MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	TTATT	2	10	24144	24153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008750	GGTCA	2	10	38215	38224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008750	AGTCG	2	10	41739	41748	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008750	AGGCT	2	10	42068	42077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008750	ATAAG	2	10	43633	43642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008750	ATCCC	2	10	43743	43752	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_008750	ATTAT	2	10	54696	54705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008750	TAGTG	2	10	68880	68889	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008750	TATCT	2	10	74293	74302	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008750	TTAAG	2	10	101175	101184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008750	TAAAG	2	10	103130	103139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008750	TAGTC	2	10	105532	105541	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008750	TGTTT	2	10	107323	107332	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008750	ACGCA	2	10	131997	132006	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008750	TTGAG	2	10	147051	147060	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008750	CTATT	2	10	147489	147498	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008750	GAATT	2	10	176504	176513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008750	TTGAA	2	10	213501	213510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008750	GATAA	2	10	215751	215760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008750	AGTCG	2	10	216995	217004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008750	AGGCT	2	10	217324	217333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008750	ATCCC	2	10	219007	219016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008750	TCCGC	2	10	219193	219202	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008750	AAAAC	2	10	230253	230262	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008750	CATAT	2	10	260101	260110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008750	CTTTA	2	10	260347	260356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008750	GAAAT	2	10	266390	266399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008750	ACCTT	2	10	268273	268282	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008750	GTCGT	2	10	279641	279650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008750	CAACA	2	10	290612	290621	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008750	ACATA	2	10	290660	290669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008750	GACTA	2	10	291124	291133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008750	AAACT	2	10	294358	294367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008750	TTTGT	2	10	331039	331048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008750	TTGCA	2	10	339149	339158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008750	TTCAA	2	10	359382	359391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008750	GAAGT	2	10	359441	359450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008750	CACCG	2	10	362107	362116	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008750	GTAAA	2	10	387037	387046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008750	GATAG	2	10	409585	409594	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008750	GGATG	2	10	411961	411970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008750	GATAA	2	10	436296	436305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008750	AGTCG	2	10	437541	437550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008750	AGGCT	2	10	437870	437879	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008750	ATAAG	2	10	439484	439493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008750	ATCCC	2	10	439601	439610	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_008750	CAACA	2	10	451732	451741	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008750	ATCTG	2	10	454238	454247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008750	GACGG	2	10	463614	463623	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008750	TTTCT	2	10	465427	465436	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008750	GGATT	2	10	469294	469303	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008750	TGATC	2	10	473264	473273	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008750	GCTGA	2	10	476295	476304	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008750	GTCAT	2	10	480906	480915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008750	GATTA	2	10	487969	487978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008750	GGATT	2	10	494492	494501	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008750	TTAGC	2	10	498465	498474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008750	TAAAA	2	10	513527	513536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008750	AGCTT	2	10	525124	525133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008750	CAATG	2	10	526253	526262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008750	GCTTC	2	10	552336	552345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008750	CGCTG	2	10	553777	553786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008750	AGCAG	2	10	557033	557042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008750	ACGCT	2	10	561685	561694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008750	CGCTG	2	10	561760	561769	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008750	ATGGT	2	10	578135	578144	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008750	ATAAA	2	10	584359	584368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008750	AACAG	2	10	593668	593677	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008750	AGTGG	2	10	593831	593840	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008750	TTGAG	2	10	593912	593921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008750	ATATT	2	10	605039	605048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008750	TAAAA	2	10	605183	605192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008750	GGGGA	2	10	610254	610263	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008750	TTATT	2	10	611594	611603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008750	CTAGG	2	10	611627	611636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008750	TCGAC	2	10	628865	628874	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008750	TAAAA	2	10	632814	632823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008750	CCATC	2	10	633030	633039	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_008750	AAAAT	2	10	633055	633064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008750	GGTTT	2	10	635986	635995	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008750	CGTAA	2	10	645966	645975	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008750	TGTGT	2	10	646784	646793	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008750	ATCTT	2	10	649419	649428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008750	GAGTT	2	10	675257	675266	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008750	AGAAT	2	10	675693	675702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008750	TTTAT	2	10	678165	678174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008750	GTTGA	2	10	683165	683174	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008750	AAACT	2	10	686015	686024	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008750	TAAAA	2	10	695487	695496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008750	AACTT	2	10	710072	710081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008750	CTTTT	2	10	721761	721770	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008750	TTGGC	2	10	741223	741232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008750	CTAGG	2	10	752794	752803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008750	GTTTG	2	10	760212	760221	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008750	TGTTT	2	10	761746	761755	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008750	ATTTG	2	10	772680	772689	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008750	CCAAG	2	10	781928	781937	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008750	AGTTT	2	10	791878	791887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008750	GCATT	2	10	793082	793091	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008750	TAAAA	2	10	800710	800719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008750	ATAGA	2	10	801351	801360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008750	CGAGC	2	10	804726	804735	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008750	TAGAA	2	10	814293	814302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008750	TTAAA	2	10	814371	814380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008750	ATTTA	2	10	846800	846809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008750	GTAGA	2	10	852411	852420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008750	TTTTC	2	10	855937	855946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008750	TAACT	2	10	856251	856260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008750	TTAAC	2	10	870813	870822	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008750	GGGGA	2	10	894394	894403	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008750	AAGCA	2	10	899363	899372	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008750	AGAGG	2	10	899525	899534	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008750	TCGCG	2	10	934237	934246	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008750	AAATC	2	10	947734	947743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008750	GCAGA	2	10	950660	950669	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008750	TGCAA	2	10	955542	955551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008750	TCAGC	2	10	972955	972964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008750	ACTTT	2	10	983394	983403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008750	AGTTT	2	10	1024171	1024180	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008750	CATTG	2	10	1025246	1025255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008750	TATTT	2	10	1028267	1028276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008750	GCTAC	2	10	1040605	1040614	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008750	TTTTG	2	10	1050859	1050868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008750	GCGAT	2	10	1080008	1080017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008750	TTGAT	2	10	1081396	1081405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008750	ATTAA	2	10	1082092	1082101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008750	TAAAC	2	10	1083375	1083384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008750	GTGTG	2	10	1083757	1083766	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008750	TTCAA	2	10	1086549	1086558	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008750	TAAAA	2	10	1102188	1102197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008750	TGGAA	2	10	1117712	1117721	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008750	TAAGT	2	10	1121578	1121587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008750	GAAGA	2	10	1129430	1129439	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008750	CAGCG	2	10	1133035	1133044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008750	ATGGC	2	10	1134672	1134681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008750	TCATT	2	10	1141692	1141701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008750	TGGCT	2	10	1144357	1144366	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008750	ATCTT	2	10	1190369	1190378	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008750	AGCAC	2	10	1197348	1197357	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_008750	AGCAC	2	10	1197802	1197811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_008750	ATGCT	2	10	1231416	1231425	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008750	TTAAG	2	10	1244365	1244374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008750	CCGGA	2	10	1262784	1262793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_008750	GATCA	2	10	1269027	1269036	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008750	GAAAA	2	10	1270228	1270237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_008750	GATCA	2	10	1278559	1278568	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_008750	AATTG	2	10	1595252	1595261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_008750	GCTAA	2	10	3554287	3554296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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407	NC_008750	CAATG	2	10	3584517	3584526	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
408	NC_008750	CTAGC	2	10	3587712	3587721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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