MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP08

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008764	TCG	2	6	256	261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583583
2	NC_008764	CGT	2	6	433	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583583
3	NC_008764	ACC	2	6	600	605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583583
4	NC_008764	CAG	2	6	689	694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583583
5	NC_008764	CGG	2	6	1097	1102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583584
6	NC_008764	TGT	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583584
7	NC_008764	GTG	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583584
8	NC_008764	GGC	2	6	1245	1250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583584
9	NC_008764	TCT	2	6	1303	1308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583584
10	NC_008764	CGC	2	6	1377	1382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583584
11	NC_008764	GCT	2	6	1406	1411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583584
12	NC_008764	GCT	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583584
13	NC_008764	TCC	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583584
14	NC_008764	CAC	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583584
15	NC_008764	CCA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583584
16	NC_008764	CAG	2	6	1680	1685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583584
17	NC_008764	GGT	2	6	1708	1713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583584
18	NC_008764	TGT	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008764	CCA	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008764	ATC	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008764	TCC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008764	GTT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583585
23	NC_008764	GCC	2	6	2393	2398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583585
24	NC_008764	GGC	2	6	2530	2535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583585
25	NC_008764	GGC	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583585
26	NC_008764	CTT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583585
27	NC_008764	AAT	2	6	2813	2818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583585
28	NC_008764	CGC	2	6	2824	2829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583585
29	NC_008764	GCT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
30	NC_008764	AGC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583585
31	NC_008764	CTG	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
32	NC_008764	TGC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
33	NC_008764	TCC	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583585
34	NC_008764	TCC	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583585
35	NC_008764	GCA	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583585
36	NC_008764	AGG	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583585
37	NC_008764	GCC	2	6	3290	3295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583585
38	NC_008764	CGG	3	9	3301	3309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583585
39	NC_008764	CTG	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
40	NC_008764	TCA	2	6	3483	3488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583585
41	NC_008764	TGT	2	6	3494	3499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583585
42	NC_008764	CCA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583585
43	NC_008764	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583585
44	NC_008764	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583585
45	NC_008764	AGC	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583585
46	NC_008764	GTG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583585
47	NC_008764	TGC	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
48	NC_008764	GCT	3	9	3720	3728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
49	NC_008764	GTC	2	6	3736	3741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
50	NC_008764	CTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
51	NC_008764	CTT	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583585
52	NC_008764	GTG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583585
53	NC_008764	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583585
54	NC_008764	GGC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583585
55	NC_008764	GGT	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583585
56	NC_008764	AAT	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583585
57	NC_008764	TTC	2	6	4298	4303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583585
58	NC_008764	TCT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583585
59	NC_008764	AAT	2	6	4462	4467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583585
60	NC_008764	GTT	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583586
61	NC_008764	GCA	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583586
62	NC_008764	AGT	2	6	4856	4861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583586
63	NC_008764	TTG	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008764	GAG	3	9	5148	5156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008764	CTG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583587
66	NC_008764	TAG	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583587
67	NC_008764	TGC	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583587
68	NC_008764	TCA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583587
69	NC_008764	TTG	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008764	TGT	2	6	5690	5695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008764	AAT	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008764	ATG	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008764	GTT	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008764	AAT	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008764	ATG	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008764	ATC	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008764	AAT	2	6	6155	6160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008764	TGT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008764	ATA	2	6	6190	6195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008764	CAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008764	TCC	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008764	TGC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008764	GAT	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.