MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris DP4 plasmid pDVUL01

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008741	TGCC	2	8	125	132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008741	GGCG	2	8	4691	4698	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008741	CAGC	2	8	4878	4885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008741	GGGA	2	8	5544	5551	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008741	GGGA	2	8	7901	7908	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008741	GTAT	2	8	8132	8139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008741	GCCC	2	8	9127	9134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_008741	CTGC	2	8	9140	9147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008741	TCGG	2	8	15152	15159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008741	GTCT	2	8	15192	15199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008741	CCGT	2	8	15351	15358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008741	GCCA	2	8	15541	15548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008741	GACG	2	8	19966	19973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008741	GGCG	2	8	20765	20772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008741	GGGC	2	8	20912	20919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008741	CCCG	2	8	22783	22790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_008741	AAAG	2	8	23535	23542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008741	CGGA	2	8	31239	31246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008741	TCGG	2	8	31593	31600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008741	GCCC	2	8	32031	32038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_008741	TTCC	2	8	32099	32106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008741	TGAA	2	8	40398	40405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008741	GACC	2	8	40486	40493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008741	TGCG	2	8	43756	43763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008741	TGCC	2	8	43842	43849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008741	CGTC	2	8	45784	45791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008741	CTCG	2	8	53413	53420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008741	CGGG	2	8	54323	54330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008741	GCGG	2	8	54862	54869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008741	GGCG	2	8	59129	59136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008741	GGCG	2	8	59266	59273	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008741	CGGG	2	8	63350	63357	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008741	AGGC	2	8	68111	68118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008741	GCAG	2	8	68274	68281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008741	CCGC	2	8	68288	68295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_008741	CCGG	2	8	70513	70520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008741	GCCA	2	8	74997	75004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008741	TGCC	2	8	81430	81437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008741	CAGG	2	8	81554	81561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008741	CCTG	2	8	81744	81751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008741	AGTG	2	8	81845	81852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008741	TCGG	2	8	93024	93031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008741	CCGG	2	8	98416	98423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008741	AAGC	2	8	98633	98640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008741	TGAA	2	8	98725	98732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008741	GCTG	2	8	106037	106044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008741	GACA	2	8	113487	113494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008741	GCAC	2	8	113499	113506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008741	CTTG	2	8	116800	116807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008741	ATCT	2	8	116914	116921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008741	CCCG	2	8	117038	117045	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_008741	CGTC	2	8	129443	129450	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008741	GCCC	2	8	129485	129492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_008741	TGTC	2	8	138888	138895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008741	GGGC	2	8	148040	148047	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008741	TCCG	2	8	153289	153296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008741	ACGG	2	8	162589	162596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008741	CGCC	2	8	166805	166812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_008741	GCCT	2	8	166820	166827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008741	GGCC	2	8	169045	169052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008741	CGCA	2	8	169153	169160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008741	GCTG	2	8	169432	169439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008741	TGCA	2	8	169552	169559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008741	CTGC	2	8	169613	169620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008741	GCGG	2	8	170936	170943	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008741	CAAC	2	8	171297	171304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008741	CACC	2	8	177118	177125	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_008741	CCGG	2	8	178219	178226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008741	GCCA	2	8	178377	178384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008741	CTGC	2	8	180992	180999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008741	GCAC	2	8	181037	181044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008741	GCCC	2	8	186344	186351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_008741	CAGG	2	8	187004	187011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008741	CGGG	2	8	187013	187020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008741	ACGG	2	8	187068	187075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008741	CGGG	2	8	187095	187102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008741	CAGA	2	8	187228	187235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008741	AAGG	2	8	187248	187255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008741	GGAC	2	8	187310	187317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008741	GCTG	2	8	194227	194234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008741	GCCC	2	8	197350	197357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008741	CCGG	2	8	197760	197767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008741	AGCC	2	8	197956	197963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008741	GATA	2	8	198340	198347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008741	TCTA	2	8	198358	198365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.