MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 2400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	AGTGA	2	10	4981	4990	40 %	20 %	40 %	0 %	120596837
2	NC_008750	GTATT	2	10	5887	5896	20 %	60 %	20 %	0 %	120596837
3	NC_008750	TTTCG	2	10	9391	9400	0 %	60 %	20 %	20 %	120596839
4	NC_008750	GCTGA	2	10	9641	9650	20 %	20 %	40 %	20 %	120596839
5	NC_008750	TGGCG	2	10	9898	9907	0 %	20 %	60 %	20 %	120596840
6	NC_008750	GTTCA	2	10	16151	16160	20 %	40 %	20 %	20 %	120596845
7	NC_008750	CGCAT	2	10	17137	17146	20 %	20 %	20 %	40 %	120596846
8	NC_008750	ACATC	2	10	17522	17531	40 %	20 %	0 %	40 %	120596846
9	NC_008750	AGTTT	2	10	18823	18832	20 %	60 %	20 %	0 %	120596846
10	NC_008750	AGCGA	2	10	19132	19141	40 %	0 %	40 %	20 %	120596846
11	NC_008750	GCGCC	2	10	20241	20250	0 %	0 %	40 %	60 %	120596847
12	NC_008750	TAGAA	2	10	23839	23848	60 %	20 %	20 %	0 %	120596851
13	NC_008750	CAACA	2	10	25777	25786	60 %	0 %	0 %	40 %	120596853
14	NC_008750	TTGTC	2	10	27857	27866	0 %	60 %	20 %	20 %	120596855
15	NC_008750	TGCGC	2	10	28409	28418	0 %	20 %	40 %	40 %	120596855
16	NC_008750	TTGTG	2	10	29974	29983	0 %	60 %	40 %	0 %	120596856
17	NC_008750	CGAAA	2	10	32460	32469	60 %	0 %	20 %	20 %	120596859
18	NC_008750	TTCGT	2	10	33132	33141	0 %	60 %	20 %	20 %	120596860
19	NC_008750	GGATC	2	10	36145	36154	20 %	20 %	40 %	20 %	120596864
20	NC_008750	CAGCA	2	10	46387	46396	40 %	0 %	20 %	40 %	120596868
21	NC_008750	GACTC	2	10	47273	47282	20 %	20 %	20 %	40 %	120596869
22	NC_008750	TGGCT	2	10	47445	47454	0 %	40 %	40 %	20 %	120596869
23	NC_008750	GATCT	2	10	48993	49002	20 %	40 %	20 %	20 %	120596870
24	NC_008750	ATCTT	2	10	49021	49030	20 %	60 %	0 %	20 %	120596870
25	NC_008750	GTATC	2	10	50444	50453	20 %	40 %	20 %	20 %	120596871
26	NC_008750	GCAAC	2	10	50498	50507	40 %	0 %	20 %	40 %	120596871
27	NC_008750	TTTTG	2	10	51244	51253	0 %	80 %	20 %	0 %	120596872
28	NC_008750	CATGC	2	10	55133	55142	20 %	20 %	20 %	40 %	120596876
29	NC_008750	TGCGC	2	10	55334	55343	0 %	20 %	40 %	40 %	120596876
30	NC_008750	CCATG	2	10	55428	55437	20 %	20 %	20 %	40 %	120596876
31	NC_008750	GCATT	2	10	57479	57488	20 %	40 %	20 %	20 %	120596878
32	NC_008750	CTGTT	2	10	57723	57732	0 %	60 %	20 %	20 %	120596878
33	NC_008750	GATTG	2	10	61576	61585	20 %	40 %	40 %	0 %	120596880
34	NC_008750	CAGTG	2	10	62906	62915	20 %	20 %	40 %	20 %	120596882
35	NC_008750	CCATT	2	10	65846	65855	20 %	40 %	0 %	40 %	120596885
36	NC_008750	TTGCA	2	10	66987	66996	20 %	40 %	20 %	20 %	120596886
37	NC_008750	ATGCC	2	10	67894	67903	20 %	20 %	20 %	40 %	120596887
38	NC_008750	GCTCA	2	10	69776	69785	20 %	20 %	20 %	40 %	120596888
39	NC_008750	GATGT	2	10	70800	70809	20 %	40 %	40 %	0 %	120596889
40	NC_008750	AGATA	2	10	71713	71722	60 %	20 %	20 %	0 %	120596890
41	NC_008750	AGTTG	2	10	75191	75200	20 %	40 %	40 %	0 %	120596892
