MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 8985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	ATGG	2	8	246	253	25 %	25 %	50 %	0 %	120596834
2	NC_008750	GCCC	2	8	413	420	0 %	0 %	25 %	75 %	120596834
3	NC_008750	CTTG	2	8	899	906	0 %	50 %	25 %	25 %	120596834
4	NC_008750	TTGG	2	8	988	995	0 %	50 %	50 %	0 %	120596834
5	NC_008750	CGTG	2	8	1127	1134	0 %	25 %	50 %	25 %	120596834
6	NC_008750	TAAC	2	8	1381	1388	50 %	25 %	0 %	25 %	120596834
7	NC_008750	CAAT	2	8	2488	2495	50 %	25 %	0 %	25 %	120596835
8	NC_008750	TGAT	2	8	2574	2581	25 %	50 %	25 %	0 %	120596835
9	NC_008750	ATGT	2	8	2627	2634	25 %	50 %	25 %	0 %	120596835
10	NC_008750	ATTT	2	8	2979	2986	25 %	75 %	0 %	0 %	120596836
11	NC_008750	CGTT	2	8	3000	3007	0 %	50 %	25 %	25 %	120596836
12	NC_008750	TGAT	2	8	4565	4572	25 %	50 %	25 %	0 %	120596837
13	NC_008750	ATTG	2	8	5514	5521	25 %	50 %	25 %	0 %	120596837
14	NC_008750	ACTA	2	8	5971	5978	50 %	25 %	0 %	25 %	120596837
15	NC_008750	GCTG	2	8	6909	6916	0 %	25 %	50 %	25 %	120596838
16	NC_008750	CGAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	50 %	25 %	120596838
17	NC_008750	ATTT	2	8	7129	7136	25 %	75 %	0 %	0 %	120596838
18	NC_008750	TTGC	2	8	7372	7379	0 %	50 %	25 %	25 %	120596838
19	NC_008750	GGCG	2	8	7475	7482	0 %	0 %	75 %	25 %	120596838
20	NC_008750	CAAA	2	8	7887	7894	75 %	0 %	0 %	25 %	120596839
21	NC_008750	TTCA	2	8	7915	7922	25 %	50 %	0 %	25 %	120596839
22	NC_008750	TGCT	2	8	7936	7943	0 %	50 %	25 %	25 %	120596839
23	NC_008750	AGTG	2	8	8232	8239	25 %	25 %	50 %	0 %	120596839
24	NC_008750	GGCG	2	8	8520	8527	0 %	0 %	75 %	25 %	120596839
25	NC_008750	TCAA	2	8	9254	9261	50 %	25 %	0 %	25 %	120596839
26	NC_008750	ACAT	2	8	11976	11983	50 %	25 %	0 %	25 %	120596842
27	NC_008750	TGGT	2	8	12269	12276	0 %	50 %	50 %	0 %	120596842
28	NC_008750	GTAG	2	8	13894	13901	25 %	25 %	50 %	0 %	120596842
29	NC_008750	TCAA	2	8	13989	13996	50 %	25 %	0 %	25 %	120596842
30	NC_008750	TTCA	2	8	15334	15341	25 %	50 %	0 %	25 %	120596843
31	NC_008750	TTAA	2	8	16467	16474	50 %	50 %	0 %	0 %	120596845
32	NC_008750	CAGA	2	8	16981	16988	50 %	0 %	25 %	25 %	120596845
33	NC_008750	TCTT	2	8	17440	17447	0 %	75 %	0 %	25 %	120596846
34	NC_008750	CCAA	2	8	17649	17656	50 %	0 %	0 %	50 %	120596846
35	NC_008750	TTGA	2	8	17947	17954	25 %	50 %	25 %	0 %	120596846
36	NC_008750	TCAC	2	8	17989	17996	25 %	25 %	0 %	50 %	120596846
37	NC_008750	GCTG	2	8	18205	18212	0 %	25 %	50 %	25 %	120596846
38	NC_008750	TGCT	2	8	18465	18472	0 %	50 %	25 %	25 %	120596846
39	NC_008750	TTGC	2	8	19247	19254	0 %	50 %	25 %	25 %	120596846
40	NC_008750	GAGT	2	8	20307	20314	25 %	25 %	50 %	0 %	120596847
41	NC_008750	CCCA	2	8	20819	20826	25 %	0 %	0 %	75 %	120596847
42	NC_008750	ATTG	2	8	21285	21292	25 %	50 %	25 %	0 %	120596848
43	NC_008750	CAAA	2	8	21481	21488	75 %	0 %	0 %	25 %	120596848
44	NC_008750	TATT	2	8	21919	21926	25 %	75 %	0 %	0 %	120596849
45	NC_008750	ATTT	2	8	22040	22047	25 %	75 %	0 %	0 %	120596849
46	NC_008750	TGCT	2	8	22210	22217	0 %	50 %	25 %	25 %	120596849
