MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	TGTCGG	2	12	7457	7468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	120586813
2	NC_008741	CCGCTG	2	12	10385	10396	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586815
3	NC_008741	CCCGGC	2	12	11917	11928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586816
4	NC_008741	GCAGGT	2	12	12969	12980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120586816
5	NC_008741	CGAGGT	2	12	14305	14316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120586817
6	NC_008741	GCCATG	2	12	17603	17614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120586819
7	NC_008741	CATGTC	2	12	18115	18126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120586819
8	NC_008741	GACGAT	2	12	18223	18234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120586819
9	NC_008741	GGCGCA	2	12	18684	18695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586819
10	NC_008741	AGGAAC	2	12	21269	21280	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	120586820
11	NC_008741	GGCATG	2	12	24797	24808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120586822
12	NC_008741	CCGGCC	2	12	25164	25175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586822
13	NC_008741	CTGCGT	2	12	26283	26294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120586823
14	NC_008741	CGCTGG	2	12	27172	27183	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120586823
15	NC_008741	CTCGGC	2	12	27810	27821	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586823
16	NC_008741	TCGCCA	2	12	29229	29240	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586825
17	NC_008741	GCGGTC	2	12	30642	30653	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008741	TCCATA	2	12	30854	30865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008741	CCTTGT	2	12	36723	36734	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	120586830
20	NC_008741	TCCACA	2	12	38750	38761	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	120586832
21	NC_008741	CCCGCC	2	12	40890	40901	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	120586833
22	NC_008741	CGTGGC	2	12	41628	41639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120586833
23	NC_008741	GGCGTG	2	12	43788	43799	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008741	AGCACC	2	12	45255	45266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120586835
25	NC_008741	GCTGTA	2	12	45417	45428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120586836
26	NC_008741	CGCCCG	2	12	47046	47057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586839
27	NC_008741	GGTGAC	2	12	47450	47461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120586839
28	NC_008741	GAGGGC	2	12	52670	52681	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120586845
29	NC_008741	GTGGGC	2	12	53547	53558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	120586846
30	NC_008741	TTGCAG	2	12	55000	55011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120586848
31	NC_008741	GAGGTC	2	12	57669	57680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120586851
32	NC_008741	CATGCT	2	12	60236	60247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	120586853
33	NC_008741	GCCGAA	2	12	61114	61125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120586854
34	NC_008741	GGCCGT	2	12	62809	62820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120586857
35	NC_008741	CCTCGC	2	12	62850	62861	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	120586857
36	NC_008741	CCTGCG	2	12	62874	62885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586857
37	NC_008741	CTACCT	2	12	65688	65699	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	120586861
38	NC_008741	GCTGGC	2	12	66926	66937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120586862
39	NC_008741	CTTCGC	2	12	69568	69579	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120586865
40	NC_008741	GCAAGC	2	12	70152	70163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120586865
41	NC_008741	AGCGGC	2	12	73620	73631	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586868
42	NC_008741	GCCTTC	2	12	74094	74105	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120586868
43	NC_008741	TCGGCC	2	12	76767	76778	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586870
44	NC_008741	GGGGCC	2	12	82902	82913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120586875
45	NC_008741	CATCAC	2	12	86976	86987	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	120586876
46	NC_008741	GACCTC	2	12	87839	87850	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586878
47	NC_008741	CGGCGT	2	12	88018	88029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120586878
48	NC_008741	CTCGCC	2	12	88577	88588	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	120586878
49	NC_008741	CGGGGT	2	12	94838	94849	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	120586882
50	NC_008741	AGGGCG	2	12	95700	95711	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120586882
51	NC_008741	TCACAA	2	12	101045	101056	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120586886
52	NC_008741	TTCGCC	2	12	103783	103794	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120586889
53	NC_008741	CCCCGC	2	12	111504	111515	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	120586892
54	NC_008741	TGGCCT	2	12	116215	116226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120586895
55	NC_008741	GCGACA	2	12	120677	120688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120586897
56	NC_008741	CGGCCC	2	12	121087	121098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586898
57	NC_008741	GCGAGG	2	12	122947	122958	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120586899
