MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax citrulli AAC00-1 chromosome

Total Repeats: 5261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008752	ACAAG	2	10	1678	1687	60 %	0 %	20 %	20 %	120608716
2	NC_008752	CGCCT	2	10	2189	2198	0 %	20 %	20 %	60 %	120608716
3	NC_008752	CCACG	2	10	3722	3731	20 %	0 %	20 %	60 %	120608717
4	NC_008752	CCACG	2	10	6257	6266	20 %	0 %	20 %	60 %	120608718
5	NC_008752	TTGGC	2	10	8737	8746	0 %	40 %	40 %	20 %	120608720
6	NC_008752	ACCGA	2	10	8940	8949	40 %	0 %	20 %	40 %	120608720
7	NC_008752	CGTGG	2	10	11782	11791	0 %	20 %	60 %	20 %	120608724
8	NC_008752	CGCGG	2	10	11808	11817	0 %	0 %	60 %	40 %	120608724
9	NC_008752	GGAGC	2	10	12001	12010	20 %	0 %	60 %	20 %	120608724
10	NC_008752	CTGGC	2	10	12873	12882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008752	GCGCT	2	10	14130	14139	0 %	20 %	40 %	40 %	120608726
12	NC_008752	GGCGC	2	10	14165	14174	0 %	0 %	60 %	40 %	120608726
13	NC_008752	GGCAC	2	10	14747	14756	20 %	0 %	40 %	40 %	120608726
14	NC_008752	GGGCC	2	10	17880	17889	0 %	0 %	60 %	40 %	120608730
15	NC_008752	GGAGG	2	10	18287	18296	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008752	GCGAA	2	10	18419	18428	40 %	0 %	40 %	20 %	120608731
17	NC_008752	CGGCA	2	10	19187	19196	20 %	0 %	40 %	40 %	120608732
18	NC_008752	ACGCC	2	10	19883	19892	20 %	0 %	20 %	60 %	120608732
19	NC_008752	CGCGC	2	10	19935	19944	0 %	0 %	40 %	60 %	120608732
20	NC_008752	GCGCG	3	15	20887	20901	0 %	0 %	60 %	40 %	120608732
21	NC_008752	CGCGG	2	10	20950	20959	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008752	AGGGC	2	10	20981	20990	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008752	GCCGC	2	10	21946	21955	0 %	0 %	40 %	60 %	120608734
24	NC_008752	GGCCA	2	10	22029	22038	20 %	0 %	40 %	40 %	120608734
25	NC_008752	GGCCG	2	10	24840	24849	0 %	0 %	60 %	40 %	120608735
26	NC_008752	GGGGT	2	10	27300	27309	0 %	20 %	80 %	0 %	120608735
27	NC_008752	CCTCC	2	10	27737	27746	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_008752	GTGGC	2	10	28827	28836	0 %	20 %	60 %	20 %	120608736
29	NC_008752	GTGCC	2	10	29268	29277	0 %	20 %	40 %	40 %	120608737
30	NC_008752	TGCGG	2	10	29642	29651	0 %	20 %	60 %	20 %	120608737
31	NC_008752	CGGTG	2	10	29834	29843	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008752	GGGCC	2	10	30451	30460	0 %	0 %	60 %	40 %	120608738
33	NC_008752	CCTGA	2	10	30875	30884	20 %	20 %	20 %	40 %	120608738
34	NC_008752	TGGCC	2	10	31225	31234	0 %	20 %	40 %	40 %	120608739
35	NC_008752	CGGCG	2	10	31813	31822	0 %	0 %	60 %	40 %	120608739
36	NC_008752	GCTGG	2	10	32035	32044	0 %	20 %	60 %	20 %	120608739
37	NC_008752	GTCGT	2	10	32733	32742	0 %	40 %	40 %	20 %	120608740
38	NC_008752	CTTGC	2	10	33326	33335	0 %	40 %	20 %	40 %	120608742
39	NC_008752	GTTCA	2	10	35529	35538	20 %	40 %	20 %	20 %	120608745
40	NC_008752	GGCGC	2	10	35696	35705	0 %	0 %	60 %	40 %	120608745
41	NC_008752	CGGGC	2	10	35979	35988	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008752	GGCGG	2	10	36725	36734	0 %	0 %	80 %	20 %	120608747
43	NC_008752	TGCGC	2	10	36824	36833	0 %	20 %	40 %	40 %	120608747
