MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	TCTG	2	8	1866	1873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008765	TCCC	2	8	16926	16933	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008765	TGCG	2	8	16935	16942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008765	AGCG	2	8	16995	17002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008765	GTTG	2	8	21093	21100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008765	CACC	2	8	22426	22433	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008765	GGTC	2	8	25374	25381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008765	GGTC	2	8	25557	25564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008765	CCCG	2	8	31693	31700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008765	CAGG	2	8	31703	31710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008765	GAAG	2	8	32966	32973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008765	CGGC	2	8	33310	33317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008765	GGTA	2	8	35073	35080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008765	GAAC	2	8	35854	35861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008765	GGAG	2	8	36121	36128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008765	CCAG	3	12	36152	36163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008765	AAGG	2	8	36176	36183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008765	CAGC	2	8	36226	36233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008765	GCGT	2	8	37515	37522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008765	GGCC	2	8	39845	39852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008765	CCGG	2	8	40008	40015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008765	GCCC	2	8	40575	40582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008765	GGCG	2	8	40588	40595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008765	CGGC	2	8	40923	40930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008765	GGGA	2	8	41645	41652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008765	GGCC	2	8	43349	43356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008765	CCGG	2	8	43512	43519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008765	CGGC	2	8	48990	48997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008765	GGAC	2	8	49090	49097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008765	CGGC	2	8	49194	49201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008765	CGGC	2	8	49561	49568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008765	GCCG	2	8	49818	49825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008765	GGAC	2	8	49916	49923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008765	TCCC	2	8	50289	50296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_008765	CTGT	2	8	51314	51321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008765	TCGT	2	8	54752	54759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008765	TTGG	2	8	55426	55433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008765	GCAC	2	8	55630	55637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008765	GGCA	2	8	55705	55712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008765	GCCG	2	8	55739	55746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008765	GCCG	2	8	56099	56106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008765	ACGA	2	8	60433	60440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008765	TGCC	2	8	68728	68735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.