MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP06

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008762	GGC	2	6	1080	1085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583545
2	NC_008762	CAG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583545
3	NC_008762	TGG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583545
4	NC_008762	ATG	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583545
5	NC_008762	GTC	2	6	1461	1466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583545
6	NC_008762	CCG	2	6	1496	1501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583545
7	NC_008762	AGC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583545
8	NC_008762	AGC	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583545
9	NC_008762	TGC	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583545
10	NC_008762	GCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583545
11	NC_008762	GTT	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583546
12	NC_008762	CGT	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583546
13	NC_008762	ACC	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583546
14	NC_008762	GTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583546
15	NC_008762	TGG	3	9	2094	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583546
16	NC_008762	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583546
17	NC_008762	GCA	2	6	2286	2291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583546
18	NC_008762	TCA	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583546
19	NC_008762	CTG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583546
20	NC_008762	CCA	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583546
21	NC_008762	GTC	2	6	2947	2952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583546
22	NC_008762	TCA	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583547
23	NC_008762	GAC	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583547
24	NC_008762	GAA	2	6	3523	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583547
25	NC_008762	GTC	3	9	3991	3999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583548
26	NC_008762	GTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583548
27	NC_008762	GGC	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583548
28	NC_008762	TGT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583549
29	NC_008762	GCA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583549
30	NC_008762	CCA	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583549
31	NC_008762	CCA	2	6	4848	4853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583549
32	NC_008762	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583550
33	NC_008762	TTG	2	6	5303	5308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583550
34	NC_008762	AAC	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583551
35	NC_008762	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583551
36	NC_008762	CTT	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583551
37	NC_008762	GCC	2	6	5626	5631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583551
38	NC_008762	ATG	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583551
39	NC_008762	GAT	3	9	5727	5735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583551
40	NC_008762	TGG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583551
41	NC_008762	ACA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583551
42	NC_008762	CAC	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583552
43	NC_008762	GGC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
44	NC_008762	CCT	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583552
45	NC_008762	CAG	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583552
46	NC_008762	GTC	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
47	NC_008762	CGG	2	6	6419	6424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
48	NC_008762	CGG	2	6	6446	6451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
49	NC_008762	TGC	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
50	NC_008762	TTG	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583552
51	NC_008762	GCG	3	9	6568	6576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
52	NC_008762	TCA	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583552
53	NC_008762	CGG	2	6	6647	6652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
54	NC_008762	GGC	2	6	6699	6704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
55	NC_008762	GTC	2	6	6730	6735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
56	NC_008762	TGC	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583552
57	NC_008762	CGG	3	9	6755	6763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
58	NC_008762	ATC	2	6	6789	6794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583552
59	NC_008762	GGC	5	15	6795	6809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
60	NC_008762	TTC	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583552
61	NC_008762	GGT	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583552
62	NC_008762	CGG	3	9	7031	7039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583552
63	NC_008762	ATG	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583552
64	NC_008762	CTG	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
65	NC_008762	GCT	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
66	NC_008762	GCT	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
67	NC_008762	GGT	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
68	NC_008762	CGG	2	6	7382	7387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
69	NC_008762	GCG	4	12	7600	7611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
70	NC_008762	TGC	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
71	NC_008762	GTT	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583553
72	NC_008762	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
73	NC_008762	CTG	3	9	8007	8015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
74	NC_008762	GCA	2	6	8167	8172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583553
75	NC_008762	CGG	2	6	8465	8470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
76	NC_008762	TGT	2	6	8717	8722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583553
77	NC_008762	GTC	2	6	8756	8761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
78	NC_008762	TGG	2	6	8908	8913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
79	NC_008762	GGT	2	6	8938	8943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
80	NC_008762	GCT	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
81	NC_008762	CTG	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
82	NC_008762	GCG	2	6	9127	9132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583553
83	NC_008762	CTG	2	6	9233	9238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
84	NC_008762	GAT	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583553
85	NC_008762	TGG	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
86	NC_008762	GCA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583553
87	NC_008762	TTG	2	6	9373	9378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583553
88	NC_008762	GTC	2	6	9447	9452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583553
89	NC_008762	TGG	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
90	NC_008762	CAA	2	6	9497	9502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583553
91	NC_008762	GTG	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583553
92	NC_008762	TTG	2	6	9894	9899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583554
93	NC_008762	GCC	2	6	9905	9910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583554
94	NC_008762	ATC	2	6	9930	9935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583554
95	NC_008762	TCT	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583554
96	NC_008762	TTC	2	6	10040	10045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583554
97	NC_008762	TCA	2	6	10083	10088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583554
98	NC_008762	GCA	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583555
99	NC_008762	GAT	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583555
100	NC_008762	ACA	2	6	10509	10514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583555
101	NC_008762	GCA	2	6	10535	10540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583555
102	NC_008762	GCA	2	6	10605	10610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583555
103	NC_008762	AGT	2	6	10695	10700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583555
104	NC_008762	CAC	2	6	10782	10787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583555
105	NC_008762	TTG	2	6	10882	10887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583556
106	NC_008762	GTT	3	9	11082	11090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583556
107	NC_008762	GCA	2	6	11131	11136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583556
108	NC_008762	GTT	2	6	11358	11363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583556
109	NC_008762	CCG	2	6	11471	11476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583556
110	NC_008762	GAA	2	6	11505	11510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583556
111	NC_008762	CGG	2	6	11579	11584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583557
112	NC_008762	AAC	2	6	11611	11616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583557
113	NC_008762	AGA	2	6	11620	11625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583557
114	NC_008762	TTG	2	6	11643	11648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583557
115	NC_008762	ATG	2	6	11666	11671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583557
116	NC_008762	ATT	2	6	11693	11698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121583557
117	NC_008762	TGC	2	6	11734	11739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583557
118	NC_008762	TAG	2	6	11745	11750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583557
119	NC_008762	CTG	3	9	12000	12008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583557
120	NC_008762	GGC	3	9	12055	12063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583557
121	NC_008762	GGC	2	6	12091	12096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583557
122	NC_008762	CAG	2	6	12138	12143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583557
123	NC_008762	GAC	2	6	13247	13252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583558
124	NC_008762	GCT	2	6	13298	13303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583558
125	NC_008762	GCG	2	6	13311	13316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583558
126	NC_008762	GCG	2	6	13407	13412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583558
127	NC_008762	GCT	2	6	13455	13460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583558
128	NC_008762	GCT	2	6	13479	13484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583558
129	NC_008762	CTT	2	6	13543	13548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583558
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132	NC_008762	TCG	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583558
133	NC_008762	GCA	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583558
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.