44	NC_008752	TGCAG	2	10	37844	37853	20 %	20 %	40 %	20 %	120608747
45	NC_008752	CGCGG	2	10	38148	38157	0 %	0 %	60 %	40 %	120608747
46	NC_008752	ATTCG	2	10	38745	38754	20 %	40 %	20 %	20 %	120608748
47	NC_008752	CGCAG	2	10	39965	39974	20 %	0 %	40 %	40 %	120608748
48	NC_008752	TGCAC	2	10	40847	40856	20 %	20 %	20 %	40 %	120608749
49	NC_008752	CCTTT	2	10	40971	40980	0 %	60 %	0 %	40 %	120608750
50	NC_008752	CCACG	2	10	42012	42021	20 %	0 %	20 %	60 %	120608751
51	NC_008752	CCAGT	2	10	43500	43509	20 %	20 %	20 %	40 %	120608751
52	NC_008752	GGCGT	2	10	44659	44668	0 %	20 %	60 %	20 %	120608751
53	NC_008752	GGTCG	2	10	45539	45548	0 %	20 %	60 %	20 %	120608752
54	NC_008752	GCCGG	2	10	45564	45573	0 %	0 %	60 %	40 %	120608752
55	NC_008752	CGCGG	2	10	45698	45707	0 %	0 %	60 %	40 %	120608752
56	NC_008752	CGGCC	2	10	47651	47660	0 %	0 %	40 %	60 %	120608753
57	NC_008752	GCAGC	2	10	47967	47976	20 %	0 %	40 %	40 %	120608754
58	NC_008752	GGGCT	2	10	48577	48586	0 %	20 %	60 %	20 %	120608754
59	NC_008752	GGGCG	2	10	48851	48860	0 %	0 %	80 %	20 %	120608755
60	NC_008752	TGGCC	2	10	49445	49454	0 %	20 %	40 %	40 %	120608755
61	NC_008752	GTGCC	2	10	49570	49579	0 %	20 %	40 %	40 %	120608755
62	NC_008752	ACGGG	2	10	49828	49837	20 %	0 %	60 %	20 %	120608755
63	NC_008752	AGGCC	2	10	50882	50891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008752	CGGGC	2	10	51718	51727	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008752	CGTGA	2	10	53077	53086	20 %	20 %	40 %	20 %	120608757
66	NC_008752	GCGCC	2	10	53677	53686	0 %	0 %	40 %	60 %	120608757
67	NC_008752	AGGCC	2	10	55358	55367	20 %	0 %	40 %	40 %	120608759
68	NC_008752	GCAGC	2	10	55666	55675	20 %	0 %	40 %	40 %	120608760
69	NC_008752	TGAGC	2	10	58324	58333	20 %	20 %	40 %	20 %	120608762
70	NC_008752	CGTGG	2	10	59145	59154	0 %	20 %	60 %	20 %	120608763
71	NC_008752	CCCGG	2	10	59460	59469	0 %	0 %	40 %	60 %	120608764
72	NC_008752	CCTGG	2	10	59648	59657	0 %	20 %	40 %	40 %	120608764
73	NC_008752	GGCCC	2	10	59678	59687	0 %	0 %	40 %	60 %	120608764
74	NC_008752	GCCCG	2	10	59928	59937	0 %	0 %	40 %	60 %	120608764
75	NC_008752	GCGCG	2	10	61111	61120	0 %	0 %	60 %	40 %	120608766
76	NC_008752	CCGCG	2	10	62052	62061	0 %	0 %	40 %	60 %	120608767
77	NC_008752	TTTTC	2	10	62472	62481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008752	AGCGC	2	10	63304	63313	20 %	0 %	40 %	40 %	120608768
79	NC_008752	GCCAT	2	10	64593	64602	20 %	20 %	20 %	40 %	120608770
80	NC_008752	GAGGT	2	10	65921	65930	20 %	20 %	60 %	0 %	120608771
81	NC_008752	GCGTC	2	10	66254	66263	0 %	20 %	40 %	40 %	120608772
82	NC_008752	CGGGC	2	10	66400	66409	0 %	0 %	60 %	40 %	120608772
83	NC_008752	GGGTG	2	10	66418	66427	0 %	20 %	80 %	0 %	120608772
84	NC_008752	GCCGC	2	10	66887	66896	0 %	0 %	40 %	60 %	120608772
85	NC_008752	GGCGC	2	10	66909	66918	0 %	0 %	60 %	40 %	120608772
86	NC_008752	AGCCG	2	10	67359	67368	20 %	0 %	40 %	40 %	120608772
87	NC_008752	CCAGG	2	10	67561	67570	20 %	0 %	40 %	40 %	120608772
88	NC_008752	TGCCG	2	10	68468	68477	0 %	20 %	40 %	40 %	120608773
89	NC_008752	GCGGA	2	10	68906	68915	20 %	0 %	60 %	20 %	120608774
90	NC_008752	TTCCA	2	10	69287	69296	20 %	40 %	0 %	40 %	120608774
