MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	AGATTA	2	12	19672	19683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008750	CTAATG	2	12	30629	30640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008750	TGAAGG	2	12	41844	41855	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008750	TGCTAT	2	12	57106	57117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008750	ATTCTG	2	12	64608	64619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008750	ATGTTT	2	12	71168	71179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008750	TGGATC	2	12	73652	73663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008750	CTGTGG	2	12	126855	126866	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008750	GTTTGC	2	12	173322	173333	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008750	TCTTTT	2	12	213404	213415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008750	TGAAGG	2	12	217100	217111	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008750	AAATGA	2	12	219256	219267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008750	AATTGA	2	12	219466	219477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008750	GAATCA	2	12	288761	288772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008750	TGGAGG	2	12	353488	353499	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008750	TGAATA	2	12	362154	362165	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008750	TCAATC	2	12	387015	387026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008750	CATTTA	2	12	404364	404375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008750	CTTTTT	2	12	411165	411176	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008750	TGAAGG	2	12	437646	437657	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008750	TTTAAT	2	12	450208	450219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008750	AGAAAT	2	12	469932	469943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008750	GACGGA	2	12	473815	473826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008750	CGCAAG	2	12	476097	476108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008750	GTGTGA	2	12	495484	495495	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008750	TAGTTG	2	12	537956	537967	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008750	TAATCT	2	12	605732	605743	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008750	TCAAAG	2	12	620618	620629	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008750	GGCTAA	2	12	626249	626260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008750	AAATCA	2	12	643557	643568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008750	TCTAAG	2	12	643572	643583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008750	GACTTT	2	12	645880	645891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008750	AACTAT	2	12	665151	665162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008750	ACTTAT	2	12	668199	668210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008750	TAGGTT	2	12	677127	677138	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008750	TGACTT	2	12	708619	708630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008750	TTGTTA	2	12	712429	712440	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008750	TTCGTC	2	12	719773	719784	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008750	ACTAAA	2	12	729092	729103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008750	ACTAAA	2	12	746637	746648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008750	ATATCG	2	12	846713	846724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008750	GTTAAT	2	12	911965	911976	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008750	TTAGCT	2	12	934044	934055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008750	TTTAAG	2	12	936448	936459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008750	TTGATT	2	12	951390	951401	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008750	TTTTAC	2	12	973088	973099	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008750	GCATCA	2	12	1028087	1028098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008750	TGATAT	2	12	1037472	1037483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008750	AAAGTC	5	30	1081414	1081443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008750	AAAATC	2	12	1085255	1085266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008750	CAACCT	3	18	1101458	1101475	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008750	TTTTAA	2	12	1126259	1126270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008750	GAGTTA	2	12	1134416	1134427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008750	GTGAGA	2	12	1140170	1140181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008750	CACAGT	2	12	1170736	1170747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008750	ATCTTT	2	12	1198224	1198235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008750	ATTTTA	2	12	1202496	1202507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008750	GCTCGC	2	12	1231528	1231539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008750	GAGTTA	2	12	1258592	1258603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008750	CCATGA	2	12	1262547	1262558	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008750	ATGACG	4	24	1272115	1272138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008750	CTTGAC	2	12	1278618	1278629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008750	GACCTT	2	12	1285932	1285943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008750	ATTAAG	2	12	1354404	1354415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008750	AATCCA	2	12	1523050	1523061	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008750	GTGTCA	2	12	1523286	1523297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008750	AAGGAG	2	12	1552087	1552098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008750	CATATG	2	12	1552449	1552460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008750	CTTATA	2	12	1606607	1606618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008750	AAAGCT	2	12	1639883	1639894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008750	AAAGCC	2	12	1649437	1649448	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008750	CTTAGA	2	12	1664274	1664285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008750	CTAAAA	2	12	1673913	1673924	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008750	ACGTTA	2	12	1690689	1690700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008750	TTTTTA	2	12	1726272	1726283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008750	AAAACA	2	12	1770869	1770880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008750	CGATAA	2	12	1774262	1774273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008750	TGATTG	2	12	1816322	1816333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008750	AATACA	2	12	1862618	1862629	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008750	ATTTTT	2	12	1872851	1872862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008750	TTAAAA	2	12	1891493	1891504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008750	TGAAGG	2	12	1903259	1903270	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008750	TTGCAA	2	12	1915297	1915308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008750	GTATTG	2	12	1946120	1946131	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008750	ACGTAA	2	12	2042356	2042367	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008750	ACTTCC	2	12	2052194	2052205	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008750	GATCGC	2	12	2242776	2242787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008750	CGTGAT	2	12	2283280	2283291	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008750	AATATA	2	12	2307073	2307084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008750	ATCAAA	2	12	2307626	2307637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008750	GATTTG	2	12	2348586	2348597	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008750	TAAAAG	2	12	2356723	2356734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008750	CTGAAA	2	12	2426814	2426825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008750	AAAAGC	2	12	2438552	2438563	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008750	CAGCAA	2	12	2486104	2486115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008750	CCTTTA	2	12	2501106	2501117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008750	ACTAGC	2	12	2515368	2515379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008750	ATCCAG	2	12	2533987	2533998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008750	TTGTTT	2	12	2567046	2567057	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008750	AACGCT	2	12	2584883	2584894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008750	CTTTAC	2	12	2658181	2658192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008750	CTTCAC	2	12	2669912	2669923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008750	GGTTAT	2	12	2706778	2706789	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008750	TAAAAA	2	12	2709662	2709673	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008750	TAATCA	2	12	2737568	2737579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008750	GCTTTT	2	12	2747214	2747225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008750	ACCATT	2	12	2766033	2766044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008750	ACAATG	2	12	2768544	2768555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008750	AAAACA	2	12	2816595	2816606	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008750	ATTAAC	2	12	2891577	2891588	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008750	AATCTC	2	12	2905818	2905829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008750	CAAAAA	2	12	2933370	2933381	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008750	TATTTT	2	12	2978035	2978046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008750	AAAATA	2	12	2988943	2988954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008750	TAGAAA	2	12	2992306	2992317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008750	TATAGG	2	12	3006699	3006710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008750	TGGAAA	2	12	3008018	3008029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008750	AAAAGC	2	12	3021318	3021329	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008750	GCTCTT	2	12	3044362	3044373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008750	CACTTG	2	12	3071617	3071628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008750	ACGTAA	2	12	3094340	3094351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008750	TCTCTT	2	12	3107931	3107942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008750	CCAAAT	2	12	3161087	3161098	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008750	CATTTT	2	12	3251941	3251952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008750	TACAGA	2	12	3254968	3254979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008750	TATAAA	2	12	3289208	3289219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.