MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	CCCTTT	2	12	2117	2128	0 %	50 %	0 %	50 %	121582471
2	NC_008765	GTGCCG	2	12	7250	7261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121582473
3	NC_008765	ACCGCC	2	12	9338	9349	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121582476
4	NC_008765	GGGCCT	2	12	10731	10742	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121582477
5	NC_008765	GGTGCA	2	12	11883	11894	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121582478
6	NC_008765	GCTTGT	2	12	18350	18361	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	121582485
7	NC_008765	ACCGTG	2	12	19604	19615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121582486
8	NC_008765	GCACCC	2	12	23218	23229	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121582493
9	NC_008765	GTTGGT	2	12	24706	24717	0 %	50 %	50 %	0 %	121582495
10	NC_008765	GCGCAC	2	12	28719	28730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121582497
11	NC_008765	TCACGC	2	12	29512	29523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121582498
12	NC_008765	CAACGA	2	12	34017	34028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	121582502
13	NC_008765	GAGCGA	2	12	34249	34260	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121582503
14	NC_008765	CGGCCA	2	12	34618	34629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121582504
15	NC_008765	CCTCGG	2	12	37374	37385	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121582509
16	NC_008765	CCGGGG	2	12	38138	38149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582510
17	NC_008765	CGCGCA	2	12	38477	38488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121582510
18	NC_008765	GTTGGT	2	12	40801	40812	0 %	50 %	50 %	0 %	121582511
19	NC_008765	GTTGCG	2	12	41796	41807	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121582514
20	NC_008765	GCCGCT	2	12	45246	45257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121582518
21	NC_008765	GTAGAG	2	12	46387	46398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	121582520
22	NC_008765	GCCACG	2	12	46415	46426	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121582520
23	NC_008765	TGCCAG	2	12	48431	48442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121582522
24	NC_008765	TGTCCT	2	12	53954	53965	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	121582527
25	NC_008765	CGGGAT	2	12	61082	61093	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121582533
26	NC_008765	CGGCTC	2	12	65970	65981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121582541
27	NC_008765	GGCACA	2	12	66920	66931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582541
28	NC_008765	CGCGCT	2	12	69529	69540	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121582545
29	NC_008765	CAGGGA	2	12	70717	70728	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121582546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.