91	NC_008752	GCCCG	2	10	69341	69350	0 %	0 %	40 %	60 %	120608774
92	NC_008752	CCGGG	2	10	69480	69489	0 %	0 %	60 %	40 %	120608774
93	NC_008752	AGGCC	2	10	70071	70080	20 %	0 %	40 %	40 %	120608774
94	NC_008752	ACGCC	2	10	70442	70451	20 %	0 %	20 %	60 %	120608775
95	NC_008752	ACGCC	2	10	70808	70817	20 %	0 %	20 %	60 %	120608775
96	NC_008752	GCTGC	2	10	71091	71100	0 %	20 %	40 %	40 %	120608775
97	NC_008752	CCTGG	2	10	71878	71887	0 %	20 %	40 %	40 %	120608776
98	NC_008752	GCGCC	2	10	72259	72268	0 %	0 %	40 %	60 %	120608776
99	NC_008752	CGCTG	2	10	72309	72318	0 %	20 %	40 %	40 %	120608776
100	NC_008752	GCAAG	2	10	73424	73433	40 %	0 %	40 %	20 %	120608777
101	NC_008752	CAGGC	2	10	76051	76060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008752	GCCGC	2	10	76139	76148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_008752	GCACC	2	10	76547	76556	20 %	0 %	20 %	60 %	120608779
104	NC_008752	CCGGC	2	10	77338	77347	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_008752	GGCCA	2	10	78298	78307	20 %	0 %	40 %	40 %	120608780
106	NC_008752	GTGCC	2	10	79083	79092	0 %	20 %	40 %	40 %	120608781
107	NC_008752	CGGCC	2	10	79342	79351	0 %	0 %	40 %	60 %	120608781
108	NC_008752	GCGCC	2	10	80217	80226	0 %	0 %	40 %	60 %	120608782
109	NC_008752	GCCTG	2	10	80495	80504	0 %	20 %	40 %	40 %	120608782
110	NC_008752	CCGCA	2	10	82236	82245	20 %	0 %	20 %	60 %	120608783
111	NC_008752	TGCGC	2	10	82558	82567	0 %	20 %	40 %	40 %	120608784
112	NC_008752	CGCTG	2	10	83348	83357	0 %	20 %	40 %	40 %	120608785
113	NC_008752	ATGGC	2	10	84609	84618	20 %	20 %	40 %	20 %	120608787
114	NC_008752	GGCCG	2	10	85167	85176	0 %	0 %	60 %	40 %	120608787
115	NC_008752	GTCAG	2	10	85773	85782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008752	CGGCG	2	10	85975	85984	0 %	0 %	60 %	40 %	120608789
117	NC_008752	CTGGG	2	10	88619	88628	0 %	20 %	60 %	20 %	120608793
118	NC_008752	CTGCG	2	10	89913	89922	0 %	20 %	40 %	40 %	120608794
119	NC_008752	TTTGT	2	10	95007	95016	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008752	GCGCC	2	10	95405	95414	0 %	0 %	40 %	60 %	120608800
121	NC_008752	CGGCC	2	10	95604	95613	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_008752	GCCCA	2	10	98141	98150	20 %	0 %	20 %	60 %	120608801
123	NC_008752	CCCGG	2	10	100386	100395	0 %	0 %	40 %	60 %	120608804
124	NC_008752	CGGGT	2	10	102543	102552	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008752	GCGCG	2	10	103870	103879	0 %	0 %	60 %	40 %	120608808
126	NC_008752	GGGCG	2	10	104512	104521	0 %	0 %	80 %	20 %	120608809
127	NC_008752	CGCAG	2	10	105271	105280	20 %	0 %	40 %	40 %	120608809
128	NC_008752	GGTCG	2	10	105614	105623	0 %	20 %	60 %	20 %	120608809
129	NC_008752	GCCGT	2	10	106065	106074	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008752	GCGCG	2	10	106390	106399	0 %	0 %	60 %	40 %	120608810
131	NC_008752	CGCGC	2	10	106626	106635	0 %	0 %	40 %	60 %	120608810
132	NC_008752	CTGGT	2	10	106788	106797	0 %	40 %	40 %	20 %	120608810
133	NC_008752	GCCGC	2	10	106838	106847	0 %	0 %	40 %	60 %	120608811
134	NC_008752	CCGCG	2	10	108428	108437	0 %	0 %	40 %	60 %	120608812
135	NC_008752	CGGCC	2	10	108832	108841	0 %	0 %	40 %	60 %	120608812
