MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	CG	4	8	80	87	0 %	0 %	50 %	50 %	121582467
2	NC_008765	CA	3	6	203	208	50 %	0 %	0 %	50 %	121582467
3	NC_008765	GC	4	8	486	493	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
4	NC_008765	GC	3	6	875	880	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
5	NC_008765	GC	3	6	889	894	0 %	0 %	50 %	50 %	121582468
6	NC_008765	GC	3	6	1124	1129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008765	GC	3	6	1307	1312	0 %	0 %	50 %	50 %	121582469
8	NC_008765	TC	3	6	1825	1830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008765	GC	3	6	2002	2007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008765	GC	3	6	2724	2729	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
11	NC_008765	CG	3	6	3194	3199	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
12	NC_008765	GC	3	6	3480	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
13	NC_008765	GC	5	10	3974	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
14	NC_008765	GC	3	6	4841	4846	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
15	NC_008765	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
16	NC_008765	CG	4	8	4946	4953	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
17	NC_008765	CG	4	8	5333	5340	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
18	NC_008765	CG	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
19	NC_008765	CG	3	6	6103	6108	0 %	0 %	50 %	50 %	121582472
20	NC_008765	GC	3	6	6761	6766	0 %	0 %	50 %	50 %	121582473
21	NC_008765	CG	4	8	7728	7735	0 %	0 %	50 %	50 %	121582474
22	NC_008765	AG	4	8	7768	7775	50 %	0 %	50 %	0 %	121582474
23	NC_008765	GC	3	6	8630	8635	0 %	0 %	50 %	50 %	121582475
24	NC_008765	GC	3	6	10784	10789	0 %	0 %	50 %	50 %	121582477
25	NC_008765	CG	4	8	12038	12045	0 %	0 %	50 %	50 %	121582478
26	NC_008765	GC	3	6	12469	12474	0 %	0 %	50 %	50 %	121582479
27	NC_008765	GC	3	6	12477	12482	0 %	0 %	50 %	50 %	121582479
28	NC_008765	AC	3	6	13148	13153	50 %	0 %	0 %	50 %	121582480
29	NC_008765	GC	3	6	13347	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	121582481
30	NC_008765	CA	3	6	14016	14021	50 %	0 %	0 %	50 %	121582482
31	NC_008765	CG	3	6	14680	14685	0 %	0 %	50 %	50 %	121582482
32	NC_008765	GC	3	6	15646	15651	0 %	0 %	50 %	50 %	121582482
33	NC_008765	GC	3	6	16729	16734	0 %	0 %	50 %	50 %	121582483
34	NC_008765	GC	3	6	17030	17035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008765	GC	3	6	17092	17097	0 %	0 %	50 %	50 %	121582484
36	NC_008765	GC	3	6	17308	17313	0 %	0 %	50 %	50 %	121582484
37	NC_008765	GC	3	6	18128	18133	0 %	0 %	50 %	50 %	121582485
38	NC_008765	GC	3	6	19229	19234	0 %	0 %	50 %	50 %	121582486
39	NC_008765	CG	3	6	20348	20353	0 %	0 %	50 %	50 %	121582487
40	NC_008765	GA	4	8	20697	20704	50 %	0 %	50 %	0 %	121582488
41	NC_008765	GA	3	6	21432	21437	50 %	0 %	50 %	0 %	121582490
42	NC_008765	GC	3	6	21810	21815	0 %	0 %	50 %	50 %	121582491
43	NC_008765	GC	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	121582491
44	NC_008765	CG	3	6	21905	21910	0 %	0 %	50 %	50 %	121582491
45	NC_008765	AG	3	6	24391	24396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008765	GC	3	6	25004	25009	0 %	0 %	50 %	50 %	121582495
47	NC_008765	GA	3	6	25023	25028	50 %	0 %	50 %	0 %	121582495
48	NC_008765	CG	3	6	25263	25268	0 %	0 %	50 %	50 %	121582495
49	NC_008765	CA	3	6	25598	25603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008765	CG	4	8	25655	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008765	GC	3	6	25680	25685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008765	GC	3	6	25892	25897	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
53	NC_008765	GA	4	8	26076	26083	50 %	0 %	50 %	0 %	121582496
54	NC_008765	CG	3	6	26157	26162	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
55	NC_008765	CG	3	6	26475	26480	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
56	NC_008765	CG	3	6	26711	26716	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
57	NC_008765	GC	3	6	27398	27403	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
58	NC_008765	GC	3	6	27650	27655	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
59	NC_008765	GC	3	6	27778	27783	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
60	NC_008765	GC	3	6	27816	27821	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
61	NC_008765	GA	3	6	28300	28305	50 %	0 %	50 %	0 %	121582496
62	NC_008765	CG	4	8	29126	29133	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
63	NC_008765	GC	3	6	29504	29509	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
64	NC_008765	GT	3	6	29749	29754	0 %	50 %	50 %	0 %	121582498
65	NC_008765	GC	3	6	30478	30483	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
66	NC_008765	CT	4	8	31040	31047	0 %	50 %	0 %	50 %	121582498
67	NC_008765	GC	3	6	31517	31522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008765	TG	3	6	31562	31567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008765	GA	3	6	32226	32231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008765	GC	3	6	32249	32254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008765	GC	3	6	33975	33980	0 %	0 %	50 %	50 %	121582502
72	NC_008765	CG	3	6	34041	34046	0 %	0 %	50 %	50 %	121582502
73	NC_008765	GC	3	6	34575	34580	0 %	0 %	50 %	50 %	121582504
74	NC_008765	CG	3	6	34740	34745	0 %	0 %	50 %	50 %	121582505
75	NC_008765	GC	3	6	34748	34753	0 %	0 %	50 %	50 %	121582505
76	NC_008765	GC	3	6	35355	35360	0 %	0 %	50 %	50 %	121582506
77	NC_008765	CG	3	6	35443	35448	0 %	0 %	50 %	50 %	121582506
