MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	GGGGT	2	10	7789	7798	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008741	CGCCA	2	10	20129	20138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_008741	CGTAT	2	10	31252	31261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008741	GTGGC	2	10	59287	59296	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008741	ATGCC	2	10	63118	63127	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008741	ACGGT	2	10	63651	63660	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008741	GTGAC	2	10	75053	75062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008741	GTGGC	2	10	80381	80390	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008741	CGGGC	2	10	81564	81573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008741	TGCAC	2	10	98666	98675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008741	TTCCC	2	10	122716	122725	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008741	GCCGT	2	10	122757	122766	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008741	GTCTC	2	10	142460	142469	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008741	TCCCC	2	10	151748	151757	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
15	NC_008741	ACGGG	2	10	162567	162576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008741	CGAGG	2	10	166725	166734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008741	TGGCG	2	10	170963	170972	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008741	GGCAA	2	10	171194	171203	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008741	CCCCG	2	10	180833	180842	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_008741	CCCGC	2	10	181016	181025	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_008741	CCCCG	2	10	186893	186902	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_008741	CACGC	2	10	186914	186923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008741	GACAG	2	10	187141	187150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008741	GACAG	2	10	187155	187164	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008741	ACCCA	2	10	198412	198421	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.