47	NC_008750	TTGG	2	8	22379	22386	0 %	50 %	50 %	0 %	120596849
48	NC_008750	TTCT	2	8	22509	22516	0 %	75 %	0 %	25 %	120596849
49	NC_008750	GCTT	2	8	23076	23083	0 %	50 %	25 %	25 %	120596849
50	NC_008750	GCAG	2	8	23353	23360	25 %	0 %	50 %	25 %	120596850
51	NC_008750	GATT	2	8	23614	23621	25 %	50 %	25 %	0 %	120596850
52	NC_008750	CCGA	2	8	23684	23691	25 %	0 %	25 %	50 %	120596850
53	NC_008750	GAGC	2	8	25190	25197	25 %	0 %	50 %	25 %	120596853
54	NC_008750	AGAA	2	8	25536	25543	75 %	0 %	25 %	0 %	120596853
55	NC_008750	TACC	2	8	25648	25655	25 %	25 %	0 %	50 %	120596853
56	NC_008750	GAAA	2	8	26316	26323	75 %	0 %	25 %	0 %	120596853
57	NC_008750	TGAG	2	8	26678	26685	25 %	25 %	50 %	0 %	120596854
58	NC_008750	GCTC	2	8	26960	26967	0 %	25 %	25 %	50 %	120596854
59	NC_008750	GGTA	2	8	27063	27070	25 %	25 %	50 %	0 %	120596854
60	NC_008750	CACC	2	8	27729	27736	25 %	0 %	0 %	75 %	120596854
61	NC_008750	TCTA	2	8	27940	27947	25 %	50 %	0 %	25 %	120596855
62	NC_008750	TCGC	2	8	28511	28518	0 %	25 %	25 %	50 %	120596855
63	NC_008750	TTTG	2	8	28884	28891	0 %	75 %	25 %	0 %	120596855
64	NC_008750	CGCC	2	8	29666	29673	0 %	0 %	25 %	75 %	120596856
65	NC_008750	TTTG	2	8	30107	30114	0 %	75 %	25 %	0 %	120596857
66	NC_008750	ACAA	2	8	30148	30155	75 %	0 %	0 %	25 %	120596857
67	NC_008750	GTTT	2	8	30760	30767	0 %	75 %	25 %	0 %	120596858
68	NC_008750	TTAT	2	8	30921	30928	25 %	75 %	0 %	0 %	120596858
69	NC_008750	TGAT	2	8	31995	32002	25 %	50 %	25 %	0 %	120596859
70	NC_008750	ACTC	2	8	33018	33025	25 %	25 %	0 %	50 %	120596860
71	NC_008750	TGAT	2	8	33245	33252	25 %	50 %	25 %	0 %	120596860
72	NC_008750	AACC	2	8	33272	33279	50 %	0 %	0 %	50 %	120596860
73	NC_008750	GTGG	2	8	35377	35384	0 %	25 %	75 %	0 %	120596863
74	NC_008750	TTTG	2	8	35586	35593	0 %	75 %	25 %	0 %	120596863
75	NC_008750	GACA	2	8	36352	36359	50 %	0 %	25 %	25 %	120596865
76	NC_008750	TTCA	2	8	36404	36411	25 %	50 %	0 %	25 %	120596865
77	NC_008750	CCCA	2	8	36428	36435	25 %	0 %	0 %	75 %	120596865
78	NC_008750	GCGG	2	8	36509	36516	0 %	0 %	75 %	25 %	120596865
79	NC_008750	ATGA	2	8	36890	36897	50 %	25 %	25 %	0 %	120596865
80	NC_008750	TTTG	2	8	37383	37390	0 %	75 %	25 %	0 %	120596866
81	NC_008750	AATT	2	8	44527	44534	50 %	50 %	0 %	0 %	120596868
82	NC_008750	ATTG	2	8	44627	44634	25 %	50 %	25 %	0 %	120596868
83	NC_008750	ATTA	2	8	44660	44667	50 %	50 %	0 %	0 %	120596868
84	NC_008750	TTTC	2	8	44901	44908	0 %	75 %	0 %	25 %	120596868
85	NC_008750	AGTT	2	8	45211	45218	25 %	50 %	25 %	0 %	120596868
86	NC_008750	TTTA	2	8	45383	45390	25 %	75 %	0 %	0 %	120596868
87	NC_008750	CTTG	2	8	45467	45474	0 %	50 %	25 %	25 %	120596868
88	NC_008750	AGCA	2	8	45982	45989	50 %	0 %	25 %	25 %	120596868
89	NC_008750	GATT	2	8	46052	46059	25 %	50 %	25 %	0 %	120596868
90	NC_008750	CGTA	2	8	46086	46093	25 %	25 %	25 %	25 %	120596868
91	NC_008750	TGAA	2	8	46162	46169	50 %	25 %	25 %	0 %	120596868
92	NC_008750	CAAC	2	8	46744	46751	50 %	0 %	0 %	50 %	120596869
93	NC_008750	GCAT	2	8	47848	47855	25 %	25 %	25 %	25 %	120596870