42	NC_008750	TAGGT	2	10	75360	75369	20 %	40 %	40 %	0 %	120596892
43	NC_008750	TTTAA	2	10	76150	76159	40 %	60 %	0 %	0 %	120596892
44	NC_008750	AATTA	2	10	79372	79381	60 %	40 %	0 %	0 %	120596895
45	NC_008750	ATCAC	2	10	79789	79798	40 %	20 %	0 %	40 %	120596896
46	NC_008750	GTTGT	2	10	83470	83479	0 %	60 %	40 %	0 %	120596899
47	NC_008750	GCTGA	2	10	84076	84085	20 %	20 %	40 %	20 %	120596899
48	NC_008750	TTCAC	2	10	86953	86962	20 %	40 %	0 %	40 %	120596903
49	NC_008750	CAATT	2	10	88140	88149	40 %	40 %	0 %	20 %	120596903
50	NC_008750	AGTTT	2	10	90745	90754	20 %	60 %	20 %	0 %	120596907
51	NC_008750	CTGCG	2	10	91957	91966	0 %	20 %	40 %	40 %	120596908
52	NC_008750	CCTTA	2	10	93108	93117	20 %	40 %	0 %	40 %	120596909
53	NC_008750	AGTTT	2	10	93142	93151	20 %	60 %	20 %	0 %	120596909
54	NC_008750	AACGT	2	10	94370	94379	40 %	20 %	20 %	20 %	120596909
55	NC_008750	TGAGT	2	10	94734	94743	20 %	40 %	40 %	0 %	120596909
56	NC_008750	TGGTA	2	10	96475	96484	20 %	40 %	40 %	0 %	120596911
57	NC_008750	TGGCT	2	10	98460	98469	0 %	40 %	40 %	20 %	120596913
58	NC_008750	TCTGC	2	10	101652	101661	0 %	40 %	20 %	40 %	120596915
59	NC_008750	CATTT	2	10	102121	102130	20 %	60 %	0 %	20 %	120596915
60	NC_008750	AAGCT	2	10	102600	102609	40 %	20 %	20 %	20 %	120596916
61	NC_008750	AAGTT	2	10	102848	102857	40 %	40 %	20 %	0 %	120596916
62	NC_008750	CCCAA	2	10	108219	108228	40 %	0 %	0 %	60 %	120596921
63	NC_008750	CGGGC	2	10	109666	109675	0 %	0 %	60 %	40 %	120596922
64	NC_008750	CTAAG	2	10	113489	113498	40 %	20 %	20 %	20 %	120596925
65	NC_008750	AATGG	2	10	113539	113548	40 %	20 %	40 %	0 %	120596925
66	NC_008750	GCGCT	2	10	113868	113877	0 %	20 %	40 %	40 %	120596926
67	NC_008750	GCCAT	2	10	114012	114021	20 %	20 %	20 %	40 %	120596926
68	NC_008750	AAGCC	2	10	114530	114539	40 %	0 %	20 %	40 %	120596927
69	NC_008750	TGGGG	2	10	114607	114616	0 %	20 %	80 %	0 %	120596927
70	NC_008750	TCCAG	2	10	116938	116947	20 %	20 %	20 %	40 %	120596928
71	NC_008750	AACAG	2	10	119186	119195	60 %	0 %	20 %	20 %	120596930
72	NC_008750	CTAAT	2	10	119686	119695	40 %	40 %	0 %	20 %	120596930
73	NC_008750	ATTAC	2	10	121250	121259	40 %	40 %	0 %	20 %	120596930
74	NC_008750	GGCTT	2	10	123929	123938	0 %	40 %	40 %	20 %	120596932
75	NC_008750	TTCAC	2	10	125744	125753	20 %	40 %	0 %	40 %	120596934
76	NC_008750	TTCGC	2	10	129491	129500	0 %	40 %	20 %	40 %	120596938
77	NC_008750	TTGAC	2	10	131794	131803	20 %	40 %	20 %	20 %	120596939
78	NC_008750	TTTAG	2	10	137698	137707	20 %	60 %	20 %	0 %	120596943
79	NC_008750	GTTCA	2	10	137709	137718	20 %	40 %	20 %	20 %	120596943
80	NC_008750	AGTCG	2	10	137896	137905	20 %	20 %	40 %	20 %	120596943
81	NC_008750	TGGGC	2	10	138094	138103	0 %	20 %	60 %	20 %	120596943
82	NC_008750	GCATC	2	10	139096	139105	20 %	20 %	20 %	40 %	120596945
83	NC_008750	AGAGA	2	10	142042	142051	60 %	0 %	40 %	0 %	120596948