58	NC_008741	CCCTGC	2	12	123944	123955	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	120586900
59	NC_008741	CGAGGG	2	12	124681	124692	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120586900
60	NC_008741	GGCACG	2	12	126270	126281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586901
61	NC_008741	CGAGGA	2	12	126702	126713	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120586901
62	NC_008741	CACGCG	2	12	126829	126840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120586902
63	NC_008741	ACCGGG	2	12	128324	128335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586903
64	NC_008741	AACAGC	2	12	128913	128924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	120586903
65	NC_008741	CCGCCC	2	12	130398	130409	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	120586904
66	NC_008741	CGAGGC	2	12	131520	131531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586905
67	NC_008741	AGGGCG	2	12	136418	136429	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120586908
68	NC_008741	CGGACG	2	12	136970	136981	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586909
69	NC_008741	AGGGCG	2	12	137395	137406	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	120586909
70	NC_008741	TCCACG	2	12	137656	137667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586909
71	NC_008741	CGCCAG	2	12	142777	142788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120586914
72	NC_008741	GCCGCA	2	12	143735	143746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120586914
73	NC_008741	CCCCAC	2	12	144526	144537	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	120586915
74	NC_008741	CCAGCA	2	12	144696	144707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120586915
75	NC_008741	GTCATG	2	12	144794	144805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120586915
76	NC_008741	GCAGGC	2	12	145644	145655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586916
77	NC_008741	GCAGCG	2	12	146610	146621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586916
78	NC_008741	TGGCGT	2	12	147639	147650	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	120586917
79	NC_008741	GGCCCC	2	12	149331	149342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586918
80	NC_008741	GTCGAA	2	12	152128	152139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120586921
81	NC_008741	CGTTGT	2	12	152967	152978	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	120586921
82	NC_008741	GCACCT	2	12	153389	153400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586922
83	NC_008741	CGCCTG	2	12	153585	153596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586922
84	NC_008741	CGGGGG	2	12	153650	153661	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	120586922
85	NC_008741	CCGTCA	2	12	153719	153730	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586922
86	NC_008741	CCCCGC	2	12	156395	156406	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	120586924
87	NC_008741	GCACCC	2	12	158767	158778	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	120586926
88	NC_008741	CGCCTG	2	12	159200	159211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586926
89	NC_008741	CCAGCA	2	12	159595	159606	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120586926
90	NC_008741	TGCGCC	2	12	160916	160927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586927
91	NC_008741	CGGCCC	2	12	161244	161255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586927
92	NC_008741	CGCCAG	2	12	161890	161901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120586927
93	NC_008741	TCTTCA	2	12	163728	163739	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	120586929
94	NC_008741	CGCTCT	2	12	165558	165569	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	120586929
95	NC_008741	CCTCGG	2	12	166069	166080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120586929
96	NC_008741	GAGACG	2	12	166154	166165	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	120586929
97	NC_008741	CGGCCC	2	12	167450	167461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120586930
98	NC_008741	TCCATC	2	12	168475	168486	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	120586931
99	NC_008741	TGCTGA	2	12	168950	168961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120586931
100	NC_008741	CTGCAA	2	12	171443	171454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120586934
101	NC_008741	ACGGGC	2	12	173039	173050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120586936
102	NC_008741	CCATGC	2	12	174386	174397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586937
103	NC_008741	CCCTGC	2	12	177417	177428	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	120586940
104	NC_008741	GACGCC	2	12	180815	180826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008741	CATGAT	2	12	182498	182509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120586945
106	NC_008741	TCGAGT	2	12	182956	182967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120586946
107	NC_008741	CAACCT	2	12	184042	184053	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	120586947
108	NC_008741	CGACCT	2	12	189415	189426	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120586951
109	NC_008741	GGTCAA	2	12	191167	191178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120586952
110	NC_008741	GTTTGA	2	12	193235	193246	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	120586953
111	NC_008741	AAGCTG	2	12	196203	196214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	120586956
112	NC_008741	AGCTTG	2	12	198091	198102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120586958
113	NC_008741	TTGTTT	2	12	198422	198433	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.