94	NC_008750	AGTT	2	8	48027	48034	25 %	50 %	25 %	0 %	120596870
95	NC_008750	AGCG	2	8	49101	49108	25 %	0 %	50 %	25 %	120596870
96	NC_008750	TGAT	2	8	49576	49583	25 %	50 %	25 %	0 %	120596871
97	NC_008750	GAAA	2	8	49727	49734	75 %	0 %	25 %	0 %	120596871
98	NC_008750	CTGA	2	8	51048	51055	25 %	25 %	25 %	25 %	120596872
99	NC_008750	GTTG	2	8	51420	51427	0 %	50 %	50 %	0 %	120596872
100	NC_008750	AAAT	2	8	51467	51474	75 %	25 %	0 %	0 %	120596872
101	NC_008750	AGGC	2	8	52915	52922	25 %	0 %	50 %	25 %	120596874
102	NC_008750	TCTT	2	8	53193	53200	0 %	75 %	0 %	25 %	120596874
103	NC_008750	CTTT	2	8	53274	53281	0 %	75 %	0 %	25 %	120596874
104	NC_008750	TGAG	2	8	53577	53584	25 %	25 %	50 %	0 %	120596875
105	NC_008750	AAAT	2	8	53914	53921	75 %	25 %	0 %	0 %	120596875
106	NC_008750	GATA	2	8	54941	54948	50 %	25 %	25 %	0 %	120596876
107	NC_008750	GGAC	2	8	55916	55923	25 %	0 %	50 %	25 %	120596877
108	NC_008750	TGAA	2	8	56214	56221	50 %	25 %	25 %	0 %	120596877
109	NC_008750	AATG	2	8	56318	56325	50 %	25 %	25 %	0 %	120596877
110	NC_008750	CTAA	2	8	56373	56380	50 %	25 %	0 %	25 %	120596877
111	NC_008750	TTTG	2	8	57284	57291	0 %	75 %	25 %	0 %	120596878
112	NC_008750	AAGT	2	8	57607	57614	50 %	25 %	25 %	0 %	120596878
113	NC_008750	ATAA	2	8	57684	57691	75 %	25 %	0 %	0 %	120596878
114	NC_008750	TTGA	2	8	58518	58525	25 %	50 %	25 %	0 %	120596878
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116	NC_008750	GCTT	2	8	59583	59590	0 %	50 %	25 %	25 %	120596878
117	NC_008750	ATCC	2	8	59918	59925	25 %	25 %	0 %	50 %	120596878
118	NC_008750	ATCA	2	8	60473	60480	50 %	25 %	0 %	25 %	120596879
119	NC_008750	AGTG	2	8	60674	60681	25 %	25 %	50 %	0 %	120596879
120	NC_008750	GGCA	2	8	60931	60938	25 %	0 %	50 %	25 %	120596879
121	NC_008750	TGAC	2	8	60993	61000	25 %	25 %	25 %	25 %	120596879
122	NC_008750	CCAA	2	8	61215	61222	50 %	0 %	0 %	50 %	120596880
123	NC_008750	CTTT	2	8	62724	62731	0 %	75 %	0 %	25 %	120596882
124	NC_008750	GAGT	2	8	63754	63761	25 %	25 %	50 %	0 %	120596883
125	NC_008750	TATG	2	8	64317	64324	25 %	50 %	25 %	0 %	120596883
126	NC_008750	CGCT	2	8	64505	64512	0 %	25 %	25 %	50 %	120596883
127	NC_008750	TGAG	2	8	65026	65033	25 %	25 %	50 %	0 %	120596884
128	NC_008750	TTTG	2	8	65091	65098	0 %	75 %	25 %	0 %	120596884
129	NC_008750	TTTC	2	8	65455	65462	0 %	75 %	0 %	25 %	120596884
130	NC_008750	TATT	2	8	65692	65699	25 %	75 %	0 %	0 %	120596885
131	NC_008750	TGCG	2	8	68112	68119	0 %	25 %	50 %	25 %	120596887
132	NC_008750	TTAT	2	8	68701	68708	25 %	75 %	0 %	0 %	120596887
133	NC_008750	CTAT	2	8	69481	69488	25 %	50 %	0 %	25 %	120596888
134	NC_008750	TTGA	2	8	69810	69817	25 %	50 %	25 %	0 %	120596888
135	NC_008750	AGCC	2	8	69957	69964	25 %	0 %	25 %	50 %	120596888
136	NC_008750	CTAT	2	8	71358	71365	25 %	50 %	0 %	25 %	120596890
137	NC_008750	GCTT	2	8	72204	72211	0 %	50 %	25 %	25 %	120596890
138	NC_008750	CAGT	2	8	72754	72761	25 %	25 %	25 %	25 %	120596891
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