84	NC_008750	AAAGT	2	10	142716	142725	60 %	20 %	20 %	0 %	120596949
85	NC_008750	GGTTT	2	10	143331	143340	0 %	60 %	40 %	0 %	120596949
86	NC_008750	GGTGA	2	10	146124	146133	20 %	20 %	60 %	0 %	120596951
87	NC_008750	GTGTG	2	10	146581	146590	0 %	40 %	60 %	0 %	120596952
88	NC_008750	TCCTT	2	10	148275	148284	0 %	60 %	0 %	40 %	120596954
89	NC_008750	GTTTT	2	10	148745	148754	0 %	80 %	20 %	0 %	120596954
90	NC_008750	CTGTG	2	10	150474	150483	0 %	40 %	40 %	20 %	120596956
91	NC_008750	ATCCT	2	10	151865	151874	20 %	40 %	0 %	40 %	120596957
92	NC_008750	ACTGC	2	10	152537	152546	20 %	20 %	20 %	40 %	120596957
93	NC_008750	TAGGC	2	10	152822	152831	20 %	20 %	40 %	20 %	120596958
94	NC_008750	GCCAA	2	10	157291	157300	40 %	0 %	20 %	40 %	120596963
95	NC_008750	CGGCA	2	10	158806	158815	20 %	0 %	40 %	40 %	120596965
96	NC_008750	AATAC	2	10	161836	161845	60 %	20 %	0 %	20 %	120596967
97	NC_008750	TGGCG	2	10	162852	162861	0 %	20 %	60 %	20 %	120596968
98	NC_008750	GTTAA	2	10	165505	165514	40 %	40 %	20 %	0 %	120596969
99	NC_008750	AACAA	2	10	165893	165902	80 %	0 %	0 %	20 %	120596970
100	NC_008750	TACTG	2	10	167466	167475	20 %	40 %	20 %	20 %	120596971
101	NC_008750	CTGTA	2	10	167913	167922	20 %	40 %	20 %	20 %	120596971
102	NC_008750	AGCGA	2	10	173623	173632	40 %	0 %	40 %	20 %	120596976
103	NC_008750	CAGTT	2	10	175558	175567	20 %	40 %	20 %	20 %	120596979
104	NC_008750	TACTC	2	10	177788	177797	20 %	40 %	0 %	40 %	120596982
105	NC_008750	AGCAA	2	10	181289	181298	60 %	0 %	20 %	20 %	120596983
106	NC_008750	CTGAT	2	10	181340	181349	20 %	40 %	20 %	20 %	120596983
107	NC_008750	TCTGT	2	10	181425	181434	0 %	60 %	20 %	20 %	120596983
108	NC_008750	GAAAA	2	10	186266	186275	80 %	0 %	20 %	0 %	120596985
109	NC_008750	GTTCT	2	10	186749	186758	0 %	60 %	20 %	20 %	120596986
110	NC_008750	TGGCG	2	10	191576	191585	0 %	20 %	60 %	20 %	120596990
111	NC_008750	AAGCC	2	10	197223	197232	40 %	0 %	20 %	40 %	120597003
112	NC_008750	TCGCG	2	10	199270	199279	0 %	20 %	40 %	40 %	120597008
113	NC_008750	CATTG	2	10	201150	201159	20 %	40 %	20 %	20 %	120597011
114	NC_008750	ATGGC	2	10	201530	201539	20 %	20 %	40 %	20 %	120597012
115	NC_008750	CGTGA	2	10	203244	203253	20 %	20 %	40 %	20 %	120597014
116	NC_008750	GCTTT	2	10	210303	210312	0 %	60 %	20 %	20 %	120597023
117	NC_008750	GCTGA	2	10	212062	212071	20 %	20 %	40 %	20 %	120597024
118	NC_008750	TGATC	2	10	212884	212893	20 %	40 %	20 %	20 %	120597026
119	NC_008750	CCATG	2	10	219536	219545	20 %	20 %	20 %	40 %	120597027
120	NC_008750	TGGTT	2	10	222102	222111	0 %	60 %	40 %	0 %	120597029
121	NC_008750	TGGAA	2	10	223988	223997	40 %	20 %	40 %	0 %	120597030
122	NC_008750	TTCTT	2	10	225540	225549	0 %	80 %	0 %	20 %	120597032
123	NC_008750	GCATG	2	10	226847	226856	20 %	20 %	40 %	20 %	120597033
124	NC_008750	CAAAC	2	10	227012	227021	60 %	0 %	0 %	40 %	120597033
