %	121582606
150	NC_008766	CCGG	2	8	54976	54983	0 %	0 %	50 %	50 %	121582609
151	NC_008766	CAGA	2	8	55320	55327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008766	TATC	2	8	55416	55423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008766	GGCC	2	8	56141	56148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008766	CGAG	2	8	57715	57722	25 %	0 %	50 %	25 %	121582612
155	NC_008766	CCAG	2	8	58054	58061	25 %	0 %	25 %	50 %	121582612
156	NC_008766	AGGA	2	8	58393	58400	50 %	0 %	50 %	0 %	121582612
157	NC_008766	TTGC	2	8	58420	58427	0 %	50 %	25 %	25 %	121582613
158	NC_008766	CCGA	2	8	58606	58613	25 %	0 %	25 %	50 %	121582613
159	NC_008766	ATGG	2	8	59648	59655	25 %	25 %	50 %	0 %	121582614
160	NC_008766	CGGC	2	8	59978	59985	0 %	0 %	50 %	50 %	121582614
161	NC_008766	ACCG	2	8	60531	60538	25 %	0 %	25 %	50 %	121582614
162	NC_008766	GCGT	2	8	60894	60901	0 %	25 %	50 %	25 %	121582615
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165	NC_008766	GAAG	2	8	61857	61864	50 %	0 %	50 %	0 %	121582616
166	NC_008766	GGCC	2	8	62202	62209	0 %	0 %	50 %	50 %	121582616
167	NC_008766	AAGG	2	8	62509	62516	50 %	0 %	50 %	0 %	121582616
168	NC_008766	CATC	2	8	62738	62745	25 %	25 %	0 %	50 %	121582616
169	NC_008766	GAGC	2	8	63399	63406	25 %	0 %	50 %	25 %	121582617

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.