136	NC_008752	CGGGC	2	10	109203	109212	0 %	0 %	60 %	40 %	120608812
137	NC_008752	GGTCG	2	10	112016	112025	0 %	20 %	60 %	20 %	120608814
138	NC_008752	GCCCA	2	10	113346	113355	20 %	0 %	20 %	60 %	120608814
139	NC_008752	AGCGA	2	10	113391	113400	40 %	0 %	40 %	20 %	120608814
140	NC_008752	GGCCG	2	10	113480	113489	0 %	0 %	60 %	40 %	120608814
141	NC_008752	GGCGT	2	10	114320	114329	0 %	20 %	60 %	20 %	120608815
142	NC_008752	GCCGC	3	15	114409	114423	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_008752	AGGGA	2	10	114794	114803	40 %	0 %	60 %	0 %	120608816
144	NC_008752	CGGGC	2	10	115177	115186	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008752	GGGCT	2	10	115361	115370	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008752	CGGGG	2	10	116900	116909	0 %	0 %	80 %	20 %	120608818
147	NC_008752	GTGCC	2	10	117483	117492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_008752	CCAGG	2	10	117500	117509	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_008752	GCGCC	2	10	117575	117584	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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151	NC_008752	GGGCG	2	10	122108	122117	0 %	0 %	80 %	20 %	120608821
152	NC_008752	AGGCG	2	10	122347	122356	20 %	0 %	60 %	20 %	120608822
153	NC_008752	CGCGG	2	10	122648	122657	0 %	0 %	60 %	40 %	120608822
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155	NC_008752	CGGGC	2	10	126647	126656	0 %	0 %	60 %	40 %	120608823
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169	NC_008752	CGGCG	2	10	140089	140098	0 %	0 %	60 %	40 %	120608837
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171	NC_008752	GCGCG	2	10	144939	144948	0 %	0 %	60 %	40 %	120608842
172	NC_008752	CGGGG	2	10	145189	145198	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_008752	TGGGC	2	10	164741	164750	0 %	20 %	60 %	20 %	120608857
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244	NC_008752	TGGCG	2	10	219803	219812	0 %	20 %	60 %	20 %	120608901
245	NC_008752	TGGAA	2	10	220364	220373	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
246	NC_008752	ACCAC	2	10	220533	220542	40 %	0 %	0 %	60 %	120608903
247	NC_008752	GGCGC	2	10	221688	221697	0 %	0 %	60 %	40 %	120608904
248	NC_008752	TGGCA	2	10	221991	222000	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_008752	CCGGC	2	10	222857	222866	0 %	0 %	40 %	60 %	120608906
250	NC_008752	CCTGG	2	10	224157	224166	0 %	20 %	40 %	40 %	120608907
251	NC_008752	CGGCC	2	10	225663	225672	0 %	0 %	40 %	60 %	120608908
252	NC_008752	GCAGG	2	10	227603	227612	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
253	NC_008752	GCGCT	2	10	227780	227789	0 %	20 %	40 %	40 %	120608911
254	NC_008752	GGCCG	2	10	229380	229389	0 %	0 %	60 %	40 %	120608912
255	NC_008752	GCCTG	2	10	230445	230454	0 %	20 %	40 %	40 %	120608913
256	NC_008752	GGGCC	2	10	231461	231470	0 %	0 %	60 %	40 %	120608914
257	NC_008752	CAGCA	2	10	232386	232395	40 %	0 %	20 %	40 %	120608916
258	NC_008752	AGGTC	2	10	233145	233154	20 %	20 %	40 %	20 %	120608917
259	NC_008752	CCACG	2	10	235989	235998	20 %	0 %	20 %	60 %	120608920
