MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP06

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008762	CA	3	6	463	468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008762	GT	3	6	998	1003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008762	CG	3	6	1094	1099	0 %	0 %	50 %	50 %	121583545
4	NC_008762	GT	4	8	1644	1651	0 %	50 %	50 %	0 %	121583545
5	NC_008762	AT	3	6	3181	3186	50 %	50 %	0 %	0 %	121583547
6	NC_008762	AT	3	6	4980	4985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008762	TA	3	6	5585	5590	50 %	50 %	0 %	0 %	121583551
8	NC_008762	GT	3	6	7491	7496	0 %	50 %	50 %	0 %	121583553
9	NC_008762	TG	3	6	10373	10378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008762	TG	3	6	10552	10557	0 %	50 %	50 %	0 %	121583555
11	NC_008762	TG	3	6	11180	11185	0 %	50 %	50 %	0 %	121583556
12	NC_008762	AC	3	6	11320	11325	50 %	0 %	0 %	50 %	121583556
13	NC_008762	AT	3	6	11839	11844	50 %	50 %	0 %	0 %	121583557
14	NC_008762	GC	3	6	12619	12624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008762	GC	3	6	12961	12966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008762	GC	3	6	15252	15257	0 %	0 %	50 %	50 %	121583558
17	NC_008762	GC	3	6	15576	15581	0 %	0 %	50 %	50 %	121583558
18	NC_008762	GC	3	6	15624	15629	0 %	0 %	50 %	50 %	121583558
19	NC_008762	GC	3	6	15673	15678	0 %	0 %	50 %	50 %	121583558
20	NC_008762	GC	3	6	15841	15846	0 %	0 %	50 %	50 %	121583558
21	NC_008762	CG	3	6	16319	16324	0 %	0 %	50 %	50 %	121583558
22	NC_008762	GT	3	6	17118	17123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008762	TG	4	8	17150	17157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008762	TG	4	8	17183	17190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008762	TG	4	8	17216	17223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008762	CT	3	6	17648	17653	0 %	50 %	0 %	50 %	121583559
27	NC_008762	AC	3	6	17933	17938	50 %	0 %	0 %	50 %	121583559
28	NC_008762	GC	3	6	18901	18906	0 %	0 %	50 %	50 %	121583561
29	NC_008762	GC	4	8	19336	19343	0 %	0 %	50 %	50 %	121583562
30	NC_008762	CG	3	6	20655	20660	0 %	0 %	50 %	50 %	121583563
31	NC_008762	TA	3	6	21555	21560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.