78	NC_008765	GC	3	6	35833	35838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008765	CG	4	8	35936	35943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008765	GC	4	8	36198	36205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008765	GC	3	6	36207	36212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008765	CG	3	6	36538	36543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008765	GC	3	6	36680	36685	0 %	0 %	50 %	50 %	121582508
84	NC_008765	GC	3	6	37079	37084	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
85	NC_008765	GC	3	6	37187	37192	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
86	NC_008765	CG	3	6	37321	37326	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
87	NC_008765	CG	3	6	37342	37347	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
88	NC_008765	GC	3	6	37983	37988	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
89	NC_008765	GC	3	6	38089	38094	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
90	NC_008765	CG	3	6	38448	38453	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
91	NC_008765	GC	3	6	38638	38643	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
92	NC_008765	GC	3	6	39052	39057	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
93	NC_008765	GC	3	6	39213	39218	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
94	NC_008765	GC	3	6	39235	39240	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
95	NC_008765	GC	3	6	39280	39285	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
96	NC_008765	GA	3	6	39653	39658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008765	CG	3	6	40067	40072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008765	CG	4	8	40132	40139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008765	GC	3	6	40178	40183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008765	GC	3	6	40483	40488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008765	CG	3	6	40548	40553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008765	CG	3	6	40618	40623	0 %	0 %	50 %	50 %	121582511
103	NC_008765	CG	3	6	40870	40875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008765	GC	4	8	41035	41042	0 %	0 %	50 %	50 %	121582512
105	NC_008765	CG	3	6	41661	41666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008765	CA	3	6	42148	42153	50 %	0 %	0 %	50 %	121582514
107	NC_008765	CG	3	6	42388	42393	0 %	0 %	50 %	50 %	121582514
108	NC_008765	GC	3	6	42564	42569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008765	GA	3	6	43157	43162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008765	CG	3	6	43571	43576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008765	CG	4	8	43636	43643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008765	GC	3	6	43682	43687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008765	CG	4	8	44483	44490	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
114	NC_008765	CG	3	6	44703	44708	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
115	NC_008765	CG	3	6	44726	44731	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
116	NC_008765	GC	3	6	44900	44905	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
117	NC_008765	CG	3	6	45197	45202	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
118	NC_008765	CG	3	6	45747	45752	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
119	NC_008765	GC	4	8	45855	45862	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
120	NC_008765	GC	4	8	45870	45877	0 %	0 %	50 %	50 %	121582518
121	NC_008765	CG	3	6	46294	46299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008765	CG	4	8	46348	46355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008765	GC	3	6	46699	46704	0 %	0 %	50 %	50 %	121582520
124	NC_008765	GC	3	6	46931	46936	0 %	0 %	50 %	50 %	121582521
125	NC_008765	CA	4	8	47613	47620	50 %	0 %	0 %	50 %	121582521
126	NC_008765	CG	3	6	48109	48114	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
127	NC_008765	GC	4	8	48123	48130	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
128	NC_008765	GC	3	6	48186	48191	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
129	NC_008765	CG	3	6	48222	48227	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
130	NC_008765	GC	3	6	48245	48250	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
131	NC_008765	GC	3	6	48642	48647	0 %	0 %	50 %	50 %	121582522
132	NC_008765	GC	3	6	48921	48926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008765	GC	3	6	48968	48973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008765	GC	3	6	49141	49146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008765	TG	3	6	49149	49154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008765	GC	3	6	49539	49544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008765	GC	3	6	49546	49551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008765	GC	3	6	49749	49754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008765	CG	5	10	49894	49903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008765	GC	3	6	50551	50556	0 %	0 %	50 %	50 %	121582523
141	NC_008765	TG	3	6	51618	51623	0 %	50 %	50 %	0 %	121582524
142	NC_008765	GC	3	6	51651	51656	0 %	0 %	50 %	50 %	121582524
143	NC_008765	GC	3	6	51845	51850	0 %	0 %	50 %	50 %	121582525
144	NC_008765	CA	3	6	51885	51890	50 %	0 %	0 %	50 %	121582525
145	NC_008765	GT	3	6	52528	52533	0 %	50 %	50 %	0 %	121582526
146	NC_008765	CG	4	8	52612	52619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008765	CG	3	6	53303	53308	0 %	0 %	50 %	50 %	121582527
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149	NC_008765	CG	3	6	54413	54418	0 %	0 %	50 %	50 %	121582528
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.