260	NC_008752	GGCCA	2	10	238509	238518	20 %	0 %	40 %	40 %	120608921
261	NC_008752	GCTGG	2	10	239474	239483	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
262	NC_008752	TGCGA	2	10	239609	239618	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_008752	CCGCC	2	10	241115	241124	0 %	0 %	20 %	80 %	120608922
264	NC_008752	AGCGC	2	10	241495	241504	20 %	0 %	40 %	40 %	120608922
265	NC_008752	CAGGC	2	10	242151	242160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
266	NC_008752	CCTGC	2	10	242557	242566	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
267	NC_008752	CGGAG	2	10	244910	244919	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
268	NC_008752	GCGCC	2	10	245047	245056	0 %	0 %	40 %	60 %	120608925
269	NC_008752	GCTGG	2	10	246842	246851	0 %	20 %	60 %	20 %	120608926
270	NC_008752	GCGCG	2	10	246914	246923	0 %	0 %	60 %	40 %	120608926
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276	NC_008752	GCTGG	2	10	256892	256901	0 %	20 %	60 %	20 %	120608933
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279	NC_008752	GCGCC	2	10	258002	258011	0 %	0 %	40 %	60 %	120608934
280	NC_008752	CGCGC	2	10	259280	259289	0 %	0 %	40 %	60 %	120608934
281	NC_008752	GGCCG	2	10	259319	259328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
282	NC_008752	TCCCC	2	10	260890	260899	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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284	NC_008752	GGCCT	2	10	263185	263194	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
285	NC_008752	CTGGT	2	10	263596	263605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_008752	GGCCT	2	10	264733	264742	0 %	20 %	40 %	40 %	120608938
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369	NC_008752	CCTGC	2	10	339553	339562	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
370	NC_008752	CCGCG	2	10	340012	340021	0 %	0 %	40 %	60 %	120609009
371	NC_008752	GGCGG	2	10	340230	340239	0 %	0 %	80 %	20 %	120609009
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382	NC_008752	GCCGC	2	10	348238	348247	0 %	0 %	40 %	60 %	120609019
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392	NC_008752	ACCGT	2	10	359998	360007	20 %	20 %	20 %	40 %	120609029
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396	NC_008752	TGCGC	2	10	364139	364148	0 %	20 %	40 %	40 %	120609035
397	NC_008752	CCAGG	2	10	364358	364367	20 %	0 %	40 %	40 %	120609035
398	NC_008752	CGACC	2	10	364574	364583	20 %	0 %	20 %	60 %	120609035
399	NC_008752	CCGGT	2	10	368145	368154	0 %	20 %	40 %	40 %	120609038
400	NC_008752	CGTGC	2	10	370261	370270	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_008752	AGGCC	2	10	371179	371188	20 %	0 %	40 %	40 %	120609042
403	NC_008752	CGCTG	2	10	372174	372183	0 %	20 %	40 %	40 %	120609044
404	NC_008752	CGTGC	2	10	377551	377560	0 %	20 %	40 %	40 %	120609054
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408	NC_008752	CCGCG	2	10	379779	379788	0 %	0 %	40 %	60 %	120609057
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444	NC_008752	AGGCC	2	10	418529	418538	20 %	0 %	40 %	40 %	120609091
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