MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP03

Total Repeats: 2230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008759	TGA	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008759	GCT	2	6	195	200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008759	AAC	2	6	227	232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008759	ACT	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008759	GTC	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008759	CTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008759	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583184
8	NC_008759	TCG	2	6	648	653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583184
9	NC_008759	CAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583184
10	NC_008759	GGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583184
11	NC_008759	CCT	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583184
12	NC_008759	CCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583184
13	NC_008759	GCG	2	6	1195	1200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583185
14	NC_008759	GCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583185
15	NC_008759	TGG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583185
16	NC_008759	GTT	2	6	1446	1451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583185
17	NC_008759	GCA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583185
18	NC_008759	GCC	3	9	1479	1487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583185
19	NC_008759	TCA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583185
20	NC_008759	TGG	2	6	1636	1641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583185
21	NC_008759	TCA	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583185
22	NC_008759	GCA	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583185
23	NC_008759	GGC	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583185
24	NC_008759	AGC	2	6	1821	1826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583185
25	NC_008759	GCA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583185
26	NC_008759	CGC	2	6	1958	1963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583185
27	NC_008759	CCT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583185
28	NC_008759	AGC	3	9	2056	2064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583185
29	NC_008759	GCT	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583185
30	NC_008759	GGT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583185
31	NC_008759	TGG	2	6	2339	2344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008759	GTG	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583186
33	NC_008759	TGG	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583186
34	NC_008759	TGG	2	6	2570	2575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583186
35	NC_008759	CAG	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583186
36	NC_008759	CCA	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583186
37	NC_008759	GAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583186
38	NC_008759	CGA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583186
39	NC_008759	GCG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583186
40	NC_008759	TGG	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583186
41	NC_008759	AGG	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008759	GCA	2	6	3154	3159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008759	CTG	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008759	CGG	2	6	3228	3233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008759	CCT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583187
46	NC_008759	CCA	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583187
47	NC_008759	ACG	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583187
48	NC_008759	CGC	2	6	3558	3563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583187
49	NC_008759	GCA	2	6	3571	3576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583187
50	NC_008759	CAC	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583187
51	NC_008759	CGT	2	6	3737	3742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583187
52	NC_008759	CCA	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583187
53	NC_008759	CGA	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583187
54	NC_008759	TGA	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583187
55	NC_008759	TGA	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583187
56	NC_008759	CTT	2	6	3854	3859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583187
57	NC_008759	ACC	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583187
58	NC_008759	CAC	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583187
59	NC_008759	CGC	2	6	4077	4082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583187
60	NC_008759	CGG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583187
61	NC_008759	CGC	2	6	4117	4122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583187
62	NC_008759	GGT	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583188
63	NC_008759	CAT	2	6	4381	4386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583188
64	NC_008759	GCC	2	6	4491	4496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008759	GCA	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008759	TTC	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583189
67	NC_008759	CGC	2	6	4684	4689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583189
68	NC_008759	GTT	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583189
69	NC_008759	CTT	2	6	4991	4996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583189
70	NC_008759	TGA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583189
71	NC_008759	GTG	2	6	5298	5303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583189
72	NC_008759	GTT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008759	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008759	ATC	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583190
75	NC_008759	GCC	2	6	5527	5532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583190
76	NC_008759	CGG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583190
77	NC_008759	CTG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583190
78	NC_008759	GTG	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583190
79	NC_008759	GCA	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583190
80	NC_008759	TGC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583190
81	NC_008759	TCA	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583191
82	NC_008759	TGG	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583191
83	NC_008759	GCT	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583191
84	NC_008759	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583191
85	NC_008759	CGC	2	6	6171	6176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583191
86	NC_008759	AGG	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583192
87	NC_008759	GGA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583192
88	NC_008759	GGC	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583192
89	NC_008759	TGG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583192
90	NC_008759	GTT	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583192
91	NC_008759	GCC	2	6	6561	6566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583192
92	NC_008759	TCA	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583192
93	NC_008759	ACG	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583192
94	NC_008759	GGT	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583192
95	NC_008759	CCA	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583192
96	NC_008759	TGC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583192
97	NC_008759	CGT	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583192
98	NC_008759	TTG	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008759	TGC	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008759	CAG	2	6	7119	7124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583193
101	NC_008759	GGC	2	6	7364	7369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583193
102	NC_008759	CCA	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583193
103	NC_008759	GTT	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583193
104	NC_008759	TGC	2	6	7452	7457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583193
105	NC_008759	GCT	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583193
106	NC_008759	TCA	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583193
107	NC_008759	TCG	2	6	7669	7674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583193
108	NC_008759	TGC	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583194
109	NC_008759	CGG	2	6	8067	8072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008759	CTT	2	6	8089	8094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583195
111	NC_008759	CAG	2	6	8126	8131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583195
112	NC_008759	CTT	2	6	8147	8152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583195
113	NC_008759	AAG	2	6	8171	8176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583195
114	NC_008759	GCT	2	6	8198	8203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583195
115	NC_008759	TGC	2	6	8204	8209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583195
116	NC_008759	GCA	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583195
117	NC_008759	CTG	2	6	8249	8254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583195
118	NC_008759	GTC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583195
119	NC_008759	ACC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583195
120	NC_008759	CGA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583196
121	NC_008759	GCC	2	6	8580	8585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583196
122	NC_008759	CGC	2	6	8661	8666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583196
123	NC_008759	TCG	2	6	8674	8679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583196
124	NC_008759	CCT	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583196
125	NC_008759	CGA	2	6	8882	8887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583196
126	NC_008759	CAG	2	6	8928	8933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583196
127	NC_008759	CCT	2	6	9047	9052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583196
128	NC_008759	GCG	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583196
129	NC_008759	CAC	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583196
130	NC_008759	CAG	2	6	9225	9230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583196
131	NC_008759	CGC	3	9	9344	9352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583196
132	NC_008759	GCG	2	6	9353	9358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583196
133	NC_008759	TCA	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583196
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137	NC_008759	TCA	2	6	9593	9598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583196
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140	NC_008759	GCA	2	6	9889	9894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008759	GCT	2	6	9937	9942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008759	CGC	2	6	9956	9961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008759	TGG	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_008759	TGA	2	6	12505	12510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583199
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249	NC_008759	CGG	2	6	19319	19324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583205
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251	NC_008759	CAC	2	6	19423	19428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583206
252	NC_008759	TCA	2	6	19528	19533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583206
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254	NC_008759	AGG	2	6	19719	19724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583207
255	NC_008759	GAA	2	6	19838	19843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583207
256	NC_008759	AAC	2	6	19866	19871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583207
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258	NC_008759	GCC	2	6	20036	20041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_008759	GAA	2	6	20115	20120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583208
260	NC_008759	CGA	2	6	20206	20211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583208
261	NC_008759	AGC	2	6	20261	20266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583208
262	NC_008759	TGA	2	6	20379	20384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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