125	NC_008750	TTTGT	2	10	229158	229167	0 %	80 %	20 %	0 %	120597036
126	NC_008750	TTTGA	2	10	232318	232327	20 %	60 %	20 %	0 %	120597039
127	NC_008750	GCAGC	2	10	238153	238162	20 %	0 %	40 %	40 %	120597047
128	NC_008750	TGCCT	2	10	238276	238285	0 %	40 %	20 %	40 %	120597047
129	NC_008750	ATCGA	2	10	238692	238701	40 %	20 %	20 %	20 %	120597047
130	NC_008750	CTGCG	2	10	239487	239496	0 %	20 %	40 %	40 %	120597047
131	NC_008750	GGGTA	2	10	240050	240059	20 %	20 %	60 %	0 %	120597048
132	NC_008750	ATTTA	2	10	241918	241927	40 %	60 %	0 %	0 %	120597049
133	NC_008750	TTCAA	2	10	243508	243517	40 %	40 %	0 %	20 %	120597051
134	NC_008750	AGATT	2	10	243833	243842	40 %	40 %	20 %	0 %	120597052
135	NC_008750	TCCTG	2	10	244637	244646	0 %	40 %	20 %	40 %	120597053
136	NC_008750	GCTGT	2	10	246272	246281	0 %	40 %	40 %	20 %	120597054
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141	NC_008750	TGGAG	2	10	255328	255337	20 %	20 %	60 %	0 %	120597063
142	NC_008750	TTGCT	2	10	255575	255584	0 %	60 %	20 %	20 %	120597063
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148	NC_008750	TATTT	2	10	262447	262456	20 %	80 %	0 %	0 %	120597069
149	NC_008750	ATTGA	2	10	263614	263623	40 %	40 %	20 %	0 %	120597070
150	NC_008750	GGCAG	2	10	266702	266711	20 %	0 %	60 %	20 %	120597073
151	NC_008750	GCTGA	2	10	267918	267927	20 %	20 %	40 %	20 %	120597073
152	NC_008750	CCTAC	2	10	268772	268781	20 %	20 %	0 %	60 %	120597074
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155	NC_008750	GTGCT	2	10	272167	272176	0 %	40 %	40 %	20 %	120597079
156	NC_008750	TGCAT	2	10	279073	279082	20 %	40 %	20 %	20 %	120597086
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159	NC_008750	GTTGG	2	10	286883	286892	0 %	40 %	60 %	0 %	120597095
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165	NC_008750	ATCAA	2	10	299018	299027	60 %	20 %	0 %	20 %	120597103
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172	NC_008750	CAATC	2	10	313744	313753	40 %	20 %	0 %	40 %	120597119
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177	NC_008750	ACACC	2	10	326207	326216	40 %	0 %	0 %	60 %	120597132
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246	NC_008750	TCTGC	2	10	462181	462190	0 %	40 %	20 %	40 %	120597253
247	NC_008750	TGTTT	2	10	462499	462508	0 %	80 %	20 %	0 %	120597254
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256	NC_008750	TTTGC	2	10	473222	473231	0 %	60 %	20 %	20 %	120597264
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258	NC_008750	GGGCG	2	10	478730	478739	0 %	0 %	80 %	20 %	120597270
259	NC_008750	CTGAG	2	10	484698	484707	20 %	20 %	40 %	20 %	120597274
260	NC_008750	TTTAT	2	10	487929	487938	20 %	80 %	0 %	0 %	120597277
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262	NC_008750	TGGCA	2	10	491694	491703	20 %	20 %	40 %	20 %	120597279
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